FuNGI

A0A553HLR4

Protein Details

Accession

A0A553HLR4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
464-489	NRPLAQEGKSKKRKKKESQDPITDKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
470-479	EGKSKKRKKK

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 4, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR029058 AB_hydrolase IPR013094 AB_hydrolase_3 IPR008728 Elongator_complex_protein_4 IPR027417 P-loop_NTPase IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR036167 tRNA_intron_Endo_cat-like_sf IPR006677 tRNA_intron_Endonuc_cat-like
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0033588 C:elongator holoenzyme complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000213 F:tRNA-intron endonuclease activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation GO:0002098 P:tRNA wobble uridine modification
Pfam	View protein in Pfam PF07859 Abhydrolase_3 PF05625 PAXNEB PF01974 tRNA_int_endo
CDD	cd19494 Elp4 cd22363 tRNA-intron_lyase_C

Amino Acid Sequences

MSLRKRNAVISSSGSAQAAQTKTDTTPIPGVRPSPLDGRPTTSSGTASLDNLLAGHSGIPMGTSLLIGEHGTTDFAGMLLRYYVAEGLVQGHQIHVLGLNEGWRAELPGLSTDSKSASKSEAPSEDKMKIAWRYENLGSAGAARDREAQRARSASNVGAATTFCHSFDLTKRLSPGDVKGQIGFHQSMTIPIPRTQPTSPFKVFIQDLASKLANSPPSYVHRVIVPNLLSPTMYSSSSSRPQEVLQFLHALRSLLRQYPKVLTAILTLPLSLYPRTTGLTRWMELLCDGVLEFIPLQSTTIHKPPPSSKGEGKDDEKVQGRPKFPTNTQTTITDSVIANVIMASALSHDDRPLVRISKVAGRYLLFDIDDVMYLRRNYNICSVFVGTIPQNPQQNVFMGLPLELMPEEAQVLVEKNAAYVADDDTFHPARLAAFDESSRRAYLQSLKNEGKKMQMAMIESNNRNRPLAQEGKSKKRKKKESQDPITDKLPGGDAEPDENIRIFDDSTPTPRKPTKKLPEEVEGYVLTPTTSSFLLQSPSSSNPEPSVAVDVPASYPLFAHLHDKGYYMMPGLRFGCDYNVYPGDPLRFHSHFAGVHFGWDEEITMMDLVGGGRLATTVKKGYLFGGAVGDASTIQKSGDDHVSRDEENGKVKPSGGPVAPPVRTFCLEWAGIWKSLSIICSAKVATRRYDSPPFQGEVRNCFLIQASKLQGSRRDLNTIVGRVANETHRTLHTYKHTMSTDNKNTPEVSIHDIGPPPVEEDYVNPANKSPRWLLGAHAYTLRFLASFGFNLGNRSGLPAPPPTETIWLDSTLSEWKGKETISANIWAPPDSAQPSSTEKRPVVINFHGGGFILGRGTDDSRWADALVKGLGAVVFSVNYRLAPGYPFPTPVEDCTDAIIQICRLAERYNFDTDRVILSGFSAGGTLATSSWIVLQDPARWNYEIPSPIPKIAGLVLFYPPLDWTLDRYQKRAACKEPDLTLPSSLTDLIDASYLHPHLPRRERTDIRLSPGLMPDELVDRLPPIHLCLCEYDMLLAEGQLFGERLEKRGKKVSVRVVEGEKHAWDKPLPLGPKGSVAFEYDIAIAAAKSWLEGQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.26
3	0.24
4	0.26
5	0.22
6	0.2
7	0.19
8	0.2
9	0.2
10	0.24
11	0.25
12	0.22
13	0.29
14	0.3
15	0.33
16	0.34
17	0.35
18	0.34
19	0.36
20	0.35
21	0.35
22	0.36
23	0.39
24	0.37
25	0.41
26	0.41
27	0.41
28	0.4
29	0.35
30	0.31
31	0.27
32	0.28
33	0.23
34	0.2
35	0.19
36	0.17
37	0.15
38	0.14
39	0.12
40	0.09
41	0.08
42	0.07
43	0.06
44	0.06
45	0.06
46	0.06
47	0.06
48	0.06
49	0.06
50	0.06
51	0.05
52	0.06
53	0.07
54	0.07
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.06
65	0.06
66	0.06
67	0.07
68	0.06
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.09
75	0.1
76	0.12
77	0.11
78	0.11
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.1
84	0.09
85	0.1
86	0.12
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.1
91	0.11
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.13
96	0.16
97	0.17
98	0.17
99	0.17
100	0.2
101	0.21
102	0.21
103	0.2
104	0.2
105	0.23
106	0.26
107	0.32
108	0.36
109	0.39
110	0.43
111	0.46
112	0.44
113	0.4
114	0.38
115	0.38
116	0.36
117	0.36
118	0.36
119	0.35
120	0.38
121	0.39
122	0.42
123	0.36
124	0.32
125	0.27
126	0.23
127	0.22
128	0.18
129	0.17
130	0.14
131	0.21
132	0.22
133	0.3
134	0.33
135	0.34
136	0.38
137	0.42
138	0.41
139	0.38
140	0.39
141	0.32
142	0.32
143	0.29
144	0.23
145	0.2
146	0.19
147	0.17
148	0.17
149	0.16
150	0.11
151	0.12
152	0.12
153	0.15
154	0.2
155	0.25
156	0.25
157	0.27
158	0.29
159	0.29
160	0.31
161	0.31
162	0.3
163	0.33
164	0.34
165	0.33
166	0.33
167	0.33
168	0.32
169	0.34
170	0.3
171	0.21
172	0.19
173	0.17
174	0.18
175	0.2
176	0.22
177	0.2
178	0.23
179	0.27
180	0.27
181	0.32
182	0.32
183	0.38
184	0.39
185	0.44
186	0.43
187	0.41
188	0.39
189	0.4
190	0.39
191	0.32
192	0.33
193	0.28
194	0.27
195	0.28
196	0.28
197	0.22
198	0.23
199	0.25
200	0.23
201	0.21
202	0.21
203	0.21
204	0.26
205	0.33
206	0.33
207	0.3
208	0.3
209	0.32
210	0.32
211	0.33
212	0.29
213	0.25
214	0.25
215	0.24
216	0.2
217	0.17
218	0.19
219	0.16
220	0.15
221	0.14
222	0.15
223	0.2
224	0.28
225	0.3
226	0.28
227	0.28
228	0.29
229	0.33
230	0.34
231	0.31
232	0.25
233	0.26
234	0.24
235	0.26
236	0.25
237	0.19
238	0.16
239	0.19
240	0.2
241	0.22
242	0.26
243	0.25
244	0.28
245	0.31
246	0.32
247	0.28
248	0.26
249	0.21
250	0.19
251	0.19
252	0.18
253	0.14
254	0.12
255	0.11
256	0.12
257	0.13
258	0.11
259	0.1
260	0.09
261	0.1
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.2
266	0.24
267	0.23
268	0.25
269	0.24
270	0.23
271	0.22
272	0.22
273	0.13
274	0.09
275	0.08
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.05
281	0.06
282	0.05
283	0.06
284	0.06
285	0.09
286	0.12
287	0.18
288	0.21
289	0.21
290	0.26
291	0.3
292	0.37
293	0.4
294	0.43
295	0.43
296	0.47
297	0.53
298	0.54
299	0.53
300	0.51
301	0.48
302	0.47
303	0.45
304	0.42
305	0.43
306	0.43
307	0.43
308	0.41
309	0.45
310	0.46
311	0.45
312	0.5
313	0.48
314	0.46
315	0.46
316	0.44
317	0.41
318	0.38
319	0.35
320	0.29
321	0.22
322	0.19
323	0.17
324	0.15
325	0.11
326	0.08
327	0.07
328	0.04
329	0.04
330	0.03
331	0.03
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.09
337	0.09
338	0.11
339	0.14
340	0.15
341	0.15
342	0.16
343	0.18
344	0.23
345	0.25
346	0.24
347	0.23
348	0.21
349	0.23
350	0.23
351	0.22
352	0.15
353	0.13
354	0.12
355	0.1
356	0.11
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.1
361	0.11
362	0.13
363	0.14
364	0.15
365	0.22
366	0.23
367	0.21
368	0.23
369	0.24
370	0.2
371	0.2
372	0.2
373	0.13
374	0.15
375	0.17
376	0.18
377	0.2
378	0.2
379	0.22
380	0.21
381	0.21
382	0.21
383	0.18
384	0.15
385	0.12
386	0.12
387	0.1
388	0.09
389	0.09
390	0.05
391	0.06
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.05
400	0.07
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.07
408	0.07
409	0.08
410	0.09
411	0.13
412	0.14
413	0.13
414	0.12
415	0.11
416	0.1
417	0.11
418	0.13
419	0.09
420	0.09
421	0.1
422	0.13
423	0.15
424	0.16
425	0.15
426	0.13
427	0.13
428	0.14
429	0.22
430	0.26
431	0.29
432	0.35
433	0.39
434	0.43
435	0.45
436	0.43
437	0.39
438	0.34
439	0.29
440	0.24
441	0.22
442	0.19
443	0.19
444	0.23
445	0.25
446	0.25
447	0.3
448	0.31
449	0.3
450	0.29
451	0.27
452	0.25
453	0.26
454	0.32
455	0.3
456	0.36
457	0.41
458	0.52
459	0.62
460	0.68
461	0.69
462	0.72
463	0.79
464	0.8
465	0.85
466	0.86
467	0.87
468	0.88
469	0.9
470	0.85
471	0.78
472	0.68
473	0.58
474	0.47
475	0.36
476	0.27
477	0.17
478	0.12
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.08
487	0.07
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.09
492	0.09
493	0.15
494	0.2
495	0.2
496	0.24
497	0.29
498	0.34
499	0.38
500	0.48
501	0.52
502	0.56
503	0.61
504	0.61
505	0.61
506	0.59
507	0.54
508	0.45
509	0.34
510	0.26
511	0.2
512	0.16
513	0.1
514	0.06
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.06
520	0.07
521	0.08
522	0.08
523	0.09
524	0.1
525	0.12
526	0.15
527	0.15
528	0.14
529	0.14
530	0.15
531	0.14
532	0.12
533	0.14
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.08
539	0.09
540	0.09
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.07
546	0.1
547	0.1
548	0.13
549	0.13
550	0.14
551	0.13
552	0.13
553	0.13
554	0.1
555	0.11
556	0.09
557	0.11
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.11
563	0.11
564	0.11
565	0.12
566	0.13
567	0.12
568	0.12
569	0.13
570	0.13
571	0.12
572	0.14
573	0.17
574	0.17
575	0.18
576	0.19
577	0.2
578	0.19
579	0.2
580	0.22
581	0.15
582	0.15
583	0.14
584	0.13
585	0.1
586	0.09
587	0.09
588	0.04
589	0.05
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.02
599	0.02
600	0.03
601	0.03
602	0.04
603	0.05
604	0.06
605	0.07
606	0.08
607	0.09
608	0.09
609	0.11
610	0.11
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.08
615	0.07
616	0.07
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.04
621	0.04
622	0.05
623	0.05
624	0.08
625	0.14
626	0.15
627	0.16
628	0.18
629	0.21
630	0.2
631	0.21
632	0.21
633	0.16
634	0.19
635	0.2
636	0.19
637	0.17
638	0.17
639	0.17
640	0.17
641	0.19
642	0.15
643	0.15
644	0.18
645	0.22
646	0.23
647	0.22
648	0.21
649	0.21
650	0.22
651	0.21
652	0.18
653	0.16
654	0.15
655	0.15
656	0.18
657	0.17
658	0.17
659	0.16
660	0.15
661	0.12
662	0.13
663	0.13
664	0.11
665	0.09
666	0.09
667	0.1
668	0.11
669	0.13
670	0.18
671	0.2
672	0.21
673	0.24
674	0.27
675	0.31
676	0.39
677	0.39
678	0.38
679	0.39
680	0.37
681	0.35
682	0.37
683	0.33
684	0.31
685	0.31
686	0.27
687	0.24
688	0.23
689	0.22
690	0.19
691	0.18
692	0.17
693	0.16
694	0.18
695	0.2
696	0.22
697	0.27
698	0.3
699	0.36
700	0.33
701	0.35
702	0.32
703	0.36
704	0.37
705	0.32
706	0.28
707	0.22
708	0.2
709	0.18
710	0.19
711	0.17
712	0.16
713	0.16
714	0.17
715	0.17
716	0.21
717	0.22
718	0.25
719	0.29
720	0.31
721	0.31
722	0.36
723	0.36
724	0.36
725	0.41
726	0.45
727	0.47
728	0.48
729	0.48
730	0.42
731	0.42
732	0.38
733	0.35
734	0.27
735	0.24
736	0.2
737	0.2
738	0.21
739	0.21
740	0.2
741	0.19
742	0.16
743	0.12
744	0.11
745	0.11
746	0.08
747	0.09
748	0.16
749	0.2
750	0.2
751	0.19
752	0.21
753	0.25
754	0.26
755	0.29
756	0.24
757	0.22
758	0.25
759	0.25
760	0.25
761	0.29
762	0.3
763	0.27
764	0.28
765	0.24
766	0.21
767	0.21
768	0.19
769	0.1
770	0.09
771	0.1
772	0.08
773	0.08
774	0.09
775	0.12
776	0.12
777	0.14
778	0.14
779	0.13
780	0.11
781	0.15
782	0.15
783	0.13
784	0.15
785	0.17
786	0.19
787	0.19
788	0.22
789	0.19
790	0.22
791	0.22
792	0.23
793	0.21
794	0.2
795	0.19
796	0.17
797	0.17
798	0.16
799	0.17
800	0.15
801	0.14
802	0.15
803	0.16
804	0.16
805	0.19
806	0.18
807	0.2
808	0.21
809	0.24
810	0.23
811	0.25
812	0.26
813	0.22
814	0.2
815	0.17
816	0.18
817	0.18
818	0.18
819	0.15
820	0.17
821	0.23
822	0.27
823	0.3
824	0.33
825	0.3
826	0.31
827	0.35
828	0.35
829	0.35
830	0.34
831	0.35
832	0.29
833	0.29
834	0.27
835	0.23
836	0.21
837	0.14
838	0.11
839	0.07
840	0.05
841	0.06
842	0.07
843	0.09
844	0.09
845	0.12
846	0.14
847	0.15
848	0.15
849	0.15
850	0.16
851	0.15
852	0.18
853	0.14
854	0.12
855	0.11
856	0.11
857	0.1
858	0.07
859	0.07
860	0.05
861	0.05
862	0.05
863	0.07
864	0.07
865	0.07
866	0.08
867	0.08
868	0.09
869	0.1
870	0.13
871	0.15
872	0.16
873	0.18
874	0.18
875	0.22
876	0.23
877	0.23
878	0.27
879	0.26
880	0.25
881	0.26
882	0.25
883	0.21
884	0.2
885	0.19
886	0.12
887	0.12
888	0.12
889	0.1
890	0.11
891	0.13
892	0.15
893	0.2
894	0.23
895	0.29
896	0.3
897	0.3
898	0.31
899	0.3
900	0.29
901	0.24
902	0.21
903	0.13
904	0.12
905	0.12
906	0.1
907	0.09
908	0.07
909	0.06
910	0.05
911	0.06
912	0.05
913	0.04
914	0.05
915	0.05
916	0.06
917	0.07
918	0.08
919	0.08
920	0.11
921	0.13
922	0.18
923	0.24
924	0.27
925	0.29
926	0.29
927	0.29
928	0.28
929	0.33
930	0.29
931	0.26
932	0.31
933	0.31
934	0.31
935	0.31
936	0.29
937	0.24
938	0.23
939	0.22
940	0.15
941	0.14
942	0.14
943	0.14
944	0.14
945	0.13
946	0.12
947	0.11
948	0.12
949	0.11
950	0.15
951	0.24
952	0.34
953	0.36
954	0.38
955	0.45
956	0.47
957	0.55
958	0.57
959	0.55
960	0.55
961	0.58
962	0.6
963	0.56
964	0.58
965	0.54
966	0.48
967	0.42
968	0.34
969	0.3
970	0.26
971	0.23
972	0.17
973	0.13
974	0.11
975	0.09
976	0.09
977	0.09
978	0.09
979	0.13
980	0.13
981	0.14
982	0.18
983	0.23
984	0.32
985	0.41
986	0.47
987	0.51
988	0.61
989	0.65
990	0.68
991	0.74
992	0.69
993	0.67
994	0.64
995	0.58
996	0.52
997	0.5
998	0.46
999	0.35
1000	0.3
1001	0.24
1002	0.21
1003	0.2
1004	0.17
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.12
1008	0.14
1009	0.13
1010	0.15
1011	0.18
1012	0.18
1013	0.2
1014	0.22
1015	0.23
1016	0.23
1017	0.22
1018	0.19
1019	0.16
1020	0.16
1021	0.14
1022	0.11
1023	0.09
1024	0.08
1025	0.08
1026	0.08
1027	0.07
1028	0.06
1029	0.13
1030	0.13
1031	0.17
1032	0.27
1033	0.31
1034	0.36
1035	0.46
1036	0.52
1037	0.55
1038	0.63
1039	0.7
1040	0.68
1041	0.69
1042	0.69
1043	0.66
1044	0.64
1045	0.59
1046	0.53
1047	0.46
1048	0.41
1049	0.37
1050	0.35
1051	0.3
1052	0.29
1053	0.31
1054	0.36
1055	0.37
1056	0.36
1057	0.39
1058	0.36
1059	0.42
1060	0.4
1061	0.36
1062	0.29
1063	0.29
1064	0.28
1065	0.24
1066	0.25
1067	0.18
1068	0.17
1069	0.14
1070	0.13
1071	0.1
1072	0.08
1073	0.09
1074	0.07

A0A553HLR4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer