Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553I8P9

Protein Details
Accession A0A553I8P9    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-73ASKAINGKAKDLKKKKKVESESEEESHydrophilic
107-129DEEDNKKKKADPKKAKATTNGKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-64SKATDSPKAKSKQLAKNVASKAINGKAKDLKKKKK
112-131KKKKADPKKAKATTNGKAKK
195-203KPEAPKKRK
415-476RPPREGGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGRGGGRGGGGGFGGRGGGRGGGRGGFGGRGGKSFEGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKTKQANGKASKAAKAADPLTVVKKAGVSKATDSPKAKSKQLAKNVASKAINGKAKDLKKKKKVESESEEESSDDSESEEESDSGDSDESEDASDAGSDSDSSDSDEEDNKKKKADPKKAKATTNGKAKKEAESESEESDSSDSEEEEADTKKGGAKVVKADSSEEGSSDSESEEDSDDSDDSEDDSEEAEEKKPEAPKKRKAEEEVSTPFKKTKTEETSEDQYTTLFAGNLGWGVTDDILYDTFKEFEGLSGARVVTDKAMQRSRGFGYVDFESHEAAKAAFEKMQGFELEGRALNLDPSKPRPAGEETPNARANDRAKQFGDSVSPESDTLFVGNLPFEVDEDAVGAFFGDTAEVKSIRLPKDPDSGNPKGFGYVTFNSIEDARSVFNSKNGAYIGEGRGARAVRLDFAGQRPPREGGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGRGGGRGGGGGFGGRGGGRGGGRGGFGGRGGKSFEGKKTTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.45
4 0.39
5 0.33
6 0.32
7 0.3
8 0.32
9 0.32
10 0.29
11 0.24
12 0.27
13 0.27
14 0.29
15 0.3
16 0.28
17 0.3
18 0.39
19 0.43
20 0.47
21 0.47
22 0.47
23 0.53
24 0.54
25 0.55
26 0.55
27 0.59
28 0.61
29 0.68
30 0.74
31 0.68
32 0.72
33 0.71
34 0.7
35 0.6
36 0.53
37 0.49
38 0.47
39 0.48
40 0.4
41 0.43
42 0.44
43 0.51
44 0.6
45 0.65
46 0.67
47 0.72
48 0.82
49 0.85
50 0.87
51 0.88
52 0.87
53 0.85
54 0.82
55 0.78
56 0.7
57 0.62
58 0.51
59 0.42
60 0.33
61 0.24
62 0.17
63 0.1
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.16
95 0.19
96 0.27
97 0.33
98 0.33
99 0.35
100 0.4
101 0.47
102 0.53
103 0.6
104 0.63
105 0.67
106 0.77
107 0.82
108 0.82
109 0.83
110 0.81
111 0.77
112 0.77
113 0.75
114 0.66
115 0.66
116 0.62
117 0.59
118 0.54
119 0.48
120 0.42
121 0.4
122 0.4
123 0.35
124 0.34
125 0.28
126 0.24
127 0.22
128 0.18
129 0.12
130 0.1
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.12
141 0.13
142 0.16
143 0.16
144 0.18
145 0.24
146 0.27
147 0.29
148 0.27
149 0.27
150 0.25
151 0.26
152 0.23
153 0.17
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.13
182 0.18
183 0.24
184 0.34
185 0.42
186 0.51
187 0.6
188 0.65
189 0.67
190 0.67
191 0.68
192 0.61
193 0.6
194 0.56
195 0.53
196 0.47
197 0.42
198 0.39
199 0.33
200 0.31
201 0.26
202 0.3
203 0.31
204 0.34
205 0.38
206 0.41
207 0.45
208 0.44
209 0.42
210 0.32
211 0.25
212 0.21
213 0.17
214 0.12
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.09
247 0.11
248 0.15
249 0.19
250 0.21
251 0.21
252 0.24
253 0.25
254 0.25
255 0.23
256 0.19
257 0.19
258 0.18
259 0.18
260 0.16
261 0.15
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.16
289 0.21
290 0.21
291 0.21
292 0.23
293 0.28
294 0.32
295 0.35
296 0.4
297 0.39
298 0.44
299 0.48
300 0.45
301 0.39
302 0.37
303 0.35
304 0.34
305 0.33
306 0.32
307 0.29
308 0.31
309 0.31
310 0.28
311 0.28
312 0.23
313 0.23
314 0.19
315 0.19
316 0.17
317 0.16
318 0.15
319 0.12
320 0.1
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.05
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.12
347 0.18
348 0.2
349 0.26
350 0.28
351 0.3
352 0.38
353 0.39
354 0.42
355 0.44
356 0.47
357 0.44
358 0.42
359 0.39
360 0.32
361 0.31
362 0.26
363 0.24
364 0.19
365 0.2
366 0.2
367 0.19
368 0.19
369 0.19
370 0.18
371 0.12
372 0.12
373 0.1
374 0.11
375 0.14
376 0.14
377 0.16
378 0.19
379 0.18
380 0.2
381 0.19
382 0.18
383 0.18
384 0.22
385 0.2
386 0.23
387 0.23
388 0.2
389 0.24
390 0.23
391 0.21
392 0.2
393 0.19
394 0.15
395 0.17
396 0.19
397 0.19
398 0.22
399 0.31
400 0.31
401 0.33
402 0.34
403 0.34
404 0.34
405 0.32
406 0.3
407 0.23
408 0.28
409 0.26
410 0.22
411 0.22
412 0.2
413 0.18
414 0.18
415 0.15
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.11
425 0.1
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.11
452 0.12
453 0.16
454 0.15
455 0.17
456 0.19
457 0.21
458 0.26
459 0.31
460 0.36