Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HJR4

Protein Details
Accession A0A553HJR4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21LIQRRGPREPLQRPNPSEAPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047150  SGT  
IPR032374  SGTA_dimer  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF16546  SGTA_dimer  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MLIQRRGPREPLQRPNPSEAPLSPPSPLRVLSAASPRHLQLALDHHTTPPLQSLLRVLSHTQKTRLDFASTLTWPNPLYQETSRITSKQANLSAMSTTSKQRLALAICDFLSSSLEDGTLSSDDKDSIDVAINCIAESFKVDPADKTAVQAAIGSQNLMQIYGVYEKLKSSGASKPASSSSSSSTAGAAGTTTTPKLPTDEEKARAEELKVQGNKAMTSKDYARAIDLYSQALALHPGNAIFLSNRAAAYSAARDHESARADAEAAVASDPKYTKAWSRLGLARFALGDARGSMEAYSQGIEHEGSGGSEAMKKGFETAKRRVEELEAEERDSSNPIPRGTPGGVGAGAGGGGMPDLSSLAGMFGGGGAGGGGGMPDLSSIMSNPMFANMAQSLMSNPDMMQNLMSNPRLREMADRFTQGGGMPDMSSLMNDPNIAEMARNMMGGGGRGAPPGSGGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.8
3 0.75
4 0.67
5 0.61
6 0.52
7 0.49
8 0.44
9 0.4
10 0.34
11 0.33
12 0.33
13 0.32
14 0.31
15 0.26
16 0.24
17 0.24
18 0.27
19 0.33
20 0.33
21 0.33
22 0.34
23 0.32
24 0.33
25 0.32
26 0.26
27 0.23
28 0.27
29 0.3
30 0.31
31 0.31
32 0.28
33 0.3
34 0.3
35 0.26
36 0.22
37 0.19
38 0.16
39 0.16
40 0.19
41 0.21
42 0.22
43 0.23
44 0.22
45 0.29
46 0.36
47 0.4
48 0.42
49 0.44
50 0.45
51 0.49
52 0.49
53 0.44
54 0.36
55 0.35
56 0.36
57 0.32
58 0.32
59 0.26
60 0.26
61 0.23
62 0.24
63 0.23
64 0.18
65 0.22
66 0.2
67 0.27
68 0.27
69 0.31
70 0.32
71 0.31
72 0.33
73 0.34
74 0.37
75 0.38
76 0.39
77 0.36
78 0.35
79 0.35
80 0.32
81 0.27
82 0.24
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.21
87 0.2
88 0.21
89 0.23
90 0.23
91 0.26
92 0.25
93 0.24
94 0.22
95 0.22
96 0.2
97 0.16
98 0.15
99 0.11
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.12
116 0.11
117 0.12
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.08
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.18
131 0.23
132 0.2
133 0.2
134 0.19
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.05
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.15
159 0.21
160 0.22
161 0.22
162 0.23
163 0.24
164 0.25
165 0.24
166 0.2
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.18
171 0.16
172 0.15
173 0.13
174 0.12
175 0.08
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.2
187 0.25
188 0.29
189 0.3
190 0.31
191 0.3
192 0.29
193 0.26
194 0.24
195 0.22
196 0.25
197 0.24
198 0.23
199 0.24
200 0.23
201 0.23
202 0.19
203 0.18
204 0.11
205 0.13
206 0.15
207 0.17
208 0.18
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.15
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.14
262 0.2
263 0.23
264 0.24
265 0.28
266 0.32
267 0.33
268 0.34
269 0.3
270 0.25
271 0.21
272 0.19
273 0.15
274 0.1
275 0.08
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.11
302 0.16
303 0.22
304 0.27
305 0.35
306 0.43
307 0.44
308 0.45
309 0.43
310 0.41
311 0.38
312 0.37
313 0.37
314 0.3
315 0.3
316 0.3
317 0.29
318 0.27
319 0.25
320 0.2
321 0.18
322 0.2
323 0.2
324 0.2
325 0.21
326 0.25
327 0.24
328 0.24
329 0.18
330 0.16
331 0.15
332 0.14
333 0.13
334 0.08
335 0.07
336 0.05
337 0.04
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.02
343 0.02
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.03
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.08
369 0.08
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.14
376 0.11
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.1
384 0.1
385 0.14
386 0.15
387 0.15
388 0.15
389 0.14
390 0.16
391 0.21
392 0.25
393 0.24
394 0.24
395 0.26
396 0.27
397 0.27
398 0.32
399 0.32
400 0.36
401 0.37
402 0.39
403 0.38
404 0.37
405 0.36
406 0.28
407 0.26
408 0.2
409 0.17
410 0.14
411 0.12
412 0.13
413 0.12
414 0.12
415 0.1
416 0.11
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.12
423 0.11
424 0.09
425 0.13
426 0.13
427 0.13
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.13
437 0.11