Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HXH3

Protein Details
Accession A0A553HXH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-232LPSWKRVMRASRPSRRPSPEKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
Amino Acid Sequences MDPSEQPEPTLPPAEQMRQRRLAKLASLNAASSSPKPAAEESHTAQSSEPSSSTPPPPSNQPQSQQIRITPKPKPAESSSAINPFSQLTSKKNESGKGSSVDSGNIRSIKRPTTAVDAEPPEALSVKKLHTTTEESLDDWSDRVLSDVFLVTLDEKRTADVRGTRLTYLPELRAELEQSGEPIKLRTSSIDAALLEAAKHVPKTKALLDYLLPSWKRVMRASRPSRRPSPEKEAVLDEAKRLCMSNCIFALTMPEYFGRDPNPNHDSLVPYLLRNHDNEDGVCLDFFTEAVSRIGEDDTIAPIFTEAMVIISGQVAKMTMNDDYKPYINPKPDATKEELAKATETDTILGPFFRISPLQTEVTKTYFASPRTIDPGHVKSSQTALQMTLKAHQGDLIGIINAFVRASPVAKNNTLSWFAFSLNSNHKRRALQVKATDVASDGFMVNVTAILDKLCEPFMDSTFSKINKIDLDYLRRAPRVDMSDETKLNADQATSDAFYNNKVEGTSNFISEVFFLTLAAHHYGLGATNSKLKDLDKDIKYVEKIIKQMEEELPKVQSFMRYVAVWLLRTASKTDYQPGKQISLPLSADKPAAFSCLPEYALQDVVENFKFVFRFKFCQRTSASLTHEVLHRGVSSAFYDKFNIRYEIFQVIKTIWPNNVYKEKLSRESRVNRQFFVQFVNLLLNDATYLLDEALTKLVKIHDYQKQLQNQGLSPEELDKIKTDLEQAEQQCQSWMQLVNDTMGMMKLFTETLRDSFTMPEIVVRLAGMLNYNLESLVGPKRGQLKVEDAKKYHFDPKTLLSDFIDVYLNLGPKPEFVKAVASDGRSYKPSNFEAASQLLQNSLGKPPETVAAWNDLRKRVAEAKDELDQAELDLGEIPPEFEDPIMGDLMTDPVILPSRHIMDRSTIVQQLLSTPKDPFSNVQMTIDDVVPADDLRKQIEEWKAERIARAKGKSKSSGDTMDTSAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.45
3 0.5
4 0.54
5 0.6
6 0.64
7 0.63
8 0.63
9 0.6
10 0.59
11 0.59
12 0.56
13 0.52
14 0.49
15 0.44
16 0.4
17 0.37
18 0.32
19 0.25
20 0.24
21 0.2
22 0.19
23 0.21
24 0.22
25 0.26
26 0.29
27 0.34
28 0.33
29 0.41
30 0.41
31 0.39
32 0.37
33 0.36
34 0.32
35 0.27
36 0.24
37 0.17
38 0.21
39 0.26
40 0.31
41 0.35
42 0.37
43 0.38
44 0.46
45 0.53
46 0.58
47 0.61
48 0.61
49 0.64
50 0.67
51 0.71
52 0.66
53 0.64
54 0.64
55 0.64
56 0.66
57 0.62
58 0.64
59 0.65
60 0.63
61 0.63
62 0.59
63 0.6
64 0.57
65 0.56
66 0.54
67 0.53
68 0.51
69 0.44
70 0.39
71 0.32
72 0.3
73 0.29
74 0.26
75 0.23
76 0.3
77 0.35
78 0.41
79 0.44
80 0.48
81 0.49
82 0.52
83 0.52
84 0.47
85 0.45
86 0.42
87 0.38
88 0.36
89 0.31
90 0.28
91 0.28
92 0.29
93 0.27
94 0.29
95 0.33
96 0.34
97 0.35
98 0.35
99 0.33
100 0.37
101 0.4
102 0.38
103 0.4
104 0.39
105 0.37
106 0.35
107 0.32
108 0.24
109 0.22
110 0.19
111 0.15
112 0.14
113 0.16
114 0.21
115 0.21
116 0.22
117 0.26
118 0.33
119 0.33
120 0.37
121 0.35
122 0.3
123 0.31
124 0.31
125 0.27
126 0.2
127 0.17
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.12
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.22
147 0.24
148 0.27
149 0.31
150 0.34
151 0.33
152 0.33
153 0.35
154 0.34
155 0.32
156 0.3
157 0.25
158 0.24
159 0.25
160 0.24
161 0.23
162 0.18
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.21
178 0.19
179 0.19
180 0.19
181 0.17
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.17
190 0.21
191 0.25
192 0.29
193 0.28
194 0.29
195 0.27
196 0.29
197 0.28
198 0.31
199 0.27
200 0.23
201 0.26
202 0.26
203 0.28
204 0.3
205 0.37
206 0.4
207 0.51
208 0.61
209 0.67
210 0.73
211 0.78
212 0.81
213 0.81
214 0.79
215 0.76
216 0.75
217 0.73
218 0.67
219 0.63
220 0.57
221 0.51
222 0.48
223 0.41
224 0.34
225 0.26
226 0.24
227 0.22
228 0.19
229 0.16
230 0.19
231 0.19
232 0.22
233 0.21
234 0.22
235 0.21
236 0.2
237 0.24
238 0.18
239 0.17
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.16
245 0.15
246 0.19
247 0.2
248 0.27
249 0.3
250 0.28
251 0.29
252 0.29
253 0.28
254 0.24
255 0.28
256 0.22
257 0.19
258 0.21
259 0.23
260 0.24
261 0.22
262 0.25
263 0.23
264 0.23
265 0.23
266 0.22
267 0.2
268 0.18
269 0.17
270 0.12
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.08
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.21
314 0.24
315 0.26
316 0.27
317 0.3
318 0.35
319 0.38
320 0.4
321 0.41
322 0.42
323 0.39
324 0.41
325 0.39
326 0.32
327 0.29
328 0.25
329 0.2
330 0.17
331 0.16
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.1
344 0.13
345 0.16
346 0.16
347 0.18
348 0.19
349 0.2
350 0.2
351 0.18
352 0.19
353 0.21
354 0.21
355 0.22
356 0.22
357 0.22
358 0.27
359 0.27
360 0.24
361 0.25
362 0.28
363 0.28
364 0.3
365 0.28
366 0.23
367 0.26
368 0.27
369 0.23
370 0.19
371 0.17
372 0.17
373 0.19
374 0.18
375 0.18
376 0.18
377 0.17
378 0.16
379 0.15
380 0.13
381 0.11
382 0.12
383 0.09
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.07
395 0.11
396 0.15
397 0.16
398 0.18
399 0.19
400 0.21
401 0.23
402 0.21
403 0.18
404 0.16
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.16
409 0.23
410 0.31
411 0.32
412 0.34
413 0.37
414 0.37
415 0.41
416 0.47
417 0.44
418 0.43
419 0.44
420 0.45
421 0.44
422 0.42
423 0.37
424 0.27
425 0.22
426 0.15
427 0.11
428 0.07
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.13
447 0.12
448 0.14
449 0.18
450 0.18
451 0.18
452 0.18
453 0.18
454 0.15
455 0.17
456 0.2
457 0.19
458 0.24
459 0.25
460 0.29
461 0.3
462 0.3
463 0.29
464 0.24
465 0.25
466 0.23
467 0.23
468 0.2
469 0.22
470 0.25
471 0.25
472 0.25
473 0.21
474 0.18
475 0.16
476 0.13
477 0.09
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.09
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.15
493 0.14
494 0.13
495 0.14
496 0.13
497 0.13
498 0.13
499 0.13
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.12
520 0.15
521 0.19
522 0.28
523 0.25
524 0.27
525 0.28
526 0.3
527 0.3
528 0.3
529 0.28
530 0.22
531 0.23
532 0.23
533 0.23
534 0.21
535 0.24
536 0.24
537 0.23
538 0.21
539 0.2
540 0.2
541 0.18
542 0.19
543 0.16
544 0.14
545 0.12
546 0.13
547 0.13
548 0.12
549 0.12
550 0.15
551 0.15
552 0.13
553 0.12
554 0.12
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.12
559 0.14
560 0.15
561 0.21
562 0.26
563 0.26
564 0.31
565 0.31
566 0.32
567 0.29
568 0.31
569 0.26
570 0.24
571 0.24
572 0.2
573 0.19
574 0.18
575 0.18
576 0.15
577 0.15
578 0.1
579 0.13
580 0.11
581 0.1
582 0.11
583 0.12
584 0.13
585 0.12
586 0.13
587 0.11
588 0.13
589 0.12
590 0.11
591 0.1
592 0.12
593 0.12
594 0.11
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.11
599 0.15
600 0.15
601 0.21
602 0.26
603 0.36
604 0.35
605 0.41
606 0.43
607 0.44
608 0.47
609 0.46
610 0.45
611 0.4
612 0.41
613 0.36
614 0.35
615 0.3
616 0.25
617 0.2
618 0.16
619 0.12
620 0.11
621 0.1
622 0.1
623 0.13
624 0.13
625 0.14
626 0.16
627 0.16
628 0.19
629 0.21
630 0.22
631 0.19
632 0.19
633 0.21
634 0.25
635 0.25
636 0.22
637 0.21
638 0.19
639 0.21
640 0.21
641 0.21
642 0.16
643 0.19
644 0.2
645 0.25
646 0.31
647 0.3
648 0.31
649 0.36
650 0.38
651 0.44
652 0.47
653 0.46
654 0.48
655 0.55
656 0.62
657 0.66
658 0.64
659 0.56
660 0.55
661 0.51
662 0.43
663 0.39
664 0.3
665 0.2
666 0.18
667 0.19
668 0.15
669 0.14
670 0.13
671 0.08
672 0.07
673 0.07
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.04
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.08
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.1
686 0.11
687 0.14
688 0.2
689 0.24
690 0.31
691 0.38
692 0.43
693 0.48
694 0.49
695 0.49
696 0.45
697 0.4
698 0.37
699 0.32
700 0.26
701 0.2
702 0.2
703 0.19
704 0.17
705 0.16
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.14
711 0.14
712 0.16
713 0.23
714 0.23
715 0.28
716 0.28
717 0.27
718 0.26
719 0.25
720 0.22
721 0.18
722 0.2
723 0.14
724 0.17
725 0.17
726 0.17
727 0.17
728 0.16
729 0.12
730 0.1
731 0.09
732 0.06
733 0.06
734 0.05
735 0.06
736 0.06
737 0.09
738 0.1
739 0.11
740 0.14
741 0.15
742 0.15
743 0.16
744 0.17
745 0.15
746 0.13
747 0.13
748 0.12
749 0.11
750 0.1
751 0.09
752 0.08
753 0.07
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.08
759 0.08
760 0.07
761 0.07
762 0.07
763 0.09
764 0.13
765 0.15
766 0.15
767 0.18
768 0.26
769 0.28
770 0.29
771 0.29
772 0.34
773 0.4
774 0.48
775 0.52
776 0.46
777 0.49
778 0.51
779 0.52
780 0.52
781 0.46
782 0.4
783 0.37
784 0.41
785 0.45
786 0.43
787 0.41
788 0.33
789 0.32
790 0.3
791 0.27
792 0.22
793 0.14
794 0.14
795 0.15
796 0.15
797 0.12
798 0.14
799 0.13
800 0.13
801 0.16
802 0.17
803 0.15
804 0.15
805 0.21
806 0.2
807 0.26
808 0.27
809 0.26
810 0.27
811 0.29
812 0.3
813 0.28
814 0.3
815 0.28
816 0.31
817 0.31
818 0.33
819 0.32
820 0.31
821 0.32
822 0.32
823 0.3
824 0.25
825 0.23
826 0.18
827 0.19
828 0.18
829 0.16
830 0.17
831 0.18
832 0.17
833 0.18
834 0.18
835 0.2
836 0.2
837 0.2
838 0.17
839 0.22
840 0.25
841 0.3
842 0.34
843 0.34
844 0.35
845 0.34
846 0.37
847 0.38
848 0.41
849 0.42
850 0.42
851 0.42
852 0.45
853 0.46
854 0.4
855 0.33
856 0.27
857 0.21
858 0.18
859 0.13
860 0.09
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.09
865 0.09
866 0.08
867 0.09
868 0.09
869 0.07
870 0.08
871 0.08
872 0.09
873 0.09
874 0.08
875 0.08
876 0.08
877 0.09
878 0.09
879 0.08
880 0.06
881 0.08
882 0.12
883 0.12
884 0.13
885 0.16
886 0.21
887 0.23
888 0.24
889 0.24
890 0.25
891 0.29
892 0.31
893 0.31
894 0.29
895 0.28
896 0.27
897 0.26
898 0.27
899 0.29
900 0.28
901 0.26
902 0.25
903 0.27
904 0.29
905 0.31
906 0.28
907 0.29
908 0.33
909 0.32
910 0.33
911 0.3
912 0.3
913 0.3
914 0.27
915 0.21
916 0.14
917 0.13
918 0.12
919 0.11
920 0.1
921 0.11
922 0.12
923 0.15
924 0.16
925 0.17
926 0.24
927 0.31
928 0.37
929 0.37
930 0.43
931 0.47
932 0.47
933 0.52
934 0.49
935 0.51
936 0.52
937 0.58
938 0.59
939 0.6
940 0.66
941 0.7
942 0.7
943 0.66
944 0.63
945 0.61
946 0.56
947 0.52