Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553IB46

Protein Details
Accession A0A553IB46    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-130DLDTKSWLASQKKRQKKIEKSRKEDEEASHydrophilic
278-304LDVSEVKIKKPKKKKSKSTRQRPADEEBasic
348-371AAQRRNALKKRKKLRPEDLARQLRHydrophilic
596-619KGSGKGKTDKRLKKIEDEKRHEAQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-86KKRREEKAAAIKKARDAAK
113-124KKRQKKIEKSRK
284-298KIKKPKKKKSKSTRQ
352-362RNALKKRKKLR
596-609KGSGKGKTDKRLKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAASIEETNRLRVSLGMKPLPVPGANGPQFKEKTPVAEGEEPASTLETREAASYDNYKKVQDAELAKKRREEKAAAIKKARDAAKRFETLQGKGLGDDDDDLDTKSWLASQKKRQKKIEKSRKEDEEASAAKAAAAAAAQYTSKDLAGVKVRHEVDAFEDGDEQILTLADKDILAEDDEGDELENIQLREREKLSEKLNLKKKKPVYDPHEINETGEQNILSQYDEEISGKKVKQFTLDGKGSSIQPPVSLGHRQAPQLQQISLDILDDLQPASDYLDVSEVKIKKPKKKKSKSTRQRPADEEDIFPTQQIEEQSMDIDSGAGFVSRKRKTEDSELLDDEDLQATLAAQRRNALKKRKKLRPEDLARQLRDEAQNDDVENDAKGGGLVIDEISEFVSGLTKEDIEERKARRATSPQRQVVTAAEDESDEDQPMKDGDDIDEGRIKRESSVPAEAAAIGVDEEKTIGTGIGAALQLLRERRLVNDAGSGELNESFRHQQAFLAEKRRRMEEIEQATRNQRERDRQGGRMDRMSVQEREQWARQQNNVRDQQTSRQMAELFNKDYKPSVDLKYVDEDGRLLGQKDAFKHLSHAFHGKGSGKGKTDKRLKKIEDEKRHEAQSVLDASQNVGMSSAAAHQTRTRREAGVRLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.36
9 0.32
10 0.29
11 0.25
12 0.32
13 0.37
14 0.39
15 0.39
16 0.45
17 0.46
18 0.44
19 0.46
20 0.37
21 0.36
22 0.36
23 0.38
24 0.36
25 0.4
26 0.39
27 0.36
28 0.35
29 0.3
30 0.27
31 0.24
32 0.17
33 0.12
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.15
41 0.23
42 0.26
43 0.32
44 0.33
45 0.33
46 0.34
47 0.35
48 0.34
49 0.34
50 0.37
51 0.41
52 0.49
53 0.56
54 0.57
55 0.61
56 0.64
57 0.64
58 0.62
59 0.56
60 0.57
61 0.61
62 0.68
63 0.69
64 0.7
65 0.65
66 0.63
67 0.66
68 0.62
69 0.59
70 0.54
71 0.55
72 0.56
73 0.57
74 0.54
75 0.56
76 0.54
77 0.48
78 0.48
79 0.44
80 0.37
81 0.33
82 0.32
83 0.24
84 0.2
85 0.18
86 0.14
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.11
95 0.16
96 0.24
97 0.32
98 0.42
99 0.53
100 0.63
101 0.73
102 0.8
103 0.84
104 0.88
105 0.91
106 0.91
107 0.91
108 0.89
109 0.9
110 0.87
111 0.82
112 0.74
113 0.65
114 0.62
115 0.53
116 0.47
117 0.39
118 0.31
119 0.25
120 0.21
121 0.18
122 0.1
123 0.08
124 0.05
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.12
135 0.21
136 0.22
137 0.23
138 0.3
139 0.31
140 0.31
141 0.31
142 0.26
143 0.22
144 0.25
145 0.23
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.1
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.08
173 0.07
174 0.09
175 0.12
176 0.12
177 0.17
178 0.17
179 0.21
180 0.23
181 0.29
182 0.3
183 0.36
184 0.41
185 0.46
186 0.55
187 0.59
188 0.59
189 0.62
190 0.66
191 0.66
192 0.7
193 0.71
194 0.68
195 0.7
196 0.71
197 0.65
198 0.64
199 0.55
200 0.47
201 0.41
202 0.34
203 0.24
204 0.2
205 0.17
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.14
218 0.15
219 0.18
220 0.21
221 0.21
222 0.24
223 0.28
224 0.31
225 0.35
226 0.36
227 0.33
228 0.31
229 0.32
230 0.29
231 0.26
232 0.23
233 0.14
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.15
238 0.16
239 0.15
240 0.19
241 0.22
242 0.23
243 0.26
244 0.27
245 0.3
246 0.29
247 0.28
248 0.23
249 0.2
250 0.2
251 0.16
252 0.13
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.14
269 0.14
270 0.16
271 0.22
272 0.28
273 0.35
274 0.45
275 0.55
276 0.61
277 0.71
278 0.8
279 0.85
280 0.91
281 0.93
282 0.94
283 0.94
284 0.92
285 0.87
286 0.8
287 0.74
288 0.69
289 0.59
290 0.49
291 0.41
292 0.34
293 0.28
294 0.24
295 0.18
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.06
306 0.06
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.06
313 0.14
314 0.16
315 0.18
316 0.22
317 0.25
318 0.28
319 0.37
320 0.42
321 0.39
322 0.41
323 0.39
324 0.37
325 0.34
326 0.3
327 0.22
328 0.14
329 0.09
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.06
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.18
339 0.26
340 0.33
341 0.41
342 0.46
343 0.56
344 0.66
345 0.73
346 0.77
347 0.8
348 0.82
349 0.82
350 0.81
351 0.81
352 0.82
353 0.8
354 0.71
355 0.63
356 0.54
357 0.48
358 0.42
359 0.34
360 0.26
361 0.21
362 0.21
363 0.19
364 0.19
365 0.15
366 0.12
367 0.11
368 0.09
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.12
391 0.14
392 0.16
393 0.22
394 0.24
395 0.31
396 0.34
397 0.34
398 0.34
399 0.42
400 0.49
401 0.53
402 0.61
403 0.58
404 0.57
405 0.57
406 0.54
407 0.45
408 0.39
409 0.28
410 0.19
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.13
415 0.12
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.13
426 0.14
427 0.15
428 0.2
429 0.19
430 0.2
431 0.21
432 0.2
433 0.16
434 0.2
435 0.23
436 0.22
437 0.26
438 0.25
439 0.24
440 0.24
441 0.22
442 0.18
443 0.13
444 0.09
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.08
463 0.09
464 0.11
465 0.11
466 0.12
467 0.14
468 0.18
469 0.19
470 0.18
471 0.21
472 0.2
473 0.2
474 0.19
475 0.18
476 0.15
477 0.15
478 0.14
479 0.1
480 0.13
481 0.14
482 0.15
483 0.17
484 0.16
485 0.16
486 0.2
487 0.26
488 0.28
489 0.36
490 0.38
491 0.42
492 0.45
493 0.46
494 0.43
495 0.42
496 0.42
497 0.42
498 0.48
499 0.51
500 0.5
501 0.5
502 0.54
503 0.55
504 0.53
505 0.5
506 0.47
507 0.49
508 0.53
509 0.61
510 0.6
511 0.61
512 0.66
513 0.69
514 0.67
515 0.61
516 0.57
517 0.5
518 0.5
519 0.49
520 0.41
521 0.35
522 0.36
523 0.37
524 0.39
525 0.39
526 0.42
527 0.45
528 0.47
529 0.52
530 0.56
531 0.59
532 0.64
533 0.69
534 0.63
535 0.59
536 0.58
537 0.59
538 0.59
539 0.56
540 0.47
541 0.42
542 0.41
543 0.4
544 0.44
545 0.42
546 0.37
547 0.37
548 0.37
549 0.35
550 0.36
551 0.34
552 0.3
553 0.3
554 0.29
555 0.31
556 0.32
557 0.34
558 0.37
559 0.38
560 0.35
561 0.3
562 0.26
563 0.2
564 0.23
565 0.22
566 0.18
567 0.17
568 0.2
569 0.23
570 0.26
571 0.32
572 0.3
573 0.28
574 0.33
575 0.36
576 0.36
577 0.37
578 0.41
579 0.35
580 0.35
581 0.39
582 0.37
583 0.38
584 0.38
585 0.39
586 0.38
587 0.46
588 0.5
589 0.55
590 0.63
591 0.66
592 0.7
593 0.75
594 0.75
595 0.77
596 0.81
597 0.82
598 0.82
599 0.82
600 0.81
601 0.78
602 0.75
603 0.66
604 0.56
605 0.48
606 0.43
607 0.38
608 0.31
609 0.27
610 0.25
611 0.24
612 0.26
613 0.24
614 0.17
615 0.13
616 0.12
617 0.09
618 0.1
619 0.13
620 0.15
621 0.15
622 0.17
623 0.22
624 0.31
625 0.38
626 0.41
627 0.41
628 0.41
629 0.45