Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HKB4

Protein Details
Accession A0A553HKB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-226DEVEPKVEPQPKKKPKKENKDKSERKDKTERRNKKDKTKKEKKKSKKYSKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-225QPKKKPKKENKDKSERKDKTERRNKKDKTKKEKKKSKKYSK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MDPANILPVLERLDDAVDNLDDALQPLANSMTDVASKLPLLDKAKLYVLMTYSIESMLFSALRLNEVDAKEHPIFKELARVRQYFDKIKNIEFPPQKPEQSLNKEAAIRFIRSDLADNKEINTKLSEMIAKERAKAALKNSKLGEKRKLDATTSERKSSEEIEFKDSDNSGEESEDEVEPKVEPQPKKKPKKENKDKSERKDKTERRNKKDKTKKEKKKSKKYSKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.1
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.08
15 0.07
16 0.08
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.11
26 0.16
27 0.19
28 0.22
29 0.23
30 0.24
31 0.26
32 0.27
33 0.25
34 0.21
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.15
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.06
46 0.05
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.14
53 0.14
54 0.16
55 0.15
56 0.21
57 0.21
58 0.23
59 0.22
60 0.19
61 0.2
62 0.18
63 0.27
64 0.23
65 0.29
66 0.33
67 0.33
68 0.34
69 0.39
70 0.43
71 0.4
72 0.42
73 0.42
74 0.39
75 0.4
76 0.45
77 0.4
78 0.44
79 0.42
80 0.39
81 0.37
82 0.39
83 0.38
84 0.33
85 0.36
86 0.36
87 0.39
88 0.4
89 0.37
90 0.35
91 0.36
92 0.35
93 0.35
94 0.29
95 0.22
96 0.19
97 0.18
98 0.16
99 0.15
100 0.17
101 0.14
102 0.17
103 0.19
104 0.18
105 0.19
106 0.22
107 0.22
108 0.2
109 0.18
110 0.14
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.1
115 0.14
116 0.2
117 0.19
118 0.2
119 0.2
120 0.22
121 0.23
122 0.24
123 0.27
124 0.29
125 0.3
126 0.34
127 0.34
128 0.39
129 0.43
130 0.46
131 0.48
132 0.44
133 0.45
134 0.47
135 0.47
136 0.41
137 0.42
138 0.43
139 0.44
140 0.44
141 0.45
142 0.39
143 0.38
144 0.38
145 0.35
146 0.35
147 0.32
148 0.3
149 0.32
150 0.32
151 0.32
152 0.33
153 0.29
154 0.24
155 0.19
156 0.18
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.11
168 0.16
169 0.21
170 0.26
171 0.34
172 0.45
173 0.56
174 0.67
175 0.75
176 0.8
177 0.84
178 0.91
179 0.93
180 0.93
181 0.93
182 0.94
183 0.95
184 0.94
185 0.94
186 0.88
187 0.85
188 0.85
189 0.84
190 0.84
191 0.85
192 0.85
193 0.83
194 0.88
195 0.89
196 0.89
197 0.91
198 0.91
199 0.91
200 0.92
201 0.94
202 0.94
203 0.96
204 0.96
205 0.96
206 0.97