Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HPQ6

Protein Details
Accession A0A553HPQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-42NAPDYLKKRKEEGKKQRRIHDGVFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-36KKRKEEGKKQRR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10.5, cyto 5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034804  SQR/QFR_C/D  
IPR018495  Succ_DH_cyt_bsu_CS  
IPR014314  Succ_DH_cytb556  
IPR000701  SuccDH_FuR_B_TM-su  
Gene Ontology GO:0045281  C:succinate dehydrogenase complex  
GO:0009055  F:electron transfer activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000104  F:succinate dehydrogenase activity  
GO:0006099  P:tricarboxylic acid cycle  
Pfam View protein in Pfam  
PF01127  Sdh_cyt  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01001  SDH_CYT_2  
CDD cd03499  SQR_TypeC_SdhC  
Amino Acid Sequences MPSMALRDVQVEQNVTSPNAPDYLKKRKEEGKKQRRIHDGVFNIVTNSKRAASHSATTHLEVSRHSQGRSDKPAKMNVQRVGVRALQQVSRPNAFTQTVPRLMLASLQTRSVPRISPPPSTNSLQINNQSSPVSTEKVTPTEAQSLLASQRLHRPVAPHLSAYDYKQTWFSSSVWTRITGGGFTAALYVFSISYLAAPLTGWHLETASLAAAAGGLPLAVKGGLKFLLAWPFTFHLFNGTRHLVWDLAKGFNKPTIHAGNWGIWGASLVSALGITYFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.22
4 0.19
5 0.17
6 0.19
7 0.19
8 0.22
9 0.28
10 0.38
11 0.45
12 0.47
13 0.53
14 0.59
15 0.69
16 0.74
17 0.78
18 0.78
19 0.81
20 0.86
21 0.88
22 0.88
23 0.83
24 0.77
25 0.76
26 0.68
27 0.63
28 0.57
29 0.48
30 0.4
31 0.37
32 0.32
33 0.24
34 0.22
35 0.18
36 0.16
37 0.19
38 0.24
39 0.25
40 0.29
41 0.3
42 0.33
43 0.33
44 0.34
45 0.34
46 0.29
47 0.26
48 0.22
49 0.25
50 0.29
51 0.3
52 0.28
53 0.31
54 0.36
55 0.43
56 0.52
57 0.52
58 0.49
59 0.5
60 0.58
61 0.6
62 0.61
63 0.61
64 0.55
65 0.57
66 0.53
67 0.5
68 0.46
69 0.4
70 0.35
71 0.3
72 0.28
73 0.23
74 0.23
75 0.28
76 0.28
77 0.28
78 0.27
79 0.24
80 0.26
81 0.25
82 0.23
83 0.23
84 0.25
85 0.25
86 0.24
87 0.24
88 0.21
89 0.2
90 0.21
91 0.17
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.17
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.21
102 0.23
103 0.28
104 0.29
105 0.32
106 0.34
107 0.35
108 0.36
109 0.31
110 0.31
111 0.28
112 0.3
113 0.29
114 0.25
115 0.25
116 0.22
117 0.18
118 0.19
119 0.18
120 0.15
121 0.12
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.17
126 0.15
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.14
135 0.13
136 0.1
137 0.17
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.21
142 0.22
143 0.29
144 0.28
145 0.23
146 0.21
147 0.24
148 0.25
149 0.24
150 0.25
151 0.18
152 0.18
153 0.2
154 0.19
155 0.17
156 0.18
157 0.17
158 0.2
159 0.22
160 0.25
161 0.24
162 0.24
163 0.23
164 0.23
165 0.22
166 0.14
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.1
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.19
218 0.2
219 0.22
220 0.22
221 0.19
222 0.2
223 0.22
224 0.23
225 0.27
226 0.29
227 0.27
228 0.28
229 0.29
230 0.24
231 0.22
232 0.26
233 0.22
234 0.25
235 0.28
236 0.28
237 0.28
238 0.32
239 0.32
240 0.28
241 0.33
242 0.33
243 0.32
244 0.35
245 0.36
246 0.33
247 0.34
248 0.32
249 0.25
250 0.18
251 0.18
252 0.13
253 0.11
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05