Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553IFC8

Protein Details
Accession A0A553IFC8    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-28TVDETSLKRKRAKAPENPSKRTKAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-24KRKRAKAPENPSKR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 1, plas 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPSTVDETSLKRKRAKAPENPSKRTKAESSDEEEDRQAEILLLEDEILKSKKNYNNITVLLGLAKDEDDPETAVFATVSVCRVFLRLLASGSLSRKAGQSERETVVIQWLKGRLSDFKKHLLLLLGDEDSASTALTLSMRLLKAETQIAGDKGESTFPKVFLKEIVGVLISNRFEDIQEEFCEKYLGEYADVRLYAFQALSDILSNRHASSIEDDLFDSVFDMLSFFDRVPESNEELGSLYVDLPKKKSDIVLSLHQQKKHCQSAWLALLKTNSNRQQRKRLLEIMAESIAPWFIQPELLMDFLTDSYNAGGSLSLIALSGVFYLIQSRNLDYPSFYQKLYSLLDCEILHSKHRSKFLRLLDTFLSSTHLPAALVASFIKRLTRLCLNAPPSAIVAVIPWVYNLFKRHPLCTFMVHRVIRDQEVKVAIENQGMNDPFDEKEEDPMQTKAIDSCLWEVVQLQSHYHPNVATIAKIISEQFTKQWYNMEDFLDHSYNSLVEAELSKSVKKPPVVEFMIPKRIFLPNDPASGAEDNLFVKLWEFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.77
3 0.77
4 0.81
5 0.85
6 0.89
7 0.89
8 0.86
9 0.83
10 0.76
11 0.72
12 0.66
13 0.63
14 0.61
15 0.6
16 0.6
17 0.6
18 0.59
19 0.54
20 0.5
21 0.43
22 0.35
23 0.29
24 0.21
25 0.14
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.16
37 0.24
38 0.29
39 0.38
40 0.44
41 0.46
42 0.52
43 0.52
44 0.52
45 0.44
46 0.39
47 0.31
48 0.24
49 0.18
50 0.11
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.16
77 0.19
78 0.21
79 0.22
80 0.19
81 0.19
82 0.19
83 0.23
84 0.25
85 0.28
86 0.31
87 0.35
88 0.36
89 0.37
90 0.36
91 0.32
92 0.37
93 0.32
94 0.27
95 0.25
96 0.25
97 0.23
98 0.24
99 0.26
100 0.25
101 0.3
102 0.38
103 0.38
104 0.43
105 0.44
106 0.43
107 0.43
108 0.37
109 0.31
110 0.25
111 0.24
112 0.17
113 0.15
114 0.14
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.07
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.14
131 0.16
132 0.15
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.11
140 0.15
141 0.13
142 0.16
143 0.17
144 0.18
145 0.22
146 0.21
147 0.21
148 0.19
149 0.21
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.14
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.12
164 0.11
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.09
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.05
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.11
218 0.14
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.11
226 0.09
227 0.06
228 0.08
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.16
236 0.14
237 0.17
238 0.2
239 0.24
240 0.28
241 0.37
242 0.4
243 0.41
244 0.41
245 0.41
246 0.45
247 0.46
248 0.42
249 0.35
250 0.33
251 0.36
252 0.4
253 0.38
254 0.31
255 0.26
256 0.27
257 0.26
258 0.25
259 0.26
260 0.27
261 0.33
262 0.41
263 0.44
264 0.54
265 0.59
266 0.63
267 0.62
268 0.6
269 0.53
270 0.48
271 0.44
272 0.35
273 0.29
274 0.23
275 0.17
276 0.12
277 0.1
278 0.07
279 0.06
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.06
312 0.06
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.13
320 0.16
321 0.2
322 0.21
323 0.2
324 0.19
325 0.19
326 0.22
327 0.22
328 0.19
329 0.14
330 0.13
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.19
337 0.22
338 0.28
339 0.3
340 0.39
341 0.4
342 0.42
343 0.49
344 0.52
345 0.58
346 0.52
347 0.51
348 0.44
349 0.44
350 0.38
351 0.31
352 0.26
353 0.16
354 0.16
355 0.13
356 0.11
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.14
370 0.2
371 0.22
372 0.25
373 0.32
374 0.35
375 0.35
376 0.35
377 0.31
378 0.26
379 0.23
380 0.19
381 0.12
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.11
390 0.14
391 0.16
392 0.25
393 0.27
394 0.31
395 0.32
396 0.36
397 0.36
398 0.39
399 0.41
400 0.38
401 0.45
402 0.42
403 0.4
404 0.4
405 0.4
406 0.38
407 0.36
408 0.31
409 0.27
410 0.29
411 0.28
412 0.25
413 0.24
414 0.21
415 0.21
416 0.2
417 0.17
418 0.19
419 0.19
420 0.18
421 0.17
422 0.17
423 0.14
424 0.16
425 0.18
426 0.14
427 0.19
428 0.21
429 0.22
430 0.23
431 0.23
432 0.22
433 0.19
434 0.2
435 0.15
436 0.15
437 0.14
438 0.14
439 0.15
440 0.16
441 0.16
442 0.15
443 0.15
444 0.15
445 0.2
446 0.19
447 0.18
448 0.2
449 0.25
450 0.26
451 0.26
452 0.23
453 0.19
454 0.24
455 0.22
456 0.19
457 0.16
458 0.15
459 0.14
460 0.15
461 0.15
462 0.12
463 0.14
464 0.15
465 0.16
466 0.22
467 0.23
468 0.23
469 0.29
470 0.28
471 0.31
472 0.33
473 0.32
474 0.27
475 0.27
476 0.32
477 0.28
478 0.25
479 0.2
480 0.18
481 0.16
482 0.16
483 0.14
484 0.09
485 0.08
486 0.1
487 0.11
488 0.15
489 0.17
490 0.18
491 0.2
492 0.27
493 0.32
494 0.35
495 0.38
496 0.4
497 0.48
498 0.51
499 0.53
500 0.55
501 0.57
502 0.63
503 0.58
504 0.53
505 0.46
506 0.47
507 0.45
508 0.4
509 0.42
510 0.36
511 0.4
512 0.4
513 0.37
514 0.36
515 0.35
516 0.31
517 0.22
518 0.19
519 0.16
520 0.17
521 0.16
522 0.12