FuNGI

A0A553HNF1

Protein Details

Accession

A0A553HNF1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
584-605	ISISTQRKRNGQPKRPRHSVTS	Hydrophilic
778-802	RGEKEVDKLLRKPRKKRVSAGSDSS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
529-543	NGEAKGGAARTSRRK
785-794	KLLRKPRKKR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000305 GIY-YIG_endonuc IPR035901 GIY-YIG_endonuc_sf IPR000690 Matrin/U1-C_Znf_C2H2 IPR003604 Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2 IPR031774 SF3A3_dom IPR024598 SF3a60/Prp9_C IPR021966 SF3a60_bindingd IPR027520 Slx1 IPR036236 Znf_C2H2_sf IPR013087 Znf_C2H2_type IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF01541 GIY-YIG PF16837 SF3A3 PF12108 SF3a60_bindingd PF11931 SF3a60_Prp9_C PF12874 zf-met
PROSITE	View protein in PROSITE PS50164 GIY_YIG PS50171 ZF_MATRIN PS00028 ZINC_FINGER_C2H2_1
CDD	cd10455 GIY-YIG_SLX1

Amino Acid Sequences

MLLEEQRFLHEDLERLEQGIADRIGEEPKHIRDRLARDHQIAEFLDRISSQSAKLLEIYRDADGSRSREIQQIGTGDPMDEFYKQLADVKSFHARYPNEPVENLERAYRPKKGADEAAQPSIVDRMFTGEEAFGRFFDLHTCHERYLNLPNAKRLTYQQYLDLFDNFAPGAGGLKRSEKLTDQYFAYVGQLALDLEMFLRKTRPLENIDKVLAEFDKQFEEDWEKDKVPEWKNEDSHATSSTGKPKATGGIWCEACEKEFTNENVYKNHLNGKKHIRAESARQKGDQESGGATNGARKEGTSTTRLKERAIAEREYRIKRLASAMSTERSDTRVNVERKQGMTDKERQQEIDNIYSASASAMQQPEREEGDEGDDDDRIYNPLKLPLAWDGKPIPFWLYKLHGLGVEFACEVCGNFVYMGRRAFDKHFNEPRHIHGLKCLGITNTTLFRDIIRIDEALKLWDKIQKDKRKDKVEDGSVVQMEDAEGNVMPEKQQAAYCVGEARGTYLVQHASLYIGSTPNPPRRLKQHNGEAKGGAARTSRRKLRPWEMVALVSGFPGMVAALKFEWALNNPHVSLHIPTNSRISISTQRKRNGQPKRPRHSVTSIMSNVHLLLRVPSFARWPLKLHFFAPEVHRAWTKCCDIATEPLRRTIPVYTDFAPVAGEGSSSTEPSPPWGVHALPLDYAPMKNYVEKTQSLYSFEREGACVVCGEHLRHGEGLYATCSNTGCEGTGHVSCWSRHLLGCKAGEDIIPTAGRCPKCEGEVLWGDMMKEMSLRLRGEKEVDKLLRKPRKKRVSAGSDSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.26
3	0.25
4	0.22
5	0.21
6	0.24
7	0.21
8	0.15
9	0.15
10	0.15
11	0.2
12	0.19
13	0.23
14	0.23
15	0.3
16	0.38
17	0.39
18	0.42
19	0.46
20	0.54
21	0.6
22	0.65
23	0.64
24	0.59
25	0.63
26	0.59
27	0.56
28	0.48
29	0.41
30	0.32
31	0.26
32	0.23
33	0.19
34	0.19
35	0.18
36	0.18
37	0.15
38	0.18
39	0.19
40	0.19
41	0.22
42	0.24
43	0.22
44	0.25
45	0.27
46	0.23
47	0.23
48	0.22
49	0.23
50	0.24
51	0.26
52	0.27
53	0.28
54	0.29
55	0.33
56	0.35
57	0.33
58	0.32
59	0.31
60	0.27
61	0.26
62	0.25
63	0.19
64	0.18
65	0.18
66	0.15
67	0.13
68	0.13
69	0.11
70	0.12
71	0.12
72	0.18
73	0.18
74	0.19
75	0.21
76	0.25
77	0.34
78	0.34
79	0.35
80	0.38
81	0.38
82	0.4
83	0.48
84	0.51
85	0.44
86	0.43
87	0.46
88	0.44
89	0.44
90	0.4
91	0.35
92	0.3
93	0.34
94	0.39
95	0.4
96	0.38
97	0.4
98	0.44
99	0.45
100	0.5
101	0.49
102	0.53
103	0.51
104	0.51
105	0.46
106	0.41
107	0.36
108	0.31
109	0.25
110	0.16
111	0.12
112	0.12
113	0.13
114	0.13
115	0.14
116	0.12
117	0.13
118	0.15
119	0.15
120	0.11
121	0.13
122	0.13
123	0.12
124	0.15
125	0.16
126	0.18
127	0.24
128	0.27
129	0.26
130	0.28
131	0.29
132	0.28
133	0.34
134	0.39
135	0.4
136	0.4
137	0.46
138	0.47
139	0.47
140	0.47
141	0.43
142	0.42
143	0.39
144	0.38
145	0.38
146	0.38
147	0.4
148	0.39
149	0.35
150	0.28
151	0.23
152	0.22
153	0.15
154	0.12
155	0.09
156	0.07
157	0.09
158	0.08
159	0.1
160	0.11
161	0.14
162	0.16
163	0.17
164	0.19
165	0.2
166	0.24
167	0.26
168	0.28
169	0.26
170	0.26
171	0.25
172	0.23
173	0.21
174	0.17
175	0.12
176	0.09
177	0.08
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.05
182	0.04
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.1
188	0.13
189	0.16
190	0.22
191	0.27
192	0.35
193	0.39
194	0.42
195	0.41
196	0.39
197	0.36
198	0.32
199	0.25
200	0.19
201	0.14
202	0.11
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.13
207	0.18
208	0.18
209	0.2
210	0.23
211	0.22
212	0.22
213	0.26
214	0.32
215	0.31
216	0.37
217	0.4
218	0.44
219	0.44
220	0.47
221	0.47
222	0.41
223	0.39
224	0.33
225	0.3
226	0.24
227	0.26
228	0.32
229	0.3
230	0.27
231	0.26
232	0.25
233	0.26
234	0.26
235	0.26
236	0.21
237	0.25
238	0.25
239	0.25
240	0.27
241	0.23
242	0.22
243	0.2
244	0.18
245	0.14
246	0.19
247	0.19
248	0.24
249	0.28
250	0.29
251	0.29
252	0.32
253	0.31
254	0.27
255	0.34
256	0.32
257	0.31
258	0.37
259	0.45
260	0.49
261	0.51
262	0.52
263	0.49
264	0.48
265	0.55
266	0.58
267	0.57
268	0.51
269	0.47
270	0.47
271	0.43
272	0.42
273	0.33
274	0.23
275	0.16
276	0.15
277	0.15
278	0.13
279	0.11
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.1
284	0.09
285	0.12
286	0.15
287	0.18
288	0.2
289	0.23
290	0.25
291	0.31
292	0.32
293	0.29
294	0.32
295	0.32
296	0.36
297	0.37
298	0.38
299	0.34
300	0.4
301	0.47
302	0.44
303	0.42
304	0.36
305	0.32
306	0.29
307	0.31
308	0.26
309	0.2
310	0.21
311	0.22
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.18
316	0.19
317	0.18
318	0.15
319	0.18
320	0.24
321	0.27
322	0.3
323	0.35
324	0.36
325	0.35
326	0.39
327	0.37
328	0.33
329	0.35
330	0.39
331	0.42
332	0.43
333	0.43
334	0.41
335	0.39
336	0.4
337	0.38
338	0.32
339	0.24
340	0.19
341	0.18
342	0.17
343	0.15
344	0.1
345	0.08
346	0.05
347	0.08
348	0.1
349	0.1
350	0.12
351	0.13
352	0.15
353	0.14
354	0.15
355	0.12
356	0.11
357	0.13
358	0.12
359	0.11
360	0.1
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.08
369	0.1
370	0.11
371	0.1
372	0.12
373	0.16
374	0.2
375	0.19
376	0.21
377	0.2
378	0.2
379	0.2
380	0.19
381	0.16
382	0.12
383	0.13
384	0.13
385	0.15
386	0.16
387	0.16
388	0.16
389	0.15
390	0.14
391	0.16
392	0.13
393	0.11
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.06
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.06
404	0.07
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.12
409	0.13
410	0.16
411	0.23
412	0.25
413	0.32
414	0.4
415	0.41
416	0.46
417	0.45
418	0.46
419	0.47
420	0.43
421	0.34
422	0.3
423	0.32
424	0.28
425	0.27
426	0.24
427	0.15
428	0.16
429	0.16
430	0.14
431	0.13
432	0.12
433	0.12
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.11
438	0.11
439	0.1
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.11
448	0.15
449	0.15
450	0.23
451	0.32
452	0.4
453	0.48
454	0.58
455	0.65
456	0.71
457	0.74
458	0.72
459	0.71
460	0.66
461	0.6
462	0.52
463	0.46
464	0.36
465	0.32
466	0.24
467	0.16
468	0.12
469	0.08
470	0.06
471	0.04
472	0.03
473	0.04
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.06
478	0.07
479	0.07
480	0.08
481	0.09
482	0.12
483	0.12
484	0.12
485	0.12
486	0.12
487	0.12
488	0.11
489	0.11
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.1
495	0.09
496	0.09
497	0.08
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.12
505	0.19
506	0.25
507	0.31
508	0.33
509	0.36
510	0.44
511	0.52
512	0.55
513	0.58
514	0.61
515	0.63
516	0.66
517	0.64
518	0.56
519	0.48
520	0.42
521	0.33
522	0.25
523	0.19
524	0.2
525	0.25
526	0.33
527	0.4
528	0.43
529	0.5
530	0.57
531	0.64
532	0.68
533	0.65
534	0.63
535	0.56
536	0.51
537	0.45
538	0.37
539	0.28
540	0.18
541	0.14
542	0.07
543	0.05
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.08
554	0.08
555	0.13
556	0.14
557	0.15
558	0.15
559	0.15
560	0.16
561	0.17
562	0.17
563	0.17
564	0.2
565	0.2
566	0.21
567	0.24
568	0.23
569	0.22
570	0.21
571	0.22
572	0.28
573	0.36
574	0.43
575	0.47
576	0.52
577	0.59
578	0.67
579	0.72
580	0.73
581	0.73
582	0.76
583	0.79
584	0.84
585	0.85
586	0.8
587	0.77
588	0.73
589	0.71
590	0.64
591	0.61
592	0.54
593	0.46
594	0.43
595	0.37
596	0.31
597	0.23
598	0.19
599	0.1
600	0.11
601	0.1
602	0.11
603	0.11
604	0.12
605	0.14
606	0.2
607	0.23
608	0.23
609	0.26
610	0.3
611	0.36
612	0.37
613	0.35
614	0.33
615	0.3
616	0.33
617	0.33
618	0.36
619	0.31
620	0.32
621	0.35
622	0.31
623	0.34
624	0.36
625	0.35
626	0.29
627	0.28
628	0.29
629	0.27
630	0.36
631	0.39
632	0.41
633	0.39
634	0.43
635	0.43
636	0.4
637	0.39
638	0.33
639	0.31
640	0.27
641	0.3
642	0.26
643	0.28
644	0.27
645	0.25
646	0.22
647	0.17
648	0.14
649	0.1
650	0.08
651	0.05
652	0.09
653	0.1
654	0.11
655	0.11
656	0.12
657	0.12
658	0.16
659	0.19
660	0.15
661	0.17
662	0.19
663	0.19
664	0.21
665	0.25
666	0.22
667	0.19
668	0.2
669	0.19
670	0.18
671	0.18
672	0.15
673	0.15
674	0.16
675	0.19
676	0.22
677	0.26
678	0.29
679	0.3
680	0.34
681	0.36
682	0.37
683	0.38
684	0.38
685	0.35
686	0.33
687	0.33
688	0.29
689	0.24
690	0.23
691	0.19
692	0.17
693	0.14
694	0.12
695	0.14
696	0.15
697	0.16
698	0.2
699	0.2
700	0.22
701	0.22
702	0.22
703	0.22
704	0.2
705	0.2
706	0.18
707	0.17
708	0.16
709	0.17
710	0.17
711	0.14
712	0.15
713	0.14
714	0.12
715	0.11
716	0.13
717	0.15
718	0.16
719	0.17
720	0.19
721	0.22
722	0.21
723	0.24
724	0.26
725	0.25
726	0.26
727	0.31
728	0.32
729	0.35
730	0.38
731	0.36
732	0.33
733	0.32
734	0.3
735	0.26
736	0.22
737	0.19
738	0.17
739	0.17
740	0.19
741	0.26
742	0.27
743	0.27
744	0.32
745	0.32
746	0.33
747	0.37
748	0.34
749	0.35
750	0.38
751	0.39
752	0.34
753	0.31
754	0.29
755	0.27
756	0.26
757	0.18
758	0.13
759	0.12
760	0.14
761	0.18
762	0.2
763	0.23
764	0.27
765	0.29
766	0.35
767	0.39
768	0.4
769	0.44
770	0.49
771	0.5
772	0.54
773	0.62
774	0.67
775	0.71
776	0.77
777	0.78
778	0.83
779	0.85
780	0.88
781	0.88
782	0.87

A0A553HNF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer