Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553HWM6

Protein Details
Accession A0A553HWM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-267APLRRPGLLKKEKKNKFGKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-178KVRRK
251-266RRPGLLKKEKKNKFGK
302-304KKK
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11.5, nucl 9, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011666  DUF1604  
IPR000467  G_patch_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07713  DUF1604  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSFKRNRAQFEADLQAQQSPYVLFGTPLPPLDPEVRDDGSYVPVWKQEVRDEHGRKRLHGAFTGGWSAGYFNTVGSKEGWTPSTFVSSRSNRHKAEDKSSQQRVEDFMDEEDLADAAEAEKLQTAQGFAGLGSTEDDGVRRGGLADLFRVQGETMGVKLLRRMGWKDGQGIGPKVRRKARLEMGSKPGATQSAGETYLFAPDNVSMIAFIKKTDHKGLGYEGESRLTPIGNASKPEAGESSDEEMLGAPLRRPGLLKKEKKNKFGKGGIGIGILNDTGSDDEDPYEIGPKISYNRVIGGDKKKKKASTTTANPALGAVPVFRSRKNILARSSKSLRKCYDGRLPLDGFVFGTEADALVSSINTEDKYPPPQIPPGWKSSKERKAEAENANYVSTADAAKASKLDPKSRAALLGEAQLPGKSVFDFLSPEARERLASATGKSNLPPALGEVPAEFALTEAEKQQELLRQLPELDKSTAVAALARGASSSGSGPAPYADDEAKRGRYRAYLEYVAGFTKTIPAKPVGVRMQDWVRELHEFVSCARIFKPMTGLMASRFTTSSTATGSGGKGGDDLLHVPPEKPKDPAEEAAKLGMYGSMTRSVRDFYPTRLLCKRFNVRPPAHVQPDAEMESGGASKASGMSAGMGMGAGEGIAVTLDELMRQAQAAAAAGTDGGTNSNNNSNDNNNSTDRNSSTGNNQKLLEDTAQRQTQVEVKPDVNEALEGKRAQDQVLKAIFGDSSDEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.32
4 0.28
5 0.23
6 0.15
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.1
11 0.12
12 0.15
13 0.16
14 0.17
15 0.17
16 0.16
17 0.19
18 0.23
19 0.23
20 0.23
21 0.27
22 0.27
23 0.26
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.23
28 0.22
29 0.18
30 0.19
31 0.22
32 0.24
33 0.26
34 0.3
35 0.34
36 0.39
37 0.48
38 0.53
39 0.59
40 0.64
41 0.64
42 0.59
43 0.61
44 0.62
45 0.56
46 0.52
47 0.48
48 0.42
49 0.42
50 0.43
51 0.34
52 0.27
53 0.22
54 0.2
55 0.14
56 0.13
57 0.1
58 0.07
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.16
64 0.18
65 0.2
66 0.23
67 0.19
68 0.21
69 0.21
70 0.27
71 0.25
72 0.25
73 0.32
74 0.35
75 0.43
76 0.51
77 0.59
78 0.53
79 0.6
80 0.66
81 0.63
82 0.66
83 0.68
84 0.67
85 0.69
86 0.74
87 0.71
88 0.63
89 0.59
90 0.53
91 0.47
92 0.4
93 0.31
94 0.25
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.16
99 0.12
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.09
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.12
146 0.15
147 0.17
148 0.21
149 0.24
150 0.28
151 0.33
152 0.36
153 0.38
154 0.37
155 0.38
156 0.38
157 0.39
158 0.39
159 0.4
160 0.42
161 0.46
162 0.49
163 0.53
164 0.53
165 0.59
166 0.62
167 0.64
168 0.65
169 0.64
170 0.64
171 0.61
172 0.56
173 0.47
174 0.39
175 0.3
176 0.26
177 0.19
178 0.15
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.15
185 0.15
186 0.13
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.12
198 0.16
199 0.2
200 0.24
201 0.26
202 0.25
203 0.26
204 0.29
205 0.29
206 0.27
207 0.26
208 0.22
209 0.2
210 0.19
211 0.18
212 0.16
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.15
217 0.16
218 0.17
219 0.19
220 0.2
221 0.2
222 0.21
223 0.19
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.12
234 0.1
235 0.07
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.15
241 0.25
242 0.35
243 0.43
244 0.51
245 0.61
246 0.68
247 0.76
248 0.81
249 0.78
250 0.76
251 0.73
252 0.68
253 0.61
254 0.56
255 0.47
256 0.39
257 0.31
258 0.22
259 0.17
260 0.11
261 0.07
262 0.05
263 0.04
264 0.03
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.11
278 0.13
279 0.15
280 0.13
281 0.15
282 0.18
283 0.19
284 0.25
285 0.33
286 0.41
287 0.45
288 0.51
289 0.55
290 0.55
291 0.57
292 0.59
293 0.57
294 0.57
295 0.58
296 0.6
297 0.6
298 0.57
299 0.53
300 0.44
301 0.36
302 0.26
303 0.18
304 0.1
305 0.06
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.17
310 0.18
311 0.25
312 0.31
313 0.35
314 0.36
315 0.45
316 0.47
317 0.5
318 0.54
319 0.53
320 0.52
321 0.54
322 0.49
323 0.45
324 0.45
325 0.44
326 0.47
327 0.47
328 0.44
329 0.42
330 0.4
331 0.35
332 0.33
333 0.27
334 0.18
335 0.12
336 0.11
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.07
352 0.09
353 0.13
354 0.14
355 0.16
356 0.17
357 0.2
358 0.21
359 0.27
360 0.28
361 0.32
362 0.34
363 0.36
364 0.4
365 0.47
366 0.54
367 0.5
368 0.5
369 0.47
370 0.49
371 0.54
372 0.53
373 0.47
374 0.4
375 0.38
376 0.35
377 0.31
378 0.25
379 0.16
380 0.12
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.12
389 0.14
390 0.19
391 0.2
392 0.23
393 0.26
394 0.25
395 0.26
396 0.22
397 0.21
398 0.17
399 0.17
400 0.15
401 0.13
402 0.12
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.18
425 0.2
426 0.2
427 0.2
428 0.21
429 0.17
430 0.16
431 0.15
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.09
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.07
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.09
450 0.13
451 0.15
452 0.17
453 0.17
454 0.16
455 0.18
456 0.19
457 0.2
458 0.19
459 0.18
460 0.15
461 0.15
462 0.14
463 0.14
464 0.12
465 0.1
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.13
486 0.17
487 0.22
488 0.23
489 0.23
490 0.23
491 0.25
492 0.29
493 0.3
494 0.32
495 0.29
496 0.28
497 0.29
498 0.28
499 0.25
500 0.2
501 0.16
502 0.1
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.15
507 0.16
508 0.2
509 0.21
510 0.28
511 0.27
512 0.29
513 0.29
514 0.31
515 0.34
516 0.33
517 0.33
518 0.27
519 0.24
520 0.22
521 0.22
522 0.19
523 0.17
524 0.15
525 0.14
526 0.2
527 0.18
528 0.18
529 0.18
530 0.21
531 0.2
532 0.2
533 0.24
534 0.18
535 0.2
536 0.2
537 0.2
538 0.17
539 0.21
540 0.21
541 0.18
542 0.17
543 0.16
544 0.16
545 0.16
546 0.15
547 0.13
548 0.13
549 0.13
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.12
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.08
559 0.1
560 0.09
561 0.12
562 0.13
563 0.13
564 0.18
565 0.24
566 0.25
567 0.26
568 0.27
569 0.31
570 0.35
571 0.4
572 0.41
573 0.38
574 0.37
575 0.36
576 0.33
577 0.26
578 0.22
579 0.16
580 0.11
581 0.09
582 0.1
583 0.15
584 0.16
585 0.16
586 0.18
587 0.19
588 0.19
589 0.25
590 0.25
591 0.22
592 0.33
593 0.34
594 0.39
595 0.45
596 0.49
597 0.48
598 0.55
599 0.6
600 0.58
601 0.65
602 0.69
603 0.65
604 0.67
605 0.69
606 0.68
607 0.65
608 0.6
609 0.52
610 0.44
611 0.45
612 0.4
613 0.34
614 0.24
615 0.18
616 0.16
617 0.15
618 0.12
619 0.08
620 0.05
621 0.05
622 0.06
623 0.06
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.05
630 0.05
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.03
635 0.02
636 0.02
637 0.02
638 0.02
639 0.02
640 0.02
641 0.03
642 0.03
643 0.04
644 0.05
645 0.05
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.05
658 0.05
659 0.06
660 0.07
661 0.08
662 0.1
663 0.17
664 0.18
665 0.21
666 0.23
667 0.27
668 0.31
669 0.34
670 0.37
671 0.33
672 0.35
673 0.35
674 0.38
675 0.35
676 0.32
677 0.31
678 0.29
679 0.36
680 0.42
681 0.45
682 0.43
683 0.43
684 0.4
685 0.4
686 0.42
687 0.36
688 0.33
689 0.32
690 0.37
691 0.38
692 0.38
693 0.36
694 0.35
695 0.37
696 0.36
697 0.38
698 0.34
699 0.33
700 0.34
701 0.36
702 0.35
703 0.29
704 0.25
705 0.22
706 0.2
707 0.24
708 0.22
709 0.22
710 0.27
711 0.27
712 0.27
713 0.31
714 0.29
715 0.33
716 0.35
717 0.34
718 0.28
719 0.28
720 0.26
721 0.2
722 0.22