Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553IFB7

Protein Details
Accession A0A553IFB7   
Localization Confidence Medium
Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
615-643EDVEKVQKQMPRKTKRRRRLEDDTFEEYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
625-633PRKTKRRRR
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_mito 7.833, cyto_nucl 12.333, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
Amino Acid Sequences MESARGPPRVKNKAAAPIQISAEQLLREAVDRQETGIQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKGFEDYVRRNRINMNNWMRYAAWELEQKEFKRARSIFERALDVDATSVVLWIRYIEAEMRNRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEEMLGNIPGTRQVFERWMEWEPDEAAWGAYIKLEKRYGEYERARAIFERFTIVRPEPRNWIKWAKFEEEFGTSDLVREVFGAAVEALGDEFVDERLFIAYARFEAKLKEYERARAIYKYALDRLPRSKSMGLHKAYTTFEKQYGDKDGVEDVVLSKRRRIYEDQIKENPKNYDIWFDYARLEETAGDLDRVRDVYERAVAQIPPTQEKRHWRRYIYLWIFYALWEEMEAKDIARARQIYKLCLDLIPHKKFTFAKVWLLKAQFEIRQGELTAARKSLGQAIGMCPKDKLFKGYVELELKLFEFVRCRTLYEKHIEWNPANCQTWIKFSELERGLDDLERTRAIFELAINQPVLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYDKTRDLYERLLEKTDHVKVWISYAHFEINIPEEEEEEAEDGSEERPVSEEAKARARKVFERAYKSMKEKDLKEERVSLLNAWLSFERTHGSEEDVEKVQKQMPRKTKRRRRLEDDTFEEYIDYVFPADDEQRQDISKMLAMASAWKEGGGSFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.65
3 0.58
4 0.53
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.18
18 0.18
19 0.2
20 0.23
21 0.23
22 0.24
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.28
27 0.29
28 0.26
29 0.26
30 0.24
31 0.22
32 0.27
33 0.22
34 0.24
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.35
42 0.35
43 0.35
44 0.38
45 0.41
46 0.43
47 0.53
48 0.58
49 0.6
50 0.67
51 0.74
52 0.78
53 0.75
54 0.71
55 0.69
56 0.68
57 0.65
58 0.64
59 0.63
60 0.61
61 0.61
62 0.61
63 0.52
64 0.46
65 0.42
66 0.34
67 0.28
68 0.27
69 0.28
70 0.33
71 0.4
72 0.39
73 0.44
74 0.46
75 0.43
76 0.48
77 0.47
78 0.47
79 0.48
80 0.54
81 0.51
82 0.5
83 0.52
84 0.43
85 0.44
86 0.37
87 0.29
88 0.22
89 0.16
90 0.13
91 0.09
92 0.08
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.1
101 0.16
102 0.23
103 0.28
104 0.31
105 0.36
106 0.37
107 0.43
108 0.48
109 0.48
110 0.47
111 0.48
112 0.48
113 0.45
114 0.49
115 0.43
116 0.35
117 0.29
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.2
153 0.22
154 0.23
155 0.22
156 0.22
157 0.19
158 0.17
159 0.17
160 0.14
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.1
167 0.1
168 0.14
169 0.17
170 0.17
171 0.2
172 0.25
173 0.28
174 0.35
175 0.38
176 0.39
177 0.41
178 0.42
179 0.4
180 0.36
181 0.34
182 0.27
183 0.23
184 0.24
185 0.19
186 0.19
187 0.23
188 0.24
189 0.29
190 0.31
191 0.33
192 0.37
193 0.41
194 0.43
195 0.44
196 0.51
197 0.47
198 0.5
199 0.53
200 0.49
201 0.44
202 0.43
203 0.4
204 0.32
205 0.3
206 0.24
207 0.21
208 0.15
209 0.15
210 0.13
211 0.11
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.13
242 0.19
243 0.2
244 0.25
245 0.25
246 0.29
247 0.32
248 0.33
249 0.33
250 0.28
251 0.28
252 0.24
253 0.25
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.27
259 0.31
260 0.33
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.33
265 0.39
266 0.43
267 0.4
268 0.37
269 0.36
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.28
274 0.21
275 0.22
276 0.21
277 0.21
278 0.21
279 0.23
280 0.22
281 0.19
282 0.17
283 0.16
284 0.14
285 0.13
286 0.1
287 0.08
288 0.11
289 0.16
290 0.16
291 0.18
292 0.22
293 0.23
294 0.27
295 0.31
296 0.36
297 0.41
298 0.48
299 0.53
300 0.57
301 0.61
302 0.58
303 0.57
304 0.49
305 0.39
306 0.35
307 0.28
308 0.26
309 0.22
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.06
366 0.08
367 0.1
368 0.1
369 0.13
370 0.15
371 0.15
372 0.21
373 0.22
374 0.22
375 0.22
376 0.23
377 0.2
378 0.19
379 0.2
380 0.22
381 0.3
382 0.32
383 0.33
384 0.32
385 0.35
386 0.35
387 0.37
388 0.36
389 0.29
390 0.34
391 0.35
392 0.37
393 0.38
394 0.38
395 0.35
396 0.3
397 0.3
398 0.24
399 0.23
400 0.22
401 0.19
402 0.18
403 0.18
404 0.17
405 0.17
406 0.18
407 0.16
408 0.14
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.17
413 0.15
414 0.13
415 0.13
416 0.16
417 0.22
418 0.23
419 0.23
420 0.18
421 0.19
422 0.22
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.25
429 0.29
430 0.28
431 0.28
432 0.24
433 0.22
434 0.2
435 0.17
436 0.15
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.17
441 0.16
442 0.18
443 0.21
444 0.24
445 0.29
446 0.32
447 0.33
448 0.33
449 0.37
450 0.39
451 0.38
452 0.38
453 0.38
454 0.37
455 0.36
456 0.32
457 0.31
458 0.27
459 0.31
460 0.28
461 0.25
462 0.23
463 0.23
464 0.32
465 0.31
466 0.31
467 0.26
468 0.26
469 0.24
470 0.22
471 0.22
472 0.14
473 0.14
474 0.13
475 0.13
476 0.12
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.09
481 0.15
482 0.16
483 0.17
484 0.16
485 0.16
486 0.15
487 0.15
488 0.15
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.14
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.14
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.16
516 0.22
517 0.26
518 0.27
519 0.29
520 0.29
521 0.29
522 0.34
523 0.35
524 0.29
525 0.26
526 0.26
527 0.24
528 0.26
529 0.27
530 0.22
531 0.2
532 0.2
533 0.21
534 0.18
535 0.18
536 0.17
537 0.16
538 0.16
539 0.15
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.13
544 0.12
545 0.1
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.08
553 0.07
554 0.09
555 0.11
556 0.12
557 0.16
558 0.2
559 0.22
560 0.32
561 0.36
562 0.37
563 0.41
564 0.44
565 0.45
566 0.48
567 0.54
568 0.53
569 0.57
570 0.6
571 0.63
572 0.66
573 0.67
574 0.67
575 0.65
576 0.64
577 0.59
578 0.64
579 0.67
580 0.66
581 0.64
582 0.62
583 0.56
584 0.53
585 0.51
586 0.42
587 0.36
588 0.32
589 0.28
590 0.25
591 0.23
592 0.21
593 0.2
594 0.2
595 0.18
596 0.16
597 0.18
598 0.17
599 0.19
600 0.22
601 0.23
602 0.27
603 0.28
604 0.28
605 0.27
606 0.29
607 0.3
608 0.29
609 0.35
610 0.41
611 0.48
612 0.58
613 0.68
614 0.76
615 0.83
616 0.9
617 0.93
618 0.93
619 0.92
620 0.92
621 0.92
622 0.91
623 0.87
624 0.83
625 0.73
626 0.62
627 0.53
628 0.42
629 0.31
630 0.22
631 0.14
632 0.08
633 0.07
634 0.06
635 0.09
636 0.11
637 0.15
638 0.19
639 0.22
640 0.24
641 0.25
642 0.26
643 0.25
644 0.25
645 0.23
646 0.2
647 0.17
648 0.16
649 0.15
650 0.21
651 0.2
652 0.2
653 0.18
654 0.17
655 0.17