FuNGI

A0A553HTC5

Protein Details

Accession

A0A553HTC5

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
674-699	GGGKWQNQSGNRKNNKGKNNRPDDAA	Hydrophilic
710-732	EDLQQKIIARKRMTRKKKAKGRS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
546-557	AERRRKEKGKGI
716-732	IIARKRMTRKKKAKGRS

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034809 Nop4_RRM4 IPR034808 Nop4p_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12676 RRM3_Nop4p cd12677 RRM4_Nop4p

Amino Acid Sequences

MGNKDLKRAAADAVVAQAESGTGAERPSKKARVDNRSLFVRGLAPHTTTETLTNFFSQHFPVKHATVVIDPQTKSSRGYGFVTFTDGEDTQAAKEQLQGHKVDGRPISLDIAESRHRQPGTGADDAALKKEDRRAALAEARKAPKLIIRNLPWSIKHSDQLAALFRSYGLVKYADVPQHKGKLSGFGFVTMRGRKNAEAAIEGVNGKVVDGRTVSVDWAVSKDEWQKHEKKDTKGSKETANDSEEDEGDDDDDDKDGKDEADEEEDEDLRNFMKDHMDNLEDEDSSAEDDEAQSDEDDAASGGASVPPTKPQTTDNKTTLFIRNLPFTTTDAELKAHFEQFGRLRYARVVHNKATDRPAGTGFVCFANEDEFKTCLKGAPRTQQSAILNKKSVLQNEAADEAGKYTIDGRLLQISQAVSKDEASRLAESGAAAREDKHQDKRRLYLLSEGAIPASSPMFNMLAPSEVKIREQSAAQRKKLIQSNPSLHISLTRLAVRNMPRNLDSKGLKALAREAVVGFASDVKAGLRQPLSKEENARNGQEDKEAERRRKEKGKGIVKQTKIMFENKEGSKVAEADGAGKSRGYGFIEYTSHRWALMGLRWLNGHAVKSDNGKTHRLIVEFAIENAQVVARRKEQQAKMKAYQPGGRKENPNQIEAKGNPRYMPKGKDFSVSGGGKWQNQSGNRKNNKGKNNRPDDAAKAASQNAAAKEDLQQKIIARKRMTRKKKAKGRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.15
3	0.14
4	0.11
5	0.09
6	0.08
7	0.07
8	0.05
9	0.06
10	0.08
11	0.15
12	0.19
13	0.26
14	0.34
15	0.41
16	0.45
17	0.54
18	0.63
19	0.65
20	0.73
21	0.74
22	0.73
23	0.72
24	0.69
25	0.6
26	0.51
27	0.45
28	0.37
29	0.33
30	0.29
31	0.25
32	0.24
33	0.27
34	0.27
35	0.24
36	0.26
37	0.23
38	0.23
39	0.23
40	0.23
41	0.2
42	0.2
43	0.21
44	0.21
45	0.27
46	0.26
47	0.28
48	0.31
49	0.32
50	0.32
51	0.31
52	0.29
53	0.24
54	0.27
55	0.3
56	0.32
57	0.3
58	0.34
59	0.36
60	0.36
61	0.35
62	0.35
63	0.32
64	0.29
65	0.32
66	0.31
67	0.29
68	0.29
69	0.3
70	0.26
71	0.23
72	0.24
73	0.2
74	0.19
75	0.17
76	0.17
77	0.14
78	0.19
79	0.19
80	0.15
81	0.19
82	0.25
83	0.28
84	0.32
85	0.32
86	0.3
87	0.36
88	0.37
89	0.39
90	0.34
91	0.31
92	0.28
93	0.28
94	0.28
95	0.21
96	0.21
97	0.16
98	0.19
99	0.22
100	0.24
101	0.25
102	0.3
103	0.3
104	0.29
105	0.29
106	0.33
107	0.34
108	0.32
109	0.3
110	0.24
111	0.29
112	0.29
113	0.29
114	0.23
115	0.18
116	0.18
117	0.24
118	0.28
119	0.25
120	0.28
121	0.29
122	0.32
123	0.39
124	0.42
125	0.43
126	0.46
127	0.47
128	0.45
129	0.43
130	0.38
131	0.36
132	0.37
133	0.38
134	0.39
135	0.41
136	0.46
137	0.49
138	0.53
139	0.49
140	0.47
141	0.45
142	0.38
143	0.36
144	0.32
145	0.3
146	0.27
147	0.28
148	0.28
149	0.24
150	0.21
151	0.19
152	0.17
153	0.16
154	0.15
155	0.13
156	0.1
157	0.1
158	0.1
159	0.13
160	0.18
161	0.21
162	0.23
163	0.27
164	0.31
165	0.36
166	0.37
167	0.37
168	0.32
169	0.36
170	0.34
171	0.34
172	0.29
173	0.26
174	0.25
175	0.25
176	0.3
177	0.26
178	0.28
179	0.26
180	0.28
181	0.25
182	0.28
183	0.28
184	0.23
185	0.19
186	0.19
187	0.18
188	0.17
189	0.16
190	0.14
191	0.12
192	0.11
193	0.09
194	0.1
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.09
203	0.09
204	0.08
205	0.09
206	0.11
207	0.09
208	0.12
209	0.19
210	0.23
211	0.27
212	0.34
213	0.4
214	0.44
215	0.55
216	0.59
217	0.58
218	0.64
219	0.7
220	0.71
221	0.71
222	0.68
223	0.64
224	0.61
225	0.59
226	0.53
227	0.45
228	0.37
229	0.31
230	0.29
231	0.23
232	0.19
233	0.14
234	0.1
235	0.09
236	0.08
237	0.08
238	0.06
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.11
253	0.11
254	0.1
255	0.1
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.12
261	0.12
262	0.14
263	0.16
264	0.17
265	0.17
266	0.19
267	0.19
268	0.14
269	0.13
270	0.12
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.04
291	0.04
292	0.05
293	0.05
294	0.09
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.17
299	0.27
300	0.33
301	0.39
302	0.39
303	0.38
304	0.39
305	0.41
306	0.41
307	0.33
308	0.31
309	0.26
310	0.26
311	0.24
312	0.24
313	0.22
314	0.19
315	0.19
316	0.16
317	0.15
318	0.13
319	0.13
320	0.12
321	0.14
322	0.14
323	0.12
324	0.12
325	0.11
326	0.14
327	0.16
328	0.19
329	0.2
330	0.19
331	0.19
332	0.2
333	0.23
334	0.25
335	0.31
336	0.32
337	0.31
338	0.37
339	0.38
340	0.39
341	0.4
342	0.36
343	0.28
344	0.25
345	0.23
346	0.19
347	0.17
348	0.14
349	0.12
350	0.1
351	0.09
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.09
357	0.1
358	0.11
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.13
364	0.18
365	0.21
366	0.29
367	0.33
368	0.36
369	0.36
370	0.4
371	0.39
372	0.42
373	0.43
374	0.37
375	0.34
376	0.31
377	0.35
378	0.32
379	0.31
380	0.24
381	0.21
382	0.19
383	0.19
384	0.19
385	0.14
386	0.12
387	0.11
388	0.09
389	0.07
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.1
398	0.1
399	0.1
400	0.11
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.08
406	0.09
407	0.11
408	0.1
409	0.11
410	0.12
411	0.12
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.09
416	0.1
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.13
422	0.18
423	0.23
424	0.31
425	0.39
426	0.47
427	0.5
428	0.53
429	0.54
430	0.51
431	0.48
432	0.44
433	0.37
434	0.3
435	0.27
436	0.23
437	0.18
438	0.15
439	0.14
440	0.08
441	0.06
442	0.05
443	0.04
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.11
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.14
457	0.13
458	0.15
459	0.22
460	0.3
461	0.38
462	0.38
463	0.43
464	0.43
465	0.49
466	0.54
467	0.51
468	0.46
469	0.46
470	0.5
471	0.49
472	0.5
473	0.43
474	0.36
475	0.34
476	0.3
477	0.23
478	0.2
479	0.19
480	0.18
481	0.18
482	0.24
483	0.27
484	0.33
485	0.33
486	0.33
487	0.32
488	0.34
489	0.35
490	0.36
491	0.32
492	0.26
493	0.28
494	0.28
495	0.26
496	0.24
497	0.26
498	0.22
499	0.21
500	0.19
501	0.15
502	0.14
503	0.13
504	0.12
505	0.09
506	0.07
507	0.07
508	0.06
509	0.06
510	0.05
511	0.07
512	0.08
513	0.12
514	0.13
515	0.16
516	0.18
517	0.27
518	0.31
519	0.33
520	0.39
521	0.4
522	0.47
523	0.48
524	0.47
525	0.42
526	0.4
527	0.37
528	0.35
529	0.32
530	0.27
531	0.34
532	0.4
533	0.43
534	0.5
535	0.52
536	0.57
537	0.64
538	0.66
539	0.65
540	0.68
541	0.72
542	0.71
543	0.78
544	0.79
545	0.72
546	0.72
547	0.65
548	0.61
549	0.53
550	0.5
551	0.43
552	0.38
553	0.44
554	0.38
555	0.4
556	0.34
557	0.33
558	0.29
559	0.27
560	0.23
561	0.17
562	0.16
563	0.15
564	0.16
565	0.16
566	0.14
567	0.13
568	0.13
569	0.11
570	0.14
571	0.14
572	0.13
573	0.13
574	0.17
575	0.2
576	0.22
577	0.24
578	0.25
579	0.23
580	0.21
581	0.2
582	0.17
583	0.19
584	0.21
585	0.26
586	0.23
587	0.25
588	0.25
589	0.26
590	0.28
591	0.26
592	0.23
593	0.16
594	0.17
595	0.18
596	0.24
597	0.28
598	0.31
599	0.33
600	0.36
601	0.36
602	0.4
603	0.42
604	0.37
605	0.34
606	0.28
607	0.31
608	0.28
609	0.27
610	0.22
611	0.17
612	0.16
613	0.15
614	0.15
615	0.12
616	0.15
617	0.19
618	0.22
619	0.28
620	0.35
621	0.44
622	0.51
623	0.58
624	0.64
625	0.68
626	0.69
627	0.71
628	0.7
629	0.66
630	0.64
631	0.61
632	0.61
633	0.6
634	0.61
635	0.61
636	0.62
637	0.67
638	0.64
639	0.61
640	0.54
641	0.49
642	0.51
643	0.46
644	0.48
645	0.44
646	0.43
647	0.42
648	0.45
649	0.51
650	0.5
651	0.54
652	0.53
653	0.54
654	0.53
655	0.56
656	0.52
657	0.48
658	0.5
659	0.43
660	0.36
661	0.37
662	0.38
663	0.37
664	0.37
665	0.38
666	0.35
667	0.42
668	0.52
669	0.53
670	0.61
671	0.66
672	0.74
673	0.8
674	0.82
675	0.85
676	0.86
677	0.87
678	0.87
679	0.88
680	0.82
681	0.77
682	0.73
683	0.68
684	0.64
685	0.56
686	0.47
687	0.4
688	0.38
689	0.34
690	0.31
691	0.31
692	0.25
693	0.24
694	0.23
695	0.21
696	0.27
697	0.35
698	0.34
699	0.31
700	0.32
701	0.33
702	0.43
703	0.49
704	0.5
705	0.47
706	0.55
707	0.64
708	0.73
709	0.8
710	0.81
711	0.85
712	0.88

A0A553HTC5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer