Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553HRZ0

Protein Details
Accession A0A553HRZ0    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-244MYRYWKKRYKIQEKNYEAKKRKBasic
383-406EESERWDKRVKKRAAHRDNNAFQDHydrophilic
490-514DLKKAEESRLRKRRERMAKNGDEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
497-505SRLRKRRER
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022190  DUF3716  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF12511  DUF3716  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSSWEKRKYGPGQSYGDGRDGMGWIEESHATLNPRRAASSASFPSGVARASEPLSSTIRSVATLAYSSLVVNVMDLQRQTPSSAYVSIALSSSEPSITGEPLEATAIKQLVRQQLWSDDEKLPTLGLALALAPMPPVRTVQLTGKGKFSLRRANNLVAALIQATSILAEKPCDGCKRGSGLFAGCVIPREPEHQSFVYGAHRRFGRLKATDRHPRLDQSYMIMYRYWKKRYKIQEKNYEAKKRKTAPASEEVTTEEPVRPTDGSQDTALADHDAETTDQNSNESAGTTQDDAAASSTSAETDAAAKAKDRLARFRALQARAKTSSDQNLKEATKESQRLATDPSALTALHRRRDIAAHKLLKAETEEGGEDFERKRAWDWTVEESERWDKRVKKRAAHRDNNAFQDYRAESNKIYKRQLQNLAPDMERYEKDKMKAIEKAAASGGLEIIETEDGELIAVDKDGSFYSTADSTTFHENKPDKAAVDRLVEDLKKAEESRLRKRRERMAKNGDEGDITYINEKNKQFNQKLARFYNKYTAEIRDSFERGTRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.58
3 0.52
4 0.42
5 0.33
6 0.27
7 0.22
8 0.19
9 0.14
10 0.12
11 0.1
12 0.12
13 0.12
14 0.11
15 0.12
16 0.15
17 0.18
18 0.22
19 0.28
20 0.31
21 0.32
22 0.33
23 0.32
24 0.33
25 0.34
26 0.38
27 0.35
28 0.33
29 0.32
30 0.31
31 0.32
32 0.29
33 0.26
34 0.18
35 0.16
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.16
40 0.18
41 0.2
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.08
58 0.07
59 0.1
60 0.1
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.16
67 0.14
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.13
96 0.18
97 0.25
98 0.25
99 0.27
100 0.26
101 0.3
102 0.34
103 0.35
104 0.35
105 0.3
106 0.31
107 0.3
108 0.28
109 0.22
110 0.18
111 0.15
112 0.11
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.17
128 0.26
129 0.31
130 0.32
131 0.34
132 0.35
133 0.36
134 0.38
135 0.39
136 0.4
137 0.37
138 0.44
139 0.46
140 0.47
141 0.47
142 0.43
143 0.38
144 0.27
145 0.24
146 0.17
147 0.12
148 0.08
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.08
157 0.1
158 0.15
159 0.17
160 0.19
161 0.2
162 0.22
163 0.27
164 0.26
165 0.26
166 0.23
167 0.21
168 0.2
169 0.2
170 0.18
171 0.13
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.15
177 0.17
178 0.18
179 0.22
180 0.21
181 0.22
182 0.21
183 0.22
184 0.26
185 0.27
186 0.25
187 0.26
188 0.26
189 0.27
190 0.3
191 0.32
192 0.32
193 0.33
194 0.39
195 0.43
196 0.51
197 0.58
198 0.58
199 0.6
200 0.54
201 0.52
202 0.48
203 0.43
204 0.35
205 0.27
206 0.29
207 0.25
208 0.23
209 0.21
210 0.2
211 0.25
212 0.31
213 0.36
214 0.38
215 0.4
216 0.48
217 0.58
218 0.67
219 0.7
220 0.73
221 0.76
222 0.76
223 0.82
224 0.83
225 0.82
226 0.77
227 0.72
228 0.71
229 0.65
230 0.65
231 0.62
232 0.58
233 0.53
234 0.55
235 0.52
236 0.45
237 0.4
238 0.35
239 0.31
240 0.26
241 0.22
242 0.15
243 0.12
244 0.11
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.14
249 0.14
250 0.15
251 0.14
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.08
257 0.07
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.09
294 0.11
295 0.16
296 0.16
297 0.22
298 0.25
299 0.29
300 0.29
301 0.35
302 0.4
303 0.4
304 0.45
305 0.41
306 0.43
307 0.41
308 0.42
309 0.37
310 0.33
311 0.36
312 0.36
313 0.35
314 0.31
315 0.34
316 0.33
317 0.32
318 0.31
319 0.26
320 0.26
321 0.27
322 0.26
323 0.26
324 0.26
325 0.26
326 0.28
327 0.26
328 0.22
329 0.19
330 0.19
331 0.15
332 0.14
333 0.14
334 0.18
335 0.22
336 0.24
337 0.24
338 0.25
339 0.25
340 0.31
341 0.34
342 0.35
343 0.39
344 0.39
345 0.39
346 0.41
347 0.39
348 0.35
349 0.32
350 0.25
351 0.17
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.15
364 0.17
365 0.21
366 0.24
367 0.28
368 0.33
369 0.34
370 0.32
371 0.33
372 0.39
373 0.34
374 0.33
375 0.34
376 0.36
377 0.45
378 0.55
379 0.59
380 0.59
381 0.69
382 0.78
383 0.82
384 0.84
385 0.83
386 0.83
387 0.81
388 0.78
389 0.71
390 0.6
391 0.49
392 0.45
393 0.39
394 0.32
395 0.3
396 0.26
397 0.23
398 0.33
399 0.4
400 0.4
401 0.44
402 0.47
403 0.52
404 0.59
405 0.67
406 0.62
407 0.62
408 0.62
409 0.6
410 0.52
411 0.45
412 0.39
413 0.35
414 0.3
415 0.27
416 0.28
417 0.29
418 0.31
419 0.37
420 0.38
421 0.39
422 0.43
423 0.42
424 0.42
425 0.37
426 0.37
427 0.31
428 0.28
429 0.23
430 0.17
431 0.15
432 0.08
433 0.08
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.06
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.12
458 0.13
459 0.22
460 0.24
461 0.23
462 0.31
463 0.33
464 0.35
465 0.41
466 0.41
467 0.33
468 0.34
469 0.39
470 0.35
471 0.37
472 0.35
473 0.31
474 0.33
475 0.32
476 0.29
477 0.26
478 0.23
479 0.23
480 0.23
481 0.27
482 0.29
483 0.37
484 0.48
485 0.55
486 0.62
487 0.66
488 0.74
489 0.78
490 0.81
491 0.83
492 0.83
493 0.85
494 0.84
495 0.82
496 0.77
497 0.68
498 0.57
499 0.48
500 0.41
501 0.31
502 0.24
503 0.2
504 0.2
505 0.22
506 0.28
507 0.29
508 0.33
509 0.4
510 0.5
511 0.51
512 0.57
513 0.65
514 0.65
515 0.72
516 0.73
517 0.75
518 0.69
519 0.7
520 0.71
521 0.64
522 0.61
523 0.56
524 0.53
525 0.49
526 0.47
527 0.46
528 0.43
529 0.42
530 0.4