FuNGI

A0A553HM87

Protein Details

Accession

A0A553HM87

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-64	TLDTMAKKDKKAQKTQKPAKLAKQQSE	Hydrophilic
262-285	MTSSNSKTDKKKPQAKKVKTEESS	Hydrophilic
456-484	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
462-475	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MSKSSKLSNTITSSGPPAWLFSNNSTSSAPTQLATTTTLDTMAKKDKKAQKTQKPAKLAKQQSEVAANPSTSSTSATQKPPAQLMDLVESFLSEQGFNDAHREFQKQRATKPWKGHSAGKAATKEHHSLVSVFQTWETFSSKDGTPNAIAQVTSVSSKSGQSSSSSSDGSSSDESSDDDDVAMADVPAAESSSSESSSSDSSSDSDSDSDSDSDSDSDNDDEKATTSKHPTSKTTSTTKSLKRKAESDTDSSSSDSDSDEEMTSSNSKTDKKKPQAKKVKTEESSESSSSESDSSSDDSSSDEEAKPKETKKIESDSDGSSESDSDSSSSSDSDSESEDEVETAAKVPLPDSDSDFSSESESEPDKKKLKIKTEGKIANGAASDSSATLEKASPEFAPLPPDPTTFKANNRGNGSNAKKTQNQPFSRISQHVVVDPRLSSNAYVSHGYGEQAHRDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHTSRSFKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.25
4	0.21
5	0.21
6	0.24
7	0.26
8	0.26
9	0.33
10	0.31
11	0.34
12	0.33
13	0.33
14	0.31
15	0.3
16	0.27
17	0.2
18	0.2
19	0.17
20	0.18
21	0.18
22	0.17
23	0.15
24	0.15
25	0.16
26	0.16
27	0.17
28	0.2
29	0.28
30	0.31
31	0.33
32	0.42
33	0.5
34	0.59
35	0.69
36	0.75
37	0.75
38	0.82
39	0.9
40	0.89
41	0.89
42	0.87
43	0.86
44	0.86
45	0.83
46	0.8
47	0.76
48	0.7
49	0.63
50	0.61
51	0.52
52	0.46
53	0.39
54	0.31
55	0.25
56	0.23
57	0.21
58	0.16
59	0.18
60	0.16
61	0.2
62	0.26
63	0.29
64	0.35
65	0.38
66	0.41
67	0.41
68	0.4
69	0.36
70	0.33
71	0.31
72	0.29
73	0.25
74	0.22
75	0.18
76	0.17
77	0.15
78	0.14
79	0.12
80	0.07
81	0.07
82	0.09
83	0.1
84	0.11
85	0.14
86	0.13
87	0.16
88	0.19
89	0.25
90	0.24
91	0.32
92	0.42
93	0.42
94	0.47
95	0.54
96	0.61
97	0.62
98	0.69
99	0.69
100	0.69
101	0.69
102	0.71
103	0.66
104	0.65
105	0.62
106	0.59
107	0.53
108	0.46
109	0.45
110	0.43
111	0.4
112	0.33
113	0.3
114	0.25
115	0.22
116	0.23
117	0.23
118	0.2
119	0.18
120	0.17
121	0.16
122	0.15
123	0.16
124	0.16
125	0.13
126	0.12
127	0.15
128	0.15
129	0.19
130	0.2
131	0.21
132	0.19
133	0.2
134	0.21
135	0.18
136	0.17
137	0.13
138	0.13
139	0.11
140	0.1
141	0.09
142	0.08
143	0.09
144	0.1
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.13
149	0.15
150	0.18
151	0.19
152	0.18
153	0.16
154	0.16
155	0.16
156	0.17
157	0.16
158	0.13
159	0.11
160	0.11
161	0.11
162	0.12
163	0.12
164	0.09
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.04
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.03
175	0.04
176	0.03
177	0.03
178	0.05
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.1
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.12
213	0.15
214	0.2
215	0.25
216	0.27
217	0.3
218	0.35
219	0.38
220	0.41
221	0.42
222	0.4
223	0.41
224	0.46
225	0.51
226	0.53
227	0.57
228	0.58
229	0.54
230	0.54
231	0.53
232	0.54
233	0.5
234	0.44
235	0.4
236	0.36
237	0.34
238	0.31
239	0.27
240	0.19
241	0.15
242	0.11
243	0.08
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.09
251	0.08
252	0.09
253	0.11
254	0.15
255	0.21
256	0.3
257	0.39
258	0.48
259	0.59
260	0.66
261	0.75
262	0.82
263	0.84
264	0.85
265	0.83
266	0.83
267	0.75
268	0.71
269	0.64
270	0.57
271	0.53
272	0.43
273	0.35
274	0.26
275	0.23
276	0.2
277	0.15
278	0.11
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.1
287	0.11
288	0.12
289	0.11
290	0.13
291	0.14
292	0.18
293	0.21
294	0.22
295	0.28
296	0.29
297	0.33
298	0.36
299	0.41
300	0.4
301	0.4
302	0.41
303	0.35
304	0.33
305	0.3
306	0.24
307	0.18
308	0.16
309	0.12
310	0.1
311	0.09
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.09
336	0.11
337	0.12
338	0.15
339	0.16
340	0.16
341	0.19
342	0.2
343	0.18
344	0.18
345	0.17
346	0.13
347	0.15
348	0.16
349	0.19
350	0.23
351	0.29
352	0.32
353	0.36
354	0.43
355	0.48
356	0.54
357	0.6
358	0.64
359	0.65
360	0.71
361	0.71
362	0.66
363	0.64
364	0.55
365	0.46
366	0.38
367	0.3
368	0.2
369	0.15
370	0.13
371	0.08
372	0.09
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.12
380	0.11
381	0.14
382	0.16
383	0.16
384	0.21
385	0.19
386	0.23
387	0.23
388	0.25
389	0.25
390	0.26
391	0.32
392	0.29
393	0.35
394	0.41
395	0.45
396	0.5
397	0.54
398	0.53
399	0.5
400	0.56
401	0.57
402	0.56
403	0.56
404	0.55
405	0.55
406	0.6
407	0.66
408	0.67
409	0.65
410	0.62
411	0.62
412	0.62
413	0.61
414	0.57
415	0.51
416	0.45
417	0.42
418	0.41
419	0.4
420	0.36
421	0.32
422	0.29
423	0.28
424	0.24
425	0.24
426	0.19
427	0.17
428	0.18
429	0.19
430	0.2
431	0.18
432	0.19
433	0.19
434	0.19
435	0.21
436	0.21
437	0.22
438	0.22
439	0.22
440	0.19
441	0.19
442	0.2
443	0.21
444	0.26
445	0.24
446	0.25
447	0.3
448	0.33
449	0.4
450	0.43
451	0.48
452	0.51
453	0.61
454	0.69
455	0.75
456	0.82
457	0.84
458	0.9
459	0.91
460	0.9
461	0.9
462	0.89
463	0.89
464	0.89
465	0.86
466	0.76
467	0.68
468	0.66
469	0.57
470	0.53
471	0.45
472	0.39
473	0.33

A0A553HM87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer