FuNGI

A0A553HLW1

Protein Details

Accession

A0A553HLW1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
57-83	HPSSVRPAPKGGKKRPNQAERRLMKAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
60-76	SVRPAPKGGKKRPNQAE

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, mito 3, pero 2, plas 1, golg 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043519 NT_sf IPR002058 PAP_assoc
Gene Ontology	GO:0046872 F:metal ion binding GO:1990817 F:poly(A) RNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF03828 PAP_assoc

Amino Acid Sequences

MQSAGGPLEDRLRNLILTSSNPEAMSELESSTVSLPPGFQHSHHISPSDEGPRDEKHPSSVRPAPKGGKKRPNQAERRLMKAEFQIPVDSRAPTHPFSRQYTPPQNHSDPYSPHHSQQQKHSSSHTSVHPATFQNRPHGSHTHEQSRRGYGQPSASSSTHQSDWRHQQQPKVDGLFRGVNVVPADAFPARGGRNPIQPQYHALYTPAGHRQPGLGPEQLANQSAFLDQLCHQIISGAEIGPDEIAEKENFRMRVESICRNVVSCYEREKNGATSEFQPETVELKCFGSLASGFATKAADMDLGLLSPISGLSPDSPDSPIPRLIEGALLAAGFGARLLTKTRVPIIKLCEKPDKILRESLLDARKKWEDGVDQEEREPDEDVPEDTEIFLDNHSRVDTDSKQSPTKSQVSQLTSSVKIAPLHEDGLISLKQGSNQSLSSYYNNAKRLLRRLNGRDITHSNSQDFTEADFILLDKVASAFVQGLYDTSLKSRILAYPSFHIGDTARLTSYRSLFGVNMMIEGEKLVLSWELRQLPSRNPKTDQAYERVIQQWKDLQYNKNFGTNPVWFNKELQLAVESLRQIPSVQIMQLRQDQYESPVQYHGRTSKIAISLSKTPSSPNIDMRSLIVQHYVVGIRDEEIRNQVHDFVALTGTQALRTVARKHKSLHLAAEYGRAVEHGRYRPEDLPILHSYMAILRRKPIPSLQQPIDFEYLIPLMRNEVGILDNIRQLPDPATLSPNKPKDKFNDSLEFPKSGVGVQCDVNFSAHLALQNTLLLRCYSYTDPRVRPLVLFVKHWAKARGINTPYRGTLSSYGYVLMVLHYLVNVVEPFVCPNLQELAPPDPDLSPQALEGIATCQGHNVRFWRDERAIHTLAQQNQLNRNHDSLGTLLQGFFEYYAQGNMMATYPKKGFDWGRDVLSLRTHGGLLSKAEKGWTGAKTVVQPQSGTAAISTEVDATKAQSPSLKSQTPLLDSAATDQTPKSKDVKEVRHRFLFAIEDPFELDHNVARTVTHNGIVAIRDEFRRAWRIIKAAGKGHASEDLLEDVKAHMEEQGKRQFMSLLDEIHGNEVFTDPRIVM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.25
3	0.2
4	0.22
5	0.26
6	0.26
7	0.27
8	0.26
9	0.26
10	0.23
11	0.22
12	0.21
13	0.17
14	0.14
15	0.13
16	0.13
17	0.13
18	0.14
19	0.14
20	0.12
21	0.11
22	0.11
23	0.12
24	0.18
25	0.19
26	0.19
27	0.26
28	0.32
29	0.37
30	0.39
31	0.39
32	0.34
33	0.35
34	0.41
35	0.4
36	0.36
37	0.33
38	0.35
39	0.37
40	0.39
41	0.42
42	0.37
43	0.37
44	0.42
45	0.43
46	0.48
47	0.53
48	0.57
49	0.58
50	0.64
51	0.65
52	0.67
53	0.74
54	0.76
55	0.78
56	0.78
57	0.83
58	0.86
59	0.88
60	0.88
61	0.87
62	0.88
63	0.82
64	0.82
65	0.76
66	0.66
67	0.6
68	0.57
69	0.53
70	0.45
71	0.42
72	0.4
73	0.36
74	0.4
75	0.37
76	0.31
77	0.27
78	0.3
79	0.33
80	0.3
81	0.33
82	0.35
83	0.39
84	0.44
85	0.49
86	0.5
87	0.56
88	0.64
89	0.66
90	0.67
91	0.69
92	0.67
93	0.63
94	0.62
95	0.58
96	0.51
97	0.5
98	0.51
99	0.46
100	0.44
101	0.51
102	0.53
103	0.51
104	0.58
105	0.63
106	0.6
107	0.6
108	0.62
109	0.59
110	0.56
111	0.55
112	0.5
113	0.47
114	0.43
115	0.42
116	0.41
117	0.39
118	0.39
119	0.4
120	0.39
121	0.41
122	0.43
123	0.44
124	0.45
125	0.46
126	0.49
127	0.51
128	0.55
129	0.56
130	0.57
131	0.59
132	0.58
133	0.6
134	0.57
135	0.52
136	0.47
137	0.41
138	0.43
139	0.42
140	0.41
141	0.39
142	0.36
143	0.35
144	0.37
145	0.36
146	0.32
147	0.34
148	0.33
149	0.37
150	0.47
151	0.54
152	0.59
153	0.58
154	0.62
155	0.65
156	0.67
157	0.65
158	0.61
159	0.53
160	0.46
161	0.47
162	0.44
163	0.35
164	0.33
165	0.26
166	0.23
167	0.21
168	0.21
169	0.16
170	0.13
171	0.16
172	0.12
173	0.12
174	0.09
175	0.13
176	0.14
177	0.17
178	0.24
179	0.25
180	0.34
181	0.39
182	0.45
183	0.45
184	0.45
185	0.46
186	0.45
187	0.43
188	0.34
189	0.29
190	0.25
191	0.22
192	0.26
193	0.29
194	0.25
195	0.24
196	0.24
197	0.24
198	0.25
199	0.27
200	0.26
201	0.21
202	0.2
203	0.21
204	0.24
205	0.24
206	0.22
207	0.19
208	0.15
209	0.14
210	0.13
211	0.13
212	0.09
213	0.1
214	0.09
215	0.15
216	0.15
217	0.15
218	0.14
219	0.15
220	0.15
221	0.15
222	0.15
223	0.1
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.06
230	0.05
231	0.07
232	0.08
233	0.09
234	0.12
235	0.17
236	0.18
237	0.19
238	0.2
239	0.19
240	0.27
241	0.31
242	0.36
243	0.35
244	0.37
245	0.37
246	0.35
247	0.35
248	0.32
249	0.29
250	0.24
251	0.28
252	0.28
253	0.29
254	0.31
255	0.32
256	0.3
257	0.31
258	0.31
259	0.26
260	0.25
261	0.29
262	0.28
263	0.26
264	0.24
265	0.2
266	0.21
267	0.19
268	0.17
269	0.12
270	0.13
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.11
281	0.11
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.06
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.05
299	0.07
300	0.08
301	0.1
302	0.11
303	0.13
304	0.15
305	0.17
306	0.2
307	0.19
308	0.19
309	0.18
310	0.16
311	0.16
312	0.13
313	0.11
314	0.08
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.06
325	0.09
326	0.11
327	0.13
328	0.18
329	0.21
330	0.23
331	0.27
332	0.32
333	0.38
334	0.41
335	0.44
336	0.48
337	0.46
338	0.48
339	0.51
340	0.5
341	0.43
342	0.44
343	0.4
344	0.34
345	0.35
346	0.38
347	0.38
348	0.35
349	0.33
350	0.33
351	0.34
352	0.31
353	0.3
354	0.27
355	0.22
356	0.23
357	0.3
358	0.3
359	0.29
360	0.29
361	0.29
362	0.26
363	0.24
364	0.21
365	0.14
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.1
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.08
383	0.13
384	0.15
385	0.18
386	0.23
387	0.26
388	0.29
389	0.3
390	0.32
391	0.34
392	0.37
393	0.33
394	0.34
395	0.37
396	0.37
397	0.38
398	0.38
399	0.35
400	0.3
401	0.3
402	0.25
403	0.2
404	0.18
405	0.17
406	0.17
407	0.15
408	0.15
409	0.14
410	0.13
411	0.11
412	0.13
413	0.12
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.1
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.12
422	0.13
423	0.14
424	0.15
425	0.15
426	0.17
427	0.2
428	0.24
429	0.26
430	0.28
431	0.29
432	0.31
433	0.38
434	0.41
435	0.42
436	0.46
437	0.48
438	0.55
439	0.57
440	0.54
441	0.51
442	0.47
443	0.47
444	0.44
445	0.4
446	0.31
447	0.27
448	0.26
449	0.22
450	0.19
451	0.15
452	0.11
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.05
460	0.03
461	0.04
462	0.04
463	0.03
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.09
475	0.08
476	0.09
477	0.1
478	0.1
479	0.13
480	0.15
481	0.16
482	0.16
483	0.18
484	0.18
485	0.17
486	0.16
487	0.13
488	0.13
489	0.13
490	0.12
491	0.1
492	0.09
493	0.11
494	0.12
495	0.13
496	0.12
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.11
501	0.12
502	0.09
503	0.08
504	0.07
505	0.07
506	0.06
507	0.06
508	0.05
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.04
513	0.04
514	0.05
515	0.08
516	0.1
517	0.11
518	0.14
519	0.16
520	0.22
521	0.32
522	0.37
523	0.37
524	0.38
525	0.42
526	0.45
527	0.5
528	0.46
529	0.39
530	0.38
531	0.35
532	0.35
533	0.35
534	0.31
535	0.25
536	0.23
537	0.24
538	0.22
539	0.27
540	0.28
541	0.29
542	0.31
543	0.36
544	0.36
545	0.37
546	0.35
547	0.31
548	0.32
549	0.29
550	0.28
551	0.25
552	0.27
553	0.22
554	0.23
555	0.24
556	0.21
557	0.18
558	0.15
559	0.14
560	0.12
561	0.12
562	0.13
563	0.1
564	0.09
565	0.1
566	0.09
567	0.09
568	0.08
569	0.09
570	0.08
571	0.09
572	0.1
573	0.1
574	0.13
575	0.17
576	0.18
577	0.16
578	0.17
579	0.16
580	0.17
581	0.21
582	0.19
583	0.16
584	0.19
585	0.19
586	0.19
587	0.22
588	0.21
589	0.18
590	0.18
591	0.19
592	0.19
593	0.2
594	0.21
595	0.19
596	0.2
597	0.23
598	0.25
599	0.25
600	0.22
601	0.2
602	0.23
603	0.28
604	0.27
605	0.27
606	0.28
607	0.28
608	0.28
609	0.28
610	0.26
611	0.21
612	0.19
613	0.14
614	0.1
615	0.09
616	0.1
617	0.09
618	0.08
619	0.08
620	0.07
621	0.07
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.14
626	0.14
627	0.15
628	0.16
629	0.16
630	0.12
631	0.12
632	0.11
633	0.08
634	0.08
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.11
644	0.17
645	0.24
646	0.28
647	0.31
648	0.33
649	0.4
650	0.44
651	0.44
652	0.42
653	0.37
654	0.35
655	0.33
656	0.34
657	0.26
658	0.2
659	0.17
660	0.13
661	0.11
662	0.11
663	0.17
664	0.17
665	0.2
666	0.22
667	0.26
668	0.28
669	0.29
670	0.31
671	0.26
672	0.27
673	0.26
674	0.26
675	0.22
676	0.2
677	0.18
678	0.17
679	0.22
680	0.2
681	0.19
682	0.2
683	0.25
684	0.26
685	0.28
686	0.3
687	0.33
688	0.38
689	0.45
690	0.45
691	0.46
692	0.46
693	0.47
694	0.44
695	0.35
696	0.27
697	0.2
698	0.18
699	0.12
700	0.12
701	0.08
702	0.07
703	0.08
704	0.08
705	0.06
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.09
710	0.09
711	0.11
712	0.11
713	0.12
714	0.11
715	0.12
716	0.12
717	0.13
718	0.14
719	0.13
720	0.17
721	0.19
722	0.23
723	0.31
724	0.37
725	0.42
726	0.43
727	0.46
728	0.49
729	0.54
730	0.55
731	0.53
732	0.52
733	0.48
734	0.53
735	0.51
736	0.45
737	0.38
738	0.33
739	0.27
740	0.21
741	0.19
742	0.14
743	0.14
744	0.14
745	0.15
746	0.16
747	0.16
748	0.15
749	0.13
750	0.11
751	0.1
752	0.1
753	0.1
754	0.1
755	0.1
756	0.1
757	0.11
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.09
762	0.09
763	0.09
764	0.12
765	0.14
766	0.19
767	0.26
768	0.33
769	0.35
770	0.39
771	0.42
772	0.39
773	0.36
774	0.36
775	0.38
776	0.32
777	0.31
778	0.32
779	0.36
780	0.38
781	0.41
782	0.38
783	0.32
784	0.36
785	0.37
786	0.41
787	0.38
788	0.41
789	0.41
790	0.42
791	0.41
792	0.37
793	0.35
794	0.29
795	0.29
796	0.27
797	0.24
798	0.21
799	0.2
800	0.17
801	0.17
802	0.14
803	0.1
804	0.07
805	0.05
806	0.05
807	0.04
808	0.05
809	0.04
810	0.05
811	0.05
812	0.05
813	0.05
814	0.06
815	0.07
816	0.08
817	0.08
818	0.08
819	0.1
820	0.12
821	0.12
822	0.13
823	0.15
824	0.18
825	0.19
826	0.2
827	0.19
828	0.16
829	0.17
830	0.18
831	0.16
832	0.12
833	0.11
834	0.11
835	0.1
836	0.1
837	0.09
838	0.09
839	0.11
840	0.11
841	0.1
842	0.13
843	0.15
844	0.16
845	0.19
846	0.22
847	0.24
848	0.29
849	0.3
850	0.35
851	0.37
852	0.39
853	0.41
854	0.44
855	0.41
856	0.36
857	0.41
858	0.39
859	0.4
860	0.43
861	0.41
862	0.38
863	0.45
864	0.5
865	0.48
866	0.44
867	0.42
868	0.36
869	0.34
870	0.31
871	0.24
872	0.19
873	0.17
874	0.15
875	0.13
876	0.12
877	0.12
878	0.11
879	0.1
880	0.08
881	0.07
882	0.07
883	0.08
884	0.08
885	0.08
886	0.08
887	0.08
888	0.09
889	0.11
890	0.11
891	0.15
892	0.16
893	0.17
894	0.18
895	0.23
896	0.25
897	0.29
898	0.35
899	0.34
900	0.36
901	0.37
902	0.38
903	0.34
904	0.34
905	0.29
906	0.23
907	0.21
908	0.18
909	0.16
910	0.16
911	0.17
912	0.17
913	0.19
914	0.19
915	0.18
916	0.19
917	0.19
918	0.2
919	0.23
920	0.21
921	0.2
922	0.21
923	0.24
924	0.27
925	0.34
926	0.36
927	0.32
928	0.31
929	0.29
930	0.3
931	0.28
932	0.24
933	0.17
934	0.12
935	0.11
936	0.12
937	0.11
938	0.1
939	0.09
940	0.1
941	0.1
942	0.12
943	0.17
944	0.17
945	0.17
946	0.2
947	0.24
948	0.31
949	0.38
950	0.39
951	0.34
952	0.4
953	0.44
954	0.43
955	0.41
956	0.35
957	0.29
958	0.26
959	0.29
960	0.27
961	0.22
962	0.2
963	0.19
964	0.23
965	0.24
966	0.27
967	0.29
968	0.29
969	0.38
970	0.46
971	0.56
972	0.61
973	0.69
974	0.74
975	0.75
976	0.73
977	0.64
978	0.58
979	0.52
980	0.44
981	0.41
982	0.34
983	0.28
984	0.27
985	0.26
986	0.24
987	0.2
988	0.17
989	0.13
990	0.14
991	0.14
992	0.13
993	0.14
994	0.15
995	0.2
996	0.21
997	0.2
998	0.19
999	0.19
1000	0.21
1001	0.21
1002	0.21
1003	0.18
1004	0.19
1005	0.18
1006	0.2
1007	0.21
1008	0.25
1009	0.3
1010	0.3
1011	0.33
1012	0.36
1013	0.4
1014	0.44
1015	0.49
1016	0.5
1017	0.49
1018	0.52
1019	0.5
1020	0.45
1021	0.42
1022	0.39
1023	0.33
1024	0.28
1025	0.24
1026	0.22
1027	0.2
1028	0.19
1029	0.17
1030	0.13
1031	0.15
1032	0.14
1033	0.12
1034	0.13
1035	0.19
1036	0.24
1037	0.32
1038	0.41
1039	0.41
1040	0.41
1041	0.42
1042	0.4
1043	0.35
1044	0.38
1045	0.32
1046	0.26
1047	0.25
1048	0.26
1049	0.26
1050	0.26
1051	0.25
1052	0.17
1053	0.15
1054	0.13
1055	0.13
1056	0.13

A0A553HLW1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer