Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HM43

Protein Details
Accession A0A553HM43    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-44NGTGPTPRGTKRKAKRDPYDDMDDDHydrophilic
277-296ETYHVFKVLRHERKNRGGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-33KRKA
174-180RGRGKGK
346-351GRAAKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 9.5, cyto 7, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
Gene Ontology GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MAALLNFWSSPSKQDKESVNGTGPTPRGTKRKAKRDPYDDMDDDDDVIPARKTPTSQRTARSRLSSASATPASTSKPRTSLTAKRRPGRPSLKSQQGDTPDTPASSRAATGPSPARAKATDAAAASSDSLVPEAPMGGLELLGNNAANAPASSAPKPEPETVQEPPVQNTGRGRGRGKGKEKLTETVSAPDKQVPVPEEDTREEHEIERLLKHRMASDKSGAVELLVQWEGEGEQDATWEAEEEIQENAADTLYEYWKAQGGRISALFHKPKNAPPETYHVFKVLRHERKNRGGGFQFEVQWVGHPATHGETTMEAETKLKNIAPELLQEYWESVGGRAKYLAARGRAAKKSRVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.44
3 0.47
4 0.51
5 0.49
6 0.45
7 0.44
8 0.42
9 0.42
10 0.37
11 0.34
12 0.33
13 0.35
14 0.39
15 0.45
16 0.54
17 0.59
18 0.69
19 0.75
20 0.81
21 0.86
22 0.85
23 0.86
24 0.83
25 0.82
26 0.72
27 0.65
28 0.57
29 0.46
30 0.4
31 0.31
32 0.24
33 0.15
34 0.15
35 0.12
36 0.11
37 0.13
38 0.13
39 0.16
40 0.25
41 0.34
42 0.4
43 0.46
44 0.53
45 0.6
46 0.66
47 0.7
48 0.66
49 0.59
50 0.53
51 0.52
52 0.46
53 0.37
54 0.36
55 0.31
56 0.25
57 0.24
58 0.23
59 0.22
60 0.25
61 0.28
62 0.25
63 0.28
64 0.29
65 0.33
66 0.39
67 0.46
68 0.51
69 0.57
70 0.63
71 0.66
72 0.72
73 0.71
74 0.74
75 0.74
76 0.7
77 0.7
78 0.71
79 0.74
80 0.69
81 0.66
82 0.62
83 0.58
84 0.56
85 0.46
86 0.41
87 0.32
88 0.3
89 0.28
90 0.23
91 0.19
92 0.14
93 0.14
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.16
98 0.18
99 0.21
100 0.23
101 0.23
102 0.24
103 0.22
104 0.24
105 0.23
106 0.21
107 0.2
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.16
112 0.13
113 0.1
114 0.09
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.04
124 0.03
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.06
138 0.08
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.19
147 0.23
148 0.23
149 0.25
150 0.26
151 0.24
152 0.24
153 0.26
154 0.23
155 0.2
156 0.2
157 0.23
158 0.23
159 0.26
160 0.26
161 0.28
162 0.35
163 0.42
164 0.46
165 0.47
166 0.47
167 0.49
168 0.5
169 0.48
170 0.43
171 0.38
172 0.33
173 0.31
174 0.31
175 0.26
176 0.24
177 0.23
178 0.21
179 0.18
180 0.19
181 0.15
182 0.15
183 0.18
184 0.19
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.23
189 0.23
190 0.21
191 0.18
192 0.18
193 0.17
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.2
201 0.24
202 0.26
203 0.26
204 0.27
205 0.26
206 0.25
207 0.25
208 0.21
209 0.16
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.16
248 0.16
249 0.18
250 0.19
251 0.21
252 0.21
253 0.29
254 0.32
255 0.3
256 0.35
257 0.36
258 0.4
259 0.47
260 0.48
261 0.44
262 0.42
263 0.49
264 0.47
265 0.47
266 0.43
267 0.38
268 0.35
269 0.33
270 0.39
271 0.41
272 0.47
273 0.52
274 0.6
275 0.65
276 0.74
277 0.81
278 0.74
279 0.71
280 0.66
281 0.62
282 0.58
283 0.52
284 0.44
285 0.37
286 0.35
287 0.26
288 0.23
289 0.21
290 0.17
291 0.14
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.17
307 0.16
308 0.15
309 0.16
310 0.2
311 0.2
312 0.24
313 0.27
314 0.26
315 0.25
316 0.24
317 0.23
318 0.2
319 0.2
320 0.16
321 0.13
322 0.18
323 0.18
324 0.19
325 0.19
326 0.2
327 0.2
328 0.26
329 0.32
330 0.29
331 0.34
332 0.41
333 0.49
334 0.56
335 0.59