Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HT88

Protein Details
Accession A0A553HT88    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-442EERQRRSPGRDRSKSRTRSRSRPNKAERPPSRQDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-362KRRKEEEEAEARLAEERKKARSRG
412-440QRRSPGRDRSKSRTRSRSRPNKAERPPSR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001715  CH_dom  
IPR036872  CH_dom_sf  
IPR003096  SM22_calponin  
Gene Ontology GO:0016043  P:cellular component organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00307  CH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50021  CH  
CDD cd21210  CH_SCP1-like  
Amino Acid Sequences MASVSSLDKDLRKLRLEKFTPAAAAEARSWIEGILGSSLPSTDLLEGLKDGVALCKLVNLAVGPPGVKFKQSAMPFVQMENISHFLRACQSPPLNLQEHDMFLTVDLYEQKDPAQVLQCISAFSRAAHAANPSTFPSPIGPKNRGPLTPQGTGYSSPRNRGFSNVSATSPTYGSRPGLASAGTGDSSGRYSPARSPTSDRIGARSPTVSSWSKKDHEGVTNPAWNIAQYGYMGGASQGNLGIAFGGRRQITSASPRVPTWQEKERQRKEQEQQQRLQMEEEKRRRQTELEADEKRAQLEEEQQWEDETRRLRAEEKRRTEEEKMKWEEEERQWRIVEEKRRKEEEEAEARLAEERKKARSRGDNRLRGQFLSQYRVEQTLAVQRTGDGDYRKQLRELELARQRENEYEEERQRRSPGRDRSKSRTRSRSRPNKAERPPSRQDSWRPRDERDYLRRQWSQQQAQELEAPVPQVPPRPLPDPTAVSVKTHKTGEASSPPAPIETQRTGEPRPLPIPGVPSSRPLPVPQAANRTDRFLASNPAPAPQTPQQSYSRELDATAERDAEDKRRAQSQDKTKAGGWAGKSLLEREMELERQRQQEWEEAQRETAQAVRSGDGGVDGIGGRWDVSQWAGYTGGDSQNRGSAGIGAGRRQIVGPRPLPHRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.61
3 0.62
4 0.63
5 0.6
6 0.57
7 0.51
8 0.45
9 0.4
10 0.31
11 0.29
12 0.23
13 0.22
14 0.19
15 0.18
16 0.17
17 0.14
18 0.13
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.12
52 0.17
53 0.17
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.26
58 0.28
59 0.33
60 0.31
61 0.37
62 0.36
63 0.36
64 0.37
65 0.3
66 0.29
67 0.28
68 0.27
69 0.21
70 0.22
71 0.21
72 0.17
73 0.22
74 0.22
75 0.2
76 0.25
77 0.26
78 0.28
79 0.33
80 0.38
81 0.37
82 0.35
83 0.38
84 0.31
85 0.31
86 0.29
87 0.25
88 0.18
89 0.15
90 0.15
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.15
99 0.15
100 0.18
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.23
105 0.23
106 0.22
107 0.22
108 0.21
109 0.16
110 0.15
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.18
116 0.19
117 0.19
118 0.21
119 0.2
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.2
124 0.23
125 0.29
126 0.35
127 0.37
128 0.39
129 0.46
130 0.49
131 0.48
132 0.45
133 0.47
134 0.46
135 0.45
136 0.43
137 0.38
138 0.36
139 0.36
140 0.35
141 0.36
142 0.33
143 0.35
144 0.38
145 0.39
146 0.38
147 0.41
148 0.43
149 0.37
150 0.42
151 0.37
152 0.34
153 0.32
154 0.32
155 0.28
156 0.24
157 0.2
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.1
178 0.15
179 0.23
180 0.26
181 0.27
182 0.34
183 0.39
184 0.44
185 0.48
186 0.44
187 0.4
188 0.42
189 0.4
190 0.35
191 0.3
192 0.25
193 0.2
194 0.25
195 0.25
196 0.22
197 0.26
198 0.31
199 0.31
200 0.33
201 0.36
202 0.35
203 0.37
204 0.38
205 0.39
206 0.37
207 0.39
208 0.37
209 0.34
210 0.29
211 0.23
212 0.2
213 0.15
214 0.11
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.13
238 0.19
239 0.24
240 0.23
241 0.25
242 0.25
243 0.28
244 0.3
245 0.32
246 0.32
247 0.35
248 0.39
249 0.47
250 0.58
251 0.62
252 0.67
253 0.69
254 0.73
255 0.71
256 0.73
257 0.74
258 0.71
259 0.68
260 0.64
261 0.6
262 0.52
263 0.47
264 0.44
265 0.4
266 0.43
267 0.48
268 0.49
269 0.51
270 0.53
271 0.52
272 0.47
273 0.46
274 0.46
275 0.43
276 0.44
277 0.41
278 0.43
279 0.45
280 0.43
281 0.37
282 0.28
283 0.22
284 0.15
285 0.19
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.2
290 0.2
291 0.21
292 0.2
293 0.17
294 0.16
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.2
299 0.27
300 0.37
301 0.44
302 0.49
303 0.53
304 0.55
305 0.59
306 0.6
307 0.6
308 0.56
309 0.55
310 0.52
311 0.47
312 0.44
313 0.41
314 0.41
315 0.39
316 0.43
317 0.36
318 0.34
319 0.33
320 0.33
321 0.35
322 0.35
323 0.39
324 0.39
325 0.45
326 0.49
327 0.52
328 0.53
329 0.53
330 0.52
331 0.5
332 0.47
333 0.41
334 0.36
335 0.33
336 0.31
337 0.3
338 0.26
339 0.2
340 0.18
341 0.18
342 0.25
343 0.3
344 0.32
345 0.37
346 0.46
347 0.52
348 0.58
349 0.65
350 0.67
351 0.66
352 0.7
353 0.64
354 0.55
355 0.48
356 0.43
357 0.35
358 0.31
359 0.28
360 0.23
361 0.23
362 0.23
363 0.22
364 0.16
365 0.15
366 0.17
367 0.18
368 0.17
369 0.16
370 0.14
371 0.16
372 0.17
373 0.18
374 0.13
375 0.14
376 0.19
377 0.24
378 0.25
379 0.25
380 0.25
381 0.24
382 0.29
383 0.29
384 0.33
385 0.35
386 0.38
387 0.37
388 0.38
389 0.37
390 0.32
391 0.33
392 0.27
393 0.24
394 0.28
395 0.34
396 0.38
397 0.39
398 0.39
399 0.41
400 0.43
401 0.46
402 0.49
403 0.52
404 0.58
405 0.65
406 0.7
407 0.75
408 0.79
409 0.82
410 0.82
411 0.82
412 0.79
413 0.8
414 0.84
415 0.86
416 0.86
417 0.87
418 0.87
419 0.86
420 0.87
421 0.88
422 0.84
423 0.81
424 0.79
425 0.75
426 0.7
427 0.66
428 0.67
429 0.67
430 0.67
431 0.68
432 0.64
433 0.61
434 0.64
435 0.64
436 0.64
437 0.62
438 0.63
439 0.6
440 0.65
441 0.65
442 0.61
443 0.63
444 0.63
445 0.62
446 0.56
447 0.58
448 0.51
449 0.48
450 0.48
451 0.4
452 0.3
453 0.23
454 0.2
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.15
459 0.16
460 0.19
461 0.22
462 0.25
463 0.27
464 0.29
465 0.33
466 0.31
467 0.31
468 0.34
469 0.31
470 0.29
471 0.32
472 0.31
473 0.3
474 0.28
475 0.27
476 0.22
477 0.24
478 0.27
479 0.29
480 0.31
481 0.28
482 0.29
483 0.29
484 0.27
485 0.26
486 0.22
487 0.23
488 0.21
489 0.21
490 0.24
491 0.28
492 0.29
493 0.35
494 0.35
495 0.33
496 0.32
497 0.32
498 0.3
499 0.27
500 0.3
501 0.28
502 0.31
503 0.27
504 0.3
505 0.3
506 0.31
507 0.31
508 0.28
509 0.29
510 0.28
511 0.33
512 0.33
513 0.39
514 0.4
515 0.45
516 0.44
517 0.43
518 0.4
519 0.35
520 0.33
521 0.27
522 0.3
523 0.26
524 0.31
525 0.27
526 0.28
527 0.28
528 0.25
529 0.3
530 0.3
531 0.37
532 0.32
533 0.37
534 0.4
535 0.42
536 0.46
537 0.42
538 0.39
539 0.31
540 0.3
541 0.28
542 0.26
543 0.26
544 0.22
545 0.2
546 0.17
547 0.19
548 0.21
549 0.23
550 0.25
551 0.27
552 0.29
553 0.36
554 0.4
555 0.45
556 0.53
557 0.58
558 0.63
559 0.62
560 0.62
561 0.56
562 0.57
563 0.53
564 0.48
565 0.39
566 0.34
567 0.31
568 0.31
569 0.31
570 0.27
571 0.27
572 0.23
573 0.22
574 0.19
575 0.22
576 0.24
577 0.27
578 0.3
579 0.33
580 0.36
581 0.37
582 0.38
583 0.36
584 0.39
585 0.41
586 0.45
587 0.43
588 0.4
589 0.41
590 0.4
591 0.38
592 0.3
593 0.29
594 0.21
595 0.21
596 0.22
597 0.2
598 0.19
599 0.19
600 0.18
601 0.14
602 0.13
603 0.08
604 0.08
605 0.07
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.06
611 0.07
612 0.07
613 0.09
614 0.11
615 0.11
616 0.13
617 0.13
618 0.13
619 0.14
620 0.16
621 0.22
622 0.21
623 0.22
624 0.21
625 0.24
626 0.25
627 0.24
628 0.21
629 0.16
630 0.16
631 0.21
632 0.21
633 0.2
634 0.23
635 0.23
636 0.23
637 0.23
638 0.27
639 0.29
640 0.36
641 0.4
642 0.44