FuNGI

A0A553HTR8

Protein Details

Accession

A0A553HTR8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
163-187	HEPPEESRRAKRRKLDSDRLCSNFR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
170-175	RRAKRR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002769 eIF6
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0042256 P:cytosolic ribosome assembly GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000054 P:ribosomal subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF01912 eIF-6
CDD	cd00527 IF6

Amino Acid Sequences

MSSNDNPETQRAPSRGPRSSNASPRGNLPTSAPVLPPLRSLGTRRLSAMSPSNNHRAPPVRSIGRTAEPLQSRYSDRPNFDLADTLYDPYFQAFFQDAEDISDPESHRDSPAGTQPPQYRGYSPVFGTEDENHSRLRALLDYTHSASPTLPDLFSSLTPPQRHEPPEESRRAKRRKLDSDRLCSNFRGFQYGKYGQVQPGHLTMELVSCDGGIYLDDTTKYDVKNILRNDHEVYCTEGPRCNIVLRHQGATAFTLKELVIKAPRSNFTSPVQAGMVFISMTHDHLLNRTAQYQIQYSPTRSARRTERDLPLNPIVSIRHNEDGSTMTRAQVRARRLYNMGLDDEDNDSCLAQIPSEFTVCPPPCQVTIECSNDEEEEESDDLNMRLNEQAPNRIGSLPFENNSSDDDEEPDDLSVDGTDYRSRQRWNRSRTALAEAAEAAQVATQEAVRAVGGELMTPSARFYIEPHKSTCTIRFNPPISGRFILLKMWSPRRSANANIDIQAVIAKGFAGPRFFPSVELRDPGKAGEIILSHPDELLQSESRIEQAASRTSAQRIRYPDEQLRINLDTSSSSIILTITSESSVQVSSNIMAVRAQFENSNEVGVFSTLTNSYALTAIGASENFYSVFEAELQDVIPICRTTIAGTRIIGRLTAGNRKGLLVPTTTTDQELQHLRNSLPDEIRIQRIEERLSALGNVIVTNDHIALVHPDLERETEEIIADVLGVEVFRQTVADNVLVGSYMSLSNRGGLVHPKTSIQDQDELSSLLQVPLVAGSVNRGSNVVGAGMVVNDWMAVTGLDTTATELSVIESVFRLGEGAAPGNINTNLKDTMAFTAKAFSSGCIGVSYEDLGPQIRGFKAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.57
3	0.6
4	0.61
5	0.62
6	0.68
7	0.71
8	0.7
9	0.67
10	0.61
11	0.61
12	0.64
13	0.57
14	0.49
15	0.42
16	0.41
17	0.38
18	0.38
19	0.33
20	0.31
21	0.31
22	0.31
23	0.3
24	0.26
25	0.26
26	0.27
27	0.31
28	0.35
29	0.38
30	0.39
31	0.4
32	0.39
33	0.37
34	0.39
35	0.43
36	0.42
37	0.42
38	0.46
39	0.53
40	0.51
41	0.5
42	0.52
43	0.51
44	0.48
45	0.49
46	0.52
47	0.5
48	0.5
49	0.54
50	0.53
51	0.5
52	0.5
53	0.45
54	0.44
55	0.42
56	0.42
57	0.4
58	0.38
59	0.39
60	0.4
61	0.47
62	0.46
63	0.45
64	0.47
65	0.48
66	0.47
67	0.42
68	0.4
69	0.31
70	0.31
71	0.28
72	0.26
73	0.22
74	0.2
75	0.19
76	0.16
77	0.16
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.12
83	0.14
84	0.13
85	0.16
86	0.17
87	0.15
88	0.15
89	0.19
90	0.18
91	0.2
92	0.23
93	0.2
94	0.19
95	0.2
96	0.2
97	0.2
98	0.29
99	0.32
100	0.31
101	0.38
102	0.42
103	0.46
104	0.48
105	0.46
106	0.39
107	0.38
108	0.41
109	0.37
110	0.33
111	0.34
112	0.31
113	0.3
114	0.32
115	0.3
116	0.31
117	0.31
118	0.32
119	0.26
120	0.25
121	0.24
122	0.22
123	0.21
124	0.17
125	0.15
126	0.17
127	0.21
128	0.25
129	0.27
130	0.28
131	0.26
132	0.24
133	0.22
134	0.2
135	0.19
136	0.17
137	0.13
138	0.12
139	0.14
140	0.15
141	0.15
142	0.18
143	0.19
144	0.24
145	0.26
146	0.29
147	0.33
148	0.39
149	0.42
150	0.44
151	0.45
152	0.48
153	0.56
154	0.62
155	0.63
156	0.65
157	0.73
158	0.76
159	0.77
160	0.77
161	0.78
162	0.8
163	0.83
164	0.85
165	0.84
166	0.84
167	0.85
168	0.8
169	0.72
170	0.63
171	0.56
172	0.5
173	0.4
174	0.4
175	0.32
176	0.3
177	0.36
178	0.37
179	0.38
180	0.37
181	0.39
182	0.34
183	0.37
184	0.36
185	0.29
186	0.28
187	0.26
188	0.22
189	0.2
190	0.16
191	0.14
192	0.12
193	0.11
194	0.08
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.04
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.07
204	0.08
205	0.11
206	0.13
207	0.13
208	0.15
209	0.2
210	0.22
211	0.29
212	0.32
213	0.35
214	0.35
215	0.38
216	0.39
217	0.36
218	0.34
219	0.28
220	0.3
221	0.27
222	0.27
223	0.25
224	0.25
225	0.23
226	0.25
227	0.25
228	0.22
229	0.22
230	0.25
231	0.32
232	0.32
233	0.32
234	0.3
235	0.3
236	0.27
237	0.27
238	0.25
239	0.16
240	0.13
241	0.13
242	0.12
243	0.14
244	0.14
245	0.14
246	0.16
247	0.18
248	0.22
249	0.25
250	0.28
251	0.31
252	0.32
253	0.33
254	0.3
255	0.34
256	0.31
257	0.29
258	0.26
259	0.21
260	0.2
261	0.16
262	0.14
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.1
272	0.12
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.14
277	0.14
278	0.16
279	0.17
280	0.17
281	0.21
282	0.22
283	0.23
284	0.28
285	0.32
286	0.36
287	0.36
288	0.4
289	0.43
290	0.48
291	0.53
292	0.54
293	0.56
294	0.58
295	0.59
296	0.59
297	0.54
298	0.48
299	0.4
300	0.34
301	0.28
302	0.23
303	0.23
304	0.2
305	0.19
306	0.18
307	0.18
308	0.17
309	0.18
310	0.17
311	0.19
312	0.16
313	0.15
314	0.17
315	0.18
316	0.22
317	0.25
318	0.27
319	0.3
320	0.32
321	0.34
322	0.33
323	0.35
324	0.34
325	0.3
326	0.27
327	0.2
328	0.19
329	0.17
330	0.17
331	0.14
332	0.11
333	0.09
334	0.08
335	0.07
336	0.09
337	0.08
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.17
346	0.17
347	0.18
348	0.18
349	0.18
350	0.18
351	0.21
352	0.21
353	0.16
354	0.22
355	0.24
356	0.24
357	0.23
358	0.23
359	0.2
360	0.2
361	0.16
362	0.1
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.08
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.09
374	0.13
375	0.13
376	0.17
377	0.16
378	0.18
379	0.18
380	0.18
381	0.17
382	0.15
383	0.18
384	0.16
385	0.15
386	0.15
387	0.15
388	0.15
389	0.16
390	0.16
391	0.12
392	0.11
393	0.11
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.09
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.05
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.06
406	0.07
407	0.1
408	0.13
409	0.17
410	0.23
411	0.33
412	0.41
413	0.48
414	0.55
415	0.57
416	0.57
417	0.56
418	0.55
419	0.47
420	0.38
421	0.31
422	0.22
423	0.19
424	0.15
425	0.12
426	0.07
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.04
435	0.03
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.05
448	0.05
449	0.07
450	0.17
451	0.22
452	0.24
453	0.26
454	0.28
455	0.3
456	0.31
457	0.35
458	0.34
459	0.32
460	0.36
461	0.41
462	0.4
463	0.43
464	0.45
465	0.41
466	0.37
467	0.34
468	0.29
469	0.24
470	0.23
471	0.19
472	0.16
473	0.19
474	0.2
475	0.27
476	0.29
477	0.29
478	0.31
479	0.34
480	0.36
481	0.35
482	0.37
483	0.36
484	0.35
485	0.34
486	0.32
487	0.28
488	0.25
489	0.21
490	0.13
491	0.07
492	0.05
493	0.04
494	0.04
495	0.06
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.1
500	0.14
501	0.14
502	0.17
503	0.19
504	0.22
505	0.22
506	0.25
507	0.24
508	0.21
509	0.21
510	0.18
511	0.17
512	0.12
513	0.11
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.11
518	0.11
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.08
523	0.08
524	0.1
525	0.08
526	0.08
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.09
532	0.09
533	0.11
534	0.13
535	0.15
536	0.16
537	0.17
538	0.2
539	0.25
540	0.25
541	0.28
542	0.29
543	0.33
544	0.35
545	0.4
546	0.41
547	0.41
548	0.42
549	0.38
550	0.37
551	0.34
552	0.3
553	0.24
554	0.19
555	0.15
556	0.13
557	0.14
558	0.1
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.07
575	0.09
576	0.09
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.11
581	0.11
582	0.11
583	0.1
584	0.11
585	0.15
586	0.14
587	0.15
588	0.12
589	0.12
590	0.12
591	0.1
592	0.1
593	0.06
594	0.08
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.06
603	0.06
604	0.05
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.07
612	0.07
613	0.06
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.07
620	0.07
621	0.08
622	0.07
623	0.08
624	0.08
625	0.07
626	0.08
627	0.08
628	0.09
629	0.15
630	0.18
631	0.18
632	0.19
633	0.22
634	0.23
635	0.23
636	0.21
637	0.15
638	0.17
639	0.18
640	0.26
641	0.24
642	0.25
643	0.26
644	0.27
645	0.28
646	0.26
647	0.24
648	0.18
649	0.17
650	0.18
651	0.2
652	0.2
653	0.19
654	0.19
655	0.17
656	0.2
657	0.24
658	0.23
659	0.23
660	0.25
661	0.24
662	0.26
663	0.29
664	0.29
665	0.26
666	0.26
667	0.28
668	0.29
669	0.33
670	0.3
671	0.29
672	0.29
673	0.31
674	0.31
675	0.27
676	0.27
677	0.23
678	0.22
679	0.2
680	0.16
681	0.14
682	0.12
683	0.11
684	0.08
685	0.07
686	0.07
687	0.08
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.07
692	0.09
693	0.1
694	0.13
695	0.12
696	0.13
697	0.13
698	0.15
699	0.15
700	0.14
701	0.14
702	0.11
703	0.11
704	0.1
705	0.1
706	0.08
707	0.07
708	0.05
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.07
719	0.09
720	0.1
721	0.09
722	0.09
723	0.1
724	0.09
725	0.09
726	0.07
727	0.06
728	0.07
729	0.07
730	0.09
731	0.09
732	0.1
733	0.11
734	0.11
735	0.12
736	0.18
737	0.23
738	0.24
739	0.25
740	0.26
741	0.28
742	0.31
743	0.34
744	0.3
745	0.31
746	0.29
747	0.3
748	0.29
749	0.28
750	0.24
751	0.21
752	0.18
753	0.13
754	0.12
755	0.1
756	0.09
757	0.07
758	0.08
759	0.06
760	0.05
761	0.08
762	0.11
763	0.12
764	0.12
765	0.12
766	0.12
767	0.13
768	0.14
769	0.11
770	0.07
771	0.07
772	0.07
773	0.06
774	0.06
775	0.05
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.04
783	0.05
784	0.05
785	0.06
786	0.06
787	0.08
788	0.08
789	0.08
790	0.07
791	0.07
792	0.08
793	0.09
794	0.09
795	0.08
796	0.08
797	0.09
798	0.08
799	0.08
800	0.07
801	0.06
802	0.09
803	0.1
804	0.11
805	0.12
806	0.12
807	0.13
808	0.16
809	0.18
810	0.17
811	0.16
812	0.18
813	0.18
814	0.18
815	0.19
816	0.17
817	0.21
818	0.24
819	0.24
820	0.2
821	0.25
822	0.24
823	0.26
824	0.25
825	0.19
826	0.19
827	0.19
828	0.19
829	0.15
830	0.15
831	0.13
832	0.14
833	0.15
834	0.12
835	0.12
836	0.13
837	0.13
838	0.13
839	0.14
840	0.17

A0A553HTR8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer