Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HVA4

Protein Details
Accession A0A553HVA4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-80RAMQAREREKEKLKRKKRQQRFKEYKYATPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-70AREREKEKLKRKKRQQR
Subcellular Location(s) mito 21, mito_nucl 13.333, cyto_mito 11.833, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MATTNQCIASMARLNLSSIIRPTAAAATIPRFLAPAASITQQRWKSAGTRAMQAREREKEKLKRKKRQQRFKEYKYATPSQDERFSLCDAMRYLRAAEVGRPPSQATYELALKIRTIKNGPVLRDRIRLPYPVKNDTRVAVICKEGSGAMHEARTSGAVAFGEESLFEMIRNNSNKLPFNRLICHVDSEPALKKAALGRILGPKGLMPSLKTNTITKSVVTMMHDMVGAENYREKIGAIRMPIGNIQFTPKQLSENIKTLVGSVQGNITVLEDRVKKDLIEVVLTSTNGPGFSLNGAFASTDEKITPAHLSTAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.27
4 0.24
5 0.21
6 0.22
7 0.2
8 0.19
9 0.2
10 0.17
11 0.16
12 0.15
13 0.16
14 0.17
15 0.19
16 0.19
17 0.17
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.15
25 0.17
26 0.19
27 0.28
28 0.29
29 0.3
30 0.29
31 0.29
32 0.29
33 0.35
34 0.4
35 0.34
36 0.4
37 0.43
38 0.49
39 0.52
40 0.54
41 0.54
42 0.54
43 0.56
44 0.55
45 0.6
46 0.63
47 0.68
48 0.74
49 0.77
50 0.8
51 0.87
52 0.91
53 0.93
54 0.94
55 0.94
56 0.95
57 0.95
58 0.92
59 0.92
60 0.85
61 0.81
62 0.78
63 0.73
64 0.64
65 0.59
66 0.55
67 0.49
68 0.5
69 0.43
70 0.37
71 0.34
72 0.32
73 0.28
74 0.23
75 0.21
76 0.17
77 0.19
78 0.18
79 0.16
80 0.16
81 0.14
82 0.17
83 0.14
84 0.16
85 0.21
86 0.23
87 0.24
88 0.24
89 0.24
90 0.22
91 0.23
92 0.21
93 0.16
94 0.15
95 0.16
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.21
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.21
105 0.29
106 0.32
107 0.35
108 0.35
109 0.39
110 0.39
111 0.41
112 0.41
113 0.38
114 0.36
115 0.39
116 0.36
117 0.37
118 0.4
119 0.43
120 0.44
121 0.41
122 0.4
123 0.35
124 0.35
125 0.28
126 0.25
127 0.19
128 0.18
129 0.15
130 0.13
131 0.13
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.21
162 0.26
163 0.27
164 0.33
165 0.31
166 0.33
167 0.33
168 0.35
169 0.35
170 0.31
171 0.32
172 0.25
173 0.23
174 0.2
175 0.21
176 0.19
177 0.17
178 0.17
179 0.13
180 0.14
181 0.16
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.18
186 0.24
187 0.25
188 0.24
189 0.21
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.15
194 0.1
195 0.16
196 0.18
197 0.21
198 0.22
199 0.23
200 0.24
201 0.28
202 0.27
203 0.21
204 0.21
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.15
224 0.17
225 0.16
226 0.2
227 0.2
228 0.21
229 0.24
230 0.22
231 0.19
232 0.17
233 0.2
234 0.17
235 0.18
236 0.22
237 0.2
238 0.22
239 0.25
240 0.32
241 0.32
242 0.35
243 0.36
244 0.32
245 0.31
246 0.3
247 0.27
248 0.22
249 0.18
250 0.13
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.09
257 0.09
258 0.14
259 0.16
260 0.17
261 0.2
262 0.21
263 0.2
264 0.21
265 0.25
266 0.21
267 0.22
268 0.2
269 0.2
270 0.22
271 0.22
272 0.21
273 0.17
274 0.16
275 0.13
276 0.13
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.15
293 0.17
294 0.14