Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HVF6

Protein Details
Accession A0A553HVF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MAPPRLKPAKKKRDSTKLVNKDDYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-13LKPAKKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Amino Acid Sequences MAPPRLKPAKKKRDSTKLVNKDDYLDAADGHEEAMGKHRVGDPVKALRFADRALDVYSEGLTKFPRSFDLAYNKARLELEKATDTVLSQALRVPTLSVLRQAFSSHQYALDINPTHTDTMFNMAQVLTGMAEIIAQDDEADDSEALQYIKRAMEVQISCFELQRIAFEKSRLELERAMRETAEYSTDQIDSGQAITNPASESQRITREEQWAVVEEPITAVTLLETIIAQIEALTAFCSMISSSLASSPEAVHASDSASALSWIDSYSENLLTQKLPTLIDDNKSTLESRLSDVMLPRAIFMGNYLDLSFRLSKIDIKKYTSELASAFAQPGLDVTSEDFLWASAHALLSLNSTLTLVSTGESDASVASVRWTALTAAQSRLSSIASRPNIDKHALATTHLLRGDISLFLQMLSYPPIAHPKARAMTPLKHAEVYYRNAGKLLDSLGRSTEDERIVCELKGAVVNVLLSSSSGKEDHSIIVNMPTSEEIERALGAVLKEKGGQWVKDHLEEMAGQGMVIIPQVFSAVMQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.9
3 0.9
4 0.9
5 0.88
6 0.84
7 0.74
8 0.67
9 0.6
10 0.51
11 0.43
12 0.33
13 0.24
14 0.19
15 0.18
16 0.14
17 0.12
18 0.11
19 0.08
20 0.08
21 0.14
22 0.16
23 0.16
24 0.19
25 0.22
26 0.28
27 0.3
28 0.34
29 0.35
30 0.41
31 0.44
32 0.44
33 0.42
34 0.39
35 0.39
36 0.35
37 0.32
38 0.24
39 0.24
40 0.22
41 0.22
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.22
54 0.24
55 0.3
56 0.38
57 0.42
58 0.45
59 0.48
60 0.45
61 0.43
62 0.42
63 0.35
64 0.31
65 0.29
66 0.28
67 0.27
68 0.27
69 0.25
70 0.24
71 0.23
72 0.2
73 0.18
74 0.14
75 0.12
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.13
82 0.16
83 0.17
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.21
89 0.21
90 0.22
91 0.24
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.22
98 0.2
99 0.17
100 0.19
101 0.2
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.13
106 0.17
107 0.17
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.17
141 0.18
142 0.2
143 0.21
144 0.23
145 0.22
146 0.22
147 0.21
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.19
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.26
158 0.24
159 0.23
160 0.24
161 0.26
162 0.32
163 0.33
164 0.32
165 0.27
166 0.26
167 0.25
168 0.21
169 0.19
170 0.12
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.14
190 0.2
191 0.22
192 0.25
193 0.27
194 0.31
195 0.31
196 0.3
197 0.27
198 0.24
199 0.22
200 0.19
201 0.15
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.12
266 0.13
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.13
274 0.13
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.1
296 0.1
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.14
301 0.2
302 0.29
303 0.29
304 0.32
305 0.34
306 0.35
307 0.37
308 0.32
309 0.28
310 0.19
311 0.19
312 0.17
313 0.15
314 0.13
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.09
362 0.12
363 0.14
364 0.15
365 0.18
366 0.18
367 0.17
368 0.18
369 0.16
370 0.14
371 0.14
372 0.2
373 0.2
374 0.23
375 0.24
376 0.27
377 0.3
378 0.3
379 0.29
380 0.23
381 0.26
382 0.24
383 0.23
384 0.24
385 0.23
386 0.24
387 0.24
388 0.22
389 0.16
390 0.17
391 0.17
392 0.12
393 0.11
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.1
404 0.17
405 0.19
406 0.21
407 0.23
408 0.28
409 0.31
410 0.32
411 0.38
412 0.36
413 0.39
414 0.45
415 0.49
416 0.44
417 0.42
418 0.41
419 0.4
420 0.4
421 0.39
422 0.4
423 0.36
424 0.34
425 0.33
426 0.33
427 0.28
428 0.25
429 0.23
430 0.19
431 0.17
432 0.18
433 0.19
434 0.2
435 0.21
436 0.21
437 0.23
438 0.22
439 0.21
440 0.22
441 0.26
442 0.25
443 0.24
444 0.23
445 0.18
446 0.16
447 0.18
448 0.17
449 0.12
450 0.11
451 0.12
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.14
463 0.16
464 0.18
465 0.18
466 0.17
467 0.21
468 0.22
469 0.2
470 0.2
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.13
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.16
483 0.16
484 0.16
485 0.18
486 0.18
487 0.26
488 0.3
489 0.32
490 0.29
491 0.37
492 0.4
493 0.42
494 0.42
495 0.34
496 0.3
497 0.28
498 0.26
499 0.2
500 0.16
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06