Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HPM6

Protein Details
Accession A0A553HPM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-211GAVFLLVRRRRRHRRQQQQSNPTEQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-199RRRRHR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11, cyto 9, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004913  Herpes_gJ  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF03229  Alpha_GJ  
Amino Acid Sequences MDNLGPLPTDFTINANCASEINDAFLLHTSIDNHDFYYLLRGPLAQTTCYPSGYAANTEQYYSPGRCPTGYTAPYTGHPWETTQGCVSTFTTTSARLTLSEVSDGITSRATTTFGDADAINAYSIQVRYQSTDFVSSSTSSPTPVSSAAIETHSPTNTPHSTNSNANKAIPGIVVGVLAAVFIAVGAVFLLVRRRRRHRRQQQQSNPTEQTQHPYSYPSELGDQVQQQQYYFGQFKVNPDNPQELDAPGRIAELDSGVAPPRDRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.18
4 0.16
5 0.18
6 0.18
7 0.16
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.15
12 0.16
13 0.14
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.13
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.2
25 0.18
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.22
31 0.23
32 0.17
33 0.17
34 0.22
35 0.23
36 0.24
37 0.23
38 0.18
39 0.2
40 0.2
41 0.22
42 0.17
43 0.2
44 0.2
45 0.21
46 0.2
47 0.19
48 0.22
49 0.21
50 0.22
51 0.21
52 0.22
53 0.21
54 0.24
55 0.26
56 0.31
57 0.31
58 0.3
59 0.29
60 0.3
61 0.31
62 0.31
63 0.27
64 0.21
65 0.19
66 0.18
67 0.2
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.17
72 0.15
73 0.17
74 0.16
75 0.14
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.16
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.2
148 0.24
149 0.31
150 0.34
151 0.34
152 0.33
153 0.32
154 0.3
155 0.27
156 0.24
157 0.17
158 0.13
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.02
168 0.02
169 0.01
170 0.02
171 0.01
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.03
177 0.1
178 0.15
179 0.22
180 0.3
181 0.41
182 0.52
183 0.64
184 0.75
185 0.8
186 0.86
187 0.91
188 0.94
189 0.95
190 0.95
191 0.9
192 0.87
193 0.79
194 0.7
195 0.63
196 0.53
197 0.49
198 0.41
199 0.37
200 0.29
201 0.29
202 0.29
203 0.27
204 0.27
205 0.22
206 0.21
207 0.2
208 0.21
209 0.21
210 0.22
211 0.24
212 0.27
213 0.26
214 0.24
215 0.25
216 0.24
217 0.26
218 0.26
219 0.21
220 0.23
221 0.24
222 0.3
223 0.38
224 0.42
225 0.41
226 0.43
227 0.49
228 0.44
229 0.45
230 0.41
231 0.32
232 0.3
233 0.27
234 0.24
235 0.17
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.11
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.09
244 0.12
245 0.14