Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HL54

Protein Details
Accession A0A553HL54    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-118TGVWVIRKQTRRKRDPEDEIIVHydrophilic
299-326KTPKTPTGTSKLKRKKSKTGQTPTSSFPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-316KDGSAKTGEKTPKTPTGTSKLKRKKSK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MATHNEPPLDEIQWRHPQSAQQMQGIHSNSVLFYFAQSPFFDPTSNNAVLANQAMFNPAMFHLIQTREAFEGRLREMSGLEFIVAQEPAETAPGTGTGVWVIRKQTRRKRDPEDEIIVHATYYIVGENIYMAPTLAQALSFRMTTISSALNKCFPAADEARVWSPSRGHVYKTAQTTANPRPRNAAESKETTPRPDESAVSNKNTSASEPKKPDQSLSAFDLMRHAEHSMLIHMQSGGDYEDENPITGKPGAFNLSKTGRTDKLQVPGITALNMSFKSTSILDMGGKKTKDGSAKTGEKTPKTPTGTSKLKRKKSKTGQTPTSSFPSYPANPILSINALNDRHPLDVGNGPERARRKLNMIAHAKGSISFPQSSGRPRQSPTEKAAPTDPDCPEIRDDKPAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.4
4 0.43
5 0.48
6 0.55
7 0.5
8 0.45
9 0.45
10 0.45
11 0.49
12 0.46
13 0.38
14 0.29
15 0.25
16 0.2
17 0.18
18 0.18
19 0.11
20 0.11
21 0.14
22 0.15
23 0.17
24 0.17
25 0.2
26 0.22
27 0.23
28 0.22
29 0.19
30 0.23
31 0.27
32 0.27
33 0.24
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.21
38 0.17
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.15
50 0.17
51 0.21
52 0.2
53 0.21
54 0.2
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.22
59 0.2
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.17
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.08
86 0.09
87 0.11
88 0.15
89 0.22
90 0.3
91 0.4
92 0.49
93 0.59
94 0.67
95 0.74
96 0.79
97 0.83
98 0.83
99 0.81
100 0.79
101 0.69
102 0.62
103 0.55
104 0.45
105 0.34
106 0.25
107 0.17
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.11
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.16
143 0.16
144 0.17
145 0.16
146 0.17
147 0.18
148 0.19
149 0.2
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.22
154 0.21
155 0.22
156 0.27
157 0.31
158 0.34
159 0.36
160 0.36
161 0.3
162 0.3
163 0.35
164 0.38
165 0.42
166 0.39
167 0.37
168 0.39
169 0.39
170 0.42
171 0.38
172 0.34
173 0.29
174 0.32
175 0.34
176 0.36
177 0.36
178 0.32
179 0.32
180 0.28
181 0.27
182 0.23
183 0.22
184 0.19
185 0.26
186 0.27
187 0.27
188 0.26
189 0.24
190 0.24
191 0.23
192 0.21
193 0.21
194 0.22
195 0.27
196 0.32
197 0.34
198 0.39
199 0.39
200 0.38
201 0.34
202 0.33
203 0.29
204 0.27
205 0.29
206 0.23
207 0.22
208 0.24
209 0.19
210 0.17
211 0.14
212 0.11
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.1
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.17
242 0.2
243 0.22
244 0.24
245 0.26
246 0.26
247 0.27
248 0.32
249 0.31
250 0.34
251 0.38
252 0.36
253 0.33
254 0.33
255 0.31
256 0.26
257 0.22
258 0.16
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.15
271 0.19
272 0.22
273 0.22
274 0.22
275 0.23
276 0.26
277 0.29
278 0.29
279 0.31
280 0.35
281 0.41
282 0.43
283 0.49
284 0.51
285 0.48
286 0.48
287 0.48
288 0.48
289 0.47
290 0.48
291 0.46
292 0.49
293 0.56
294 0.6
295 0.65
296 0.67
297 0.72
298 0.79
299 0.8
300 0.82
301 0.83
302 0.87
303 0.87
304 0.88
305 0.88
306 0.85
307 0.81
308 0.74
309 0.68
310 0.59
311 0.48
312 0.4
313 0.37
314 0.32
315 0.32
316 0.31
317 0.27
318 0.26
319 0.26
320 0.26
321 0.21
322 0.2
323 0.17
324 0.21
325 0.2
326 0.2
327 0.23
328 0.23
329 0.22
330 0.21
331 0.2
332 0.16
333 0.2
334 0.23
335 0.24
336 0.25
337 0.25
338 0.31
339 0.34
340 0.36
341 0.37
342 0.36
343 0.38
344 0.44
345 0.5
346 0.55
347 0.58
348 0.55
349 0.52
350 0.51
351 0.45
352 0.38
353 0.33
354 0.27
355 0.25
356 0.22
357 0.21
358 0.24
359 0.28
360 0.34
361 0.42
362 0.46
363 0.47
364 0.49
365 0.58
366 0.61
367 0.64
368 0.64
369 0.65
370 0.58
371 0.56
372 0.59
373 0.56
374 0.52
375 0.52
376 0.46
377 0.41
378 0.41
379 0.4
380 0.39
381 0.37
382 0.36