Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HXU1

Protein Details
Accession A0A553HXU1    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MDPPAANQKRKRGRPANASRDDEVHydrophilic
53-73DGESRPRKRGRPAKDVPQEPQBasic
75-98ETSETQPSKRLRRQQSTTQIQDRTHydrophilic
110-133EVETVKRGRPKKGRQVKPPEPELEBasic
173-201ETNSSATQRPSKKRKKPNHPVNKKHSEEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-12RKR
58-64PRKRGRP
115-125KRGRPKKGRQV
181-196RPSKKRKKPNHPVNKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR025212  CAD_CENP-Q  
Gene Ontology GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13094  CENP-Q  
Amino Acid Sequences MDPPAANQKRKRGRPANASRDDEVKDASNSVTTMPDQNNQTNGDVGVDDRSVDGESRPRKRGRPAKDVPQEPQPETSETQPSKRLRRQQSTTQIQDRTTERDSRPVPSEEVETVKRGRPKKGRQVKPPEPELEQEEADDENENEGNEENSSLLRRSRRDRRSATDSSTIQGQETNSSATQRPSKKRKKPNHPVNKKHSEEGAEPGELGDEVGTTSQAQKRQGRRPRSSQDAQPSINEPEPDVAIPQRKRGRPSKSEADDKTSGTGTGLQSGSSQRRKKPVDEAPQMESGRRGSSTAHQKSREHRRPSAEQDQSPTRSPSSDSDSSSPPYRHITERTRRVPQQIIESKWSSLDPSSIANIAGLLHSVSLPILLHVIPKQYAHAEDVLEKVMRGLCKRSARLPFPPASTLPRREDELDFERTQSAVEVLLSQLDPLQHSVELLRREKERAEKELERQYKVLDRLSTNARAEARERRDRLRKVHVLVPTSTHDLVTNDIDLLPVNKDTSQVFASVQDEEMLSLAGQINNHMKSMRGNLQQIDGVLPAIEKSHALLRTTLQPQFGQKQLESIMLGHVVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.9
3 0.9
4 0.89
5 0.86
6 0.77
7 0.72
8 0.65
9 0.55
10 0.46
11 0.38
12 0.3
13 0.26
14 0.24
15 0.2
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.15
20 0.2
21 0.22
22 0.27
23 0.31
24 0.34
25 0.37
26 0.37
27 0.36
28 0.31
29 0.29
30 0.24
31 0.19
32 0.16
33 0.14
34 0.12
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.13
41 0.19
42 0.28
43 0.36
44 0.44
45 0.49
46 0.55
47 0.65
48 0.72
49 0.73
50 0.75
51 0.76
52 0.79
53 0.82
54 0.82
55 0.74
56 0.74
57 0.71
58 0.62
59 0.59
60 0.5
61 0.44
62 0.4
63 0.4
64 0.4
65 0.37
66 0.39
67 0.43
68 0.48
69 0.54
70 0.61
71 0.67
72 0.68
73 0.75
74 0.78
75 0.81
76 0.84
77 0.84
78 0.84
79 0.81
80 0.74
81 0.65
82 0.63
83 0.55
84 0.51
85 0.45
86 0.45
87 0.38
88 0.43
89 0.44
90 0.44
91 0.46
92 0.43
93 0.41
94 0.34
95 0.36
96 0.3
97 0.33
98 0.29
99 0.27
100 0.27
101 0.3
102 0.35
103 0.37
104 0.44
105 0.5
106 0.59
107 0.67
108 0.75
109 0.8
110 0.83
111 0.9
112 0.9
113 0.87
114 0.84
115 0.77
116 0.68
117 0.62
118 0.56
119 0.48
120 0.38
121 0.3
122 0.24
123 0.2
124 0.18
125 0.16
126 0.11
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.1
139 0.14
140 0.19
141 0.24
142 0.34
143 0.44
144 0.52
145 0.6
146 0.66
147 0.69
148 0.72
149 0.72
150 0.69
151 0.66
152 0.57
153 0.49
154 0.45
155 0.37
156 0.29
157 0.25
158 0.2
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.12
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.26
167 0.32
168 0.42
169 0.5
170 0.61
171 0.69
172 0.78
173 0.85
174 0.89
175 0.92
176 0.93
177 0.93
178 0.94
179 0.94
180 0.93
181 0.92
182 0.84
183 0.75
184 0.66
185 0.59
186 0.49
187 0.44
188 0.36
189 0.26
190 0.23
191 0.2
192 0.17
193 0.13
194 0.11
195 0.06
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.08
202 0.11
203 0.14
204 0.21
205 0.28
206 0.36
207 0.46
208 0.55
209 0.62
210 0.66
211 0.72
212 0.73
213 0.74
214 0.71
215 0.67
216 0.67
217 0.63
218 0.57
219 0.49
220 0.44
221 0.38
222 0.36
223 0.29
224 0.2
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.11
229 0.11
230 0.17
231 0.17
232 0.25
233 0.32
234 0.34
235 0.41
236 0.48
237 0.54
238 0.53
239 0.6
240 0.62
241 0.6
242 0.65
243 0.61
244 0.59
245 0.52
246 0.46
247 0.4
248 0.3
249 0.25
250 0.16
251 0.18
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.11
256 0.12
257 0.16
258 0.22
259 0.27
260 0.31
261 0.31
262 0.4
263 0.42
264 0.44
265 0.5
266 0.53
267 0.55
268 0.57
269 0.57
270 0.51
271 0.54
272 0.52
273 0.43
274 0.35
275 0.25
276 0.19
277 0.16
278 0.13
279 0.09
280 0.15
281 0.26
282 0.32
283 0.37
284 0.4
285 0.43
286 0.51
287 0.61
288 0.64
289 0.6
290 0.58
291 0.59
292 0.61
293 0.66
294 0.68
295 0.62
296 0.53
297 0.52
298 0.51
299 0.48
300 0.43
301 0.37
302 0.28
303 0.23
304 0.23
305 0.21
306 0.24
307 0.24
308 0.24
309 0.25
310 0.26
311 0.28
312 0.3
313 0.28
314 0.22
315 0.23
316 0.23
317 0.24
318 0.29
319 0.37
320 0.42
321 0.51
322 0.55
323 0.59
324 0.59
325 0.61
326 0.59
327 0.52
328 0.52
329 0.5
330 0.46
331 0.44
332 0.43
333 0.38
334 0.33
335 0.31
336 0.22
337 0.15
338 0.13
339 0.1
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.06
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.12
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.14
379 0.16
380 0.22
381 0.29
382 0.31
383 0.37
384 0.43
385 0.46
386 0.51
387 0.54
388 0.51
389 0.47
390 0.48
391 0.43
392 0.42
393 0.43
394 0.42
395 0.4
396 0.39
397 0.38
398 0.39
399 0.38
400 0.38
401 0.36
402 0.36
403 0.32
404 0.31
405 0.29
406 0.25
407 0.24
408 0.18
409 0.13
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.11
425 0.15
426 0.21
427 0.24
428 0.26
429 0.27
430 0.29
431 0.34
432 0.41
433 0.42
434 0.42
435 0.46
436 0.48
437 0.53
438 0.61
439 0.62
440 0.56
441 0.51
442 0.48
443 0.47
444 0.45
445 0.42
446 0.36
447 0.33
448 0.34
449 0.39
450 0.43
451 0.37
452 0.38
453 0.34
454 0.32
455 0.35
456 0.4
457 0.43
458 0.46
459 0.49
460 0.54
461 0.62
462 0.68
463 0.71
464 0.72
465 0.71
466 0.66
467 0.68
468 0.64
469 0.58
470 0.52
471 0.48
472 0.42
473 0.39
474 0.35
475 0.29
476 0.25
477 0.22
478 0.23
479 0.21
480 0.18
481 0.13
482 0.13
483 0.12
484 0.11
485 0.12
486 0.11
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.13
491 0.13
492 0.16
493 0.16
494 0.15
495 0.15
496 0.16
497 0.17
498 0.17
499 0.16
500 0.14
501 0.13
502 0.12
503 0.11
504 0.09
505 0.07
506 0.08
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.13
511 0.2
512 0.2
513 0.21
514 0.2
515 0.19
516 0.22
517 0.29
518 0.34
519 0.35
520 0.39
521 0.39
522 0.42
523 0.42
524 0.39
525 0.33
526 0.24
527 0.18
528 0.14
529 0.12
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.07
534 0.09
535 0.15
536 0.18
537 0.19
538 0.21
539 0.23
540 0.31
541 0.37
542 0.38
543 0.35
544 0.35
545 0.4
546 0.45
547 0.47
548 0.44
549 0.38
550 0.39
551 0.38
552 0.37
553 0.31
554 0.26
555 0.23