Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553IBN6

Protein Details
Accession A0A553IBN6    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-90FPKYREWKSRPTKRTWDPAAHydrophilic
226-253RFLPNYKKRSLSKRLKPHKVSEKKPYTPHydrophilic
283-310AQEERLEKQKAKKEEKKREREKDFIAPDBasic
312-333PAVDGGEERKKKKRKTKAQDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-249KKRSLSKRLKPHKVSEKK
279-304KKRMAQEERLEKQKAKKEEKKREREK
317-328GEERKKKKRKTK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 7.5, cyto_mito 6.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTNNAPKPWDVSITALPPWKPKANINKTDDIDKWKIDPFLPTVSLLTAICRSDNVGGNLAEESSFIVLFPKYREWKSRPTKRTWDPAAILKARDLIKLLARSVPAPEALRVLQDDVAADVIKIRNLVNNKEKFVKRRQRLLGPNAATLKALQLLTNTYIQVQGNTVSAIGGYKIKELMVKRELAKFIVYVWAFFVFRQFNKQNVQKKVWPSHVDPLLKNESWDRFLPNYKKRSLSKRLKPHKVSEKKPYTPFPPAAEPSKVDLQLEAGEYHIGRDAKKRMAQEERLEKQKAKKEEKKREREKDFIAPDEPAVDGGEERKKKKRKTKAQDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.34
4 0.34
5 0.33
6 0.35
7 0.39
8 0.41
9 0.39
10 0.45
11 0.52
12 0.58
13 0.66
14 0.67
15 0.7
16 0.66
17 0.69
18 0.64
19 0.61
20 0.55
21 0.47
22 0.42
23 0.38
24 0.38
25 0.33
26 0.33
27 0.28
28 0.28
29 0.28
30 0.26
31 0.23
32 0.21
33 0.21
34 0.18
35 0.17
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.12
40 0.14
41 0.16
42 0.21
43 0.21
44 0.22
45 0.21
46 0.22
47 0.22
48 0.2
49 0.16
50 0.11
51 0.1
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.07
56 0.07
57 0.09
58 0.11
59 0.19
60 0.24
61 0.28
62 0.37
63 0.41
64 0.51
65 0.61
66 0.69
67 0.69
68 0.72
69 0.78
70 0.76
71 0.82
72 0.76
73 0.72
74 0.64
75 0.64
76 0.63
77 0.55
78 0.48
79 0.38
80 0.38
81 0.32
82 0.29
83 0.24
84 0.18
85 0.2
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.11
114 0.14
115 0.21
116 0.28
117 0.31
118 0.33
119 0.4
120 0.44
121 0.46
122 0.54
123 0.58
124 0.55
125 0.61
126 0.64
127 0.66
128 0.7
129 0.7
130 0.68
131 0.59
132 0.56
133 0.48
134 0.43
135 0.34
136 0.26
137 0.2
138 0.14
139 0.12
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.1
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.1
165 0.11
166 0.16
167 0.17
168 0.2
169 0.21
170 0.25
171 0.25
172 0.23
173 0.23
174 0.17
175 0.15
176 0.17
177 0.15
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.15
184 0.12
185 0.13
186 0.2
187 0.21
188 0.24
189 0.31
190 0.39
191 0.44
192 0.48
193 0.53
194 0.51
195 0.56
196 0.59
197 0.59
198 0.56
199 0.51
200 0.52
201 0.53
202 0.52
203 0.45
204 0.44
205 0.42
206 0.38
207 0.35
208 0.31
209 0.27
210 0.27
211 0.27
212 0.25
213 0.23
214 0.31
215 0.39
216 0.44
217 0.48
218 0.49
219 0.55
220 0.57
221 0.64
222 0.66
223 0.68
224 0.7
225 0.75
226 0.82
227 0.85
228 0.85
229 0.85
230 0.85
231 0.85
232 0.82
233 0.82
234 0.81
235 0.78
236 0.78
237 0.74
238 0.69
239 0.67
240 0.63
241 0.56
242 0.53
243 0.49
244 0.47
245 0.44
246 0.4
247 0.37
248 0.38
249 0.34
250 0.28
251 0.24
252 0.21
253 0.2
254 0.19
255 0.15
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.21
264 0.26
265 0.32
266 0.36
267 0.4
268 0.43
269 0.51
270 0.57
271 0.6
272 0.65
273 0.64
274 0.67
275 0.68
276 0.65
277 0.64
278 0.66
279 0.66
280 0.67
281 0.7
282 0.74
283 0.82
284 0.88
285 0.9
286 0.93
287 0.93
288 0.9
289 0.88
290 0.84
291 0.82
292 0.77
293 0.71
294 0.62
295 0.52
296 0.44
297 0.38
298 0.31
299 0.21
300 0.16
301 0.12
302 0.1
303 0.14
304 0.23
305 0.28
306 0.34
307 0.44
308 0.53
309 0.63
310 0.73
311 0.79
312 0.81
313 0.86