Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HT96

Protein Details
Accession A0A553HT96    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-247SATGGKTKRERERKAKQLVEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-111RGGQRGGRGARERGGRGGRFPRERD
233-242TKRERERKAK
255-303ERPRGGRGGRGGASRGGARGDGRGRGEGRGRGGSRGDFRGDFRGDRGGR
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 13, nucl 5, mito 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLFTVLGTEEEDEPQPSGPVKTVDKNLPRTTKRNVEPQAPIKPAGTTGGRRAGPGGNEGAFRDRNAGHSANQRKPTDEVSRGGQRGGRGARERGGRGGRFPRERDDRHTKGLGIGGSEKQAAQSWGATEGGAEAKDEQAGEEIAQTELKEATAEDAEDVATPAEPEDKHVSYSEYLAQQAEKKLALGDNLELRKPNEGSKVDKKWANAKALNKEDDDDFISATGGKTKRERERKAKQLVEIDNRFVESERPRGGRGGRGGASRGGARGDGRGRGEGRGRGGSRGDFRGDFRGDRGGRPAGRENASINTSDESAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.18
4 0.19
5 0.18
6 0.17
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.19
13 0.23
14 0.28
15 0.34
16 0.41
17 0.48
18 0.55
19 0.61
20 0.66
21 0.68
22 0.68
23 0.7
24 0.71
25 0.68
26 0.7
27 0.67
28 0.64
29 0.67
30 0.69
31 0.69
32 0.62
33 0.58
34 0.48
35 0.43
36 0.37
37 0.32
38 0.29
39 0.23
40 0.26
41 0.32
42 0.31
43 0.31
44 0.32
45 0.31
46 0.28
47 0.27
48 0.25
49 0.19
50 0.19
51 0.2
52 0.22
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.18
57 0.19
58 0.23
59 0.24
60 0.23
61 0.32
62 0.41
63 0.44
64 0.52
65 0.5
66 0.48
67 0.48
68 0.51
69 0.49
70 0.44
71 0.39
72 0.37
73 0.43
74 0.42
75 0.4
76 0.36
77 0.29
78 0.31
79 0.31
80 0.31
81 0.28
82 0.3
83 0.34
84 0.36
85 0.37
86 0.37
87 0.41
88 0.35
89 0.38
90 0.44
91 0.47
92 0.48
93 0.49
94 0.51
95 0.53
96 0.55
97 0.58
98 0.6
99 0.56
100 0.56
101 0.55
102 0.47
103 0.4
104 0.39
105 0.31
106 0.22
107 0.2
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.12
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.06
157 0.06
158 0.09
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.16
166 0.15
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.11
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.1
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.19
187 0.19
188 0.2
189 0.22
190 0.23
191 0.3
192 0.38
193 0.43
194 0.45
195 0.46
196 0.46
197 0.47
198 0.5
199 0.5
200 0.46
201 0.47
202 0.5
203 0.53
204 0.54
205 0.46
206 0.42
207 0.35
208 0.31
209 0.27
210 0.19
211 0.13
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.14
217 0.13
218 0.16
219 0.21
220 0.29
221 0.39
222 0.49
223 0.58
224 0.63
225 0.72
226 0.79
227 0.84
228 0.81
229 0.76
230 0.74
231 0.73
232 0.72
233 0.64
234 0.57
235 0.47
236 0.43
237 0.38
238 0.3
239 0.27
240 0.21
241 0.25
242 0.28
243 0.29
244 0.3
245 0.34
246 0.36
247 0.37
248 0.37
249 0.37
250 0.34
251 0.34
252 0.35
253 0.32
254 0.32
255 0.26
256 0.23
257 0.17
258 0.16
259 0.14
260 0.18
261 0.2
262 0.23
263 0.24
264 0.28
265 0.28
266 0.31
267 0.36
268 0.34
269 0.35
270 0.39
271 0.38
272 0.36
273 0.38
274 0.39
275 0.39
276 0.39
277 0.38
278 0.32
279 0.33
280 0.38
281 0.38
282 0.34
283 0.31
284 0.37
285 0.35
286 0.35
287 0.38
288 0.39
289 0.37
290 0.42
291 0.47
292 0.45
293 0.47
294 0.46
295 0.43
296 0.41
297 0.41
298 0.36
299 0.31
300 0.25
301 0.23
302 0.21
303 0.19
304 0.17
305 0.17