FuNGI

A0A553IFA9

Protein Details

Accession

A0A553IFA9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-159	TGEQQDTKKGRKPRKGKSAEKDAEA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
142-153	KKGRKPRKGKSA

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MSTSTFSYAQAAKGQSTAQAATSQQSPHQSQTPSVISSNPNPDTNATNASTRAPSVAVSTSSNDIDSSRSVRSASAKPDASRPNGNEVSQGEGNAAPSVAGSVSSSKVGSELASTNGVPKGTESRGRSINTGSDTGEQQDTKKGRKPRKGKSAEKDAEAGQEPEKEVPPPKVELFEAPIPSVNFWVQRQQAHKAKSVDLSASTVANVTQSADSKARSPNSEAVDSNRGTFNGKQGSKRDGEPSRNGTNQGPRRAAPRGARAHEKQSEMNLLANNPASWPTPETAAVNLKAQPQTQSEKPEKEEKEDGGAAKPKQKKEWVQLPDFVPSVKFETMPNNTRGSRGGRVGGSRGGRDAAASHHTANPTERAQDVNAVSRSNAGSKREGASAREGRKNVPHAEHSRLPKESTSDNTNGEQLKPNHSGVVNGTYHEQPRQASTPNQQQPEENVKGSESQKDTKTQSNRDTHPQGQNTANHRNGERTRGGNRGRGGFNQNNPNGMSHYAPNSYTNQHHAYQFPSNGSRHLAYGAGYSPISYSFPGQPGPGRKSTNGSRGRGSGRMPAMAPINMPYDANVYSAPSSGMYAFDAGNNLLQLAQTQVEYYFSVENCVKDWYLRKHMDSQGFVPIHFIASFNRMRELLVDHNILRQACLASAVLELVMGGDGVERVRSKEGWEKWVIQDMNSRDPSARHDGPSTWQPFSNGFQHPMMSPHYPVEAPPVFSPTSEHGFANGSYGMPPINGPTMNGINGHARPHESQLSAAVPEFSPSIATFNGLKSASHGSSQEAKAPAHKGINGDVSPSEQPSAVTNGVMSGQSRASLDGLHAVNGIGLGHANQGH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.23
3	0.24
4	0.22
5	0.18
6	0.19
7	0.19
8	0.2
9	0.23
10	0.22
11	0.23
12	0.29
13	0.31
14	0.33
15	0.39
16	0.38
17	0.36
18	0.42
19	0.42
20	0.37
21	0.35
22	0.35
23	0.33
24	0.37
25	0.44
26	0.4
27	0.38
28	0.37
29	0.38
30	0.37
31	0.36
32	0.35
33	0.28
34	0.27
35	0.26
36	0.28
37	0.27
38	0.24
39	0.22
40	0.18
41	0.16
42	0.17
43	0.18
44	0.17
45	0.17
46	0.19
47	0.21
48	0.21
49	0.21
50	0.18
51	0.16
52	0.17
53	0.18
54	0.19
55	0.17
56	0.18
57	0.18
58	0.21
59	0.26
60	0.3
61	0.33
62	0.38
63	0.41
64	0.41
65	0.49
66	0.53
67	0.53
68	0.55
69	0.51
70	0.52
71	0.51
72	0.5
73	0.46
74	0.4
75	0.41
76	0.34
77	0.31
78	0.24
79	0.21
80	0.21
81	0.17
82	0.15
83	0.08
84	0.07
85	0.08
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.08
90	0.09
91	0.1
92	0.11
93	0.1
94	0.1
95	0.11
96	0.1
97	0.11
98	0.11
99	0.12
100	0.14
101	0.14
102	0.16
103	0.18
104	0.18
105	0.15
106	0.16
107	0.19
108	0.22
109	0.29
110	0.3
111	0.34
112	0.4
113	0.42
114	0.42
115	0.39
116	0.39
117	0.35
118	0.33
119	0.29
120	0.26
121	0.25
122	0.25
123	0.26
124	0.22
125	0.2
126	0.27
127	0.29
128	0.33
129	0.39
130	0.46
131	0.53
132	0.62
133	0.72
134	0.74
135	0.81
136	0.85
137	0.88
138	0.88
139	0.9
140	0.84
141	0.76
142	0.68
143	0.58
144	0.52
145	0.43
146	0.36
147	0.26
148	0.24
149	0.22
150	0.22
151	0.22
152	0.2
153	0.22
154	0.24
155	0.25
156	0.27
157	0.27
158	0.27
159	0.27
160	0.26
161	0.28
162	0.28
163	0.26
164	0.23
165	0.25
166	0.23
167	0.22
168	0.22
169	0.18
170	0.17
171	0.17
172	0.23
173	0.24
174	0.29
175	0.33
176	0.4
177	0.46
178	0.46
179	0.52
180	0.48
181	0.47
182	0.45
183	0.43
184	0.35
185	0.29
186	0.27
187	0.21
188	0.19
189	0.16
190	0.12
191	0.11
192	0.09
193	0.08
194	0.07
195	0.08
196	0.09
197	0.12
198	0.14
199	0.15
200	0.18
201	0.24
202	0.25
203	0.26
204	0.29
205	0.32
206	0.35
207	0.37
208	0.35
209	0.34
210	0.36
211	0.34
212	0.32
213	0.27
214	0.23
215	0.23
216	0.23
217	0.24
218	0.27
219	0.3
220	0.34
221	0.36
222	0.41
223	0.41
224	0.42
225	0.45
226	0.43
227	0.46
228	0.47
229	0.5
230	0.51
231	0.5
232	0.5
233	0.46
234	0.48
235	0.49
236	0.5
237	0.46
238	0.41
239	0.44
240	0.45
241	0.47
242	0.43
243	0.45
244	0.46
245	0.47
246	0.54
247	0.53
248	0.56
249	0.55
250	0.52
251	0.45
252	0.39
253	0.39
254	0.32
255	0.31
256	0.24
257	0.2
258	0.18
259	0.17
260	0.15
261	0.11
262	0.12
263	0.1
264	0.1
265	0.12
266	0.11
267	0.12
268	0.13
269	0.13
270	0.15
271	0.17
272	0.17
273	0.17
274	0.19
275	0.21
276	0.22
277	0.22
278	0.22
279	0.22
280	0.26
281	0.27
282	0.33
283	0.35
284	0.37
285	0.4
286	0.46
287	0.44
288	0.44
289	0.45
290	0.38
291	0.36
292	0.35
293	0.32
294	0.27
295	0.32
296	0.28
297	0.32
298	0.37
299	0.35
300	0.38
301	0.45
302	0.47
303	0.5
304	0.58
305	0.57
306	0.54
307	0.57
308	0.53
309	0.48
310	0.42
311	0.33
312	0.24
313	0.18
314	0.18
315	0.14
316	0.13
317	0.12
318	0.18
319	0.23
320	0.27
321	0.28
322	0.29
323	0.29
324	0.29
325	0.31
326	0.29
327	0.26
328	0.24
329	0.24
330	0.21
331	0.22
332	0.23
333	0.24
334	0.22
335	0.19
336	0.17
337	0.15
338	0.14
339	0.13
340	0.12
341	0.09
342	0.11
343	0.12
344	0.13
345	0.14
346	0.15
347	0.16
348	0.16
349	0.17
350	0.15
351	0.15
352	0.14
353	0.13
354	0.13
355	0.16
356	0.16
357	0.18
358	0.18
359	0.17
360	0.17
361	0.17
362	0.17
363	0.17
364	0.19
365	0.16
366	0.17
367	0.19
368	0.2
369	0.23
370	0.23
371	0.21
372	0.26
373	0.3
374	0.33
375	0.36
376	0.35
377	0.34
378	0.37
379	0.4
380	0.35
381	0.31
382	0.33
383	0.32
384	0.37
385	0.4
386	0.4
387	0.4
388	0.38
389	0.36
390	0.3
391	0.28
392	0.25
393	0.23
394	0.23
395	0.22
396	0.22
397	0.22
398	0.24
399	0.23
400	0.22
401	0.25
402	0.21
403	0.24
404	0.25
405	0.24
406	0.23
407	0.22
408	0.22
409	0.17
410	0.21
411	0.16
412	0.13
413	0.15
414	0.15
415	0.16
416	0.16
417	0.16
418	0.11
419	0.14
420	0.15
421	0.16
422	0.18
423	0.23
424	0.33
425	0.37
426	0.39
427	0.37
428	0.35
429	0.38
430	0.42
431	0.38
432	0.29
433	0.23
434	0.21
435	0.25
436	0.25
437	0.26
438	0.21
439	0.22
440	0.23
441	0.28
442	0.3
443	0.33
444	0.39
445	0.4
446	0.45
447	0.48
448	0.49
449	0.52
450	0.55
451	0.54
452	0.55
453	0.5
454	0.45
455	0.43
456	0.46
457	0.44
458	0.46
459	0.43
460	0.37
461	0.36
462	0.39
463	0.37
464	0.36
465	0.34
466	0.3
467	0.31
468	0.37
469	0.39
470	0.38
471	0.38
472	0.38
473	0.36
474	0.35
475	0.4
476	0.36
477	0.39
478	0.42
479	0.41
480	0.38
481	0.37
482	0.34
483	0.28
484	0.25
485	0.2
486	0.13
487	0.15
488	0.14
489	0.14
490	0.16
491	0.16
492	0.18
493	0.18
494	0.22
495	0.23
496	0.24
497	0.25
498	0.24
499	0.26
500	0.27
501	0.27
502	0.24
503	0.25
504	0.24
505	0.23
506	0.25
507	0.21
508	0.18
509	0.17
510	0.15
511	0.11
512	0.12
513	0.11
514	0.1
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.09
522	0.1
523	0.12
524	0.12
525	0.13
526	0.17
527	0.23
528	0.27
529	0.3
530	0.31
531	0.3
532	0.36
533	0.4
534	0.46
535	0.47
536	0.45
537	0.42
538	0.44
539	0.46
540	0.43
541	0.39
542	0.35
543	0.29
544	0.28
545	0.26
546	0.24
547	0.23
548	0.2
549	0.18
550	0.14
551	0.14
552	0.13
553	0.13
554	0.11
555	0.11
556	0.11
557	0.12
558	0.1
559	0.09
560	0.09
561	0.1
562	0.1
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.08
567	0.07
568	0.08
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.07
575	0.07
576	0.06
577	0.06
578	0.05
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.08
585	0.08
586	0.09
587	0.11
588	0.1
589	0.14
590	0.15
591	0.15
592	0.15
593	0.17
594	0.16
595	0.17
596	0.24
597	0.27
598	0.35
599	0.39
600	0.4
601	0.46
602	0.53
603	0.55
604	0.5
605	0.45
606	0.44
607	0.41
608	0.38
609	0.32
610	0.25
611	0.21
612	0.18
613	0.17
614	0.1
615	0.15
616	0.18
617	0.17
618	0.19
619	0.18
620	0.18
621	0.19
622	0.21
623	0.2
624	0.22
625	0.24
626	0.22
627	0.24
628	0.27
629	0.26
630	0.22
631	0.19
632	0.15
633	0.12
634	0.13
635	0.11
636	0.09
637	0.09
638	0.08
639	0.07
640	0.06
641	0.06
642	0.04
643	0.04
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.04
649	0.06
650	0.07
651	0.09
652	0.11
653	0.12
654	0.16
655	0.25
656	0.29
657	0.34
658	0.37
659	0.39
660	0.39
661	0.47
662	0.43
663	0.36
664	0.39
665	0.36
666	0.41
667	0.39
668	0.37
669	0.3
670	0.31
671	0.35
672	0.37
673	0.36
674	0.3
675	0.31
676	0.32
677	0.36
678	0.44
679	0.42
680	0.35
681	0.33
682	0.32
683	0.32
684	0.35
685	0.37
686	0.31
687	0.31
688	0.29
689	0.3
690	0.28
691	0.29
692	0.29
693	0.24
694	0.23
695	0.2
696	0.22
697	0.2
698	0.2
699	0.25
700	0.23
701	0.23
702	0.23
703	0.25
704	0.23
705	0.23
706	0.26
707	0.22
708	0.25
709	0.24
710	0.23
711	0.2
712	0.22
713	0.22
714	0.22
715	0.18
716	0.13
717	0.12
718	0.12
719	0.11
720	0.09
721	0.1
722	0.09
723	0.12
724	0.12
725	0.12
726	0.17
727	0.18
728	0.19
729	0.19
730	0.19
731	0.21
732	0.23
733	0.25
734	0.22
735	0.24
736	0.25
737	0.3
738	0.32
739	0.28
740	0.27
741	0.27
742	0.28
743	0.25
744	0.23
745	0.2
746	0.15
747	0.15
748	0.15
749	0.11
750	0.11
751	0.1
752	0.12
753	0.11
754	0.13
755	0.13
756	0.14
757	0.19
758	0.18
759	0.17
760	0.18
761	0.24
762	0.23
763	0.25
764	0.24
765	0.24
766	0.32
767	0.33
768	0.36
769	0.33
770	0.33
771	0.36
772	0.38
773	0.38
774	0.34
775	0.35
776	0.31
777	0.32
778	0.39
779	0.34
780	0.33
781	0.28
782	0.28
783	0.28
784	0.27
785	0.24
786	0.17
787	0.17
788	0.17
789	0.22
790	0.19
791	0.17
792	0.15
793	0.15
794	0.16
795	0.16
796	0.14
797	0.12
798	0.11
799	0.13
800	0.13
801	0.14
802	0.13
803	0.13
804	0.13
805	0.17
806	0.17
807	0.16
808	0.16
809	0.15
810	0.14
811	0.14
812	0.13
813	0.06
814	0.06
815	0.06

A0A553IFA9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer