FuNGI

A0A553HN87

Protein Details

Accession

A0A553HN87

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
122-145	AEFVRYHKLKHNRKKATINGEQNH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 14, nucl 12.5, cyto 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013197 RNA_pol_III_RPC82-rel_HTH IPR008806 RNA_pol_III_Rpc82_C IPR039748 RPC3 IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF08221 HTH_9 PF05645 RNA_pol_Rpc82

Amino Acid Sequences

MLVTKNAAELCTLLVNELYGQLPSRIVAALLARGRSQVRDLALYTSLNPKQVRHGLSLVIQHNLVFYQTDHETANTTYEANPRAAYHLVRVGKILDVINRKYGLMAKNIVNDLLMLGHVEIAEFVRYHKLKHNRKKATINGEQNHEYEHEHDLENGDTGDPFDDDSHYVNGNGTTHKTGEDTKPIQADEIFDTMAQLIAAGVVETVSTTMFQSPQDLKASVEQECMKEFPNGIRGAKVTAEFDTMVKSQIKAIGAERSTTKRKLQESALYEPSNIKRRKLANGAMSNGFAGDSGGSILRDEPNTVVRLNFDKCLVELRNQKLIEHAEDFVGETTAQVFAALLASLCRKVYRCQYDQHTIMTEEEEETYFTGVRVTTEEIFEHLCPGVDVSTGIGTASEDDIDIRFSEKIRKYPPQIKGSHLQGTLDEGDEIIGSDDEDYDHSGERPSGAHVNGHHHGSVTQNGVSYNGNHTREGQLSRTEQIRQMRQHLLILAEAKQQFVRHCGQNEWTVDFGPLVQQLRYVELDTMIEDSFGRQGLRLTRILREKGKLDDKTLPAMALMRKPDVHVKMAEMEMAGFLEVQEVPRDNNRAANRTMFFWFFDEARTLKRVLDNAYKSMVRCLERLEVERYKKKNVLSVTDRRDVQGKEEEMLRGDVYNEYLDFLDIEKRLLSQVSKLDDLVSIFQDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.11
4	0.12
5	0.11
6	0.09
7	0.1
8	0.11
9	0.11
10	0.11
11	0.12
12	0.1
13	0.1
14	0.11
15	0.11
16	0.16
17	0.19
18	0.2
19	0.19
20	0.23
21	0.24
22	0.24
23	0.26
24	0.24
25	0.23
26	0.25
27	0.26
28	0.26
29	0.27
30	0.25
31	0.25
32	0.29
33	0.29
34	0.32
35	0.32
36	0.3
37	0.37
38	0.43
39	0.45
40	0.41
41	0.41
42	0.37
43	0.39
44	0.46
45	0.39
46	0.33
47	0.3
48	0.25
49	0.24
50	0.21
51	0.18
52	0.11
53	0.09
54	0.12
55	0.13
56	0.15
57	0.15
58	0.15
59	0.17
60	0.17
61	0.19
62	0.15
63	0.15
64	0.16
65	0.2
66	0.22
67	0.21
68	0.22
69	0.2
70	0.23
71	0.25
72	0.23
73	0.21
74	0.27
75	0.28
76	0.27
77	0.27
78	0.25
79	0.23
80	0.24
81	0.23
82	0.21
83	0.26
84	0.27
85	0.31
86	0.31
87	0.3
88	0.29
89	0.33
90	0.29
91	0.28
92	0.3
93	0.29
94	0.32
95	0.33
96	0.31
97	0.26
98	0.22
99	0.18
100	0.13
101	0.1
102	0.06
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.05
108	0.05
109	0.07
110	0.06
111	0.08
112	0.16
113	0.17
114	0.2
115	0.29
116	0.39
117	0.49
118	0.6
119	0.7
120	0.71
121	0.79
122	0.86
123	0.85
124	0.84
125	0.83
126	0.82
127	0.76
128	0.72
129	0.66
130	0.57
131	0.5
132	0.42
133	0.33
134	0.25
135	0.23
136	0.19
137	0.17
138	0.17
139	0.17
140	0.16
141	0.15
142	0.13
143	0.1
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.11
153	0.12
154	0.12
155	0.12
156	0.12
157	0.13
158	0.13
159	0.14
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.15
164	0.16
165	0.19
166	0.21
167	0.28
168	0.28
169	0.29
170	0.31
171	0.3
172	0.3
173	0.26
174	0.24
175	0.18
176	0.17
177	0.14
178	0.11
179	0.12
180	0.1
181	0.1
182	0.07
183	0.05
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.02
190	0.02
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.04
196	0.05
197	0.06
198	0.07
199	0.11
200	0.13
201	0.16
202	0.18
203	0.18
204	0.19
205	0.22
206	0.25
207	0.21
208	0.23
209	0.22
210	0.2
211	0.21
212	0.21
213	0.18
214	0.17
215	0.17
216	0.15
217	0.19
218	0.21
219	0.2
220	0.2
221	0.19
222	0.19
223	0.19
224	0.19
225	0.14
226	0.12
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.13
231	0.12
232	0.14
233	0.13
234	0.13
235	0.12
236	0.15
237	0.15
238	0.14
239	0.15
240	0.18
241	0.18
242	0.19
243	0.21
244	0.24
245	0.28
246	0.3
247	0.33
248	0.34
249	0.36
250	0.39
251	0.41
252	0.43
253	0.43
254	0.45
255	0.46
256	0.4
257	0.38
258	0.37
259	0.38
260	0.39
261	0.36
262	0.31
263	0.32
264	0.35
265	0.41
266	0.44
267	0.45
268	0.45
269	0.47
270	0.49
271	0.44
272	0.4
273	0.34
274	0.27
275	0.21
276	0.12
277	0.07
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.06
286	0.07
287	0.07
288	0.08
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.14
295	0.15
296	0.15
297	0.14
298	0.13
299	0.12
300	0.17
301	0.17
302	0.19
303	0.25
304	0.28
305	0.34
306	0.34
307	0.34
308	0.32
309	0.32
310	0.28
311	0.23
312	0.2
313	0.13
314	0.13
315	0.13
316	0.1
317	0.09
318	0.06
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.1
336	0.19
337	0.25
338	0.28
339	0.33
340	0.39
341	0.44
342	0.44
343	0.42
344	0.35
345	0.29
346	0.27
347	0.22
348	0.16
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.11
367	0.1
368	0.1
369	0.08
370	0.07
371	0.06
372	0.07
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.03
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.16
394	0.18
395	0.24
396	0.29
397	0.36
398	0.42
399	0.5
400	0.58
401	0.58
402	0.58
403	0.56
404	0.56
405	0.55
406	0.53
407	0.44
408	0.36
409	0.27
410	0.28
411	0.24
412	0.18
413	0.13
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.05
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.1
434	0.12
435	0.12
436	0.14
437	0.15
438	0.22
439	0.23
440	0.24
441	0.21
442	0.18
443	0.19
444	0.18
445	0.19
446	0.15
447	0.14
448	0.13
449	0.13
450	0.14
451	0.14
452	0.14
453	0.17
454	0.22
455	0.23
456	0.23
457	0.24
458	0.26
459	0.29
460	0.3
461	0.26
462	0.24
463	0.25
464	0.27
465	0.28
466	0.27
467	0.29
468	0.33
469	0.38
470	0.37
471	0.41
472	0.43
473	0.41
474	0.4
475	0.37
476	0.31
477	0.25
478	0.23
479	0.19
480	0.2
481	0.19
482	0.18
483	0.18
484	0.19
485	0.18
486	0.21
487	0.25
488	0.24
489	0.27
490	0.29
491	0.31
492	0.35
493	0.36
494	0.34
495	0.29
496	0.25
497	0.22
498	0.2
499	0.16
500	0.12
501	0.13
502	0.12
503	0.11
504	0.13
505	0.13
506	0.16
507	0.17
508	0.16
509	0.13
510	0.12
511	0.13
512	0.11
513	0.12
514	0.09
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.11
523	0.16
524	0.2
525	0.24
526	0.25
527	0.3
528	0.37
529	0.43
530	0.45
531	0.45
532	0.44
533	0.48
534	0.55
535	0.51
536	0.48
537	0.5
538	0.47
539	0.47
540	0.45
541	0.36
542	0.28
543	0.29
544	0.28
545	0.24
546	0.24
547	0.22
548	0.22
549	0.25
550	0.32
551	0.31
552	0.31
553	0.28
554	0.28
555	0.28
556	0.28
557	0.27
558	0.19
559	0.15
560	0.12
561	0.11
562	0.09
563	0.05
564	0.05
565	0.06
566	0.06
567	0.07
568	0.09
569	0.1
570	0.12
571	0.17
572	0.21
573	0.2
574	0.28
575	0.32
576	0.35
577	0.36
578	0.41
579	0.38
580	0.37
581	0.4
582	0.34
583	0.3
584	0.27
585	0.27
586	0.2
587	0.21
588	0.21
589	0.19
590	0.21
591	0.22
592	0.21
593	0.21
594	0.25
595	0.26
596	0.29
597	0.38
598	0.38
599	0.39
600	0.43
601	0.43
602	0.39
603	0.42
604	0.41
605	0.34
606	0.31
607	0.32
608	0.34
609	0.36
610	0.4
611	0.42
612	0.44
613	0.51
614	0.59
615	0.59
616	0.6
617	0.61
618	0.6
619	0.59
620	0.56
621	0.56
622	0.56
623	0.63
624	0.62
625	0.64
626	0.62
627	0.57
628	0.58
629	0.49
630	0.45
631	0.44
632	0.38
633	0.34
634	0.36
635	0.36
636	0.31
637	0.32
638	0.27
639	0.19
640	0.18
641	0.17
642	0.15
643	0.15
644	0.13
645	0.13
646	0.13
647	0.12
648	0.12
649	0.12
650	0.16
651	0.14
652	0.15
653	0.14
654	0.15
655	0.16
656	0.19
657	0.19
658	0.19
659	0.25
660	0.29
661	0.3
662	0.29
663	0.29
664	0.27
665	0.28
666	0.25

A0A553HN87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer