Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553I3Z5

Protein Details
Accession A0A553I3Z5   
Localization Confidence Medium
Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-34DEPAGPRTKKQKISENQTTNNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 5.5, cyto_nucl 14, nucl 21.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MGLVDYSSDSSESDEPAGPRTKKQKISENQTTNNSIAKSELPPLPSAFHDLYASTVRVSASDDPALHQGRKRVNPHKVGNWPSHLYIEWHPTPTERTILTTLLSNLQSSLTSSITAPITITSFLTSDLGTPQPLHISLSRPIVLSTSQKDTFQADLESSIRSSGIAPFELAPVGVEWHRTAESARSFLVLRVGSTKKGEDHGKNPQLAALLRRANAVVTAFGQPALYAFARSSDNNNNNTPKNPRNRNEGTGVEVDHAFHVSIAWSFAEPSVEIRRLTEETFNSANRWCMTSPPGDDGDEGKSSRGGGSKEKADEGSLRTAMTTTTTIKDAISAMCVHVDGIKAKIGNVVTHVPLPDSRRRRDGDKGGRGLFGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.24
4 0.33
5 0.31
6 0.38
7 0.47
8 0.53
9 0.59
10 0.65
11 0.7
12 0.72
13 0.8
14 0.83
15 0.82
16 0.8
17 0.77
18 0.73
19 0.65
20 0.59
21 0.49
22 0.38
23 0.31
24 0.27
25 0.23
26 0.25
27 0.26
28 0.24
29 0.26
30 0.27
31 0.27
32 0.25
33 0.28
34 0.23
35 0.21
36 0.2
37 0.18
38 0.2
39 0.21
40 0.2
41 0.14
42 0.15
43 0.13
44 0.13
45 0.16
46 0.16
47 0.17
48 0.19
49 0.19
50 0.2
51 0.26
52 0.3
53 0.29
54 0.28
55 0.31
56 0.37
57 0.45
58 0.53
59 0.56
60 0.62
61 0.69
62 0.73
63 0.75
64 0.75
65 0.73
66 0.7
67 0.66
68 0.59
69 0.52
70 0.46
71 0.39
72 0.33
73 0.31
74 0.32
75 0.28
76 0.27
77 0.26
78 0.25
79 0.28
80 0.26
81 0.26
82 0.19
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.19
87 0.18
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.16
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.21
139 0.19
140 0.16
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.16
176 0.11
177 0.1
178 0.14
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.14
184 0.18
185 0.24
186 0.22
187 0.26
188 0.35
189 0.39
190 0.38
191 0.37
192 0.34
193 0.3
194 0.27
195 0.24
196 0.2
197 0.18
198 0.17
199 0.18
200 0.17
201 0.15
202 0.15
203 0.13
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.16
220 0.22
221 0.28
222 0.31
223 0.36
224 0.39
225 0.39
226 0.42
227 0.44
228 0.43
229 0.48
230 0.54
231 0.54
232 0.58
233 0.62
234 0.62
235 0.6
236 0.53
237 0.47
238 0.39
239 0.35
240 0.27
241 0.22
242 0.19
243 0.14
244 0.13
245 0.09
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.1
258 0.14
259 0.16
260 0.16
261 0.17
262 0.2
263 0.21
264 0.23
265 0.25
266 0.21
267 0.23
268 0.26
269 0.26
270 0.25
271 0.24
272 0.26
273 0.22
274 0.23
275 0.19
276 0.18
277 0.21
278 0.24
279 0.25
280 0.25
281 0.26
282 0.24
283 0.25
284 0.23
285 0.24
286 0.22
287 0.2
288 0.17
289 0.16
290 0.15
291 0.17
292 0.19
293 0.18
294 0.22
295 0.27
296 0.32
297 0.34
298 0.35
299 0.34
300 0.32
301 0.33
302 0.3
303 0.3
304 0.25
305 0.23
306 0.21
307 0.2
308 0.19
309 0.18
310 0.17
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.16
315 0.16
316 0.17
317 0.16
318 0.14
319 0.14
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.13
327 0.12
328 0.13
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.2
333 0.19
334 0.18
335 0.21
336 0.22
337 0.21
338 0.23
339 0.23
340 0.21
341 0.24
342 0.29
343 0.36
344 0.4
345 0.45
346 0.51
347 0.55
348 0.59
349 0.65
350 0.7
351 0.71
352 0.73
353 0.75
354 0.69