Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553HVF6

Protein Details
Accession A0A553HVF6   
Localization Confidence Medium
Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MAPPRLKPAKKKRDSTKLVNKDDYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-13LKPAKKKR
Subcellular Location(s) cyto 3, cyto_nucl 12.5, mito 3, nucl 20
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Amino Acid Sequences MAPPRLKPAKKKRDSTKLVNKDDYLDAADGHEEAMGKHRVGDPVKALRFADRALDVYSEGLTKFPRSFDLAYNKARLELEKATDTVLSQALRVPTLSVLRQAFSSHQYALDINPTHTDTMFNMAQVLTGMAEIIAQDDEADDSEALQYIKRAMEVQISCFELQRIAFEKSRLELERAMRETAEYSTDQIDSGQAITNPASESQRITREEQWAVVEEPITAVTLLETIIAQIEALTAFCSMISSSLASSPEAVHASDSASALSWIDSYSENLLTQKLPTLIDDNKSTLESRLSDVMLPRAIFMGNYLDLSFRLSKIDIKKYTSELASAFAQPGLDVTSEDFLWASAHALLSLNSTLTLVSTGESDASVASVRWTALTAAQSRLSSIASRPNIDKHALATTHLLRGDISLFLQMLSYPPIAHPKARAMTPLKHAEVYYRNAGKLLDSLGRSTEDERIVCELKGAVVNVLLSSSSGKEDHSIIVNMPTSEEIERALGAVLKEKGGQWVKDHLEEMAGQGMVIIPQVFSAVMQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.9
3 0.9
4 0.9
5 0.88
6 0.84
7 0.74
8 0.67
9 0.6
10 0.51
11 0.43
12 0.33
13 0.24
14 0.19
15 0.18
16 0.14
17 0.12
18 0.11
19 0.08
20 0.08
21 0.14
22 0.16
23 0.16
24 0.19
25 0.22
26 0.28
27 0.3
28 0.34
29 0.35
30 0.41
31 0.44
32 0.44
33 0.42
34 0.39
35 0.39
36 0.35
37 0.32
38 0.24
39 0.24
40 0.22
41 0.22
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.22
54 0.24
55 0.3
56 0.38
57 0.42
58 0.45
59 0.48
60 0.45
61 0.43
62 0.42
63 0.35
64 0.31
65 0.29
66 0.28
67 0.27
68 0.27
69 0.25
70 0.24
71 0.23
72 0.2
73 0.18
74 0.14
75 0.12
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.13
82 0.16
83 0.17
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.21
89 0.21
90 0.22
91 0.24
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.22
98 0.2
99 0.17
100 0.19
101 0.2
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.13
106 0.17
107 0.17
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.17
141 0.18
142 0.2
143 0.21
144 0.23
145 0.22
146 0.22
147 0.21
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.19
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.26
158 0.24
159 0.23
160 0.24
161 0.26
162 0.32
163 0.33
164 0.32
165 0.27
166 0.26
167 0.25
168 0.21
169 0.19
170 0.12
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.14
190 0.2
191 0.22
192 0.25
193 0.27
194 0.31
195 0.31
196 0.3
197 0.27
198 0.24
199 0.22
200 0.19
201 0.15
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.12
266 0.13
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.13
274 0.13
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.1
296 0.1
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.14
301 0.2
302 0.29
303 0.29
304 0.32
305 0.34
306 0.35
307 0.37
308 0.32
309 0.28
310 0.19
311 0.19
312 0.17
313 0.15
314 0.13
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.09
362 0.12
363 0.14
364 0.15
365 0.18
366 0.18
367 0.17
368 0.18
369 0.16
370 0.14
371 0.14
372 0.2
373 0.2
374 0.23
375 0.24
376 0.27
377 0.3
378 0.3
379 0.29
380 0.23
381 0.26
382 0.24
383 0.23
384 0.24
385 0.23
386 0.24
387 0.24
388 0.22
389 0.16
390 0.17
391 0.17
392 0.12
393 0.11
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.1
404 0.17
405 0.19
406 0.21
407 0.23
408 0.28
409 0.31
410 0.32
411 0.38
412 0.36
413 0.39
414 0.45
415 0.49
416 0.44
417 0.42
418 0.41
419 0.4
420 0.4
421 0.39
422 0.4
423 0.36
424 0.34
425 0.33
426 0.33
427 0.28
428 0.25
429 0.23
430 0.19
431 0.17
432 0.18
433 0.19
434 0.2
435 0.21
436 0.21
437 0.23
438 0.22
439 0.21
440 0.22
441 0.26
442 0.25
443 0.24
444 0.23
445 0.18
446 0.16
447 0.18
448 0.17
449 0.12
450 0.11
451 0.12
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.14
463 0.16
464 0.18
465 0.18
466 0.17
467 0.21
468 0.22
469 0.2
470 0.2
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.13
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.16
483 0.16
484 0.16
485 0.18
486 0.18
487 0.26
488 0.3
489 0.32
490 0.29
491 0.37
492 0.4
493 0.42
494 0.42
495 0.34
496 0.3
497 0.28
498 0.26
499 0.2
500 0.16
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06