FuNGI

A0A553IFB2

Protein Details

Accession

A0A553IFB2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
403-425	APDDKPARKRGGRRARKAKEATA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
402-422	PAPDDKPARKRGGRRARKAKE

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC IPR027105 Prp31 IPR019175 Prp31_C
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000244 P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF09785 Prp31_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MSTLADELLQDFEDSGSENGDVQHDTGLDLDDGPVVSNGNHDENGDMMLDGDEEEELDDEDETMRDIGDITNAMEDESAAKARVEKMQLGNVKDVRKVTSVMDRLEPLLKDISRFESKPLSQATINVGNIEDNPEYKILTESNTLSTQIDGEIMKVHKFIRDHYSTRFPELETLIQNPIEYAKVVAILGNGPMDSDSIRAIQDSKDNSLGESLKSVLDGPSLMVVTVEATTSKGQEITQEELERILRACHMMIKMDKAKKTLTEYVQSRMSIFAPNLTAVVGSLTAAQLINTAGGLTNLSRVPACNIAAWGTNKSRSAAFATNTSIRQQGYLYYSPIIRGIPPDLKKKAMKAVAAKLVLAARADTSHATPDGSYGEELRIQCLERLDKITEPPPNKGQRALPAPDDKPARKRGGRRARKAKEATAMTELRKAQNRMAFGKEEKEAGYGTGDSTVGLGMIGQAGDGRIRGMQVDNRTRAKLSQKNKGWGGATPLGGAASSLRGFGQSAHNIDLRGKGLRTSGVGSTIGGGAGTASSLAFTPVQGLELVDPKVQAELSRKRKAEEDRWFKGGTFTQVGAASSTNGGFKVPAQPPSKKIDTGASKMGPPALPVKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.09
3	0.09
4	0.09
5	0.1
6	0.1
7	0.12
8	0.13
9	0.11
10	0.13
11	0.11
12	0.11
13	0.11
14	0.12
15	0.1
16	0.1
17	0.1
18	0.09
19	0.09
20	0.09
21	0.09
22	0.08
23	0.08
24	0.1
25	0.13
26	0.14
27	0.15
28	0.14
29	0.15
30	0.14
31	0.16
32	0.13
33	0.1
34	0.08
35	0.08
36	0.07
37	0.07
38	0.07
39	0.06
40	0.05
41	0.06
42	0.05
43	0.06
44	0.06
45	0.06
46	0.06
47	0.07
48	0.07
49	0.08
50	0.07
51	0.07
52	0.06
53	0.07
54	0.07
55	0.08
56	0.09
57	0.08
58	0.1
59	0.1
60	0.1
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.1
65	0.1
66	0.09
67	0.1
68	0.12
69	0.15
70	0.2
71	0.22
72	0.26
73	0.28
74	0.35
75	0.4
76	0.4
77	0.45
78	0.45
79	0.44
80	0.42
81	0.41
82	0.36
83	0.33
84	0.32
85	0.28
86	0.32
87	0.34
88	0.33
89	0.34
90	0.31
91	0.31
92	0.34
93	0.31
94	0.24
95	0.25
96	0.23
97	0.22
98	0.23
99	0.27
100	0.29
101	0.3
102	0.31
103	0.33
104	0.33
105	0.37
106	0.38
107	0.35
108	0.3
109	0.31
110	0.34
111	0.31
112	0.31
113	0.26
114	0.23
115	0.2
116	0.2
117	0.22
118	0.17
119	0.11
120	0.13
121	0.12
122	0.12
123	0.12
124	0.14
125	0.1
126	0.12
127	0.14
128	0.14
129	0.17
130	0.18
131	0.19
132	0.17
133	0.17
134	0.15
135	0.12
136	0.12
137	0.09
138	0.08
139	0.12
140	0.13
141	0.13
142	0.14
143	0.15
144	0.17
145	0.18
146	0.21
147	0.25
148	0.31
149	0.33
150	0.37
151	0.46
152	0.44
153	0.48
154	0.45
155	0.37
156	0.34
157	0.33
158	0.31
159	0.23
160	0.24
161	0.22
162	0.2
163	0.2
164	0.16
165	0.15
166	0.12
167	0.1
168	0.08
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.14
190	0.15
191	0.17
192	0.19
193	0.19
194	0.19
195	0.21
196	0.21
197	0.16
198	0.15
199	0.14
200	0.1
201	0.1
202	0.11
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.05
217	0.06
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.11
223	0.14
224	0.16
225	0.18
226	0.18
227	0.18
228	0.19
229	0.19
230	0.16
231	0.13
232	0.1
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.1
237	0.1
238	0.13
239	0.13
240	0.18
241	0.25
242	0.29
243	0.31
244	0.3
245	0.3
246	0.3
247	0.35
248	0.35
249	0.31
250	0.34
251	0.34
252	0.36
253	0.37
254	0.35
255	0.3
256	0.24
257	0.22
258	0.16
259	0.14
260	0.12
261	0.1
262	0.1
263	0.09
264	0.08
265	0.07
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.03
270	0.04
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.03
279	0.04
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.03
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.12
296	0.13
297	0.15
298	0.14
299	0.16
300	0.16
301	0.17
302	0.16
303	0.14
304	0.17
305	0.17
306	0.17
307	0.16
308	0.19
309	0.2
310	0.21
311	0.21
312	0.18
313	0.15
314	0.15
315	0.13
316	0.13
317	0.15
318	0.15
319	0.15
320	0.14
321	0.15
322	0.14
323	0.15
324	0.13
325	0.09
326	0.09
327	0.11
328	0.17
329	0.21
330	0.27
331	0.29
332	0.33
333	0.34
334	0.35
335	0.39
336	0.36
337	0.36
338	0.34
339	0.38
340	0.38
341	0.37
342	0.34
343	0.29
344	0.25
345	0.22
346	0.17
347	0.12
348	0.06
349	0.06
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.08
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.12
367	0.11
368	0.13
369	0.15
370	0.16
371	0.14
372	0.17
373	0.18
374	0.18
375	0.2
376	0.24
377	0.28
378	0.28
379	0.31
380	0.36
381	0.41
382	0.41
383	0.42
384	0.39
385	0.4
386	0.44
387	0.42
388	0.39
389	0.39
390	0.38
391	0.41
392	0.44
393	0.41
394	0.41
395	0.46
396	0.48
397	0.48
398	0.55
399	0.61
400	0.66
401	0.73
402	0.78
403	0.82
404	0.8
405	0.84
406	0.81
407	0.74
408	0.71
409	0.63
410	0.55
411	0.5
412	0.47
413	0.38
414	0.39
415	0.36
416	0.32
417	0.36
418	0.35
419	0.33
420	0.34
421	0.37
422	0.35
423	0.36
424	0.35
425	0.31
426	0.33
427	0.29
428	0.27
429	0.23
430	0.21
431	0.18
432	0.14
433	0.14
434	0.11
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.08
439	0.07
440	0.07
441	0.05
442	0.05
443	0.04
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.07
456	0.1
457	0.14
458	0.23
459	0.31
460	0.37
461	0.4
462	0.41
463	0.41
464	0.43
465	0.48
466	0.48
467	0.48
468	0.52
469	0.56
470	0.63
471	0.64
472	0.63
473	0.55
474	0.48
475	0.48
476	0.42
477	0.34
478	0.27
479	0.24
480	0.2
481	0.18
482	0.16
483	0.09
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.11
491	0.17
492	0.19
493	0.21
494	0.24
495	0.25
496	0.25
497	0.27
498	0.28
499	0.23
500	0.22
501	0.2
502	0.19
503	0.19
504	0.2
505	0.21
506	0.2
507	0.19
508	0.18
509	0.18
510	0.16
511	0.16
512	0.14
513	0.12
514	0.09
515	0.08
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.03
520	0.03
521	0.04
522	0.04
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.1
532	0.14
533	0.16
534	0.15
535	0.15
536	0.14
537	0.15
538	0.15
539	0.16
540	0.21
541	0.3
542	0.39
543	0.48
544	0.49
545	0.5
546	0.58
547	0.63
548	0.65
549	0.66
550	0.66
551	0.63
552	0.66
553	0.65
554	0.57
555	0.54
556	0.48
557	0.42
558	0.36
559	0.31
560	0.3
561	0.3
562	0.3
563	0.25
564	0.22
565	0.17
566	0.14
567	0.15
568	0.12
569	0.11
570	0.11
571	0.1
572	0.12
573	0.2
574	0.23
575	0.31
576	0.37
577	0.42
578	0.46
579	0.54
580	0.57
581	0.49
582	0.47
583	0.48
584	0.5
585	0.5
586	0.53
587	0.48
588	0.45
589	0.44
590	0.46
591	0.37
592	0.31

A0A553IFB2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer