FuNGI

A0A553IDQ6

Protein Details

Accession

A0A553IDQ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
227-247	SMPHPRPRERMQKEHQRREEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
34-57	GSIPVRRKRRIESSITPKGSPPLK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039601 Rrn5
Gene Ontology	GO:0000500 C:RNA polymerase I upstream activating factor complex GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I

Amino Acid Sequences

MDIDSDDDYRESNSEKEIARSPIYSPRGASPIRGSIPVRRKRRIESSITPKGSPPLKRMKGNFNAAYLDLLNRDINDAASGLIHGEAEEEEKEEDADQQIGAVMWSAAEKAAFFAAVSRLGRADFTGISARIGTKSELEVHQYLVLLDATEGEGVRQNALRPVDIPAAVEIGAECAAALEAAADALSLCQESYEEQVEKKRWGSRWRVTAQLVETIKSQQRRDSEASMPHPRPRERMQKEHQRREEEEDDRKEQLQMEKEEQENKGKRLDESPFFQFFRVQNWLLLSNRVFMNSAIPDGNWRAASEEHEPPAIQMTVLSDLYALAVSVTRRLLVSALYVAESRIRRNSFEVVQRQRKTWISVEDVIAAVSSLGMKQNSNEFWARCARRLQLDVVNDMTGEDKVTDEEDEGLHTHSEQGMDSDDQLLRTVESEPESTEESGDSIEEDEDDYGEIMSYDEIEAVLGYPVVDSMHSRHSTPEPSTSTTTDILSNSQDEADEGEQEEYPEEEEDDEEHDGDIKMKDQQETSGDDLHLDTMALDIEEAMISLESTERTVDGTDATRAIESRIRAEHKLEGGAELLDMQASMKAERKLWAILRDHDNTKTGNQKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.26
4	0.31
5	0.34
6	0.34
7	0.34
8	0.34
9	0.38
10	0.41
11	0.39
12	0.35
13	0.35
14	0.39
15	0.38
16	0.39
17	0.35
18	0.38
19	0.38
20	0.42
21	0.4
22	0.43
23	0.52
24	0.58
25	0.62
26	0.63
27	0.67
28	0.7
29	0.78
30	0.77
31	0.75
32	0.76
33	0.77
34	0.79
35	0.76
36	0.69
37	0.6
38	0.59
39	0.57
40	0.52
41	0.49
42	0.5
43	0.54
44	0.61
45	0.65
46	0.68
47	0.7
48	0.74
49	0.69
50	0.61
51	0.55
52	0.48
53	0.44
54	0.34
55	0.27
56	0.18
57	0.17
58	0.15
59	0.13
60	0.14
61	0.13
62	0.12
63	0.11
64	0.1
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.06
70	0.06
71	0.05
72	0.06
73	0.06
74	0.07
75	0.08
76	0.09
77	0.09
78	0.09
79	0.1
80	0.09
81	0.11
82	0.1
83	0.11
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.08
88	0.08
89	0.07
90	0.05
91	0.04
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.06
99	0.06
100	0.05
101	0.07
102	0.08
103	0.13
104	0.13
105	0.13
106	0.14
107	0.14
108	0.14
109	0.13
110	0.14
111	0.09
112	0.11
113	0.14
114	0.14
115	0.14
116	0.15
117	0.15
118	0.14
119	0.16
120	0.14
121	0.12
122	0.13
123	0.17
124	0.17
125	0.21
126	0.21
127	0.2
128	0.2
129	0.19
130	0.17
131	0.14
132	0.13
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.05
140	0.09
141	0.09
142	0.1
143	0.11
144	0.12
145	0.16
146	0.17
147	0.17
148	0.15
149	0.18
150	0.19
151	0.18
152	0.18
153	0.14
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.08
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.05
162	0.04
163	0.04
164	0.03
165	0.03
166	0.02
167	0.02
168	0.02
169	0.02
170	0.02
171	0.02
172	0.02
173	0.03
174	0.03
175	0.03
176	0.03
177	0.03
178	0.04
179	0.07
180	0.11
181	0.12
182	0.13
183	0.2
184	0.22
185	0.25
186	0.28
187	0.32
188	0.34
189	0.41
190	0.49
191	0.51
192	0.58
193	0.58
194	0.59
195	0.55
196	0.52
197	0.45
198	0.43
199	0.36
200	0.27
201	0.26
202	0.24
203	0.27
204	0.29
205	0.28
206	0.26
207	0.29
208	0.34
209	0.37
210	0.37
211	0.37
212	0.38
213	0.44
214	0.47
215	0.47
216	0.46
217	0.49
218	0.46
219	0.47
220	0.48
221	0.53
222	0.51
223	0.59
224	0.63
225	0.68
226	0.77
227	0.82
228	0.81
229	0.77
230	0.72
231	0.7
232	0.68
233	0.62
234	0.6
235	0.55
236	0.5
237	0.46
238	0.44
239	0.37
240	0.32
241	0.3
242	0.28
243	0.26
244	0.26
245	0.28
246	0.29
247	0.32
248	0.31
249	0.36
250	0.34
251	0.32
252	0.33
253	0.31
254	0.3
255	0.31
256	0.34
257	0.28
258	0.28
259	0.32
260	0.31
261	0.3
262	0.3
263	0.29
264	0.25
265	0.26
266	0.27
267	0.22
268	0.2
269	0.2
270	0.23
271	0.19
272	0.21
273	0.17
274	0.15
275	0.14
276	0.14
277	0.13
278	0.1
279	0.12
280	0.1
281	0.11
282	0.09
283	0.08
284	0.09
285	0.1
286	0.11
287	0.09
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.12
292	0.15
293	0.16
294	0.15
295	0.15
296	0.15
297	0.14
298	0.15
299	0.12
300	0.08
301	0.06
302	0.06
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.06
307	0.05
308	0.06
309	0.05
310	0.04
311	0.03
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.11
328	0.11
329	0.12
330	0.18
331	0.18
332	0.19
333	0.22
334	0.25
335	0.25
336	0.32
337	0.4
338	0.43
339	0.52
340	0.52
341	0.5
342	0.52
343	0.49
344	0.45
345	0.4
346	0.35
347	0.3
348	0.31
349	0.31
350	0.27
351	0.25
352	0.21
353	0.16
354	0.12
355	0.07
356	0.04
357	0.04
358	0.03
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.11
364	0.12
365	0.15
366	0.18
367	0.17
368	0.19
369	0.28
370	0.29
371	0.28
372	0.31
373	0.31
374	0.32
375	0.34
376	0.34
377	0.31
378	0.31
379	0.3
380	0.27
381	0.24
382	0.2
383	0.18
384	0.15
385	0.09
386	0.08
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.07
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.12
412	0.11
413	0.09
414	0.1
415	0.1
416	0.09
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.13
421	0.15
422	0.14
423	0.13
424	0.12
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.07
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.08
458	0.16
459	0.17
460	0.18
461	0.21
462	0.25
463	0.3
464	0.31
465	0.36
466	0.32
467	0.35
468	0.38
469	0.36
470	0.35
471	0.32
472	0.3
473	0.25
474	0.22
475	0.19
476	0.18
477	0.17
478	0.15
479	0.14
480	0.12
481	0.11
482	0.13
483	0.12
484	0.11
485	0.11
486	0.11
487	0.11
488	0.12
489	0.12
490	0.1
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.1
501	0.11
502	0.11
503	0.13
504	0.13
505	0.12
506	0.17
507	0.19
508	0.22
509	0.21
510	0.24
511	0.24
512	0.28
513	0.29
514	0.28
515	0.25
516	0.23
517	0.23
518	0.2
519	0.17
520	0.13
521	0.1
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.06
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.12
544	0.13
545	0.14
546	0.14
547	0.15
548	0.14
549	0.17
550	0.18
551	0.18
552	0.21
553	0.28
554	0.32
555	0.34
556	0.37
557	0.4
558	0.39
559	0.4
560	0.36
561	0.29
562	0.25
563	0.23
564	0.19
565	0.14
566	0.11
567	0.07
568	0.07
569	0.06
570	0.07
571	0.08
572	0.1
573	0.15
574	0.18
575	0.2
576	0.24
577	0.26
578	0.31
579	0.35
580	0.41
581	0.41
582	0.46
583	0.52
584	0.55
585	0.56
586	0.53
587	0.5
588	0.45
589	0.45

A0A553IDQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer