Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553I202

Protein Details
Accession A0A553I202   
Localization Confidence High
Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-112VITNSPPRRVRTPTKSRRRKVSIPNNLPNEQHydrophilic
382-413VMSQRKPKAKETKQPPKTKRKKKAGTQSNPILHydrophilic
639-661DSPSKAPAKPRGRGRSKKTDDTSHydrophilic
665-692AQPTPSDKPSPKRSRGRPQKDKTTSTPIHydrophilic
695-719PGVSASSPKRPRGRPRKSSNTSIAIHydrophilic
832-851SKSVICLWRRNLRGKERKRYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-101RVRTPTKSRRRK
324-331KEPAPRKK
386-405RKPKAKETKQPPKTKRKKKA
643-656KAPAKPRGRGRSKK
672-684KPSPKRSRGRPQK
702-711PKRPRGRPRK
846-849KERK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 24
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MASTDILMSSPHRPRALDPTSVPSSSPCLPSLDEIFLKNRPDRPSLITGTHDAPIPADARTTFTSAANILREAPEIDIDTEVITNSPPRRVRTPTKSRRRKVSIPNNLPNEQSLDKPAVMVGSLSPQDKPWQKFKSKSFTQQSNQNFPPAGPKARTSNTISKTRPAGTREAVSRHFTPTAEDSFPANNARGEKRKIDKNESADGALANVQSETAMPRRGDWTPPKANESIVLDSDSDSRELFSSAQKAPVSKDVFQTLYDQYGRQDLDLSPEGCPQPQAGFLKKRKRIEMISTGQEEAKKQPHEEIPPNDFPRPNEQKQRMAPKEPAPRKKTRTITELAIAPFAAPVSPNFDLAGPATKESMLDYFDADGAVKALVEHQSAVMSQRKPKAKETKQPPKTKRKKKAGTQSNPILLSPSSALKQSSNQDFVFGTSSQLMQEDSPTTLRDLQAAIRASNTLHSDPFDEDVGRRLWQAGSRDEGGELMGMDIIDLQHSSTIITEPDSAATPGDRKFVDIDDLLDSPRPVSPILEETSESEQANSHPLQSQSTKHDSSAKSSESEGSANTMTTTPRPKYELFTDAQLSKQIISYGFKPVKKRTAMIALLNQCWTSKHQGASASSIQPLSTSTRSPPLVQQKPVDSPSKAPAKPRGRGRSKKTDDTSASVAQPTPSDKPSPKRSRGRPQKDKTTSTPITEPGVSASSPKRPRGRPRKSSNTSIAIPDSENETPSPMSSPDPVFSSPPPLDLTISDEGDMSLTLSPTDQQTELFKHITKAVTSAPRSQDPSKPSWHEKMLLYDPIILEELTSWLNGGELTRVGHDGEVSPFDVKKWCESKSVICLWRRNLRGKERKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.47
3 0.5
4 0.48
5 0.44
6 0.46
7 0.48
8 0.47
9 0.44
10 0.35
11 0.36
12 0.33
13 0.33
14 0.26
15 0.24
16 0.25
17 0.28
18 0.3
19 0.3
20 0.28
21 0.28
22 0.3
23 0.32
24 0.37
25 0.38
26 0.41
27 0.41
28 0.43
29 0.45
30 0.48
31 0.51
32 0.5
33 0.48
34 0.45
35 0.43
36 0.41
37 0.39
38 0.33
39 0.25
40 0.21
41 0.2
42 0.18
43 0.14
44 0.14
45 0.13
46 0.16
47 0.19
48 0.21
49 0.2
50 0.19
51 0.21
52 0.21
53 0.24
54 0.21
55 0.2
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.15
62 0.14
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.08
71 0.13
72 0.15
73 0.23
74 0.27
75 0.32
76 0.39
77 0.47
78 0.56
79 0.61
80 0.71
81 0.74
82 0.8
83 0.86
84 0.89
85 0.91
86 0.89
87 0.88
88 0.88
89 0.88
90 0.88
91 0.88
92 0.89
93 0.85
94 0.78
95 0.69
96 0.59
97 0.53
98 0.43
99 0.34
100 0.29
101 0.25
102 0.22
103 0.22
104 0.2
105 0.15
106 0.14
107 0.12
108 0.09
109 0.11
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.23
115 0.31
116 0.35
117 0.4
118 0.47
119 0.55
120 0.63
121 0.7
122 0.72
123 0.72
124 0.78
125 0.77
126 0.78
127 0.75
128 0.75
129 0.75
130 0.74
131 0.68
132 0.61
133 0.52
134 0.43
135 0.46
136 0.42
137 0.4
138 0.33
139 0.35
140 0.38
141 0.41
142 0.45
143 0.44
144 0.48
145 0.48
146 0.55
147 0.54
148 0.52
149 0.54
150 0.54
151 0.52
152 0.46
153 0.46
154 0.41
155 0.44
156 0.43
157 0.44
158 0.43
159 0.42
160 0.4
161 0.38
162 0.36
163 0.31
164 0.3
165 0.29
166 0.29
167 0.26
168 0.25
169 0.23
170 0.22
171 0.24
172 0.23
173 0.2
174 0.18
175 0.2
176 0.26
177 0.31
178 0.34
179 0.4
180 0.46
181 0.53
182 0.58
183 0.63
184 0.64
185 0.62
186 0.64
187 0.58
188 0.51
189 0.43
190 0.36
191 0.28
192 0.22
193 0.16
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.1
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.19
205 0.21
206 0.29
207 0.34
208 0.4
209 0.44
210 0.47
211 0.49
212 0.47
213 0.45
214 0.41
215 0.38
216 0.31
217 0.24
218 0.22
219 0.18
220 0.18
221 0.19
222 0.17
223 0.13
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.16
231 0.16
232 0.21
233 0.21
234 0.22
235 0.23
236 0.3
237 0.31
238 0.28
239 0.3
240 0.28
241 0.28
242 0.28
243 0.29
244 0.22
245 0.23
246 0.21
247 0.19
248 0.17
249 0.2
250 0.19
251 0.16
252 0.17
253 0.13
254 0.17
255 0.21
256 0.21
257 0.18
258 0.21
259 0.21
260 0.19
261 0.2
262 0.15
263 0.12
264 0.16
265 0.19
266 0.22
267 0.31
268 0.39
269 0.49
270 0.56
271 0.6
272 0.6
273 0.62
274 0.6
275 0.58
276 0.59
277 0.54
278 0.52
279 0.49
280 0.45
281 0.41
282 0.37
283 0.31
284 0.26
285 0.27
286 0.23
287 0.22
288 0.26
289 0.3
290 0.35
291 0.42
292 0.43
293 0.43
294 0.49
295 0.51
296 0.5
297 0.46
298 0.42
299 0.44
300 0.47
301 0.47
302 0.49
303 0.51
304 0.56
305 0.61
306 0.7
307 0.64
308 0.61
309 0.59
310 0.58
311 0.64
312 0.65
313 0.69
314 0.65
315 0.69
316 0.7
317 0.74
318 0.73
319 0.67
320 0.64
321 0.58
322 0.53
323 0.47
324 0.45
325 0.36
326 0.28
327 0.23
328 0.17
329 0.13
330 0.11
331 0.08
332 0.04
333 0.04
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.16
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.03
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.09
369 0.14
370 0.15
371 0.19
372 0.26
373 0.32
374 0.35
375 0.43
376 0.51
377 0.54
378 0.61
379 0.68
380 0.72
381 0.76
382 0.83
383 0.84
384 0.85
385 0.87
386 0.89
387 0.89
388 0.88
389 0.88
390 0.87
391 0.89
392 0.88
393 0.85
394 0.82
395 0.77
396 0.7
397 0.61
398 0.52
399 0.42
400 0.31
401 0.23
402 0.16
403 0.12
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.09
408 0.13
409 0.16
410 0.19
411 0.21
412 0.2
413 0.21
414 0.2
415 0.2
416 0.19
417 0.15
418 0.12
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.08
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.14
437 0.14
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.11
442 0.13
443 0.14
444 0.11
445 0.1
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.13
450 0.12
451 0.1
452 0.09
453 0.11
454 0.12
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.13
460 0.16
461 0.15
462 0.17
463 0.17
464 0.17
465 0.16
466 0.16
467 0.12
468 0.09
469 0.08
470 0.05
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.04
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.12
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.13
500 0.15
501 0.12
502 0.13
503 0.12
504 0.13
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.09
509 0.1
510 0.09
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.11
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.15
519 0.18
520 0.19
521 0.18
522 0.15
523 0.14
524 0.13
525 0.17
526 0.14
527 0.12
528 0.13
529 0.14
530 0.17
531 0.19
532 0.22
533 0.24
534 0.3
535 0.3
536 0.29
537 0.35
538 0.33
539 0.36
540 0.38
541 0.33
542 0.28
543 0.28
544 0.28
545 0.22
546 0.22
547 0.16
548 0.14
549 0.12
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.1
554 0.13
555 0.19
556 0.18
557 0.2
558 0.24
559 0.24
560 0.28
561 0.31
562 0.32
563 0.27
564 0.29
565 0.3
566 0.27
567 0.26
568 0.24
569 0.2
570 0.16
571 0.15
572 0.14
573 0.12
574 0.13
575 0.14
576 0.22
577 0.27
578 0.3
579 0.35
580 0.4
581 0.47
582 0.47
583 0.47
584 0.42
585 0.45
586 0.45
587 0.43
588 0.44
589 0.4
590 0.38
591 0.38
592 0.33
593 0.25
594 0.23
595 0.22
596 0.22
597 0.22
598 0.22
599 0.24
600 0.29
601 0.3
602 0.34
603 0.35
604 0.29
605 0.26
606 0.25
607 0.22
608 0.18
609 0.18
610 0.17
611 0.15
612 0.15
613 0.16
614 0.22
615 0.24
616 0.25
617 0.32
618 0.37
619 0.42
620 0.45
621 0.47
622 0.45
623 0.49
624 0.52
625 0.49
626 0.4
627 0.36
628 0.39
629 0.45
630 0.42
631 0.43
632 0.49
633 0.52
634 0.58
635 0.65
636 0.69
637 0.7
638 0.78
639 0.81
640 0.82
641 0.82
642 0.84
643 0.78
644 0.76
645 0.69
646 0.64
647 0.6
648 0.52
649 0.45
650 0.37
651 0.33
652 0.25
653 0.23
654 0.22
655 0.2
656 0.2
657 0.25
658 0.29
659 0.37
660 0.48
661 0.56
662 0.63
663 0.7
664 0.77
665 0.82
666 0.88
667 0.91
668 0.91
669 0.9
670 0.91
671 0.89
672 0.86
673 0.81
674 0.8
675 0.72
676 0.65
677 0.58
678 0.49
679 0.44
680 0.38
681 0.32
682 0.24
683 0.22
684 0.18
685 0.18
686 0.2
687 0.26
688 0.31
689 0.39
690 0.46
691 0.53
692 0.64
693 0.72
694 0.8
695 0.81
696 0.85
697 0.89
698 0.87
699 0.87
700 0.84
701 0.79
702 0.7
703 0.62
704 0.54
705 0.44
706 0.38
707 0.3
708 0.27
709 0.22
710 0.21
711 0.17
712 0.17
713 0.16
714 0.16
715 0.17
716 0.13
717 0.15
718 0.18
719 0.19
720 0.19
721 0.22
722 0.23
723 0.24
724 0.23
725 0.29
726 0.25
727 0.25
728 0.26
729 0.24
730 0.23
731 0.21
732 0.25
733 0.22
734 0.22
735 0.2
736 0.18
737 0.17
738 0.16
739 0.15
740 0.1
741 0.07
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.09
746 0.1
747 0.13
748 0.12
749 0.13
750 0.17
751 0.21
752 0.25
753 0.27
754 0.27
755 0.26
756 0.3
757 0.32
758 0.28
759 0.26
760 0.29
761 0.35
762 0.37
763 0.42
764 0.43
765 0.46
766 0.52
767 0.53
768 0.53
769 0.5
770 0.52
771 0.54
772 0.56
773 0.58
774 0.59
775 0.6
776 0.58
777 0.55
778 0.57
779 0.54
780 0.5
781 0.44
782 0.4
783 0.35
784 0.31
785 0.29
786 0.21
787 0.16
788 0.12
789 0.12
790 0.1
791 0.1
792 0.08
793 0.07
794 0.07
795 0.08
796 0.08
797 0.08
798 0.09
799 0.1
800 0.11
801 0.12
802 0.13
803 0.13
804 0.13
805 0.13
806 0.15
807 0.16
808 0.16
809 0.18
810 0.17
811 0.19
812 0.24
813 0.23
814 0.3
815 0.33
816 0.34
817 0.38
818 0.42
819 0.47
820 0.5
821 0.57
822 0.56
823 0.58
824 0.63
825 0.64
826 0.7
827 0.7
828 0.71
829 0.71
830 0.75
831 0.79