Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HJA4

Protein Details
Accession A0A553HJA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-116SQASAAPKKKRGRKSKAELASEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-109PKKKRGRKSK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MASPPHSYSPAGSPPYPSHSQLPSKKRTSMATELSIQPPSLKRRKASTMSVTSAGSAHPLRQTSFPPDETLARGYSPSYQRSPSVDTMSLVSGSQASAAPKKKRGRKSKAELASEAAAAAVRNGASSTVGGRAATIVSSASGTLGKDGDGDVGRDGDNDGSFELPENMASRSAARTKEQIEEEKELVALLKSQMDNIQFDRYEVWHRQSIKPQDVKRHINSVTSQSCPTNVHQMMQVVCKMYLGDIVEAARDIQQEWIDLGEKQTDLEDDKLEPSNELSKYRRQAPLRPEHLREAYRRRKAAADNGGALGSLMVWNQQTHNGAERFAFHWASGYGIGYHNLAGSFSRKKTSSTLAASVHLTGSTACPSHDENQIAGSSFGTMRHPTKSANKLKSDIFPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.44
3 0.45
4 0.42
5 0.4
6 0.42
7 0.52
8 0.56
9 0.62
10 0.65
11 0.67
12 0.69
13 0.67
14 0.65
15 0.63
16 0.62
17 0.59
18 0.54
19 0.53
20 0.51
21 0.5
22 0.46
23 0.38
24 0.34
25 0.34
26 0.39
27 0.43
28 0.45
29 0.47
30 0.53
31 0.62
32 0.64
33 0.67
34 0.67
35 0.65
36 0.63
37 0.61
38 0.54
39 0.45
40 0.39
41 0.3
42 0.24
43 0.17
44 0.16
45 0.17
46 0.19
47 0.2
48 0.23
49 0.26
50 0.3
51 0.34
52 0.33
53 0.32
54 0.33
55 0.33
56 0.33
57 0.32
58 0.25
59 0.2
60 0.19
61 0.17
62 0.22
63 0.25
64 0.28
65 0.29
66 0.3
67 0.32
68 0.35
69 0.4
70 0.37
71 0.37
72 0.33
73 0.3
74 0.29
75 0.27
76 0.24
77 0.18
78 0.14
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.16
85 0.24
86 0.29
87 0.37
88 0.46
89 0.55
90 0.63
91 0.72
92 0.76
93 0.79
94 0.84
95 0.86
96 0.85
97 0.81
98 0.72
99 0.64
100 0.55
101 0.44
102 0.34
103 0.24
104 0.15
105 0.1
106 0.09
107 0.06
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.18
163 0.2
164 0.24
165 0.26
166 0.29
167 0.28
168 0.3
169 0.29
170 0.26
171 0.23
172 0.18
173 0.16
174 0.11
175 0.08
176 0.05
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.15
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.13
189 0.16
190 0.17
191 0.19
192 0.2
193 0.24
194 0.27
195 0.33
196 0.39
197 0.42
198 0.47
199 0.48
200 0.53
201 0.58
202 0.61
203 0.56
204 0.56
205 0.48
206 0.44
207 0.42
208 0.4
209 0.35
210 0.3
211 0.29
212 0.23
213 0.24
214 0.23
215 0.23
216 0.24
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.23
221 0.23
222 0.23
223 0.23
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.11
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.12
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.18
263 0.19
264 0.23
265 0.24
266 0.29
267 0.34
268 0.4
269 0.47
270 0.45
271 0.51
272 0.56
273 0.63
274 0.65
275 0.67
276 0.64
277 0.62
278 0.64
279 0.61
280 0.59
281 0.59
282 0.6
283 0.62
284 0.61
285 0.56
286 0.56
287 0.56
288 0.58
289 0.57
290 0.5
291 0.44
292 0.42
293 0.4
294 0.34
295 0.29
296 0.19
297 0.1
298 0.06
299 0.04
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.12
305 0.14
306 0.15
307 0.23
308 0.22
309 0.22
310 0.22
311 0.24
312 0.22
313 0.23
314 0.22
315 0.15
316 0.16
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.13
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.14
331 0.19
332 0.21
333 0.27
334 0.27
335 0.29
336 0.34
337 0.39
338 0.42
339 0.41
340 0.45
341 0.41
342 0.43
343 0.41
344 0.37
345 0.31
346 0.22
347 0.17
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.14
354 0.18
355 0.21
356 0.27
357 0.27
358 0.25
359 0.27
360 0.28
361 0.26
362 0.23
363 0.19
364 0.15
365 0.13
366 0.14
367 0.15
368 0.2
369 0.21
370 0.25
371 0.27
372 0.32
373 0.41
374 0.5
375 0.56
376 0.6
377 0.63
378 0.64
379 0.66