Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HYB1

Protein Details
Accession A0A553HYB1    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-183YDPEERRRKNEARRYRDRNGDNBasic
212-233TTNTPPTRERPRRRRSLTPEYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-189RRRKNEARRYRDRNGDNFPRRHR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDSMDLDHDMDIDVDLVPDEPIVPEFDPGNRSPGEIDDDADARCPTKVYIKGLEVMNPSDVKAYVAEHCSDSSLDLERIEWIDDNSANLLFASETIASQALVALAAEPISEVSQLPARHLLSAKPFLTRPEIALQVRPARESDKKQAGAASRSRFYLLNPEYDPEERRRKNEARRYRDRNGDNFPRRHRRQSRTDESEEPFDVNLYDDSPATTNTPPTRERPRRRRSLTPEYETADSRIDSYRPSNRGRELFPDSISSRPRTSRDRSASPIRDRDGDRDMDDRADHDPAARERNRHRAHAIKSHLSRQNRAKELFPTEAASESGRLDDKVEDAATLLSKGITLPLMDGSNDTPAPPISSRRLEDRITIPVKGSLADRITTPESTANSAFSIRGAASQRSSNTGFAIKGSAGKSVKELFPDKFGGNTGKELFGEAPVGGRTRQRKKAGDLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.07
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.13
13 0.16
14 0.2
15 0.2
16 0.24
17 0.21
18 0.22
19 0.21
20 0.22
21 0.26
22 0.22
23 0.22
24 0.2
25 0.21
26 0.21
27 0.22
28 0.2
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.2
34 0.25
35 0.29
36 0.34
37 0.36
38 0.41
39 0.41
40 0.44
41 0.39
42 0.35
43 0.32
44 0.26
45 0.25
46 0.21
47 0.2
48 0.16
49 0.14
50 0.14
51 0.15
52 0.17
53 0.18
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.07
78 0.06
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.11
101 0.11
102 0.13
103 0.17
104 0.17
105 0.19
106 0.2
107 0.22
108 0.24
109 0.3
110 0.29
111 0.28
112 0.28
113 0.28
114 0.32
115 0.3
116 0.27
117 0.24
118 0.29
119 0.27
120 0.29
121 0.31
122 0.31
123 0.31
124 0.3
125 0.27
126 0.27
127 0.32
128 0.36
129 0.4
130 0.43
131 0.43
132 0.43
133 0.46
134 0.45
135 0.44
136 0.45
137 0.4
138 0.33
139 0.33
140 0.33
141 0.3
142 0.26
143 0.3
144 0.25
145 0.25
146 0.24
147 0.25
148 0.26
149 0.28
150 0.3
151 0.27
152 0.36
153 0.34
154 0.37
155 0.45
156 0.51
157 0.59
158 0.67
159 0.7
160 0.7
161 0.77
162 0.82
163 0.8
164 0.81
165 0.76
166 0.72
167 0.7
168 0.71
169 0.69
170 0.67
171 0.69
172 0.71
173 0.7
174 0.75
175 0.76
176 0.73
177 0.75
178 0.78
179 0.79
180 0.76
181 0.77
182 0.72
183 0.64
184 0.59
185 0.49
186 0.39
187 0.29
188 0.21
189 0.16
190 0.11
191 0.09
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.09
200 0.12
201 0.13
202 0.17
203 0.18
204 0.23
205 0.33
206 0.42
207 0.52
208 0.6
209 0.67
210 0.74
211 0.78
212 0.83
213 0.81
214 0.82
215 0.79
216 0.73
217 0.67
218 0.59
219 0.54
220 0.45
221 0.37
222 0.27
223 0.19
224 0.15
225 0.13
226 0.11
227 0.11
228 0.15
229 0.2
230 0.24
231 0.28
232 0.3
233 0.33
234 0.36
235 0.36
236 0.37
237 0.37
238 0.34
239 0.31
240 0.31
241 0.28
242 0.29
243 0.31
244 0.28
245 0.24
246 0.25
247 0.29
248 0.32
249 0.37
250 0.42
251 0.46
252 0.48
253 0.51
254 0.58
255 0.62
256 0.61
257 0.6
258 0.52
259 0.51
260 0.48
261 0.46
262 0.4
263 0.34
264 0.29
265 0.26
266 0.25
267 0.21
268 0.19
269 0.17
270 0.15
271 0.14
272 0.12
273 0.12
274 0.15
275 0.17
276 0.25
277 0.26
278 0.3
279 0.34
280 0.45
281 0.47
282 0.47
283 0.5
284 0.49
285 0.53
286 0.56
287 0.57
288 0.55
289 0.55
290 0.59
291 0.61
292 0.56
293 0.58
294 0.58
295 0.61
296 0.58
297 0.57
298 0.51
299 0.5
300 0.51
301 0.47
302 0.39
303 0.32
304 0.26
305 0.25
306 0.23
307 0.18
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.14
342 0.14
343 0.18
344 0.22
345 0.27
346 0.29
347 0.35
348 0.4
349 0.38
350 0.41
351 0.4
352 0.43
353 0.39
354 0.38
355 0.33
356 0.3
357 0.29
358 0.25
359 0.23
360 0.19
361 0.19
362 0.19
363 0.18
364 0.2
365 0.23
366 0.22
367 0.22
368 0.21
369 0.21
370 0.24
371 0.24
372 0.2
373 0.19
374 0.19
375 0.18
376 0.14
377 0.14
378 0.1
379 0.15
380 0.17
381 0.19
382 0.21
383 0.25
384 0.26
385 0.3
386 0.32
387 0.28
388 0.27
389 0.27
390 0.24
391 0.21
392 0.22
393 0.17
394 0.2
395 0.19
396 0.24
397 0.23
398 0.23
399 0.26
400 0.29
401 0.3
402 0.31
403 0.35
404 0.3
405 0.34
406 0.37
407 0.33
408 0.3
409 0.32
410 0.31
411 0.28
412 0.31
413 0.29
414 0.27
415 0.27
416 0.27
417 0.24
418 0.2
419 0.2
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.16
424 0.16
425 0.23
426 0.32
427 0.4
428 0.5
429 0.57
430 0.62
431 0.69