FuNGI

A0A553HN94

Protein Details

Accession

A0A553HN94

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-124	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito_nucl 8.666, nucl 8.5, mito 8.5, cyto_nucl 8.333, cyto_mito 8.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPAAFRWLSTKYPKIISPVVEDKPIVMDDGSVIPVDTTRPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPKDEEEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKDKQADKEELLKMIKQQNGGVLPPETLASLTKKAFDSNSITPGTPFMDILAISLRYWCAYKLNTDPGWANMKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPDHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQEGKARTCKICGQKGHDAQNCRGDTKQKDGEFDEKEKAVQQKPFIWLHVSVLREYLAVELEVPGLPFRWDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPALEIRENGIDTLTAIWRDNLTFMGGYMTKDGHVDLERAQYILDGLGKQEDAIFRRRKEVEDRREASFKRRKLQEQQRNGQNFSKGAKGYGDVPENGAPSGLPLTHDMIVKRGATAGDANTANKSAAAVLKSQIQGLMATSKKDETETPETQTPPSALAKRKASMMEADNVSTTGSESTSSDEPEDSVRLWEDGYADRYYEAKFHVDAKDLDFRRKVAWAYTEGLAWVLRYYFQGCPSWEWFYPYHYAPFAQDFTDLAKLEIKFEKGRIARPFEQLMSVQPAASRHVLPDVFHPLMTDSESPIIDFYPEDFVVDLNGKKMAWQGVALLPFIEMPRLLAAIEEKYPLLSADDAARNEPGREYLLLSEENQELYDDITAHFYSKKQGAPKYKLDPRKSQGLSGKIEKMPDYLPHSTLEYPLERKELPDVDNDRSLTTHYDMPSSSHTHKSMLLRGVRLPVPALNSSDIEELKGKIRNSGRSYRGAPLGRQHNDGRRERMNYGPDSRRNGNNRQSSQYSNGGRHSGYNAFPGPPPVIPTGWAPPPPGFPGFGNGLPPPPPPAYHGPGRGGYGNGYGNSGGQAHNQWNAPPGVPPYQDYGRQYNGPPPGYQGQDRRPYDDGRGQRGGYK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.49
4	0.51
5	0.47
6	0.47
7	0.48
8	0.46
9	0.45
10	0.42
11	0.36
12	0.34
13	0.31
14	0.24
15	0.16
16	0.13
17	0.11
18	0.13
19	0.13
20	0.1
21	0.1
22	0.09
23	0.09
24	0.12
25	0.14
26	0.17
27	0.23
28	0.26
29	0.29
30	0.32
31	0.36
32	0.39
33	0.37
34	0.38
35	0.34
36	0.35
37	0.32
38	0.3
39	0.26
40	0.21
41	0.19
42	0.13
43	0.1
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.13
50	0.18
51	0.21
52	0.22
53	0.28
54	0.37
55	0.45
56	0.52
57	0.55
58	0.55
59	0.53
60	0.55
61	0.49
62	0.46
63	0.39
64	0.33
65	0.27
66	0.23
67	0.21
68	0.18
69	0.16
70	0.11
71	0.1
72	0.1
73	0.13
74	0.13
75	0.17
76	0.2
77	0.28
78	0.37
79	0.44
80	0.46
81	0.44
82	0.46
83	0.45
84	0.44
85	0.39
86	0.32
87	0.28
88	0.26
89	0.24
90	0.24
91	0.21
92	0.2
93	0.18
94	0.15
95	0.1
96	0.13
97	0.19
98	0.26
99	0.36
100	0.45
101	0.55
102	0.66
103	0.73
104	0.79
105	0.81
106	0.77
107	0.74
108	0.75
109	0.75
110	0.73
111	0.76
112	0.72
113	0.69
114	0.71
115	0.66
116	0.57
117	0.55
118	0.49
119	0.41
120	0.43
121	0.41
122	0.39
123	0.4
124	0.39
125	0.38
126	0.42
127	0.42
128	0.35
129	0.34
130	0.33
131	0.33
132	0.33
133	0.29
134	0.22
135	0.2
136	0.18
137	0.18
138	0.12
139	0.11
140	0.12
141	0.13
142	0.17
143	0.17
144	0.2
145	0.2
146	0.23
147	0.23
148	0.25
149	0.28
150	0.27
151	0.32
152	0.31
153	0.3
154	0.28
155	0.28
156	0.25
157	0.19
158	0.16
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.11
170	0.11
171	0.13
172	0.14
173	0.18
174	0.23
175	0.31
176	0.31
177	0.33
178	0.33
179	0.32
180	0.37
181	0.32
182	0.27
183	0.21
184	0.21
185	0.18
186	0.18
187	0.15
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.14
202	0.16
203	0.17
204	0.21
205	0.28
206	0.29
207	0.3
208	0.32
209	0.36
210	0.41
211	0.43
212	0.5
213	0.48
214	0.52
215	0.54
216	0.52
217	0.54
218	0.48
219	0.42
220	0.33
221	0.27
222	0.22
223	0.22
224	0.19
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.07
238	0.07
239	0.11
240	0.13
241	0.13
242	0.17
243	0.19
244	0.23
245	0.25
246	0.25
247	0.24
248	0.26
249	0.25
250	0.21
251	0.26
252	0.23
253	0.24
254	0.26
255	0.26
256	0.23
257	0.27
258	0.33
259	0.35
260	0.4
261	0.43
262	0.47
263	0.54
264	0.6
265	0.67
266	0.64
267	0.61
268	0.56
269	0.6
270	0.54
271	0.45
272	0.41
273	0.39
274	0.37
275	0.41
276	0.45
277	0.38
278	0.4
279	0.41
280	0.46
281	0.44
282	0.44
283	0.39
284	0.32
285	0.31
286	0.32
287	0.35
288	0.33
289	0.32
290	0.32
291	0.33
292	0.38
293	0.38
294	0.35
295	0.31
296	0.27
297	0.27
298	0.27
299	0.23
300	0.18
301	0.18
302	0.17
303	0.14
304	0.14
305	0.11
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.09
319	0.1
320	0.11
321	0.15
322	0.16
323	0.16
324	0.19
325	0.18
326	0.15
327	0.14
328	0.13
329	0.1
330	0.08
331	0.08
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.06
344	0.07
345	0.1
346	0.12
347	0.13
348	0.13
349	0.14
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.08
354	0.05
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.13
380	0.13
381	0.12
382	0.12
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.09
394	0.1
395	0.18
396	0.24
397	0.24
398	0.3
399	0.32
400	0.33
401	0.42
402	0.5
403	0.51
404	0.56
405	0.58
406	0.55
407	0.6
408	0.58
409	0.58
410	0.55
411	0.51
412	0.49
413	0.52
414	0.55
415	0.59
416	0.7
417	0.7
418	0.72
419	0.75
420	0.76
421	0.73
422	0.7
423	0.62
424	0.53
425	0.45
426	0.36
427	0.32
428	0.23
429	0.2
430	0.17
431	0.15
432	0.16
433	0.17
434	0.18
435	0.14
436	0.15
437	0.16
438	0.15
439	0.15
440	0.12
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.06
445	0.05
446	0.06
447	0.08
448	0.1
449	0.12
450	0.11
451	0.12
452	0.14
453	0.13
454	0.12
455	0.11
456	0.09
457	0.08
458	0.09
459	0.08
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.1
464	0.11
465	0.1
466	0.09
467	0.08
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.08
473	0.12
474	0.12
475	0.12
476	0.12
477	0.1
478	0.09
479	0.09
480	0.13
481	0.1
482	0.1
483	0.11
484	0.11
485	0.11
486	0.12
487	0.12
488	0.14
489	0.21
490	0.22
491	0.25
492	0.28
493	0.28
494	0.27
495	0.27
496	0.21
497	0.16
498	0.17
499	0.2
500	0.2
501	0.25
502	0.28
503	0.28
504	0.29
505	0.28
506	0.25
507	0.24
508	0.22
509	0.2
510	0.18
511	0.17
512	0.15
513	0.15
514	0.14
515	0.1
516	0.09
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.08
522	0.09
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.1
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.08
537	0.11
538	0.1
539	0.1
540	0.1
541	0.12
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.1
546	0.1
547	0.14
548	0.15
549	0.16
550	0.17
551	0.19
552	0.26
553	0.26
554	0.29
555	0.27
556	0.26
557	0.25
558	0.26
559	0.24
560	0.18
561	0.19
562	0.18
563	0.2
564	0.19
565	0.18
566	0.16
567	0.15
568	0.13
569	0.1
570	0.07
571	0.05
572	0.05
573	0.06
574	0.08
575	0.09
576	0.11
577	0.14
578	0.15
579	0.19
580	0.21
581	0.24
582	0.22
583	0.24
584	0.22
585	0.22
586	0.25
587	0.22
588	0.21
589	0.18
590	0.18
591	0.15
592	0.18
593	0.16
594	0.13
595	0.12
596	0.11
597	0.12
598	0.15
599	0.14
600	0.12
601	0.15
602	0.14
603	0.17
604	0.19
605	0.2
606	0.18
607	0.18
608	0.25
609	0.23
610	0.3
611	0.32
612	0.38
613	0.39
614	0.41
615	0.43
616	0.36
617	0.36
618	0.3
619	0.26
620	0.23
621	0.2
622	0.16
623	0.15
624	0.15
625	0.16
626	0.18
627	0.16
628	0.11
629	0.15
630	0.15
631	0.15
632	0.17
633	0.21
634	0.2
635	0.19
636	0.19
637	0.16
638	0.16
639	0.18
640	0.15
641	0.1
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.1
646	0.1
647	0.08
648	0.07
649	0.07
650	0.09
651	0.09
652	0.1
653	0.09
654	0.09
655	0.1
656	0.13
657	0.12
658	0.09
659	0.1
660	0.09
661	0.1
662	0.12
663	0.13
664	0.11
665	0.11
666	0.12
667	0.14
668	0.15
669	0.15
670	0.12
671	0.1
672	0.11
673	0.1
674	0.09
675	0.06
676	0.05
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.07
682	0.08
683	0.09
684	0.1
685	0.09
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.07
691	0.07
692	0.11
693	0.15
694	0.16
695	0.17
696	0.18
697	0.18
698	0.18
699	0.18
700	0.14
701	0.13
702	0.13
703	0.13
704	0.12
705	0.14
706	0.14
707	0.15
708	0.17
709	0.15
710	0.15
711	0.13
712	0.13
713	0.1
714	0.1
715	0.1
716	0.07
717	0.07
718	0.09
719	0.09
720	0.1
721	0.11
722	0.12
723	0.15
724	0.19
725	0.23
726	0.27
727	0.35
728	0.44
729	0.49
730	0.57
731	0.62
732	0.67
733	0.72
734	0.72
735	0.74
736	0.68
737	0.72
738	0.65
739	0.63
740	0.61
741	0.58
742	0.56
743	0.52
744	0.54
745	0.45
746	0.46
747	0.39
748	0.35
749	0.3
750	0.29
751	0.3
752	0.26
753	0.26
754	0.25
755	0.27
756	0.26
757	0.26
758	0.25
759	0.22
760	0.22
761	0.23
762	0.25
763	0.23
764	0.23
765	0.27
766	0.27
767	0.24
768	0.3
769	0.33
770	0.33
771	0.37
772	0.37
773	0.32
774	0.29
775	0.29
776	0.23
777	0.22
778	0.22
779	0.18
780	0.2
781	0.2
782	0.22
783	0.24
784	0.27
785	0.28
786	0.3
787	0.3
788	0.3
789	0.35
790	0.36
791	0.39
792	0.4
793	0.4
794	0.37
795	0.38
796	0.41
797	0.38
798	0.34
799	0.29
800	0.24
801	0.23
802	0.23
803	0.23
804	0.2
805	0.2
806	0.21
807	0.22
808	0.2
809	0.18
810	0.18
811	0.17
812	0.2
813	0.24
814	0.23
815	0.28
816	0.33
817	0.4
818	0.45
819	0.53
820	0.53
821	0.55
822	0.58
823	0.55
824	0.58
825	0.52
826	0.48
827	0.48
828	0.53
829	0.5
830	0.51
831	0.52
832	0.53
833	0.59
834	0.62
835	0.61
836	0.58
837	0.59
838	0.58
839	0.59
840	0.57
841	0.54
842	0.57
843	0.58
844	0.58
845	0.61
846	0.62
847	0.64
848	0.64
849	0.67
850	0.68
851	0.69
852	0.67
853	0.67
854	0.66
855	0.62
856	0.61
857	0.6
858	0.56
859	0.5
860	0.49
861	0.45
862	0.41
863	0.38
864	0.36
865	0.32
866	0.28
867	0.29
868	0.28
869	0.26
870	0.27
871	0.28
872	0.26
873	0.22
874	0.24
875	0.22
876	0.2
877	0.2
878	0.23
879	0.25
880	0.28
881	0.29
882	0.28
883	0.27
884	0.3
885	0.33
886	0.31
887	0.28
888	0.24
889	0.26
890	0.27
891	0.26
892	0.26
893	0.23
894	0.24
895	0.23
896	0.24
897	0.24
898	0.22
899	0.22
900	0.25
901	0.31
902	0.34
903	0.4
904	0.44
905	0.43
906	0.44
907	0.45
908	0.42
909	0.35
910	0.31
911	0.28
912	0.26
913	0.22
914	0.21
915	0.19
916	0.17
917	0.17
918	0.17
919	0.13
920	0.13
921	0.17
922	0.18
923	0.22
924	0.23
925	0.23
926	0.27
927	0.28
928	0.25
929	0.25
930	0.26
931	0.29
932	0.29
933	0.3
934	0.32
935	0.35
936	0.4
937	0.42
938	0.43
939	0.42
940	0.44
941	0.44
942	0.45
943	0.48
944	0.45
945	0.4
946	0.41
947	0.42
948	0.43
949	0.48
950	0.49
951	0.51
952	0.59
953	0.61
954	0.6
955	0.58
956	0.56
957	0.57
958	0.57
959	0.56
960	0.54
961	0.57

A0A553HN94

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer