FuNGI

A0A553HJ61

Protein Details

Accession

A0A553HJ61

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-51	DDILFQQRPRKRAKQDPADMKAEL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
543-589	QRGNQRGGGARGGNQQRGGQRGGGQPRGRGGPPRAGHAPGHMGRAGR

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 7, cysk 4, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MASADGPGLAEAIQRLHLVDPANDINIDDILFQQRPRKRAKQDPADMKAELERKYLTPSNTFSPEWLNRLQQRWDSPADLTELFRIAPTQTRTVTRFQRHGLEGRVTGYKNVTVPANSATAKNSTSLARKPGSRADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEATAAVEEQMLRSTSSAVDGTKSKLERVIRLGAEGGLLEVAPGLNRGIDFSKKSAVNEKEAKAIEAVLDQEPEDSPDIEEVNGHADNVNGIEEEPNDEEDEDIDALLPVEFPALEPHANLAASSARKAGREWAHMVDINRDITNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAARHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRETFDEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDFERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKQKDIYVISTPKRPVPLEHYLWAGKNIHKIVDHQKKFLEKGWKEADQAMRGKDKPLPTLGAPRGGGNQQRGNQRGGGARGGNQQRGGQRGGGQPRGRGGPPRAGHAPGHMGRAGRPGGFTSVAQDKNLWVHLVQFLRKQSLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTAQEKSHIHMIIQKSVARLRPEDRVLPQIIRMRELLSRGIAVHHGGLLPIVKEIVEILFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDPVGSVIIVPPGGGDEAPPVVDLQKMILDPPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKLSEADLAKIKREPCAVCDVAMDQCHQAAMNYKQLTQELYKGLMGIPIGKKLFSLKRLIVWNKEGVRTPGILLNEGVSTKVSGGQPTVHVFEIKTGRETRDSSDILPFVKGFTPLLKALPQQKRNIVAKTLHVPLSDVECLTTTLVDGIIPDFFQGGESRAKAKDKMLKICKSWESEIWDEVSFSKIKSLNLQEIIQKRQQEAVNIVQAATLQCPKFLKHFAMCHDQWLIKEHISSLRQALSDQNLQLLPDYEQRIEVLKDLSFVDADTRIQLKGKVACEIHSADELVLTELILDNVLADYEPAEIAALLSAFVFQEKTDSVPNLTGNLERGMKTIIEISEKVNTVQTDRQVIQSAEDSNDFVSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITDLTDVLEGTIVRTITRLDETCREVKNAARIIGDPELYQKMQTAQEMIKRDITAVASLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.12
4	0.15
5	0.16
6	0.16
7	0.2
8	0.2
9	0.22
10	0.21
11	0.2
12	0.18
13	0.16
14	0.15
15	0.1
16	0.11
17	0.15
18	0.17
19	0.19
20	0.27
21	0.32
22	0.39
23	0.48
24	0.56
25	0.61
26	0.7
27	0.78
28	0.81
29	0.86
30	0.89
31	0.86
32	0.81
33	0.71
34	0.62
35	0.58
36	0.52
37	0.43
38	0.36
39	0.32
40	0.28
41	0.35
42	0.39
43	0.36
44	0.36
45	0.38
46	0.42
47	0.45
48	0.44
49	0.38
50	0.41
51	0.41
52	0.4
53	0.41
54	0.43
55	0.44
56	0.49
57	0.54
58	0.52
59	0.53
60	0.54
61	0.54
62	0.48
63	0.42
64	0.39
65	0.37
66	0.31
67	0.27
68	0.23
69	0.2
70	0.18
71	0.16
72	0.16
73	0.13
74	0.19
75	0.22
76	0.25
77	0.28
78	0.34
79	0.37
80	0.44
81	0.52
82	0.53
83	0.55
84	0.55
85	0.59
86	0.58
87	0.6
88	0.58
89	0.53
90	0.46
91	0.43
92	0.44
93	0.37
94	0.35
95	0.31
96	0.29
97	0.25
98	0.25
99	0.25
100	0.2
101	0.21
102	0.21
103	0.23
104	0.21
105	0.22
106	0.22
107	0.22
108	0.22
109	0.21
110	0.21
111	0.21
112	0.26
113	0.29
114	0.34
115	0.36
116	0.38
117	0.42
118	0.49
119	0.49
120	0.49
121	0.48
122	0.47
123	0.47
124	0.45
125	0.45
126	0.36
127	0.32
128	0.27
129	0.24
130	0.18
131	0.14
132	0.15
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.08
139	0.09
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.05
144	0.05
145	0.04
146	0.04
147	0.04
148	0.04
149	0.04
150	0.05
151	0.07
152	0.08
153	0.08
154	0.09
155	0.1
156	0.1
157	0.12
158	0.13
159	0.12
160	0.14
161	0.15
162	0.18
163	0.23
164	0.24
165	0.23
166	0.27
167	0.3
168	0.33
169	0.36
170	0.4
171	0.34
172	0.35
173	0.34
174	0.28
175	0.25
176	0.2
177	0.15
178	0.07
179	0.07
180	0.05
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.08
189	0.11
190	0.15
191	0.18
192	0.19
193	0.26
194	0.27
195	0.3
196	0.37
197	0.38
198	0.42
199	0.47
200	0.46
201	0.47
202	0.45
203	0.44
204	0.35
205	0.31
206	0.23
207	0.17
208	0.18
209	0.12
210	0.12
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.12
215	0.13
216	0.11
217	0.1
218	0.11
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.09
223	0.12
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.1
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.1
236	0.11
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.11
242	0.12
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.07
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.11
259	0.12
260	0.12
261	0.12
262	0.11
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.17
267	0.17
268	0.18
269	0.19
270	0.26
271	0.27
272	0.31
273	0.33
274	0.32
275	0.34
276	0.37
277	0.37
278	0.33
279	0.3
280	0.27
281	0.24
282	0.21
283	0.18
284	0.17
285	0.2
286	0.16
287	0.14
288	0.16
289	0.16
290	0.19
291	0.2
292	0.19
293	0.17
294	0.23
295	0.23
296	0.2
297	0.21
298	0.19
299	0.18
300	0.17
301	0.17
302	0.15
303	0.17
304	0.19
305	0.18
306	0.17
307	0.17
308	0.18
309	0.19
310	0.19
311	0.17
312	0.15
313	0.15
314	0.14
315	0.15
316	0.14
317	0.1
318	0.07
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.1
347	0.11
348	0.15
349	0.16
350	0.18
351	0.21
352	0.24
353	0.24
354	0.27
355	0.35
356	0.38
357	0.47
358	0.47
359	0.52
360	0.54
361	0.56
362	0.61
363	0.52
364	0.46
365	0.44
366	0.44
367	0.37
368	0.33
369	0.3
370	0.2
371	0.19
372	0.16
373	0.09
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.11
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.09
406	0.09
407	0.1
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.09
412	0.07
413	0.06
414	0.08
415	0.08
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.1
421	0.1
422	0.07
423	0.08
424	0.09
425	0.11
426	0.11
427	0.11
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.07
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.04
442	0.03
443	0.03
444	0.04
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.09
455	0.1
456	0.1
457	0.13
458	0.17
459	0.21
460	0.23
461	0.26
462	0.3
463	0.31
464	0.35
465	0.33
466	0.34
467	0.36
468	0.4
469	0.38
470	0.38
471	0.37
472	0.35
473	0.37
474	0.33
475	0.28
476	0.29
477	0.35
478	0.33
479	0.33
480	0.34
481	0.32
482	0.31
483	0.31
484	0.27
485	0.21
486	0.23
487	0.22
488	0.2
489	0.2
490	0.23
491	0.31
492	0.4
493	0.4
494	0.36
495	0.39
496	0.41
497	0.42
498	0.43
499	0.43
500	0.33
501	0.39
502	0.42
503	0.41
504	0.39
505	0.42
506	0.39
507	0.34
508	0.36
509	0.31
510	0.31
511	0.29
512	0.3
513	0.29
514	0.28
515	0.25
516	0.24
517	0.24
518	0.2
519	0.28
520	0.27
521	0.27
522	0.25
523	0.24
524	0.23
525	0.24
526	0.26
527	0.22
528	0.25
529	0.27
530	0.33
531	0.34
532	0.34
533	0.32
534	0.31
535	0.29
536	0.26
537	0.24
538	0.18
539	0.18
540	0.24
541	0.26
542	0.25
543	0.23
544	0.25
545	0.24
546	0.27
547	0.26
548	0.19
549	0.2
550	0.24
551	0.28
552	0.32
553	0.31
554	0.29
555	0.29
556	0.31
557	0.28
558	0.28
559	0.25
560	0.27
561	0.26
562	0.3
563	0.29
564	0.29
565	0.28
566	0.25
567	0.29
568	0.22
569	0.23
570	0.2
571	0.18
572	0.17
573	0.2
574	0.2
575	0.14
576	0.13
577	0.11
578	0.12
579	0.12
580	0.12
581	0.11
582	0.16
583	0.17
584	0.17
585	0.16
586	0.15
587	0.15
588	0.16
589	0.13
590	0.07
591	0.08
592	0.12
593	0.13
594	0.14
595	0.16
596	0.17
597	0.18
598	0.19
599	0.18
600	0.18
601	0.2
602	0.2
603	0.18
604	0.18
605	0.17
606	0.18
607	0.18
608	0.15
609	0.19
610	0.18
611	0.24
612	0.24
613	0.27
614	0.27
615	0.32
616	0.34
617	0.34
618	0.38
619	0.33
620	0.31
621	0.29
622	0.28
623	0.23
624	0.19
625	0.12
626	0.07
627	0.06
628	0.11
629	0.11
630	0.1
631	0.16
632	0.17
633	0.18
634	0.22
635	0.22
636	0.17
637	0.22
638	0.23
639	0.2
640	0.21
641	0.21
642	0.17
643	0.2
644	0.23
645	0.2
646	0.21
647	0.2
648	0.24
649	0.25
650	0.26
651	0.25
652	0.26
653	0.26
654	0.23
655	0.26
656	0.25
657	0.24
658	0.22
659	0.21
660	0.18
661	0.18
662	0.19
663	0.16
664	0.11
665	0.12
666	0.1
667	0.1
668	0.09
669	0.08
670	0.07
671	0.06
672	0.06
673	0.05
674	0.05
675	0.05
676	0.05
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.05
691	0.04
692	0.05
693	0.04
694	0.04
695	0.04
696	0.04
697	0.06
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.07
705	0.07
706	0.07
707	0.06
708	0.06
709	0.07
710	0.07
711	0.07
712	0.08
713	0.1
714	0.13
715	0.19
716	0.23
717	0.28
718	0.28
719	0.29
720	0.34
