Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HVW1

Protein Details
Accession A0A553HVW1    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
367-397TSRHTSPPSPSKEKRPRGRPRKAIVKSPQDLHydrophilic
424-446TVAEHRGRGRPKRSGTKAEDSAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-390PSKEKRPRGRPRKAI
429-439RGRGRPKRSGT
454-468RALKRRALKQSRARR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MYNSIRAMGLADANRALEILSNDPKQLEKARSRFSRSPPSYRSYPSGTTTQLYTPSEADKEQSWLSEQRFQLSMEYRASLPASQFDAHIREELRQIDEGNDNNTRPVPIGMEYTTYARNCVKKRWVEQGIWNKDWKWRGGVVWRWKHEEPPEPELEVQKGLEAEKEIQSNPLPLWMRRPRTKTARAEKDNDSGAEDDEETRQLKYACALREHEREASRPFHQFVYQVSREREQIQQQLRRNGGNIEDPADINTRAYEGVKKIWMERKIWDKKWGMMPGMSWKHEQPFEEWIEQEMSEISYPGPITPPRRDSPVQFSEMNLTKFRSVPPSPAELNPEVLSTNMNHPVPMVIDAPGTLDTLHNDTALNTSRHTSPPSPSKEKRPRGRPRKAIVKSPQDLPTPESPVSLRRSKRLQEAKATTTASDTVAEHRGRGRPKRSGTKAEDSAHGASTTDSRALKRRALKQSRARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.14
4 0.12
5 0.13
6 0.17
7 0.23
8 0.24
9 0.25
10 0.26
11 0.27
12 0.29
13 0.35
14 0.38
15 0.41
16 0.48
17 0.57
18 0.64
19 0.72
20 0.75
21 0.76
22 0.78
23 0.75
24 0.77
25 0.73
26 0.72
27 0.69
28 0.66
29 0.63
30 0.57
31 0.54
32 0.48
33 0.47
34 0.43
35 0.38
36 0.36
37 0.33
38 0.32
39 0.3
40 0.28
41 0.25
42 0.25
43 0.26
44 0.24
45 0.24
46 0.2
47 0.22
48 0.2
49 0.2
50 0.21
51 0.24
52 0.27
53 0.33
54 0.32
55 0.32
56 0.33
57 0.32
58 0.34
59 0.32
60 0.33
61 0.27
62 0.28
63 0.25
64 0.25
65 0.25
66 0.21
67 0.18
68 0.17
69 0.18
70 0.17
71 0.18
72 0.19
73 0.21
74 0.2
75 0.22
76 0.2
77 0.19
78 0.22
79 0.24
80 0.23
81 0.21
82 0.21
83 0.21
84 0.24
85 0.24
86 0.24
87 0.25
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.21
92 0.18
93 0.17
94 0.14
95 0.12
96 0.15
97 0.14
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.21
102 0.19
103 0.2
104 0.22
105 0.29
106 0.3
107 0.36
108 0.43
109 0.47
110 0.52
111 0.6
112 0.61
113 0.57
114 0.63
115 0.66
116 0.66
117 0.6
118 0.58
119 0.49
120 0.48
121 0.48
122 0.4
123 0.33
124 0.27
125 0.28
126 0.34
127 0.41
128 0.46
129 0.51
130 0.53
131 0.56
132 0.54
133 0.56
134 0.53
135 0.54
136 0.49
137 0.47
138 0.46
139 0.41
140 0.41
141 0.38
142 0.33
143 0.25
144 0.19
145 0.14
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.13
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.14
158 0.18
159 0.18
160 0.16
161 0.26
162 0.32
163 0.39
164 0.45
165 0.5
166 0.52
167 0.59
168 0.68
169 0.69
170 0.72
171 0.75
172 0.73
173 0.73
174 0.69
175 0.64
176 0.56
177 0.46
178 0.37
179 0.27
180 0.22
181 0.17
182 0.14
183 0.1
184 0.09
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.12
192 0.16
193 0.17
194 0.19
195 0.22
196 0.26
197 0.3
198 0.32
199 0.34
200 0.3
201 0.3
202 0.31
203 0.31
204 0.28
205 0.27
206 0.26
207 0.22
208 0.22
209 0.21
210 0.2
211 0.25
212 0.25
213 0.27
214 0.28
215 0.28
216 0.28
217 0.3
218 0.31
219 0.26
220 0.31
221 0.34
222 0.39
223 0.42
224 0.47
225 0.46
226 0.43
227 0.4
228 0.33
229 0.28
230 0.23
231 0.19
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.11
239 0.1
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.14
247 0.14
248 0.18
249 0.24
250 0.27
251 0.26
252 0.3
253 0.38
254 0.45
255 0.47
256 0.51
257 0.46
258 0.47
259 0.52
260 0.51
261 0.41
262 0.33
263 0.31
264 0.32
265 0.34
266 0.32
267 0.26
268 0.24
269 0.26
270 0.28
271 0.28
272 0.21
273 0.22
274 0.24
275 0.24
276 0.23
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.17
281 0.11
282 0.09
283 0.07
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.09
290 0.12
291 0.17
292 0.23
293 0.28
294 0.29
295 0.35
296 0.37
297 0.38
298 0.43
299 0.43
300 0.41
301 0.36
302 0.35
303 0.35
304 0.38
305 0.36
306 0.28
307 0.25
308 0.23
309 0.23
310 0.25
311 0.26
312 0.23
313 0.25
314 0.27
315 0.31
316 0.31
317 0.32
318 0.36
319 0.29
320 0.31
321 0.26
322 0.23
323 0.18
324 0.16
325 0.15
326 0.11
327 0.14
328 0.17
329 0.17
330 0.16
331 0.16
332 0.17
333 0.16
334 0.17
335 0.14
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.11
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.14
351 0.18
352 0.18
353 0.16
354 0.18
355 0.21
356 0.23
357 0.28
358 0.27
359 0.3
360 0.38
361 0.46
362 0.54
363 0.56
364 0.65
365 0.71
366 0.78
367 0.81
368 0.83
369 0.86
370 0.87
371 0.93
372 0.92
373 0.9
374 0.91
375 0.86
376 0.85
377 0.84
378 0.83
379 0.76
380 0.72
381 0.68
382 0.6
383 0.57
384 0.51
385 0.47
386 0.42
387 0.39
388 0.34
389 0.3
390 0.32
391 0.37
392 0.4
393 0.38
394 0.4
395 0.48
396 0.52
397 0.61
398 0.66
399 0.66
400 0.68
401 0.71
402 0.69
403 0.67
404 0.62
405 0.52
406 0.44
407 0.38
408 0.29
409 0.24
410 0.2
411 0.18
412 0.23
413 0.24
414 0.23
415 0.27
416 0.33
417 0.4
418 0.49
419 0.53
420 0.56
421 0.65
422 0.74
423 0.78
424 0.81
425 0.8
426 0.81
427 0.8
428 0.74
429 0.68
430 0.62
431 0.55
432 0.47
433 0.39
434 0.29
435 0.22
436 0.21
437 0.2
438 0.2
439 0.2
440 0.23
441 0.31
442 0.36
443 0.43
444 0.49
445 0.57
446 0.64
447 0.71
448 0.78