FuNGI

A0A553HWB4

Protein Details

Accession

A0A553HWB4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
441-470	IYSWKTNRRSTYHRKRKRWVKTRHIIDTTR	Hydrophilic
603-626	EGKVEARGKLRSRKRKVDDQNAAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
453-460	HRKRKRWV
603-618	EGKVEARGKLRSRKRK

Subcellular Location(s)

mito 15.5, cyto_mito 11.5, cyto 6.5, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MHSLVQPNSWVALRLPSGNLRVLQVAPNTTISLGKYGSFPTNLIIQRPYHLTYELQDRQPNENFNRLRIVPAAELYADILAEGEKTPVSEDATPAPDVEGADNGPSEAVEYSLVDPDSGAVVATTDRAEIDASARQTLTLDEIEALKKDGTDAGRALIAKLMLSHTAIDQKTEYSLAKYKLLKTRKYIRRFSILPLDVPMLDYWTLEDKDASRIMEMREEMIGLLGCWANVHFGGTDPCEAPPTLKTEQEGEDTKMEEPELVQTSAPGRWLVVDDTGGLLVAAMAERMGILYASEEDKLNREQRGAKHSNSRQGGSTAGQQPQIKDEEGSTQVPARQEDGSEVKPESEGATQSKSPQTSHKRPAEHVVPYAHANTITHIHPNAQPNLSFLRYYDFDITNPTHTPYHPLAKHLMTLSWLQLLEPELDSTYNSPPPRATPEEIYSWKTNRRSTYHRKRKRWVKTRHIIDTTRKGEFSGLVVASSMDPISIMRHAVPLLAGGAPIAIYSQSIEALTELADCYSLGRRAAWATNMPEGLADKTLEEQEKWTGNDDFPLNPSLVLGASIQTSRVRKWQVLPGRTHPLMSGKGGSEGYIFTAWRVKPAEGKVEARGKLRSRKRKVDDQNAAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.24
3	0.26
4	0.29
5	0.31
6	0.31
7	0.27
8	0.28
9	0.27
10	0.28
11	0.26
12	0.26
13	0.24
14	0.24
15	0.23
16	0.21
17	0.22
18	0.18
19	0.18
20	0.16
21	0.15
22	0.16
23	0.18
24	0.21
25	0.2
26	0.2
27	0.19
28	0.26
29	0.27
30	0.28
31	0.29
32	0.26
33	0.28
34	0.32
35	0.33
36	0.27
37	0.28
38	0.26
39	0.26
40	0.35
41	0.38
42	0.39
43	0.41
44	0.42
45	0.47
46	0.5
47	0.55
48	0.49
49	0.52
50	0.48
51	0.47
52	0.5
53	0.44
54	0.42
55	0.36
56	0.35
57	0.27
58	0.26
59	0.25
60	0.18
61	0.18
62	0.16
63	0.13
64	0.09
65	0.07
66	0.06
67	0.05
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.08
74	0.09
75	0.12
76	0.12
77	0.14
78	0.17
79	0.2
80	0.2
81	0.19
82	0.18
83	0.16
84	0.16
85	0.15
86	0.12
87	0.1
88	0.1
89	0.1
90	0.09
91	0.08
92	0.07
93	0.07
94	0.06
95	0.06
96	0.06
97	0.07
98	0.08
99	0.11
100	0.11
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.09
105	0.08
106	0.07
107	0.04
108	0.05
109	0.05
110	0.06
111	0.06
112	0.05
113	0.05
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.09
118	0.12
119	0.13
120	0.14
121	0.14
122	0.14
123	0.14
124	0.14
125	0.14
126	0.1
127	0.1
128	0.09
129	0.11
130	0.12
131	0.12
132	0.13
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.13
137	0.13
138	0.14
139	0.14
140	0.14
141	0.16
142	0.16
143	0.16
144	0.14
145	0.12
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.16
154	0.16
155	0.16
156	0.16
157	0.15
158	0.16
159	0.17
160	0.17
161	0.14
162	0.2
163	0.21
164	0.26
165	0.29
166	0.34
167	0.41
168	0.48
169	0.49
170	0.52
171	0.61
172	0.64
173	0.7
174	0.71
175	0.68
176	0.68
177	0.65
178	0.62
179	0.61
180	0.53
181	0.44
182	0.38
183	0.34
184	0.26
185	0.25
186	0.2
187	0.11
188	0.1
189	0.09
190	0.08
191	0.11
192	0.12
193	0.11
194	0.12
195	0.11
196	0.14
197	0.16
198	0.15
199	0.12
200	0.14
201	0.14
202	0.17
203	0.16
204	0.14
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.1
209	0.09
210	0.05
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.07
222	0.08
223	0.1
224	0.09
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.15
231	0.16
232	0.16
233	0.17
234	0.18
235	0.2
236	0.22
237	0.23
238	0.2
239	0.19
240	0.19
241	0.19
242	0.17
243	0.15
244	0.11
245	0.09
246	0.1
247	0.11
248	0.11
249	0.1
250	0.1
251	0.12
252	0.12
253	0.13
254	0.09
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.04
266	0.03
267	0.03
268	0.02
269	0.02
270	0.02
271	0.02
272	0.02
273	0.02
274	0.02
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.03
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.08
285	0.12
286	0.15
287	0.15
288	0.16
289	0.21
290	0.24
291	0.33
292	0.35
293	0.35
294	0.41
295	0.44
296	0.5
297	0.47
298	0.44
299	0.36
300	0.32
301	0.31
302	0.22
303	0.25
304	0.21
305	0.2
306	0.23
307	0.23
308	0.22
309	0.23
310	0.24
311	0.19
312	0.15
313	0.13
314	0.13
315	0.14
316	0.15
317	0.13
318	0.12
319	0.14
320	0.15
321	0.15
322	0.14
323	0.11
324	0.11
325	0.13
326	0.16
327	0.15
328	0.15
329	0.15
330	0.13
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.12
338	0.13
339	0.15
340	0.18
341	0.18
342	0.18
343	0.26
344	0.34
345	0.4
346	0.49
347	0.53
348	0.53
349	0.53
350	0.59
351	0.55
352	0.48
353	0.42
354	0.34
355	0.29
356	0.28
357	0.27
358	0.2
359	0.15
360	0.13
361	0.11
362	0.12
363	0.11
364	0.12
365	0.11
366	0.13
367	0.17
368	0.21
369	0.24
370	0.22
371	0.22
372	0.22
373	0.24
374	0.23
375	0.19
376	0.15
377	0.16
378	0.16
379	0.18
380	0.2
381	0.17
382	0.16
383	0.2
384	0.21
385	0.2
386	0.2
387	0.2
388	0.17
389	0.17
390	0.22
391	0.22
392	0.29
393	0.27
394	0.29
395	0.31
396	0.3
397	0.32
398	0.27
399	0.24
400	0.17
401	0.17
402	0.15
403	0.14
404	0.13
405	0.1
406	0.11
407	0.12
408	0.11
409	0.1
410	0.1
411	0.08
412	0.08
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.16
417	0.16
418	0.17
419	0.17
420	0.2
421	0.26
422	0.29
423	0.29
424	0.29
425	0.31
426	0.37
427	0.39
428	0.41
429	0.38
430	0.37
431	0.41
432	0.42
433	0.44
434	0.43
435	0.47
436	0.52
437	0.6
438	0.68
439	0.72
440	0.77
441	0.82
442	0.86
443	0.91
444	0.92
445	0.91
446	0.91
447	0.9
448	0.9
449	0.89
450	0.88
451	0.84
452	0.79
453	0.76
454	0.76
455	0.69
456	0.61
457	0.52
458	0.43
459	0.37
460	0.32
461	0.25
462	0.2
463	0.16
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.12
468	0.12
469	0.1
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.08
477	0.09
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.04
490	0.03
491	0.03
492	0.04
493	0.05
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.07
506	0.1
507	0.12
508	0.12
509	0.13
510	0.14
511	0.17
512	0.2
513	0.22
514	0.24
515	0.25
516	0.28
517	0.28
518	0.26
519	0.24
520	0.22
521	0.21
522	0.17
523	0.14
524	0.11
525	0.13
526	0.17
527	0.18
528	0.17
529	0.18
530	0.21
531	0.25
532	0.26
533	0.28
534	0.26
535	0.25
536	0.29
537	0.28
538	0.24
539	0.23
540	0.23
541	0.19
542	0.17
543	0.16
544	0.13
545	0.11
546	0.1
547	0.08
548	0.07
549	0.09
550	0.09
551	0.11
552	0.16
553	0.18
554	0.2
555	0.27
556	0.32
557	0.35
558	0.4
559	0.48
560	0.53
561	0.58
562	0.62
563	0.62
564	0.66
565	0.62
566	0.58
567	0.5
568	0.45
569	0.41
570	0.37
571	0.33
572	0.24
573	0.27
574	0.27
575	0.25
576	0.2
577	0.17
578	0.17
579	0.15
580	0.14
581	0.12
582	0.2
583	0.19
584	0.24
585	0.27
586	0.26
587	0.31
588	0.36
589	0.43
590	0.42
591	0.45
592	0.47
593	0.52
594	0.54
595	0.51
596	0.55
597	0.54
598	0.59
599	0.67
600	0.7
601	0.72
602	0.79
603	0.83
604	0.86
605	0.89
606	0.9

A0A553HWB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer