Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HJJ3

Protein Details
Accession A0A553HJJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-173HSSDGPKPERKPKVKKHVSFCCCFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-165RKQRGNSERPSDGRRHEKIPQASGAHSSDGPKPERKPKVKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018306  Phage_T5_Orf172_DNA-bd  
Pfam View protein in Pfam  
PF10544  T5orf172  
Amino Acid Sequences MPFIPNTPESLLGRSDSKNPSTTCRGITSGGRPCRRPLTATPGSSPAASPAASPPAISRSRVNRLRVDDPSDPDLYCWQHKDQASSSAKSSPGPASRTKLNPIRQESFESLVDRLGIVEAERNGRKQRGNSERPSDGRRHEKIPQASGAHSSDGPKPERKPKVKKHVSFCCCFTIPVYEEEGEGEEEQPPRPKPRPIQNTSTKPDTAKLPSKQHLAPAQSSQRPSLAPSKQSSAQSAMSQTSQYLSFIPNSVLPETAASLLKELSKPYSQMDEPGYIYIFWLTPESQPSAPPAEVARDLLAPPPRPDMRQRRTSDVLQSFATQSTRAGASSKTILLKIGRASNVQRRLNEWQRQCGYNISLIRYYPYVSSSRPSTPRKMPHSHKVERLIHIELEGQGLRVNHKVDCDACGKNHREWFEVEATRAGINTVDEIVRRWSDWDEGNPQRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.35
4 0.37
5 0.41
6 0.41
7 0.46
8 0.5
9 0.51
10 0.47
11 0.45
12 0.43
13 0.4
14 0.44
15 0.45
16 0.47
17 0.53
18 0.55
19 0.54
20 0.57
21 0.62
22 0.59
23 0.56
24 0.53
25 0.53
26 0.55
27 0.56
28 0.54
29 0.5
30 0.48
31 0.43
32 0.36
33 0.29
34 0.22
35 0.19
36 0.17
37 0.15
38 0.19
39 0.18
40 0.19
41 0.17
42 0.23
43 0.25
44 0.27
45 0.3
46 0.34
47 0.44
48 0.51
49 0.55
50 0.54
51 0.59
52 0.63
53 0.61
54 0.61
55 0.55
56 0.53
57 0.52
58 0.47
59 0.4
60 0.34
61 0.34
62 0.31
63 0.3
64 0.29
65 0.27
66 0.32
67 0.34
68 0.38
69 0.36
70 0.42
71 0.43
72 0.41
73 0.41
74 0.38
75 0.37
76 0.33
77 0.34
78 0.3
79 0.3
80 0.32
81 0.35
82 0.35
83 0.41
84 0.44
85 0.49
86 0.51
87 0.53
88 0.58
89 0.6
90 0.61
91 0.56
92 0.58
93 0.53
94 0.49
95 0.43
96 0.36
97 0.29
98 0.24
99 0.22
100 0.16
101 0.13
102 0.09
103 0.07
104 0.06
105 0.08
106 0.09
107 0.15
108 0.17
109 0.2
110 0.24
111 0.29
112 0.33
113 0.35
114 0.43
115 0.48
116 0.56
117 0.6
118 0.62
119 0.63
120 0.64
121 0.64
122 0.59
123 0.55
124 0.56
125 0.52
126 0.5
127 0.5
128 0.54
129 0.54
130 0.52
131 0.5
132 0.43
133 0.4
134 0.39
135 0.34
136 0.27
137 0.23
138 0.22
139 0.21
140 0.24
141 0.26
142 0.28
143 0.32
144 0.4
145 0.49
146 0.57
147 0.64
148 0.69
149 0.77
150 0.83
151 0.85
152 0.85
153 0.86
154 0.82
155 0.75
156 0.67
157 0.61
158 0.51
159 0.44
160 0.35
161 0.29
162 0.24
163 0.22
164 0.22
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.12
170 0.11
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.15
176 0.17
177 0.22
178 0.25
179 0.31
180 0.36
181 0.45
182 0.55
183 0.55
184 0.62
185 0.66
186 0.71
187 0.69
188 0.66
189 0.56
190 0.47
191 0.43
192 0.38
193 0.34
194 0.34
195 0.36
196 0.38
197 0.4
198 0.43
199 0.42
200 0.43
201 0.41
202 0.36
203 0.32
204 0.3
205 0.33
206 0.32
207 0.33
208 0.29
209 0.26
210 0.23
211 0.24
212 0.27
213 0.24
214 0.24
215 0.25
216 0.28
217 0.3
218 0.31
219 0.3
220 0.25
221 0.24
222 0.21
223 0.21
224 0.18
225 0.15
226 0.14
227 0.12
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.18
256 0.16
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.18
261 0.18
262 0.17
263 0.13
264 0.13
265 0.1
266 0.08
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.11
272 0.14
273 0.13
274 0.14
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.15
287 0.19
288 0.18
289 0.19
290 0.25
291 0.26
292 0.28
293 0.37
294 0.44
295 0.47
296 0.55
297 0.58
298 0.59
299 0.62
300 0.63
301 0.62
302 0.54
303 0.49
304 0.4
305 0.38
306 0.31
307 0.28
308 0.25
309 0.16
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.12
317 0.14
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.18
322 0.18
323 0.2
324 0.21
325 0.24
326 0.23
327 0.24
328 0.3
329 0.37
330 0.45
331 0.47
332 0.45
333 0.45
334 0.53
335 0.59
336 0.62
337 0.58
338 0.58
339 0.58
340 0.58
341 0.55
342 0.49
343 0.42
344 0.39
345 0.38
346 0.31
347 0.29
348 0.28
349 0.28
350 0.24
351 0.24
352 0.18
353 0.18
354 0.18
355 0.17
356 0.21
357 0.24
358 0.3
359 0.38
360 0.43
361 0.48
362 0.54
363 0.62
364 0.67
365 0.72
366 0.73
367 0.74
368 0.79
369 0.78
370 0.77
371 0.78
372 0.76
373 0.7
374 0.67
375 0.59
376 0.5
377 0.43
378 0.37
379 0.27
380 0.24
381 0.2
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.17
386 0.18
387 0.2
388 0.17
389 0.19
390 0.23
391 0.22
392 0.25
393 0.28
394 0.28
395 0.31
396 0.39
397 0.41
398 0.44
399 0.49
400 0.48
401 0.46
402 0.45
403 0.45
404 0.45
405 0.44
406 0.38
407 0.34
408 0.32
409 0.3
410 0.27
411 0.22
412 0.15
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.12
417 0.12
418 0.14
419 0.18
420 0.19
421 0.19
422 0.2
423 0.21
424 0.24
425 0.28
426 0.32
427 0.37