Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HTM1

Protein Details
Accession A0A553HTM1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-75ALFRRCWWCKLRFSRYRAVCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027516  EIF3C  
IPR008905  EIF3C_N_dom  
IPR000717  PCI_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0031369  F:translation initiation factor binding  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF05470  eIF-3c_N  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MDVALDDVDGGLDGGVGVGRFWGGDRGYRRPRRMAVGVWRMADADADAGVNTVDDALFRRCWWCKLRFSRYRAVCGEGRYGVLVRRWAGREPCEVDDVLMGSTQHTRSKAGARGAEDGWMDGCGAARKKQKSETAGGPCAVAVAATVQRSQLLWHVGCPVNYQWSHSLLSIFWTYTIYEATSLNLSATAPSRMMASNGGHDVKDRKGQLSPNEETPEEQQLQRDLKHLDHLLSRCREIRTTIPRMLDGMPEVARKHQDSREALFSELVNHMKNADTEIQDFASLYTSEESKRVLDKAKQSRETNPKGIKTWLYQDHPNWADVSHNNIWKARSMDKLRLEHPPPKLDELYTVFQRPAICWGGRQPHQPSPPPFAVCPSIFFFDQRQRQRPHTHILLPVWAVNPNIVVVQPNRATAIQILSPTSHAHPATDQRPPANMSRFFRSGDDSSSESSSDEEELYSEEEEEKDVEESEEDDSEEEDEDEDESDEGSSDEEGVKKTGASRFLRGDSSESEDSDEDQPKTVKSARDKRFAELEATIDAIEKKQKINDWGAVSNEFDKLNRQAVKMTERGQPPKLYIKAIVELEDAMNETISKQKVTPKKMNATSARGLNAVKQKIKKLKQDHQTEVDRYREDPLDFLASEDEEEEAPPPKPKKTKAENYAAQVELQDEEGFETVVKGGRTLQFTPESIFKHLRTILESRGKKNTDRLEQIRIMEKLHAVANTPYQTIRVLLTLVSARFDLGTGTSNSMPLEQWKAAEKELSTLFEVLEKNRDHIVIENAEEWDDDDKPPTIQPGEKYIKVPGSVVSYVERLDDELTRSLQTIDPHTSEYIDRLTDEGALYNVIVRGLLYYETLGKDSTLQIPQDSLNRIVMRRLEHVYFKPAQVVKILEENAWKPVPAAVESVITPRGSITDATQLLNVLCNYLFVNSEGIIRARAMLCQIYFLALHDEYYKARDMMLMSHLQETINSFDVQTQILYNRTLVQVGLCAFRKGLVYDAQNTLQEICGSGRQKELLAQGVMIQRFAQVSPEQERLEKQRQLPFHMHINLELLECVYLTCSMLLEIPLLAQTGSSPDIKKRVISKTYRRMLEYHERQIFTGPPENTRDHVMQASRALAAGEWKKAINFVHSIKIWDLMPNTDEIKTMLSKQIQEEGLRTYLFTYAPFYDTLAVSTLSSMFDLDDRKVASIVSKMISHEELAAALDQVTSTVIFRKGVELSRLQSLALTLSDKAAALIETNERTLEQRTQGTANAFDRRGGQNQRGGRGGGQKTGRGGARTGGTGQRQAGGTQFTGGVLGGAVRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.03
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.04
6 0.04
7 0.04
8 0.06
9 0.1
10 0.11
11 0.18
12 0.23
13 0.33
14 0.45
15 0.54
16 0.6
17 0.63
18 0.68
19 0.69
20 0.7
21 0.68
22 0.68
23 0.68
24 0.67
25 0.59
26 0.54
27 0.47
28 0.41
29 0.33
30 0.22
31 0.13
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.05
40 0.04
41 0.05
42 0.08
43 0.11
44 0.13
45 0.14
46 0.21
47 0.24
48 0.32
49 0.4
50 0.44
51 0.51
52 0.61
53 0.71
54 0.74
55 0.77
56 0.8
57 0.79
58 0.79
59 0.71
60 0.66
61 0.59
62 0.53
63 0.52
64 0.42
65 0.37
66 0.3
67 0.29
68 0.27
69 0.26
70 0.27
71 0.24
72 0.29
73 0.31
74 0.36
75 0.41
76 0.42
77 0.46
78 0.47
79 0.47
80 0.44
81 0.41
82 0.34
83 0.3
84 0.26
85 0.18
86 0.15
87 0.12
88 0.1
89 0.15
90 0.17
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.25
95 0.32
96 0.37
97 0.4
98 0.42
99 0.41
100 0.44
101 0.42
102 0.41
103 0.34
104 0.28
105 0.22
106 0.17
107 0.14
108 0.1
109 0.11
110 0.13
111 0.16
112 0.22
113 0.3
114 0.36
115 0.42
116 0.5
117 0.56
118 0.56
119 0.61
120 0.63
121 0.63
122 0.62
123 0.57
124 0.49
125 0.41
126 0.35
127 0.27
128 0.18
129 0.09
130 0.07
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.2
140 0.19
141 0.2
142 0.27
143 0.28
144 0.29
145 0.31
146 0.28
147 0.29
148 0.29
149 0.31
150 0.27
151 0.28
152 0.29
153 0.26
154 0.26
155 0.18
156 0.21
157 0.19
158 0.17
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.15
182 0.15
183 0.17
184 0.21
185 0.22
186 0.2
187 0.22
188 0.25
189 0.25
190 0.31
191 0.29
192 0.27
193 0.31
194 0.37
195 0.42
196 0.47
197 0.47
198 0.46
199 0.48
200 0.46
201 0.43
202 0.4
203 0.39
204 0.33
205 0.31
206 0.27
207 0.29
208 0.32
209 0.31
210 0.33
211 0.29
212 0.27
213 0.33
214 0.32
215 0.29
216 0.32
217 0.34
218 0.38
219 0.39
220 0.41
221 0.39
222 0.39
223 0.38
224 0.35
225 0.41
226 0.42
227 0.46
228 0.48
229 0.45
230 0.43
231 0.44
232 0.41
233 0.34
234 0.25
235 0.22
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.21
240 0.24
241 0.25
242 0.29
243 0.3
244 0.36
245 0.38
246 0.42
247 0.45
248 0.43
249 0.41
250 0.36
251 0.32
252 0.27
253 0.26
254 0.24
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.17
262 0.17
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.17
267 0.17
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.16
279 0.18
280 0.23
281 0.28
282 0.37
283 0.47
284 0.55
285 0.61
286 0.61
287 0.68
288 0.72
289 0.73
290 0.73
291 0.69
292 0.64
293 0.58
294 0.59
295 0.53
296 0.46
297 0.47
298 0.45
299 0.42
300 0.44
301 0.43
302 0.48
303 0.45
304 0.43
305 0.35
306 0.28
307 0.27
308 0.22
309 0.29
310 0.25
311 0.27
312 0.28
313 0.3
314 0.31
315 0.3
316 0.33
317 0.29
318 0.33
319 0.35
320 0.41
321 0.46
322 0.49
323 0.48
324 0.53
325 0.54
326 0.52
327 0.53
328 0.5
329 0.46
330 0.46
331 0.45
332 0.37
333 0.36
334 0.34
335 0.33
336 0.3
337 0.29
338 0.24
339 0.25
340 0.25
341 0.21
342 0.21
343 0.21
344 0.18
345 0.18
346 0.24
347 0.3
348 0.33
349 0.4
350 0.4
351 0.44
352 0.5
353 0.56
354 0.54
355 0.54
356 0.55
357 0.5
358 0.45
359 0.4
360 0.39
361 0.31
362 0.3
363 0.26
364 0.24
365 0.21
366 0.23
367 0.24
368 0.28
369 0.36
370 0.41
371 0.47
372 0.49
373 0.56
374 0.63
375 0.63
376 0.62
377 0.59
378 0.55
379 0.52
380 0.48
381 0.43
382 0.36
383 0.33
384 0.26
385 0.22
386 0.17
387 0.12
388 0.11
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.09
393 0.08
394 0.13
395 0.14
396 0.14
397 0.16
398 0.15
399 0.16
400 0.15
401 0.16
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.11
406 0.12
407 0.13
408 0.13
409 0.16
410 0.14
411 0.14
412 0.16
413 0.22
414 0.25
415 0.28
416 0.29
417 0.26
418 0.28
419 0.3
420 0.33
421 0.34
422 0.36
423 0.34
424 0.38
425 0.39
426 0.38
427 0.37
428 0.36
429 0.3
430 0.26
431 0.26
432 0.22
433 0.22
434 0.21
435 0.2
436 0.15
437 0.14
438 0.13
439 0.1
440 0.09
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.11
485 0.13
486 0.2
487 0.21
488 0.25
489 0.27
490 0.29
491 0.3
492 0.28
493 0.27
494 0.21
495 0.25
496 0.22
497 0.19
498 0.19
499 0.18
500 0.19
501 0.21
502 0.23
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.16
507 0.2
508 0.21
509 0.22
510 0.28
511 0.39
512 0.44
513 0.53
514 0.54
515 0.53
516 0.54
517 0.5
518 0.43
519 0.33
520 0.28
521 0.18
522 0.17
523 0.14
524 0.1
525 0.09
526 0.08
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.13
531 0.16
532 0.19
533 0.23
534 0.27
535 0.26
536 0.27
537 0.27
538 0.26
539 0.24
540 0.21
541 0.19
542 0.14
543 0.11
544 0.12
545 0.13
546 0.18
547 0.19
548 0.19
549 0.2
550 0.23
551 0.27
552 0.27
553 0.29
554 0.29
555 0.32
556 0.35
557 0.36
558 0.34
559 0.33
560 0.37
561 0.35
562 0.3
563 0.27
564 0.25
565 0.25
566 0.24
567 0.22
568 0.15
569 0.14
570 0.12
571 0.1
572 0.09
573 0.06
574 0.05
575 0.04
576 0.04
577 0.08
578 0.09
579 0.09
580 0.1
581 0.17
582 0.25
583 0.32
584 0.4
585 0.43
586 0.51
587 0.54
588 0.6
589 0.57
590 0.55
591 0.51
592 0.45
593 0.39
594 0.32
595 0.28
596 0.25
597 0.27
598 0.26
599 0.28
600 0.28
601 0.34
602 0.42
603 0.48
604 0.52
605 0.55
606 0.59
607 0.64
608 0.69
609 0.68
610 0.65
611 0.64
612 0.58
613 0.53
614 0.48
615 0.39
616 0.32
617 0.3
618 0.25
619 0.2
620 0.17
621 0.15
622 0.13
623 0.12
624 0.12
625 0.1
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.07
634 0.07
635 0.12
636 0.13
637 0.17
638 0.22
639 0.28
640 0.36
641 0.44
642 0.53
643 0.56
644 0.63
645 0.63
646 0.61
647 0.59
648 0.5
649 0.41
650 0.31
651 0.24
652 0.16
653 0.12
654 0.09
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.08
666 0.11
667 0.14
668 0.15
669 0.17
670 0.17
671 0.17
672 0.19
673 0.21
674 0.19
675 0.2
676 0.22
677 0.2
678 0.22
679 0.23
680 0.22
681 0.21
682 0.22
683 0.25
684 0.32
685 0.34
686 0.34
687 0.39
688 0.41
689 0.39
690 0.44
691 0.44
692 0.41
693 0.45
694 0.45
695 0.44
696 0.45
697 0.45
698 0.43
699 0.36
700 0.31
701 0.24
702 0.21
703 0.16
704 0.15
705 0.14
706 0.1
707 0.11
708 0.13
709 0.13
710 0.13
711 0.12
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.1
716 0.08
717 0.07
718 0.06
719 0.07
720 0.08
721 0.08
722 0.08
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.06
728 0.05
729 0.07
730 0.07
731 0.09
732 0.09
733 0.1
734 0.1
735 0.1
736 0.1
737 0.09
738 0.12
739 0.1
740 0.11
741 0.14
742 0.15
743 0.15
744 0.17
745 0.15
746 0.15
747 0.16
748 0.16
749 0.13
750 0.12
751 0.12
752 0.14
753 0.14
754 0.12
755 0.17
756 0.16
757 0.17
758 0.17
759 0.18
760 0.15
761 0.16
762 0.19
763 0.14
764 0.15
765 0.14
766 0.13
767 0.13
768 0.12
769 0.11
770 0.09
771 0.09
772 0.08
773 0.09
774 0.09
775 0.1
776 0.1
777 0.11
778 0.11
779 0.13
780 0.14
781 0.22
782 0.25
783 0.27
784 0.28
785 0.29
786 0.29
787 0.27
788 0.26
789 0.18
790 0.18
791 0.17
792 0.16
793 0.15
794 0.14
795 0.13
796 0.13
797 0.12
798 0.08
799 0.09
800 0.09
801 0.1
802 0.11
803 0.11
804 0.11
805 0.12
806 0.12
807 0.14
808 0.14
809 0.16
810 0.17
811 0.17
812 0.18
813 0.18
814 0.18
815 0.16
816 0.16
817 0.14
818 0.11
819 0.1
820 0.09
821 0.09
822 0.09
823 0.09
824 0.07
825 0.06
826 0.06
827 0.06
828 0.06
829 0.06
830 0.05
831 0.05
832 0.04
833 0.04
834 0.05
835 0.05
836 0.05
837 0.05
838 0.07
839 0.08
840 0.08
841 0.08
842 0.08
843 0.09
844 0.1
845 0.13
846 0.14
847 0.14
848 0.14
849 0.15
850 0.16
851 0.19
852 0.2
853 0.17
854 0.19
855 0.2
856 0.21
857 0.22
858 0.24
859 0.22
860 0.24
861 0.26
862 0.24
863 0.26
864 0.28
865 0.31
866 0.3
867 0.28
868 0.31
869 0.28
870 0.27
871 0.25
872 0.25
873 0.2
874 0.22
875 0.23
876 0.17
877 0.19
878 0.19
879 0.21
880 0.2
881 0.18
882 0.14
883 0.15
884 0.15
885 0.13
886 0.14
887 0.1
888 0.11
889 0.12
890 0.13
891 0.13
892 0.11
893 0.1
894 0.09
895 0.09
896 0.09
897 0.09
898 0.09
899 0.14
900 0.16
901 0.16
902 0.16
903 0.16
904 0.15
905 0.17
906 0.15
907 0.1
908 0.08
909 0.08
910 0.09
911 0.09
912 0.09
913 0.07
914 0.09
915 0.08
916 0.09
917 0.1
918 0.1
919 0.1
920 0.09
921 0.1
922 0.09
923 0.1
924 0.1
925 0.11
926 0.11
927 0.12
928 0.12
929 0.11
930 0.1
931 0.1
932 0.13
933 0.11
934 0.11
935 0.11
936 0.12
937 0.12
938 0.14
939 0.15
940 0.11
941 0.11
942 0.12
943 0.12
944 0.13
945 0.16
946 0.16
947 0.16
948 0.17
949 0.18
950 0.16
951 0.16
952 0.15
953 0.14
954 0.14
955 0.12
956 0.11
957 0.12
958 0.13
959 0.13
960 0.12
961 0.1
962 0.1
963 0.12
964 0.13
965 0.12
966 0.13
967 0.13
968 0.13
969 0.12
970 0.1
971 0.11
972 0.12
973 0.16
974 0.15
975 0.15
976 0.14
977 0.16
978 0.16
979 0.14
980 0.16
981 0.16
982 0.18
983 0.21
984 0.25
985 0.25
986 0.24
987 0.24
988 0.22
989 0.18
990 0.15
991 0.13
992 0.11
993 0.15
994 0.17
995 0.17
996 0.19
997 0.19
998 0.19
999 0.21
1000 0.23
1001 0.21
1002 0.19
1003 0.18
1004 0.2
1005 0.24
1006 0.24
1007 0.21
1008 0.18
1009 0.15
1010 0.15
1011 0.15
1012 0.14
1013 0.11
1014 0.15
1015 0.2
1016 0.25
1017 0.25
1018 0.26
1019 0.3
1020 0.35
1021 0.42
1022 0.43
1023 0.45
1024 0.47
1025 0.49
1026 0.53
1027 0.55
1028 0.5
1029 0.5
1030 0.48
1031 0.43
1032 0.37
1033 0.36
1034 0.31
1035 0.26
1036 0.22
1037 0.14
1038 0.1
1039 0.09
1040 0.08
1041 0.07
1042 0.06
1043 0.06
1044 0.06
1045 0.06
1046 0.06
1047 0.07
1048 0.07
1049 0.07
1050 0.06
1051 0.06
1052 0.06
1053 0.07
1054 0.06
1055 0.05
1056 0.05
1057 0.07
1058 0.09
1059 0.12
1060 0.13
1061 0.17
1062 0.23
1063 0.25
1064 0.29
1065 0.34
1066 0.41
1067 0.47
1068 0.55
1069 0.62
1070 0.66
1071 0.74
1072 0.73
1073 0.69
1074 0.62
1075 0.61
1076 0.62
1077 0.6
1078 0.59
1079 0.58
1080 0.54
1081 0.52
1082 0.53
1083 0.48
1084 0.41
1085 0.41
1086 0.33
1087 0.3
1088 0.34
1089 0.36
1090 0.35
1091 0.37
1092 0.33
1093 0.27
1094 0.31
1095 0.28
1096 0.26
1097 0.26
1098 0.26
1099 0.21
1100 0.2
1101 0.18
1102 0.13
1103 0.19
1104 0.19
1105 0.19
1106 0.19
1107 0.2
1108 0.2
1109 0.23
1110 0.23
1111 0.2
1112 0.23
1113 0.23
1114 0.29
1115 0.29
1116 0.32
1117 0.29
1118 0.31
1119 0.27
1120 0.25
1121 0.24
1122 0.19
1123 0.19
1124 0.19
1125 0.2
1126 0.18
1127 0.18
1128 0.15
1129 0.17
1130 0.16
1131 0.18
1132 0.22
1133 0.24
1134 0.26
1135 0.27
1136 0.33
1137 0.33
1138 0.33
1139 0.32
1140 0.29
1141 0.28
1142 0.26
1143 0.24
1144 0.18
1145 0.17
1146 0.16
1147 0.15
1148 0.15
1149 0.14
1150 0.16
1151 0.16
1152 0.16
1153 0.16
1154 0.16
1155 0.16
1156 0.14
1157 0.13
1158 0.11
1159 0.12
1160 0.11
1161 0.1
1162 0.1
1163 0.09
1164 0.08
1165 0.1
1166 0.12
1167 0.13
1168 0.16
1169 0.16
1170 0.17
1171 0.17
1172 0.17
1173 0.16
1174 0.17
1175 0.19
1176 0.17
1177 0.18
1178 0.18
1179 0.22
1180 0.22
1181 0.21
1182 0.18
1183 0.16
1184 0.14
1185 0.13
1186 0.13
1187 0.09
1188 0.08
1189 0.08
1190 0.06
1191 0.06
1192 0.07
1193 0.06
1194 0.06
1195 0.1
1196 0.12
1197 0.13
1198 0.14
1199 0.17
1200 0.2
1201 0.24
1202 0.29
1203 0.29
1204 0.3
1205 0.34
1206 0.34
1207 0.31
1208 0.27
1209 0.23
1210 0.2
1211 0.17
1212 0.16
1213 0.11
1214 0.12
1215 0.13
1216 0.12
1217 0.12
1218 0.11
1219 0.09
1220 0.09
1221 0.11
1222 0.14
1223 0.15
1224 0.16
1225 0.17
1226 0.17
1227 0.18
1228 0.22
1229 0.25
1230 0.25
1231 0.28
1232 0.3
1233 0.32
1234 0.35
1235 0.36
1236 0.38
1237 0.37
1238 0.39
1239 0.36
1240 0.34
1241 0.37
1242 0.38
1243 0.44
1244 0.45
1245 0.46
1246 0.47
1247 0.51
1248 0.55
1249 0.53
1250 0.5
1251 0.46
1252 0.48
1253 0.45
1254 0.45
1255 0.43
1256 0.41
1257 0.4
1258 0.45
1259 0.43
1260 0.36
1261 0.34
1262 0.31
1263 0.3
1264 0.29
1265 0.31
1266 0.31
1267 0.32
1268 0.34
1269 0.34
1270 0.33
1271 0.31
1272 0.3
1273 0.29
1274 0.26
1275 0.23
1276 0.2
1277 0.2
1278 0.15
1279 0.15
1280 0.14
1281 0.11
1282 0.07