Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HP18

Protein Details
Accession A0A553HP18    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-165LPHGEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTBasic
286-308DGTKTPKGKTTRKRKSTAGDVDDHydrophilic
313-341AAKNATPASPDRKRKRQSKIPDIEEPKKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-156KKERKKRTHD
296-299TRKR
322-347PDRKRKRQSKIPDIEEPKKSARKKKN
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARAKKADGLKQPAPVAPAPAMVPMPTMQMQQPQHQQLQHQMAPQHQMPQAIAQQPPMQPMQGAIPPQQRTIGIDEFIRVRDSVHQRFNTITALMKSFGDDFVRQTNLLIGEPAPFDNGTGASMQSLVASLDIGGQLSDLLPHGEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTPYFLYMQTARPIIANDLGADAPKGAVQEEGQRRWASMSPQEKVAWNNAYQFNLRLYNARVHSYKAGNPDARNMSDGDALNYADANGIAQADVTTDEAMAPNDQDAIAEQLQMATPSIAQDDGTKTPKGKTTRKRKSTAGDVDDGDSSAAKNATPASPDRKRKRQSKIPDIEEPKKSARKKKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.43
3 0.37
4 0.29
5 0.26
6 0.21
7 0.2
8 0.19
9 0.15
10 0.15
11 0.12
12 0.15
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.24
17 0.27
18 0.32
19 0.4
20 0.43
21 0.47
22 0.47
23 0.48
24 0.49
25 0.54
26 0.5
27 0.46
28 0.43
29 0.41
30 0.44
31 0.43
32 0.4
33 0.34
34 0.33
35 0.29
36 0.31
37 0.33
38 0.31
39 0.31
40 0.27
41 0.3
42 0.29
43 0.32
44 0.28
45 0.23
46 0.19
47 0.19
48 0.2
49 0.18
50 0.19
51 0.22
52 0.28
53 0.3
54 0.31
55 0.31
56 0.28
57 0.27
58 0.3
59 0.26
60 0.2
61 0.19
62 0.2
63 0.2
64 0.2
65 0.19
66 0.14
67 0.12
68 0.2
69 0.28
70 0.33
71 0.4
72 0.4
73 0.41
74 0.42
75 0.42
76 0.35
77 0.28
78 0.24
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.16
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.15
95 0.14
96 0.13
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.07
131 0.09
132 0.13
133 0.21
134 0.32
135 0.41
136 0.47
137 0.54
138 0.62
139 0.69
140 0.77
141 0.81
142 0.8
143 0.82
144 0.87
145 0.9
146 0.84
147 0.75
148 0.65
149 0.6
150 0.53
151 0.47
152 0.38
153 0.29
154 0.28
155 0.29
156 0.28
157 0.22
158 0.21
159 0.18
160 0.16
161 0.14
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.13
180 0.18
181 0.2
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.24
186 0.25
187 0.2
188 0.23
189 0.27
190 0.25
191 0.28
192 0.29
193 0.29
194 0.28
195 0.3
196 0.24
197 0.2
198 0.24
199 0.23
200 0.24
201 0.23
202 0.22
203 0.2
204 0.2
205 0.2
206 0.17
207 0.17
208 0.22
209 0.23
210 0.26
211 0.24
212 0.24
213 0.28
214 0.28
215 0.29
216 0.29
217 0.33
218 0.34
219 0.34
220 0.38
221 0.37
222 0.35
223 0.33
224 0.28
225 0.23
226 0.23
227 0.23
228 0.18
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.13
273 0.17
274 0.21
275 0.22
276 0.23
277 0.26
278 0.33
279 0.4
280 0.46
281 0.52
282 0.6
283 0.69
284 0.77
285 0.8
286 0.81
287 0.8
288 0.81
289 0.8
290 0.74
291 0.68
292 0.6
293 0.55
294 0.48
295 0.4
296 0.29
297 0.19
298 0.14
299 0.12
300 0.11
301 0.08
302 0.09
303 0.12
304 0.13
305 0.16
306 0.21
307 0.28
308 0.38
309 0.49
310 0.58
311 0.66
312 0.75
313 0.81
314 0.87
315 0.88
316 0.89
317 0.89
318 0.9
319 0.86
320 0.87
321 0.87
322 0.85
323 0.8
324 0.74
325 0.72
326 0.7
327 0.72