Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553I4U5

Protein Details
Accession A0A553I4U5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-248HYTAFKKRKATSKKSVTAKSKGKHydrophilic
403-426TGDIRDAKRMRKYRRNKDGWYPRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-257KKRKATSKKSVTAKSKGKAVGKSRKAK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, pero 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR029256  Heliccase-ass-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR001912  Ribosomal_S4/S9_N  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0019843  F:rRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00163  Ribosomal_S4  
PF01479  S4  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PF14773  VIGSSK  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MNPNWLKKTDFVTWKQDHDHRDTAVIRRYMIQDRGDYQKYNKLCGSLRQLAHKLSLLPPESATRQKHEKLLLEKLYDMGILSSTSKLSNVEHGVTVSAMARRRLPVVMTRLRMAETVQAATKMIEQGHVRVGVECITDPAFFVTRNQEDLVTWTADKTADLRLSLPIYRQVRPTHNKTDPIVIPDDESTASDASVESEVKQILPIKRKLKPQPIDHDEWSDESDGHYTAFKKRKATSKKSVTAKSKGKAVGKSRKAKLQLNDSTASETEAQATIPTSIPVYFQKRRTAFDENLKALHEAGLRLPPDYSDIYFSDDERLEEIEEKPQFEPSSGIKPCHPYKDIKITGGLIPASLAQYLRDYQIQGVRFLYDLFVHQRGGLLGDDMGLGKTVQVAAFLTVAFGKTGDIRDAKRMRKYRRNKDGWYPRVLIVCPGSLIQNWKNELERWGWWVIDLFHGPQRDDVLGAARAGRLEVMVTTYTTYKNSANEVNMVPWDIVIADECHCIKDPAAGITQSMNLVNSLCRIGLTGTAIQNNYEELWALLNWTNPGQFGTLRDWQRMVAKPLAIGQSHDATLQQLSMARTTAKKLRDNLLPKFFLRRLKSLIADQLPKKSDKVVFCPLSDLQRQAYENILASAIAQFVLTSFDRCPCGTGKTRGHCCHTMTADGEKWQSLTFPLIMSLQKLANHFNLLMPRSTDVSDKYRRELRILQAAAPNDWESHYASRDSMLGLANPEYCGKWKVLKKLLEFWHTNGDKVLVFSHSVRLLNILQQLFNKTLYNVSYLDGSLSYEERQAAVDDFNCDPNQFIFLISTKAGGVGLNITSANKVVIMDPHWNPSYDLQAQDRAYRIGQTRDVDVYRLISVGTIEEITYARQIYKQQQANIGYNASNERRYFKGVQHQSKGELFGIQNLLTYNGDEGVLRHIVNKTNVAEARAGVKMIDIDMNKVAQAVEDDIPIKKEGGFDDETGGLKQLSNMLTAPNNKRGIIQPSKTANKAKSDPIQAILAGEGVEYTHENSEVIGSSKIENELSRWAEKAIDPEGGLADMALFVDSQQDPSTGVNYQSFDYEFNPPMDVMQRQFCTMAKEFGFSNATEFALAVEGMTQEQRRNCLDSFYKNRAEKLRDVGEIKIEGVKTEANTKGSVKLEPNVDDQSNVDSHPVAAENIKKEDPPPQNARTATADVKQEPRSSPVNATVPIALSHDRPKPDGRSVSIWLSDDEETDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.64
3 0.64
4 0.62
5 0.61
6 0.6
7 0.51
8 0.53
9 0.52
10 0.52
11 0.54
12 0.49
13 0.43
14 0.42
15 0.46
16 0.46
17 0.47
18 0.44
19 0.4
20 0.42
21 0.49
22 0.49
23 0.47
24 0.45
25 0.47
26 0.45
27 0.46
28 0.44
29 0.41
30 0.4
31 0.44
32 0.5
33 0.5
34 0.51
35 0.54
36 0.57
37 0.54
38 0.54
39 0.48
40 0.42
41 0.37
42 0.42
43 0.35
44 0.32
45 0.31
46 0.33
47 0.36
48 0.41
49 0.4
50 0.4
51 0.46
52 0.49
53 0.54
54 0.56
55 0.58
56 0.57
57 0.62
58 0.61
59 0.55
60 0.51
61 0.45
62 0.39
63 0.31
64 0.25
65 0.16
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.19
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.2
82 0.19
83 0.15
84 0.16
85 0.18
86 0.19
87 0.22
88 0.23
89 0.25
90 0.26
91 0.27
92 0.3
93 0.36
94 0.42
95 0.42
96 0.42
97 0.41
98 0.41
99 0.38
100 0.32
101 0.28
102 0.22
103 0.22
104 0.21
105 0.2
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.17
110 0.15
111 0.18
112 0.18
113 0.19
114 0.23
115 0.24
116 0.23
117 0.21
118 0.21
119 0.18
120 0.18
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.16
130 0.22
131 0.22
132 0.25
133 0.26
134 0.23
135 0.23
136 0.26
137 0.26
138 0.2
139 0.18
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.14
145 0.16
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.19
150 0.22
151 0.23
152 0.23
153 0.26
154 0.28
155 0.3
156 0.35
157 0.38
158 0.45
159 0.53
160 0.59
161 0.6
162 0.63
163 0.66
164 0.62
165 0.65
166 0.57
167 0.52
168 0.48
169 0.38
170 0.34
171 0.28
172 0.28
173 0.2
174 0.18
175 0.15
176 0.12
177 0.11
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.14
188 0.2
189 0.24
190 0.32
191 0.4
192 0.46
193 0.51
194 0.61
195 0.68
196 0.72
197 0.75
198 0.75
199 0.78
200 0.78
201 0.79
202 0.72
203 0.67
204 0.57
205 0.5
206 0.43
207 0.33
208 0.25
209 0.19
210 0.17
211 0.13
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.21
216 0.29
217 0.32
218 0.37
219 0.43
220 0.53
221 0.61
222 0.68
223 0.7
224 0.73
225 0.78
226 0.81
227 0.84
228 0.82
229 0.81
230 0.8
231 0.72
232 0.69
233 0.66
234 0.63
235 0.62
236 0.64
237 0.65
238 0.66
239 0.72
240 0.7
241 0.71
242 0.72
243 0.71
244 0.67
245 0.67
246 0.64
247 0.6
248 0.58
249 0.51
250 0.47
251 0.4
252 0.36
253 0.26
254 0.19
255 0.16
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.1
266 0.16
267 0.24
268 0.29
269 0.33
270 0.42
271 0.44
272 0.48
273 0.52
274 0.53
275 0.51
276 0.54
277 0.58
278 0.5
279 0.49
280 0.46
281 0.4
282 0.33
283 0.3
284 0.21
285 0.14
286 0.14
287 0.17
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.13
292 0.15
293 0.16
294 0.15
295 0.14
296 0.14
297 0.18
298 0.19
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.17
304 0.17
305 0.13
306 0.15
307 0.15
308 0.18
309 0.19
310 0.21
311 0.2
312 0.23
313 0.22
314 0.2
315 0.22
316 0.18
317 0.26
318 0.27
319 0.28
320 0.27
321 0.34
322 0.38
323 0.41
324 0.41
325 0.37
326 0.42
327 0.51
328 0.51
329 0.45
330 0.43
331 0.38
332 0.37
333 0.34
334 0.27
335 0.16
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.09
340 0.08
341 0.06
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.18
349 0.18
350 0.18
351 0.18
352 0.17
353 0.15
354 0.15
355 0.13
356 0.09
357 0.1
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.14
365 0.11
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.07
391 0.1
392 0.13
393 0.14
394 0.24
395 0.31
396 0.36
397 0.44
398 0.52
399 0.59
400 0.66
401 0.76
402 0.78
403 0.82
404 0.85
405 0.81
406 0.83
407 0.84
408 0.8
409 0.75
410 0.67
411 0.58
412 0.52
413 0.47
414 0.38
415 0.28
416 0.22
417 0.17
418 0.14
419 0.12
420 0.11
421 0.15
422 0.16
423 0.2
424 0.21
425 0.22
426 0.23
427 0.24
428 0.25
429 0.23
430 0.2
431 0.2
432 0.19
433 0.17
434 0.16
435 0.16
436 0.14
437 0.13
438 0.13
439 0.11
440 0.13
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.15
445 0.13
446 0.12
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.07
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.15
470 0.16
471 0.16
472 0.18
473 0.18
474 0.17
475 0.15
476 0.15
477 0.12
478 0.09
479 0.08
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.07
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.09
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.13
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.1
500 0.09
501 0.08
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.08
513 0.1
514 0.11
515 0.12
516 0.13
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.1
521 0.08
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.09
537 0.13
538 0.19
539 0.2
540 0.21
541 0.21
542 0.21
543 0.26
544 0.27
545 0.26
546 0.22
547 0.2
548 0.2
549 0.22
550 0.24
551 0.18
552 0.16
553 0.14
554 0.13
555 0.13
556 0.13
557 0.1
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.06
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.12
569 0.17
570 0.2
571 0.24
572 0.27
573 0.31
574 0.37
575 0.42
576 0.46
577 0.47
578 0.44
579 0.4
580 0.42
581 0.41
582 0.41
583 0.38
584 0.35
585 0.33
586 0.33
587 0.34
588 0.31
589 0.32
590 0.28
591 0.31
592 0.29
593 0.29
594 0.29
595 0.28
596 0.27
597 0.25
598 0.26
599 0.23
600 0.28
601 0.31
602 0.31
603 0.3
604 0.33
605 0.3
606 0.3
607 0.29
608 0.24
609 0.17
610 0.18
611 0.18
612 0.16
613 0.16
614 0.13
615 0.11
616 0.11
617 0.1
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.05
622 0.04
623 0.04
624 0.03
625 0.03
626 0.06
627 0.06
628 0.07
629 0.08
630 0.09
631 0.11
632 0.11
633 0.13
634 0.11
635 0.16
636 0.2
637 0.28
638 0.33
639 0.39
640 0.47
641 0.49
642 0.53
643 0.51
644 0.47
645 0.44
646 0.38
647 0.33
648 0.26
649 0.26
650 0.22
651 0.2
652 0.19
653 0.14
654 0.13
655 0.11
656 0.1
657 0.08
658 0.08
659 0.07
660 0.06
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.1
667 0.11
668 0.13
669 0.14
670 0.13
671 0.14
672 0.14
673 0.14
674 0.16
675 0.15
676 0.14
677 0.13
678 0.13
679 0.14
680 0.14
681 0.14
682 0.14
683 0.19
684 0.27
685 0.28
686 0.31
687 0.35
688 0.35
689 0.38
690 0.4
691 0.37
692 0.38
693 0.37
694 0.36
695 0.33
696 0.33
697 0.29
698 0.26
699 0.22
700 0.13
701 0.13
702 0.12
703 0.1
704 0.11
705 0.12
706 0.12
707 0.11
708 0.12
709 0.12
710 0.1
711 0.1
712 0.09
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.08
720 0.09
721 0.1
722 0.11
723 0.17
724 0.22
725 0.29
726 0.36
727 0.42
728 0.43
729 0.5
730 0.54
731 0.53
732 0.5
733 0.43
734 0.45
735 0.4
736 0.38
737 0.29
738 0.25
739 0.19
740 0.18
741 0.18
742 0.09
743 0.1
744 0.1
745 0.13
746 0.13
747 0.13
748 0.13
749 0.15
750 0.14
751 0.16
752 0.2
753 0.17
754 0.16
755 0.17
756 0.19
757 0.18
758 0.18
759 0.16
760 0.12
761 0.13
762 0.13
763 0.14
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.11
768 0.11
769 0.09
770 0.09
771 0.07
772 0.08
773 0.08
774 0.08
775 0.09
776 0.08
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.09
781 0.1
782 0.11
783 0.12
784 0.14
785 0.14
786 0.13
787 0.13
788 0.12
789 0.13
790 0.1
791 0.09
792 0.08
793 0.09
794 0.11
795 0.1
796 0.1
797 0.08
798 0.08
799 0.08
800 0.07
801 0.06
802 0.06
803 0.06
804 0.06
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.07
809 0.06
810 0.05
811 0.06
812 0.06
813 0.07
814 0.1
815 0.15
816 0.16
817 0.21
818 0.21
819 0.21
820 0.22
821 0.22
822 0.25
823 0.21
824 0.23
825 0.2
826 0.25
827 0.25
828 0.26
829 0.26
830 0.22
831 0.2
832 0.22
833 0.23
834 0.21
835 0.25
836 0.24
837 0.25
838 0.27
839 0.27
840 0.24
841 0.22
842 0.19
843 0.15
844 0.14
845 0.11
846 0.08
847 0.08
848 0.07
849 0.07
850 0.05
851 0.05
852 0.06
853 0.06
854 0.07
855 0.08
856 0.08
857 0.08
858 0.1
859 0.14
860 0.2
861 0.29
862 0.33
863 0.35
864 0.41
865 0.45
866 0.46
867 0.43
868 0.38
869 0.3
870 0.26
871 0.29
872 0.24
873 0.24
874 0.22
875 0.24
876 0.24
877 0.29
878 0.31
879 0.31
880 0.4
881 0.45
882 0.53
883 0.55
884 0.55
885 0.53
886 0.52
887 0.49
888 0.39
889 0.32
890 0.23
891 0.21
892 0.21
893 0.17
894 0.16
895 0.14
896 0.15
897 0.12
898 0.12
899 0.09
900 0.08
901 0.08
902 0.07
903 0.08
904 0.09
905 0.11
906 0.1
907 0.13
908 0.14
909 0.18
910 0.2
911 0.24
912 0.22
913 0.27
914 0.28
915 0.27
916 0.25
917 0.22
918 0.23
919 0.19
920 0.18
921 0.12
922 0.11
923 0.1
924 0.1
925 0.13
926 0.1
927 0.12
928 0.13
929 0.13
930 0.13
931 0.13
932 0.12
933 0.08
934 0.09
935 0.1
936 0.09
937 0.11
938 0.12
939 0.12
940 0.14
941 0.15
942 0.14
943 0.12
944 0.13
945 0.13
946 0.17
947 0.18
948 0.17
949 0.19
950 0.2
951 0.2
952 0.18
953 0.18
954 0.13
955 0.11
956 0.11
957 0.13
958 0.12
959 0.12
960 0.12
961 0.14
962 0.18
963 0.25
964 0.3
965 0.34
966 0.35
967 0.34
968 0.36
969 0.39
970 0.44
971 0.45
972 0.43
973 0.43
974 0.5
975 0.55
976 0.57
977 0.59
978 0.54
979 0.53
980 0.54
981 0.53
982 0.52
983 0.51
984 0.48
985 0.44
986 0.41
987 0.33
988 0.3
989 0.23
990 0.16
991 0.11
992 0.08
993 0.06
994 0.04
995 0.05
996 0.06
997 0.07
998 0.07
999 0.08
1000 0.08
1001 0.08
1002 0.09
1003 0.09
1004 0.1
1005 0.1
1006 0.1
1007 0.11
1008 0.13
1009 0.14
1010 0.14
1011 0.14
1012 0.14
1013 0.2
1014 0.23
1015 0.23
1016 0.22
1017 0.22
1018 0.22
1019 0.23
1020 0.25
1021 0.21
1022 0.19
1023 0.17
1024 0.17
1025 0.17
1026 0.15
1027 0.13
1028 0.09
1029 0.07
1030 0.05
1031 0.05
1032 0.04
1033 0.04
1034 0.03
1035 0.08
1036 0.08
1037 0.1
1038 0.11
1039 0.11
1040 0.12
1041 0.13
1042 0.15
1043 0.13
1044 0.15
1045 0.16
1046 0.17
1047 0.17
1048 0.18
1049 0.18
1050 0.18
1051 0.19
1052 0.22
1053 0.21
1054 0.21
1055 0.21
1056 0.19
1057 0.2
1058 0.22
1059 0.22
1060 0.2
1061 0.25
1062 0.25
1063 0.25
1064 0.27
1065 0.27
1066 0.3
1067 0.29
1068 0.32
1069 0.26
1070 0.26
1071 0.25
1072 0.28
1073 0.29
1074 0.22
1075 0.22
1076 0.17
1077 0.17
1078 0.15
1079 0.15
1080 0.11
1081 0.1
1082 0.1
1083 0.07
1084 0.06
1085 0.06
1086 0.07
1087 0.11
1088 0.12
1089 0.16
1090 0.19
1091 0.23
1092 0.26
1093 0.3
1094 0.29
1095 0.34
1096 0.38
1097 0.43
1098 0.5
1099 0.54
1100 0.6
1101 0.58
1102 0.64
1103 0.64
1104 0.64
1105 0.6
1106 0.59
1107 0.57
1108 0.53
1109 0.53
1110 0.48
1111 0.44
1112 0.4
1113 0.35
1114 0.31
1115 0.25
1116 0.2
1117 0.19
1118 0.2
1119 0.16
1120 0.22
1121 0.25
1122 0.23
1123 0.25
1124 0.27
1125 0.31
1126 0.31
1127 0.34
1128 0.31
1129 0.32
1130 0.35
1131 0.36
1132 0.39
1133 0.38
1134 0.36
1135 0.33
1136 0.3
1137 0.29
1138 0.25
1139 0.22
1140 0.19
1141 0.14
1142 0.14
1143 0.14
1144 0.14
1145 0.12
1146 0.16
1147 0.21
1148 0.24
1149 0.28
1150 0.3
1151 0.29
1152 0.3
1153 0.38
1154 0.41
1155 0.45
1156 0.49
1157 0.49
1158 0.55
1159 0.55
1160 0.58
1161 0.53
1162 0.5
1163 0.45
1164 0.42
1165 0.44
1166 0.4
1167 0.46
1168 0.47
1169 0.46
1170 0.43
1171 0.44
1172 0.43
1173 0.41
1174 0.41
1175 0.42
1176 0.42
1177 0.39
1178 0.39
1179 0.35
1180 0.32
1181 0.29
1182 0.28
1183 0.22
1184 0.21
1185 0.27
1186 0.31
1187 0.32
1188 0.35
1189 0.41
1190 0.44
1191 0.52
1192 0.55
1193 0.53
1194 0.53
1195 0.54
1196 0.55
1197 0.52
1198 0.47
1199 0.38
1200 0.35
1201 0.3
1202 0.25