Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HTM3

Protein Details
Accession A0A553HTM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-212AATSSKSSSKKGRIEKRRKTSKIVFPKYGDKTKKKRKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-212SSSKKGRIEKRRKTSKIVFPKYGDKTKKKRKH
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019434  DUF2423  
Pfam View protein in Pfam  
PF10338  DUF2423  
Amino Acid Sequences MPAVSRRPFALNPLNATPRSLSIGYCQFTHYGSSISPAITFDLFNLSSQLATEHRIPQRILHASLFSIQSRILTANNSKYFDGISIMAKSSRASSRKANNQRLKAKVFGPVETERNARLSAKLLELAAAPKPEQAESESMNVVEDTDAGNNSNAEKEGATAADETAMDVDIAKTAATSSKSSSKKGRIEKRRKTSKIVFPKYGDKTKKKRKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.46
3 0.47
4 0.41
5 0.33
6 0.33
7 0.28
8 0.22
9 0.22
10 0.29
11 0.28
12 0.27
13 0.27
14 0.23
15 0.23
16 0.25
17 0.19
18 0.14
19 0.13
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.09
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.09
38 0.11
39 0.14
40 0.2
41 0.23
42 0.27
43 0.27
44 0.28
45 0.34
46 0.35
47 0.35
48 0.29
49 0.26
50 0.23
51 0.26
52 0.25
53 0.18
54 0.15
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.14
62 0.21
63 0.24
64 0.26
65 0.25
66 0.24
67 0.24
68 0.21
69 0.19
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.16
79 0.16
80 0.19
81 0.25
82 0.32
83 0.43
84 0.52
85 0.6
86 0.62
87 0.69
88 0.73
89 0.71
90 0.65
91 0.58
92 0.48
93 0.45
94 0.39
95 0.31
96 0.29
97 0.26
98 0.26
99 0.25
100 0.25
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.14
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.08
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.16
166 0.25
167 0.28
168 0.33
169 0.42
170 0.47
171 0.54
172 0.63
173 0.7
174 0.72
175 0.81
176 0.86
177 0.89
178 0.91
179 0.87
180 0.86
181 0.86
182 0.85
183 0.85
184 0.83
185 0.8
186 0.74
187 0.78
188 0.77
189 0.77
190 0.77
191 0.76
192 0.78