Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HMS1

Protein Details
Accession A0A553HMS1    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-63TPTNGDQPPRPLKRRRVAETSPHydrophilic
358-386LSDKARGKERKEKEKKRRKLANLNRKGGSBasic
471-492DLSPRKLTKKLSQQRNKLFQPHHydrophilic
621-641ALVIMRRSKIQRRPEQPEAVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
361-382KARGKERKEKEKKRRKLANLNR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019135  Polycomb_protein_VEFS-Box  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09733  VEFS-Box  
CDD cd21552  VEFS-box_ctSUZ12-like  
Amino Acid Sequences MATVSSPYKRDSLPFIHRAWKTAVDHLPLGMGIKLSTANGDTPTNGDQPPRPLKRRRVAETSPEAARAVPGCLLSEIADDVEKALRIEVLSITRVDSSNPRPANLHYGNGSPEKKDIPVIKARCRVLVCEWSPPVCRVLHCDSQICNFKVFRDSDDVCRTARIYLPTPFQIPSGKIFIERPDGTGFSLGDQYLIRVEIESAGDPKWPPMDLLPKDQVNESESSDPRRWILSTQFVYAFEKGRASSEVKITKVKEVDLPLGLVMDMDLRWSTSHAAASSARFSDSVPPPDIKMNHINGALEPLTNGHVNGRVDNAPNDHRKTDNERNGVAEDEEEHEEATTPSRSLRTREKQNYNLKLLSDKARGKERKEKEKKRRKLANLNRKGGSVTWAVPLIGEFTLENYHCIRCYATHSSMQLLQQHLEDHTDIIYKVDPVHAYIRIFAPDEDALRSLNPTFHSFSSIDDQESDAEGDLSPRKLTKKLSQQRNKLFQPHPIKPRDNRLLIPHIKQPLYDRLSKAVLESGSLVDPPPIDDSWLIQKHRDIIRDYSDVLPDEKEYILEWDAFVSKECVTSAPHLQDVYIRFIQDKALWLAASQNRMAEWAKHLSYLKFRNALTEDTITEALVIMRRSKIQRRPEQPEAVKVPSPRAAYRKSVAGCPDCTNTFGTDDKGIVPEAAGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.5
3 0.55
4 0.54
5 0.55
6 0.52
7 0.51
8 0.45
9 0.47
10 0.48
11 0.43
12 0.43
13 0.4
14 0.36
15 0.28
16 0.26
17 0.18
18 0.13
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.14
27 0.15
28 0.14
29 0.17
30 0.21
31 0.23
32 0.23
33 0.25
34 0.26
35 0.34
36 0.44
37 0.51
38 0.56
39 0.62
40 0.72
41 0.78
42 0.84
43 0.83
44 0.81
45 0.79
46 0.8
47 0.78
48 0.72
49 0.64
50 0.56
51 0.48
52 0.39
53 0.34
54 0.25
55 0.19
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.09
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.17
83 0.21
84 0.24
85 0.32
86 0.33
87 0.33
88 0.34
89 0.36
90 0.44
91 0.39
92 0.37
93 0.3
94 0.31
95 0.33
96 0.39
97 0.38
98 0.29
99 0.3
100 0.28
101 0.27
102 0.31
103 0.31
104 0.3
105 0.38
106 0.44
107 0.5
108 0.56
109 0.56
110 0.55
111 0.52
112 0.49
113 0.46
114 0.48
115 0.41
116 0.41
117 0.42
118 0.4
119 0.41
120 0.39
121 0.36
122 0.28
123 0.27
124 0.26
125 0.3
126 0.34
127 0.34
128 0.36
129 0.35
130 0.41
131 0.48
132 0.43
133 0.4
134 0.34
135 0.33
136 0.36
137 0.35
138 0.3
139 0.3
140 0.31
141 0.35
142 0.4
143 0.4
144 0.34
145 0.34
146 0.32
147 0.26
148 0.27
149 0.24
150 0.22
151 0.25
152 0.29
153 0.3
154 0.31
155 0.3
156 0.28
157 0.26
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.2
162 0.2
163 0.21
164 0.22
165 0.26
166 0.25
167 0.24
168 0.23
169 0.23
170 0.22
171 0.22
172 0.2
173 0.13
174 0.14
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.13
196 0.22
197 0.23
198 0.29
199 0.33
200 0.33
201 0.33
202 0.34
203 0.31
204 0.24
205 0.23
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.26
210 0.27
211 0.27
212 0.25
213 0.25
214 0.23
215 0.2
216 0.23
217 0.26
218 0.26
219 0.27
220 0.27
221 0.27
222 0.29
223 0.28
224 0.25
225 0.17
226 0.16
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.17
232 0.23
233 0.26
234 0.26
235 0.31
236 0.31
237 0.32
238 0.31
239 0.29
240 0.26
241 0.25
242 0.25
243 0.2
244 0.19
245 0.15
246 0.14
247 0.12
248 0.08
249 0.06
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.09
260 0.08
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.17
270 0.2
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.24
275 0.28
276 0.28
277 0.24
278 0.26
279 0.24
280 0.24
281 0.24
282 0.24
283 0.19
284 0.21
285 0.18
286 0.12
287 0.1
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.06
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.17
301 0.18
302 0.23
303 0.25
304 0.24
305 0.24
306 0.27
307 0.35
308 0.42
309 0.44
310 0.42
311 0.4
312 0.41
313 0.4
314 0.37
315 0.28
316 0.18
317 0.11
318 0.1
319 0.11
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.1
330 0.12
331 0.15
332 0.25
333 0.31
334 0.41
335 0.51
336 0.57
337 0.63
338 0.72
339 0.74
340 0.68
341 0.62
342 0.52
343 0.44
344 0.39
345 0.35
346 0.32
347 0.29
348 0.28
349 0.36
350 0.4
351 0.43
352 0.51
353 0.54
354 0.59
355 0.67
356 0.75
357 0.77
358 0.84
359 0.88
360 0.89
361 0.9
362 0.88
363 0.88
364 0.88
365 0.88
366 0.87
367 0.84
368 0.74
369 0.65
370 0.56
371 0.45
372 0.37
373 0.28
374 0.19
375 0.14
376 0.13
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.09
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.06
385 0.08
386 0.08
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.16
395 0.2
396 0.22
397 0.25
398 0.25
399 0.26
400 0.28
401 0.29
402 0.27
403 0.22
404 0.2
405 0.17
406 0.17
407 0.16
408 0.15
409 0.13
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.16
426 0.15
427 0.16
428 0.14
429 0.14
430 0.12
431 0.13
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.14
441 0.16
442 0.16
443 0.2
444 0.19
445 0.21
446 0.24
447 0.23
448 0.2
449 0.18
450 0.18
451 0.15
452 0.16
453 0.14
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.09
458 0.1
459 0.11
460 0.11
461 0.13
462 0.15
463 0.19
464 0.25
465 0.31
466 0.4
467 0.49
468 0.6
469 0.67
470 0.75
471 0.81
472 0.85
473 0.81
474 0.79
475 0.72
476 0.7
477 0.7
478 0.68
479 0.67
480 0.66
481 0.69
482 0.65
483 0.73
484 0.72
485 0.66
486 0.61
487 0.58
488 0.6
489 0.57
490 0.55
491 0.51
492 0.48
493 0.45
494 0.43
495 0.41
496 0.4
497 0.4
498 0.41
499 0.37
500 0.35
501 0.37
502 0.36
503 0.32
504 0.26
505 0.22
506 0.17
507 0.17
508 0.14
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.11
516 0.1
517 0.11
518 0.11
519 0.13
520 0.21
521 0.27
522 0.27
523 0.26
524 0.28
525 0.35
526 0.39
527 0.42
528 0.36
529 0.35
530 0.4
531 0.4
532 0.41
533 0.35
534 0.33
535 0.3
536 0.27
537 0.23
538 0.18
539 0.18
540 0.15
541 0.13
542 0.11
543 0.13
544 0.13
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.12
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.12
555 0.12
556 0.13
557 0.17
558 0.22
559 0.23
560 0.25
561 0.24
562 0.24
563 0.27
564 0.27
565 0.3
566 0.25
567 0.23
568 0.22
569 0.22
570 0.25
571 0.22
572 0.23
573 0.19
574 0.19
575 0.18
576 0.18
577 0.25
578 0.26
579 0.27
580 0.24
581 0.22
582 0.2
583 0.23
584 0.25
585 0.2
586 0.21
587 0.24
588 0.24
589 0.28
590 0.31
591 0.32
592 0.4
593 0.44
594 0.46
595 0.45
596 0.44
597 0.46
598 0.46
599 0.45
600 0.41
601 0.37
602 0.31
603 0.29
604 0.29
605 0.22
606 0.19
607 0.16
608 0.13
609 0.14
610 0.14
611 0.14
612 0.16
613 0.22
614 0.3
615 0.39
616 0.46
617 0.54
618 0.63
619 0.71
620 0.78
621 0.81
622 0.84
623 0.79
624 0.8
625 0.75
626 0.7
627 0.64
628 0.57
629 0.53
630 0.49
631 0.48
632 0.45
633 0.47
634 0.47
635 0.49
636 0.5
637 0.53
638 0.49
639 0.51
640 0.53
641 0.51
642 0.49
643 0.47
644 0.49
645 0.42
646 0.41
647 0.37
648 0.31
649 0.29
650 0.27
651 0.25
652 0.22
653 0.22
654 0.21
655 0.21
656 0.2
657 0.17