Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HS79

Protein Details
Accession A0A553HS79    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-163RRYNMDKKKTTKKTSKNSSDSHydrophilic
225-244MQLAEKRRRKEVKLNNPKGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-237EKRRRKEVK
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MASPGTPKTMSSRLLTMKFMQRAAASTPSTPGTPPPNDQSNKRRKVSHNTTPQENVDTLVNQAAIQAAIAEEEKKVESALLKRAEELGDAHWVLDVPPQAKGHTVRTPLNVIQVGFAQIDSSDILGNESDPAGTLHESVPALRRYNMDKKKTTKKTSKNSSDSGSESESDSGSDSDSDSDSDISSSEETSGRQSFGSKSRVTSTIQSSAKTLPKGKKSTEQLKAMQLAEKRRRKEVKLNNPKGGIISISSGGGPSPRPSVSFTCFKCGQRGHKAIDCKNPGNRTVTNFDFGSIPAAASRWSREYTWVETQTQRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.44
3 0.44
4 0.47
5 0.47
6 0.45
7 0.4
8 0.34
9 0.33
10 0.34
11 0.34
12 0.27
13 0.24
14 0.26
15 0.25
16 0.25
17 0.23
18 0.25
19 0.26
20 0.28
21 0.32
22 0.35
23 0.43
24 0.47
25 0.55
26 0.6
27 0.64
28 0.69
29 0.7
30 0.72
31 0.7
32 0.77
33 0.78
34 0.78
35 0.78
36 0.74
37 0.75
38 0.71
39 0.65
40 0.57
41 0.48
42 0.39
43 0.29
44 0.24
45 0.19
46 0.16
47 0.14
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.07
52 0.06
53 0.05
54 0.04
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.05
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.11
65 0.14
66 0.22
67 0.26
68 0.25
69 0.26
70 0.27
71 0.27
72 0.23
73 0.21
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.1
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.17
88 0.2
89 0.22
90 0.25
91 0.29
92 0.29
93 0.31
94 0.34
95 0.31
96 0.33
97 0.29
98 0.23
99 0.2
100 0.17
101 0.16
102 0.12
103 0.11
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.17
131 0.21
132 0.32
133 0.4
134 0.42
135 0.46
136 0.52
137 0.62
138 0.69
139 0.72
140 0.72
141 0.74
142 0.77
143 0.81
144 0.83
145 0.78
146 0.71
147 0.65
148 0.57
149 0.49
150 0.41
151 0.32
152 0.23
153 0.18
154 0.16
155 0.13
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.14
182 0.2
183 0.24
184 0.22
185 0.23
186 0.25
187 0.27
188 0.28
189 0.29
190 0.28
191 0.31
192 0.32
193 0.3
194 0.29
195 0.32
196 0.34
197 0.33
198 0.36
199 0.34
200 0.42
201 0.46
202 0.48
203 0.52
204 0.56
205 0.62
206 0.63
207 0.62
208 0.57
209 0.57
210 0.58
211 0.5
212 0.46
213 0.4
214 0.42
215 0.46
216 0.5
217 0.48
218 0.54
219 0.6
220 0.62
221 0.68
222 0.69
223 0.71
224 0.75
225 0.81
226 0.77
227 0.72
228 0.66
229 0.57
230 0.46
231 0.35
232 0.25
233 0.18
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.13
243 0.13
244 0.15
245 0.19
246 0.24
247 0.28
248 0.35
249 0.35
250 0.38
251 0.43
252 0.43
253 0.47
254 0.49
255 0.53
256 0.55
257 0.6
258 0.6
259 0.6
260 0.68
261 0.67
262 0.7
263 0.68
264 0.64
265 0.66
266 0.64
267 0.61
268 0.58
269 0.55
270 0.51
271 0.5
272 0.47
273 0.43
274 0.39
275 0.36
276 0.3
277 0.27
278 0.24
279 0.17
280 0.15
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.14
285 0.18
286 0.18
287 0.21
288 0.22
289 0.28
290 0.32
291 0.37
292 0.44
293 0.45
294 0.46