Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553IEQ1

Protein Details
Accession A0A553IEQ1    Localization Confidence High Confidence Score 23.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-58TESLPKKERHATEQPKKRASHydrophilic
109-136ENPLELSKPLRKDRKRKRRDENDDLEGNBasic
476-502AKQQHGFKGERRKPRERADSSSKPQERBasic
521-551AKDGKPKDLKFSKTKGKKGVVKSKFKGRGARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-127KPLRKDRKRKRR
414-423RVSRAKDPRK
464-551GRARKLFGRSAAAKQQHGFKGERRKPRERADSSSKPQERGNGIKPPEKFIFEGRRASAKDGKPKDLKFSKTKGKKGVVKSKFKGRGAR
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5.5, cyto_mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSRTKSSLAAPSKAIDPTLDALFASSSGPIVAPSKDRYTESLPKKERHATEQPKKRASAAESSADEEEEDDESLSELEHDGDDMNEDEEAGSQEDIGSDDGEESTSRTENPLELSKPLRKDRKRKRRDENDDLEGNYMRKLAEEEETEERQEKRRKGGTGQAVETEDTAEDETPPVHESLRKPEEHVDVELDKANRTLFLGNVSVEAVTSSKAKKILISHLETPLSELDTSTGPHRIESVRFRSTPFSADAGPKRAAFINKAVMSATTKSTNAYAVYSTPLASRTALRALNGTVVLDRHLRTDSVAHPSAIDNRRCVFVGNLGFVDDETVVNTNADGETVTKKRYKVPADTEEGLWRIFGEHAGKVESVRVPRDDKTRVGKGFAYVQFYDGNDVESALLLNGKKFPPMLPRPLRVSRAKDPRKTALAMERTTKARLDAIKSTDGKRKSTKYTPKITPEQQSQAGRARKLFGRSAAAKQQHGFKGERRKPRERADSSSKPQERGNGIKPPEKFIFEGRRASAKDGKPKDLKFSKTKGKKGVVKSKFKGRGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.25
3 0.21
4 0.21
5 0.2
6 0.18
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.11
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.08
17 0.1
18 0.12
19 0.16
20 0.2
21 0.25
22 0.28
23 0.3
24 0.34
25 0.4
26 0.48
27 0.52
28 0.59
29 0.61
30 0.62
31 0.67
32 0.71
33 0.68
34 0.66
35 0.68
36 0.69
37 0.72
38 0.79
39 0.81
40 0.79
41 0.76
42 0.7
43 0.66
44 0.59
45 0.57
46 0.51
47 0.49
48 0.43
49 0.45
50 0.42
51 0.35
52 0.31
53 0.22
54 0.18
55 0.12
56 0.11
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.16
98 0.2
99 0.2
100 0.23
101 0.28
102 0.33
103 0.39
104 0.47
105 0.54
106 0.58
107 0.68
108 0.76
109 0.82
110 0.86
111 0.9
112 0.92
113 0.93
114 0.94
115 0.93
116 0.9
117 0.85
118 0.78
119 0.68
120 0.59
121 0.49
122 0.4
123 0.29
124 0.22
125 0.15
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.13
130 0.14
131 0.18
132 0.22
133 0.24
134 0.25
135 0.27
136 0.27
137 0.32
138 0.39
139 0.38
140 0.41
141 0.47
142 0.49
143 0.49
144 0.57
145 0.57
146 0.55
147 0.53
148 0.47
149 0.42
150 0.38
151 0.34
152 0.26
153 0.16
154 0.11
155 0.1
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.12
165 0.14
166 0.23
167 0.29
168 0.29
169 0.3
170 0.34
171 0.38
172 0.36
173 0.35
174 0.29
175 0.23
176 0.24
177 0.25
178 0.21
179 0.17
180 0.15
181 0.14
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.08
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.06
195 0.05
196 0.07
197 0.08
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.14
202 0.17
203 0.24
204 0.28
205 0.32
206 0.33
207 0.34
208 0.34
209 0.31
210 0.3
211 0.22
212 0.17
213 0.13
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.14
224 0.17
225 0.23
226 0.28
227 0.29
228 0.29
229 0.31
230 0.32
231 0.31
232 0.3
233 0.25
234 0.2
235 0.18
236 0.22
237 0.23
238 0.24
239 0.25
240 0.22
241 0.21
242 0.22
243 0.22
244 0.18
245 0.19
246 0.21
247 0.2
248 0.2
249 0.19
250 0.17
251 0.18
252 0.17
253 0.16
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.13
290 0.14
291 0.18
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.26
297 0.29
298 0.29
299 0.24
300 0.24
301 0.26
302 0.25
303 0.25
304 0.17
305 0.16
306 0.17
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.08
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.1
326 0.12
327 0.15
328 0.18
329 0.19
330 0.25
331 0.33
332 0.37
333 0.4
334 0.46
335 0.5
336 0.53
337 0.53
338 0.49
339 0.43
340 0.39
341 0.31
342 0.23
343 0.16
344 0.11
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.14
354 0.15
355 0.15
356 0.17
357 0.19
358 0.21
359 0.25
360 0.31
361 0.32
362 0.35
363 0.4
364 0.45
365 0.43
366 0.43
367 0.41
368 0.36
369 0.4
370 0.37
371 0.35
372 0.27
373 0.27
374 0.26
375 0.25
376 0.26
377 0.18
378 0.17
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.06
385 0.08
386 0.07
387 0.08
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.13
392 0.16
393 0.23
394 0.3
395 0.39
396 0.42
397 0.47
398 0.54
399 0.59
400 0.63
401 0.6
402 0.62
403 0.61
404 0.65
405 0.7
406 0.7
407 0.7
408 0.7
409 0.68
410 0.62
411 0.57
412 0.55
413 0.52
414 0.48
415 0.46
416 0.43
417 0.41
418 0.41
419 0.37
420 0.29
421 0.27
422 0.28
423 0.29
424 0.31
425 0.33
426 0.39
427 0.41
428 0.44
429 0.47
430 0.46
431 0.47
432 0.49
433 0.52
434 0.52
435 0.6
436 0.66
437 0.68
438 0.74
439 0.76
440 0.77
441 0.79
442 0.78
443 0.76
444 0.72
445 0.69
446 0.67
447 0.61
448 0.57
449 0.57
450 0.56
451 0.51
452 0.45
453 0.44
454 0.41
455 0.44
456 0.43
457 0.39
458 0.41
459 0.42
460 0.46
461 0.51
462 0.51
463 0.49
464 0.48
465 0.52
466 0.48
467 0.48
468 0.45
469 0.44
470 0.5
471 0.55
472 0.64
473 0.64
474 0.7
475 0.74
476 0.81
477 0.85
478 0.8
479 0.81
480 0.8
481 0.82
482 0.8
483 0.82
484 0.76
485 0.68
486 0.64
487 0.62
488 0.59
489 0.57
490 0.56
491 0.54
492 0.55
493 0.58
494 0.57
495 0.57
496 0.53
497 0.48
498 0.43
499 0.43
500 0.48
501 0.48
502 0.53
503 0.49
504 0.53
505 0.51
506 0.56
507 0.56
508 0.53
509 0.58
510 0.58
511 0.64
512 0.65
513 0.66
514 0.7
515 0.69
516 0.7
517 0.69
518 0.72
519 0.73
520 0.75
521 0.81
522 0.8
523 0.82
524 0.82
525 0.84
526 0.86
527 0.85
528 0.86
529 0.84
530 0.85
531 0.85