Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553IBD8

Protein Details
Accession A0A553IBD8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-49LEEYKHSQKRRQRERFAQAHGRRBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010304  SMN_Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
CDD cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MATGEQGLTHNEIWDDSALIDSWDQALEEYKHSQKRRQRERFAQAHGRRVRIDLMSPEFSDEDHSIFRGQITNKTITQSRTSDAKQNLLEIDESSDRGRLETTSEMKKENLNIRQETGNVATQHSQPRASGPPPAPAGLLGTIRDEGLKRLLMSWYYAGYYTGYYEGQRDSPHNQGPSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.09
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.06
13 0.11
14 0.11
15 0.14
16 0.19
17 0.26
18 0.34
19 0.38
20 0.46
21 0.49
22 0.59
23 0.67
24 0.73
25 0.76
26 0.79
27 0.85
28 0.84
29 0.85
30 0.85
31 0.78
32 0.78
33 0.72
34 0.65
35 0.55
36 0.49
37 0.44
38 0.34
39 0.31
40 0.26
41 0.27
42 0.26
43 0.25
44 0.25
45 0.22
46 0.2
47 0.21
48 0.17
49 0.13
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.16
58 0.2
59 0.22
60 0.22
61 0.24
62 0.26
63 0.24
64 0.27
65 0.24
66 0.22
67 0.24
68 0.24
69 0.29
70 0.28
71 0.3
72 0.26
73 0.26
74 0.24
75 0.2
76 0.19
77 0.12
78 0.13
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.07
87 0.09
88 0.12
89 0.16
90 0.2
91 0.21
92 0.22
93 0.23
94 0.24
95 0.27
96 0.3
97 0.32
98 0.33
99 0.34
100 0.34
101 0.35
102 0.33
103 0.31
104 0.25
105 0.24
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.21
110 0.26
111 0.25
112 0.24
113 0.19
114 0.23
115 0.26
116 0.25
117 0.29
118 0.25
119 0.29
120 0.3
121 0.3
122 0.27
123 0.22
124 0.23
125 0.17
126 0.17
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.13
135 0.15
136 0.13
137 0.15
138 0.17
139 0.16
140 0.18
141 0.18
142 0.16
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.15
154 0.17
155 0.19
156 0.22
157 0.25
158 0.32
159 0.38