721	0.36
722	0.38
723	0.41
724	0.41
725	0.36
726	0.41
727	0.4
728	0.34
729	0.29
730	0.25
731	0.19
732	0.15
733	0.15
734	0.09
735	0.1
736	0.1
737	0.1
738	0.11
739	0.11
740	0.11
741	0.11
742	0.12
743	0.13
744	0.13
745	0.13
746	0.12
747	0.1
748	0.1
749	0.09
750	0.08
751	0.07
752	0.06
753	0.05
754	0.04
755	0.04
756	0.03
757	0.04
758	0.04
759	0.04
760	0.04
761	0.04
762	0.05
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.06
770	0.06
771	0.07
772	0.1
773	0.11
774	0.11
775	0.17
776	0.2
777	0.2
778	0.23
779	0.26
780	0.29
781	0.34
782	0.4
783	0.37
784	0.41
785	0.42
786	0.44
787	0.41
788	0.36
789	0.32
790	0.25
791	0.22
792	0.15
793	0.13
794	0.09
795	0.07
796	0.06
797	0.05
798	0.06
799	0.06
800	0.07
801	0.09
802	0.11
803	0.13
804	0.14
805	0.14
806	0.14
807	0.15
808	0.17
809	0.17
810	0.19
811	0.19
812	0.23
813	0.25
814	0.25
815	0.24
816	0.26
817	0.26
818	0.24
819	0.22
820	0.19
821	0.17
822	0.18
823	0.17
824	0.16
825	0.15
826	0.13
827	0.13
828	0.16
829	0.15
830	0.15
831	0.2
832	0.18
833	0.19
834	0.22
835	0.22
836	0.2
837	0.25
838	0.24
839	0.22
840	0.29
841	0.27
842	0.24
843	0.24
844	0.22
845	0.2
846	0.2
847	0.18
848	0.11
849	0.11
850	0.1
851	0.09
852	0.09
853	0.12
854	0.14
855	0.21
856	0.21
857	0.22
858	0.23
859	0.24
860	0.26
861	0.22
862	0.23
863	0.17
864	0.17
865	0.16
866	0.16
867	0.15
868	0.14
869	0.12
870	0.14
871	0.13
872	0.16
873	0.16
874	0.16
875	0.16
876	0.21
877	0.25
878	0.24
879	0.29
880	0.25
881	0.3
882	0.39
883	0.43
884	0.42
885	0.4
886	0.43
887	0.41
888	0.42
889	0.39
890	0.33
891	0.31
892	0.27
893	0.24
894	0.21
895	0.19
896	0.17
897	0.15
898	0.14
899	0.12
900	0.12
901	0.11
902	0.08
903	0.07
904	0.07
905	0.11
906	0.11
907	0.11
908	0.12
909	0.13
910	0.15
911	0.17
912	0.19
913	0.15
914	0.15
915	0.14
916	0.19
917	0.22
918	0.21
919	0.23
920	0.23
921	0.25
922	0.28
923	0.3
924	0.28
925	0.3
926	0.3
927	0.28
928	0.29
929	0.28
930	0.25
931	0.24
932	0.21
933	0.16
934	0.15
935	0.15
936	0.12
937	0.12
938	0.14
939	0.14
940	0.16
941	0.17
942	0.2
943	0.29
944	0.38
945	0.42
946	0.44
947	0.48
948	0.54
949	0.57
950	0.57
951	0.52
952	0.45
953	0.44
954	0.43
955	0.42
956	0.36
957	0.31
958	0.28
959	0.24
960	0.26
961	0.22
962	0.17
963	0.14
964	0.12
965	0.13
966	0.12
967	0.11
968	0.07
969	0.06
970	0.06
971	0.06
972	0.05
973	0.05
974	0.05
975	0.05
976	0.05
977	0.05
978	0.05
979	0.06
980	0.06
981	0.08
982	0.12
983	0.13
984	0.16
985	0.19
986	0.23
987	0.24
988	0.3
989	0.36
990	0.39
991	0.49
992	0.55
993	0.58
994	0.58
995	0.63
996	0.62
997	0.58
998	0.54
999	0.48
1000	0.46
1001	0.42
1002	0.41
1003	0.35
1004	0.3
1005	0.26
1006	0.23
1007	0.21
1008	0.15
1009	0.13
1010	0.17
1011	0.17
1012	0.18
1013	0.24
1014	0.29
1015	0.32
1016	0.35
1017	0.37
1018	0.38
1019	0.41
1020	0.45
1021	0.43
1022	0.4
1023	0.35
1024	0.38
1025	0.38
1026	0.35
1027	0.34
1028	0.34
1029	0.35
1030	0.32
1031	0.31
1032	0.25
1033	0.24
1034	0.21
1035	0.19
1036	0.19
1037	0.14
1038	0.17
1039	0.18
1040	0.2
1041	0.24
1042	0.27
1043	0.31
1044	0.32
1045	0.36
1046	0.39
1047	0.47
1048	0.45
1049	0.44
1050	0.44
1051	0.39
1052	0.34
1053	0.34
1054	0.31
1055	0.24
1056	0.24
1057	0.23
1058	0.26
1059	0.26
1060	0.26
1061	0.24
1062	0.24
1063	0.23
1064	0.24
1065	0.26
1066	0.24
1067	0.27
1068	0.25
1069	0.26
1070	0.23
1071	0.23
1072	0.23
1073	0.2
1074	0.18
1075	0.19
1076	0.22
1077	0.19
1078	0.19
1079	0.2
1080	0.22
1081	0.21
1082	0.2
1083	0.17
1084	0.14
1085	0.15
1086	0.15
1087	0.15
1088	0.13
1089	0.12
1090	0.12
1091	0.11
1092	0.12
1093	0.13
1094	0.14
1095	0.14
1096	0.16
1097	0.18
1098	0.21
1099	0.25
1100	0.27
1101	0.3
1102	0.3
1103	0.3
1104	0.33
1105	0.33
1106	0.3
1107	0.25
1108	0.24
1109	0.17
1110	0.17
1111	0.16
1112	0.13
1113	0.11
1114	0.09
1115	0.07
1116	0.07
1117	0.07
1118	0.06
1119	0.05
1120	0.04
1121	0.04
1122	0.05
1123	0.04
1124	0.04
1125	0.04
1126	0.05
1127	0.05
1128	0.05
1129	0.05
1130	0.05
1131	0.05
1132	0.05
1133	0.05
1134	0.04
1135	0.04
1136	0.05
1137	0.05
1138	0.05
1139	0.06
1140	0.05
1141	0.08
1142	0.08
1143	0.11
1144	0.15
1145	0.17
1146	0.18
1147	0.21
1148	0.22
1149	0.21
1150	0.22
1151	0.21
1152	0.19
1153	0.21
1154	0.22
1155	0.19
1156	0.2
1157	0.2
1158	0.18
1159	0.18
1160	0.2
1161	0.18
1162	0.19
1163	0.2
1164	0.21
1165	0.25
1166	0.26
1167	0.25
1168	0.25
1169	0.24
1170	0.25
1171	0.28
1172	0.3
1173	0.31
1174	0.31
1175	0.34
1176	0.34
1177	0.33
1178	0.32
1179	0.3
1180	0.29
1181	0.24
1182	0.24
1183	0.22
1184	0.18
1185	0.2
1186	0.17
1187	0.17
1188	0.18
1189	0.18
1190	0.18
1191	0.19
1192	0.18
1193	0.17
1194	0.23
1195	0.22
1196	0.23
1197	0.21
1198	0.23
1199	0.21
1200	0.21
1201	0.2
1202	0.14
1203	0.13
1204	0.1
1205	0.12
1206	0.16
1207	0.2
1208	0.2
1209	0.25
1210	0.26
1211	0.27
1212	0.29
1213	0.27
1214	0.22
1215	0.21
1216	0.19
1217	0.15
1218	0.15
1219	0.14
1220	0.12
1221	0.15
1222	0.12
1223	0.1
1224	0.11
1225	0.11
1226	0.13
1227	0.19
1228	0.2
1229	0.22
1230	0.28
1231	0.34
1232	0.4
1233	0.42
1234	0.42
1235	0.39
1236	0.41
1237	0.45
1238	0.45
1239	0.42
1240	0.37
1241	0.36
1242	0.38
1243	0.4
1244	0.36
1245	0.27
1246	0.26
1247	0.28
1248	0.27
1249	0.26
1250	0.23
1251	0.23
1252	0.25
1253	0.26
1254	0.26
1255	0.26
1256	0.32
1257	0.37
1258	0.38
1259	0.38
1260	0.36
1261	0.35
1262	0.33
1263	0.3
1264	0.25

A0A553HJ61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer