FuNGI

A0A553HRQ8

Protein Details

Accession

A0A553HRQ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
537-569	STSDATPSKKPSKSKDKKETAKKKTPNSAAMTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-43	EKKNSASAKSKAPLARARESKKP
544-561	SKKPSKSKDKKETAKKKT

Subcellular Location(s)

mito 8, nucl 18

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MRSTKANIGSLSSMANKVRQEKKNSASAKSKAPLARARESKKPFKSANTVDESSSDSDSSSDGGNSNGSDSDSDLDAARAKFLASKAAKQNKNNKTAEQKVNGAKSAATPVKPAANGSAPTSAQKSAEESSSSSSSESDSDTSDSGGAPSKTVTSKQNSGPSKAKRGSSSESTSSSGSSDEDDEVGKKNNAVNKNQALAREQSEESDSSSDDEMPDAGTETKVKGIAKGAVVDAEGSSSEESDSGSESDDEGDGGKTAVARTNGKDVTKESVSQVSRAQWLNNSDFMLRKASSDNPGKEVADFFSNANLEGKQVWYFTAPASLPITVLKDMEIDLSKATNGGSLLTHNGDNYGLDLESYATNTQIQLIIPSNGVNHGIDSTVHLRRMAKFGPGGEVHATATDNYIPLPKPVREQPEGLKVRYTPIGVPTPVTSSIAPTKSISTNVPSSQTKKTARIQSPSSSESESASDSDVEMTTPSASITPASQVKSAKSSTTNGDRKRKHMGDEDQSTKRLKAVESTEGPGVKQNSTQGSKLGSTSDATPSKKPSKSKDKKETAKKKTPNSAAMTPIKAKQTPIPLPSYPGMKH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.28
3	0.29
4	0.36
5	0.45
6	0.51
7	0.57
8	0.62
9	0.66
10	0.71
11	0.71
12	0.7
13	0.69
14	0.65
15	0.66
16	0.59
17	0.61
18	0.55
19	0.58
20	0.57
21	0.55
22	0.6
23	0.61
24	0.63
25	0.66
26	0.71
27	0.74
28	0.74
29	0.76
30	0.71
31	0.69
32	0.74
33	0.71
34	0.71
35	0.69
36	0.63
37	0.55
38	0.51
39	0.46
40	0.38
41	0.32
42	0.24
43	0.16
44	0.15
45	0.14
46	0.14
47	0.12
48	0.1
49	0.09
50	0.1
51	0.11
52	0.1
53	0.11
54	0.11
55	0.11
56	0.1
57	0.11
58	0.12
59	0.11
60	0.12
61	0.11
62	0.11
63	0.15
64	0.15
65	0.15
66	0.13
67	0.12
68	0.15
69	0.15
70	0.24
71	0.22
72	0.3
73	0.39
74	0.49
75	0.56
76	0.61
77	0.72
78	0.71
79	0.78
80	0.74
81	0.71
82	0.7
83	0.73
84	0.73
85	0.67
86	0.65
87	0.62
88	0.63
89	0.57
90	0.48
91	0.39
92	0.31
93	0.35
94	0.32
95	0.25
96	0.23
97	0.24
98	0.28
99	0.27
100	0.27
101	0.22
102	0.22
103	0.23
104	0.23
105	0.25
106	0.22
107	0.23
108	0.25
109	0.22
110	0.19
111	0.19
112	0.2
113	0.17
114	0.19
115	0.18
116	0.17
117	0.2
118	0.2
119	0.2
120	0.17
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.15
125	0.12
126	0.11
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.1
133	0.14
134	0.12
135	0.11
136	0.11
137	0.13
138	0.15
139	0.18
140	0.23
141	0.24
142	0.3
143	0.35
144	0.43
145	0.44
146	0.48
147	0.54
148	0.54
149	0.57
150	0.57
151	0.55
152	0.5
153	0.52
154	0.52
155	0.5
156	0.5
157	0.44
158	0.42
159	0.4
160	0.36
161	0.31
162	0.26
163	0.19
164	0.14
165	0.12
166	0.11
167	0.09
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.12
172	0.14
173	0.13
174	0.13
175	0.15
176	0.21
177	0.26
178	0.28
179	0.34
180	0.34
181	0.38
182	0.38
183	0.37
184	0.33
185	0.31
186	0.3
187	0.26
188	0.23
189	0.2
190	0.2
191	0.19
192	0.18
193	0.16
194	0.14
195	0.11
196	0.12
197	0.11
198	0.09
199	0.09
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.1
210	0.11
211	0.11
212	0.12
213	0.14
214	0.14
215	0.15
216	0.14
217	0.12
218	0.12
219	0.11
220	0.08
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.05
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.08
246	0.1
247	0.11
248	0.12
249	0.18
250	0.2
251	0.2
252	0.21
253	0.2
254	0.22
255	0.22
256	0.21
257	0.17
258	0.22
259	0.21
260	0.22
261	0.22
262	0.19
263	0.22
264	0.22
265	0.21
266	0.17
267	0.2
268	0.21
269	0.2
270	0.19
271	0.16
272	0.16
273	0.17
274	0.17
275	0.14
276	0.13
277	0.13
278	0.15
279	0.2
280	0.26
281	0.26
282	0.25
283	0.26
284	0.26
285	0.24
286	0.22
287	0.17
288	0.12
289	0.12
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.09
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.07
305	0.1
306	0.09
307	0.1
308	0.11
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.12
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.06
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.08
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.09
360	0.1
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.09
367	0.13
368	0.15
369	0.15
370	0.17
371	0.19
372	0.2
373	0.25
374	0.23
375	0.21
376	0.21
377	0.21
378	0.24
379	0.22
380	0.22
381	0.19
382	0.19
383	0.15
384	0.14
385	0.14
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.1
392	0.1
393	0.13
394	0.17
395	0.17
396	0.21
397	0.27
398	0.34
399	0.34
400	0.37
401	0.38
402	0.45
403	0.47
404	0.44
405	0.4
406	0.33
407	0.34
408	0.32
409	0.29
410	0.2
411	0.21
412	0.24
413	0.22
414	0.23
415	0.21
416	0.21
417	0.21
418	0.21
419	0.17
420	0.16
421	0.21
422	0.21
423	0.22
424	0.2
425	0.22
426	0.22
427	0.24
428	0.22
429	0.21
430	0.24
431	0.24
432	0.29
433	0.3
434	0.32
435	0.36
436	0.42
437	0.42
438	0.45
439	0.51
440	0.56
441	0.59
442	0.61
443	0.61
444	0.59
445	0.6
446	0.56
447	0.5
448	0.42
449	0.36
450	0.31
451	0.27
452	0.22
453	0.17
454	0.16
455	0.13
456	0.11
457	0.12
458	0.1
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.12
470	0.16
471	0.18
472	0.21
473	0.22
474	0.24
475	0.29
476	0.29
477	0.28
478	0.27
479	0.29
480	0.32
481	0.41
482	0.47
483	0.52
484	0.61
485	0.62
486	0.64
487	0.71
488	0.68
489	0.63
490	0.64
491	0.64
492	0.63
493	0.68
494	0.71
495	0.64
496	0.64
497	0.6
498	0.51
499	0.44
500	0.37
501	0.29
502	0.29
503	0.3
504	0.35
505	0.36
506	0.39
507	0.4
508	0.38
509	0.37
510	0.36
511	0.33
512	0.26
513	0.25
514	0.26
515	0.3
516	0.34
517	0.34
518	0.31
519	0.32
520	0.32
521	0.31
522	0.28
523	0.21
524	0.19
525	0.2
526	0.26
527	0.29
528	0.31
529	0.34
530	0.41
531	0.48
532	0.53
533	0.58
534	0.61
535	0.66
536	0.74
537	0.81
538	0.84
539	0.86
540	0.9
541	0.94
542	0.94
543	0.94
544	0.94
545	0.92
546	0.9
547	0.9
548	0.87
549	0.85
550	0.81
551	0.75
552	0.73
553	0.7
554	0.65
555	0.59
556	0.55
557	0.53
558	0.47
559	0.45
560	0.43
561	0.47
562	0.49
563	0.5
564	0.51
565	0.46
566	0.5
567	0.5

A0A553HRQ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer