FuNGI

A0A553HNX1

Protein Details

Accession

A0A553HNX1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
241-263	LENAPPRPKKWIRRSGWTRYPAD	Hydrophilic
372-395	CSQQRPTWMKHKKSRELRDKIAKE	Hydrophilic
897-920	YANTKGTKTNRKSLHKRPFWRGGT	Hydrophilic
1158-1182	GGSSSSSSPRKPRQRKILPYSSQAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
569-587	VKGKKKGDPPRPAARQKKP

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 6, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019760 DNA-dir_DNA_pol_A_CS IPR002297 DNA-dir_DNA_pol_A_mt IPR001098 DNA-dir_DNA_pol_A_palm_dom IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041336 DNApol_Exo IPR047580 POLG_palm_dom IPR012337 RNaseH-like_sf
Gene Ontology	GO:0005760 C:gamma DNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0006260 P:DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF00476 DNA_pol_A PF18136 DNApol_Exo
PROSITE	View protein in PROSITE PS00447 DNA_POLYMERASE_A
CDD	cd08641 DNA_pol_gammaA

Amino Acid Sequences

MRSTLTIDLRLAFGIELNSVQRVHKIVFTSAHKLLSNRQFLPLAIRPTHWLQMLPVMNKCLGVTQARKVDTYLTIQTMKEVQPLPTGEQLKEVMRPYERRIDSELRAPCEASGAVAATALALVVASKMADECSSDCDPGARRYVVSFPSEARFNEIGVQHLSSHVHKQVFLNKSVPPPNELVNLSKDHLRRHNLLGKNTDNTAPIAFDIPQIQGRTLDEHFHKLGADCAEPFLSYAKQFALENAPPRPKKWIRRSGWTRYPADGSKPSHVEAPDENMLCFDVEVMWKESSFAVMACAMSPTAWYAWLSPWLLGESDSDKHLIPLGNPSRDRVIVGHNIGYDRARILEEYDLKQTRNSFLDTMSLHVAVNGMCSQQRPTWMKHKKSRELRDKIAKETQDLDLANLLASNSLRDDEEELWVERSSINSLRDVAKFHLNTTIDKDARNDFGELDRDGIVNKLDQLLDYCAADVAVTHRVYKIVFPNFLEVCPHPVSFAALRHLSSVILPVDRSWDSYIANAEATYHKLSDAVQERLIGLTEKALAIKDDEDKWSTDPWLKQLDWSGQEIKMVKGKKKGDPPRPAARQKKPGMPQWYKGLFLKSNGPMNLTVRSRIAPLLLRLAWDGYPLHWSDKYGWTFRVPLEDASKYSSTQLVRCDFSDEAIEALKNDEKALYFKLPHKDGPTARCCNPLAKSYLAYFDKGTLSSEYPYAKEALDMNASCSYWISARDRIMSQMVVYESDRASNTISNQHGYILPQIIPMGTITRRAVENTWLTASNAKKNRVGSELKAMVKAPPGYSFVGADVDSEELWIASVIGDATFKLHGGNAIGFMTLEGTKAAGTDLHSRTASILGITRNDAKVFNYGRIYGAGLKFAATLLRQFNPSLSEQETLDVAGKLYANTKGTKTNRKSLHKRPFWRGGTESFVFNKLEEFAEQERPRTPVLGAGITEALMGRFISKGAYLTSRINWAIQSSGVDYLHLLIVSMDYLVRRFNINARLAISVHDEIRYLVKNEDKYRAAMALQVSNLWTRAMFAQQVGIDDLPQACAYFSAVDIDHVLRKEVDMDCVTPSHSTPIHAGESIDIVQLLEKGSDAFLDPAIIPANHAPKLEDISYTPRVPIMQSLSMDQTLKDLSFLKAQITNDDQELRDILKNQKKSSGGGSSSSSSPRKPRQRKILPYSSQAELIPHMYEPFEAKFPSNSNFNGGDWTFEKMPPRTGRGSWPRL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.1
3	0.11
4	0.11
5	0.14
6	0.14
7	0.15
8	0.17
9	0.19
10	0.2
11	0.22
12	0.24
13	0.26
14	0.32
15	0.37
16	0.4
17	0.41
18	0.43
19	0.41
20	0.4
21	0.46
22	0.48
23	0.5
24	0.45
25	0.46
26	0.43
27	0.41
28	0.47
29	0.44
30	0.42
31	0.36
32	0.36
33	0.37
34	0.4
35	0.44
36	0.37
37	0.32
38	0.26
39	0.32
40	0.37
41	0.36
42	0.35
43	0.33
44	0.32
45	0.32
46	0.31
47	0.24
48	0.21
49	0.25
50	0.26
51	0.31
52	0.38
53	0.39
54	0.39
55	0.38
56	0.38
57	0.34
58	0.35
59	0.31
60	0.28
61	0.29
62	0.29
63	0.3
64	0.31
65	0.29
66	0.3
67	0.28
68	0.25
69	0.28
70	0.31
71	0.32
72	0.35
73	0.37
74	0.31
75	0.33
76	0.33
77	0.3
78	0.32
79	0.32
80	0.29
81	0.33
82	0.37
83	0.39
84	0.47
85	0.47
86	0.45
87	0.5
88	0.51
89	0.48
90	0.52
91	0.52
92	0.46
93	0.46
94	0.43
95	0.36
96	0.32
97	0.28
98	0.2
99	0.15
100	0.12
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.06
105	0.06
106	0.05
107	0.04
108	0.02
109	0.03
110	0.03
111	0.03
112	0.03
113	0.04
114	0.04
115	0.05
116	0.06
117	0.08
118	0.09
119	0.15
120	0.17
121	0.17
122	0.17
123	0.2
124	0.23
125	0.25
126	0.3
127	0.26
128	0.24
129	0.26
130	0.32
131	0.31
132	0.31
133	0.28
134	0.25
135	0.28
136	0.31
137	0.29
138	0.31
139	0.28
140	0.25
141	0.29
142	0.27
143	0.26
144	0.24
145	0.25
146	0.18
147	0.19
148	0.22
149	0.19
150	0.23
151	0.26
152	0.26
153	0.26
154	0.3
155	0.37
156	0.39
157	0.4
158	0.38
159	0.36
160	0.42
161	0.48
162	0.45
163	0.4
164	0.37
165	0.36
166	0.38
167	0.36
168	0.32
169	0.28
170	0.3
171	0.28
172	0.32
173	0.32
174	0.34
175	0.4
176	0.43
177	0.44
178	0.49
179	0.57
180	0.57
181	0.6
182	0.61
183	0.57
184	0.54
185	0.52
186	0.45
187	0.38
188	0.33
189	0.27
190	0.2
191	0.16
192	0.15
193	0.13
194	0.12
195	0.13
196	0.13
197	0.17
198	0.17
199	0.17
200	0.17
201	0.18
202	0.21
203	0.2
204	0.24
205	0.23
206	0.27
207	0.27
208	0.26
209	0.26
210	0.22
211	0.25
212	0.21
213	0.2
214	0.15
215	0.16
216	0.16
217	0.15
218	0.15
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.12
223	0.11
224	0.13
225	0.13
226	0.14
227	0.19
228	0.21
229	0.26
230	0.32
231	0.41
232	0.41
233	0.42
234	0.5
235	0.52
236	0.59
237	0.65
238	0.68
239	0.65
240	0.75
241	0.83
242	0.83
243	0.84
244	0.81
245	0.73
246	0.66
247	0.65
248	0.56
249	0.53
250	0.5
251	0.45
252	0.43
253	0.42
254	0.39
255	0.38
256	0.36
257	0.33
258	0.27
259	0.29
260	0.28
261	0.27
262	0.26
263	0.22
264	0.22
265	0.18
266	0.17
267	0.1
268	0.06
269	0.07
270	0.09
271	0.12
272	0.12
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.13
277	0.12
278	0.09
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.07
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.09
293	0.13
294	0.14
295	0.13
296	0.13
297	0.13
298	0.13
299	0.12
300	0.13
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.13
305	0.12
306	0.12
307	0.15
308	0.14
309	0.12
310	0.21
311	0.27
312	0.32
313	0.33
314	0.34
315	0.34
316	0.34
317	0.34
318	0.25
319	0.24
320	0.23
321	0.25
322	0.25
323	0.23
324	0.23
325	0.23
326	0.22
327	0.17
328	0.11
329	0.11
330	0.1
331	0.09
332	0.1
333	0.15
334	0.18
335	0.2
336	0.27
337	0.28
338	0.28
339	0.3
340	0.3
341	0.28
342	0.26
343	0.26
344	0.2
345	0.18
346	0.22
347	0.2
348	0.2
349	0.18
350	0.16
351	0.14
352	0.13
353	0.13
354	0.09
355	0.1
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.12
361	0.12
362	0.21
363	0.23
364	0.27
365	0.38
366	0.47
367	0.56
368	0.62
369	0.71
370	0.73
371	0.8
372	0.86
373	0.86
374	0.84
375	0.83
376	0.85
377	0.78
378	0.74
379	0.71
380	0.61
381	0.52
382	0.47
383	0.39
384	0.32
385	0.29
386	0.23
387	0.17
388	0.16
389	0.13
390	0.11
391	0.09
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.1
400	0.09
401	0.12
402	0.13
403	0.13
404	0.14
405	0.14
406	0.14
407	0.11
408	0.11
409	0.12
410	0.14
411	0.15
412	0.14
413	0.16
414	0.19
415	0.2
416	0.22
417	0.21
418	0.24
419	0.24
420	0.23
421	0.28
422	0.25
423	0.25
424	0.28
425	0.33
426	0.27
427	0.27
428	0.29
429	0.25
430	0.26
431	0.27
432	0.22
433	0.15
434	0.17
435	0.18
436	0.16
437	0.16
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.1
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.08
449	0.1
450	0.1
451	0.09
452	0.09
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.06
457	0.06
458	0.1
459	0.1
460	0.11
461	0.11
462	0.12
463	0.12
464	0.15
465	0.2
466	0.19
467	0.21
468	0.21
469	0.25
470	0.25
471	0.25
472	0.25
473	0.18
474	0.2
475	0.2
476	0.19
477	0.14
478	0.14
479	0.16
480	0.15
481	0.16
482	0.15
483	0.14
484	0.14
485	0.15
486	0.15
487	0.13
488	0.11
489	0.12
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.08
494	0.11
495	0.11
496	0.13
497	0.11
498	0.12
499	0.11
500	0.12
501	0.13
502	0.1
503	0.1
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.1
508	0.1
509	0.09
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.15
514	0.18
515	0.18
516	0.18
517	0.18
518	0.18
519	0.18
520	0.18
521	0.12
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.09
532	0.1
533	0.12
534	0.13
535	0.14
536	0.14
537	0.15
538	0.15
539	0.17
540	0.16
541	0.18
542	0.22
543	0.21
544	0.21
545	0.22
546	0.25
547	0.22
548	0.24
549	0.22
550	0.18
551	0.2
552	0.2
553	0.18
554	0.19
555	0.21
556	0.22
557	0.27
558	0.31
559	0.35
560	0.45
561	0.53
562	0.59
563	0.64
564	0.68
565	0.7
566	0.75
567	0.78
568	0.78
569	0.76
570	0.76
571	0.71
572	0.71
573	0.66
574	0.65
575	0.66
576	0.6
577	0.55
578	0.53
579	0.51
580	0.44
581	0.4
582	0.36
583	0.27
584	0.25
585	0.28
586	0.22
587	0.24
588	0.23
589	0.23
590	0.21
591	0.21
592	0.24
593	0.19
594	0.18
595	0.15
596	0.15
597	0.15
598	0.14
599	0.14
600	0.1
601	0.1
602	0.13
603	0.12
604	0.12
605	0.11
606	0.12
607	0.1
608	0.1
609	0.09
610	0.06
611	0.08
612	0.09
613	0.1
614	0.1
615	0.11
616	0.12
617	0.19
618	0.21
619	0.21
620	0.21
621	0.21
622	0.22
623	0.22
624	0.23
625	0.17
626	0.16
627	0.18
628	0.18
629	0.17
630	0.19
631	0.2
632	0.16
633	0.16
634	0.17
635	0.15
636	0.16
637	0.2
638	0.19
639	0.2
640	0.2
641	0.22
642	0.18
643	0.18
644	0.17
645	0.12
646	0.1
647	0.09
648	0.09
649	0.06
650	0.07
651	0.08
652	0.07
653	0.07
654	0.07
655	0.07
656	0.09
657	0.11
658	0.12
659	0.14
660	0.19
661	0.24
662	0.26
663	0.28
664	0.3
665	0.33
666	0.35
667	0.39
668	0.42
669	0.41
670	0.4
671	0.43
672	0.4
673	0.38
674	0.36
675	0.32
676	0.28
677	0.24
678	0.24
679	0.2
680	0.26
681	0.23
682	0.22
683	0.19
684	0.17
685	0.17
686	0.16
687	0.16
688	0.12
689	0.12
690	0.12
691	0.14
692	0.13
693	0.12
694	0.13
695	0.13
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.1
700	0.13
701	0.12
702	0.14
703	0.14
704	0.14
705	0.13
706	0.12
707	0.11
708	0.09
709	0.12
710	0.13
711	0.15
712	0.16
713	0.19
714	0.19
715	0.2
716	0.2
717	0.18
718	0.14
719	0.13
720	0.12
721	0.11
722	0.11
723	0.11
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.1
728	0.11
729	0.11
730	0.12
731	0.16
732	0.17
733	0.16
734	0.16
735	0.17
736	0.16
737	0.16
738	0.16
739	0.12
740	0.11
741	0.11
742	0.1
743	0.09
744	0.09
745	0.08
746	0.09
747	0.07
748	0.1
749	0.1
750	0.12
751	0.12
752	0.14
753	0.14
754	0.17
755	0.18
756	0.17
757	0.18
758	0.17
759	0.17
760	0.21
761	0.22
762	0.25
763	0.29
764	0.31
765	0.33
766	0.34
767	0.36
768	0.37
769	0.38
770	0.32
771	0.35
772	0.38
773	0.35
774	0.35
775	0.33
776	0.28
777	0.28
778	0.27
779	0.2
780	0.16
781	0.17
782	0.17
783	0.17
784	0.16
785	0.13
786	0.13
787	0.12
788	0.1
789	0.08
790	0.08
791	0.07
792	0.07
793	0.06
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.04
798	0.03
799	0.03
800	0.03
801	0.03
802	0.04
803	0.04
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.06
810	0.07
811	0.07
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.07
818	0.06
819	0.06
820	0.05
821	0.05
822	0.05
823	0.05
824	0.06
825	0.05
826	0.07
827	0.15
828	0.17
829	0.19
830	0.2
831	0.2
832	0.2
833	0.2
834	0.18
835	0.11
836	0.12
837	0.11
838	0.12
839	0.14
840	0.16
841	0.16
842	0.17
843	0.17
844	0.15
845	0.21
846	0.21
847	0.23
848	0.22
849	0.22
850	0.22
851	0.22
852	0.22
853	0.19
854	0.18
855	0.15
856	0.14
857	0.13
858	0.13
859	0.12
860	0.12
861	0.07
862	0.11
863	0.13
864	0.14
865	0.16
866	0.16
867	0.16
868	0.18
869	0.2
870	0.19
871	0.18
872	0.18
873	0.17
874	0.18
875	0.17
876	0.14
877	0.14
878	0.11
879	0.09
880	0.08
881	0.09
882	0.08
883	0.1
884	0.13
885	0.13
886	0.15
887	0.17
888	0.25
889	0.31
890	0.42
891	0.45
892	0.51
893	0.59
894	0.67
895	0.75
896	0.77
897	0.81
898	0.8
899	0.83
900	0.83
901	0.84
902	0.77
903	0.74
904	0.66
905	0.59
906	0.55
907	0.48
908	0.43
909	0.34
910	0.33
911	0.27
912	0.23
913	0.21
914	0.15
915	0.15
916	0.12
917	0.15
918	0.16
919	0.25
920	0.26
921	0.27
922	0.28
923	0.29
924	0.29
925	0.26
926	0.23
927	0.18
928	0.19
929	0.19
930	0.17
931	0.16
932	0.16
933	0.14
934	0.14
935	0.1
936	0.07
937	0.06
938	0.06
939	0.05
940	0.05
941	0.05
942	0.06
943	0.06
944	0.07
945	0.09
946	0.11
947	0.14
948	0.16
949	0.17
950	0.21
951	0.21
952	0.21
953	0.2
954	0.18
955	0.17
956	0.15
957	0.15
958	0.12
959	0.14
960	0.13
961	0.13
962	0.12
963	0.12
964	0.12
965	0.1
966	0.09
967	0.05
968	0.06
969	0.06
970	0.06
971	0.05
972	0.05
973	0.06
974	0.07
975	0.08
976	0.1
977	0.11
978	0.17
979	0.24
980	0.27
981	0.28
982	0.29
983	0.3
984	0.29
985	0.29
986	0.28
987	0.22
988	0.2
989	0.18
990	0.16
991	0.15
992	0.19
993	0.2
994	0.17
995	0.18
996	0.23
997	0.3
998	0.34
999	0.4
1000	0.38
1001	0.37
1002	0.37
1003	0.35
1004	0.29
1005	0.26
1006	0.24
1007	0.2
1008	0.19
1009	0.18
1010	0.17
1011	0.17
1012	0.17
1013	0.14
1014	0.11
1015	0.09
1016	0.11
1017	0.13
1018	0.13
1019	0.12
1020	0.15
1021	0.15
1022	0.16
1023	0.17
1024	0.15
1025	0.13
1026	0.14
1027	0.13
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.1
1031	0.08
1032	0.08
1033	0.09
1034	0.08
1035	0.08
1036	0.09
1037	0.09
1038	0.09
1039	0.11
1040	0.13
1041	0.16
1042	0.15
1043	0.17
1044	0.14
1045	0.15
1046	0.19
1047	0.18
1048	0.21
1049	0.19
1050	0.2
1051	0.2
1052	0.2
1053	0.21
1054	0.18
1055	0.18
1056	0.18
1057	0.17
1058	0.18
1059	0.18
1060	0.22
1061	0.23
1062	0.22
1063	0.22
1064	0.17
1065	0.19
1066	0.17
1067	0.15
1068	0.11
1069	0.09
1070	0.09
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.07
1076	0.07
1077	0.07
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.08
1081	0.09
1082	0.09
1083	0.1
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.12
1087	0.16
1088	0.21
1089	0.22
1090	0.22
1091	0.22
1092	0.22
1093	0.27
1094	0.26
1095	0.23
1096	0.21
1097	0.26
1098	0.31
1099	0.3
1100	0.28
1101	0.25
1102	0.25
1103	0.24
1104	0.27
1105	0.25
1106	0.25
1107	0.25
1108	0.27
1109	0.29
1110	0.31
1111	0.3
1112	0.25
1113	0.21
1114	0.18
1115	0.17
1116	0.16
1117	0.15
1118	0.15
1119	0.2
1120	0.2
1121	0.22
1122	0.24
1123	0.25
1124	0.29
1125	0.31
1126	0.31
1127	0.29
1128	0.32
1129	0.29
1130	0.26
1131	0.27
1132	0.24
1133	0.23
1134	0.27
1135	0.34
1136	0.39
1137	0.46
1138	0.46
1139	0.52
1140	0.51
1141	0.51
1142	0.53
1143	0.51
1144	0.45
1145	0.41
1146	0.42
1147	0.38
1148	0.39
1149	0.43
1150	0.4
1151	0.37
1152	0.44
1153	0.51
1154	0.59
1155	0.66
1156	0.74
1157	0.78
1158	0.86
1159	0.91
1160	0.92
1161	0.92
1162	0.87
1163	0.84
1164	0.78
1165	0.69
1166	0.6
1167	0.5
1168	0.41
1169	0.33
1170	0.29
1171	0.22
1172	0.18
1173	0.17
1174	0.15
1175	0.15
1176	0.17
1177	0.17
1178	0.18
1179	0.19
1180	0.2
1181	0.23
1182	0.27
1183	0.3
1184	0.32
1185	0.3
1186	0.33
1187	0.33
1188	0.31
1189	0.34
1190	0.3
1191	0.3
1192	0.26
1193	0.31
1194	0.28
1195	0.28
1196	0.35
1197	0.31
1198	0.4
1199	0.42
1200	0.46
1201	0.46
1202	0.47
1203	0.55

A0A553HNX1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer