Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HTN6

Protein Details
Accession A0A553HTN6    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-117ARAAKAAKAKSKKRRREELASGASHydrophilic
350-379NARGESNDNDKNKKKRKKVKKSDEFDNLFKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-109AARAAKAAKAKSKKRRR
360-370KNKKKRKKVKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MATQKRAGRDAQISTQTSSNASTAGAETQEATPYSQALSRLEPLQPVLAGLAHRNHNQHRRAAWWRCFGMLRRSCAKLVEKLVVAIAAAHRTAARAAKAAKAKSKKRRREELASGASVTVAAVGANDALVVRESHSQMDIITSHAAWLHDVLAPRCYLAFSQLAADNQFAALGVVLLGILAQVKAACDCVAPRSANPLLSPPSACKIPAAAAAAERKPLSVESPNTVAKIGSTATTLALDSRLTARETPLAPKGQQESQREATRGIGGKAISREDVERAAEQRKRKETREAKDIQPTTNTSHAKTSTPVKEETSTSSGRRLQVPSAQVENGDEGARPAKKMKTAQITKENARGESNDNDKNKKKRKKVKKSDEFDNLFKGLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.4
4 0.35
5 0.31
6 0.24
7 0.17
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.13
12 0.12
13 0.1
14 0.12
15 0.12
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.18
26 0.2
27 0.23
28 0.24
29 0.24
30 0.23
31 0.22
32 0.2
33 0.17
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.14
38 0.18
39 0.21
40 0.25
41 0.31
42 0.4
43 0.47
44 0.51
45 0.54
46 0.52
47 0.55
48 0.62
49 0.65
50 0.64
51 0.63
52 0.59
53 0.56
54 0.58
55 0.54
56 0.55
57 0.51
58 0.49
59 0.46
60 0.48
61 0.46
62 0.47
63 0.47
64 0.43
65 0.41
66 0.39
67 0.34
68 0.31
69 0.3
70 0.24
71 0.2
72 0.14
73 0.11
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.15
83 0.16
84 0.22
85 0.28
86 0.32
87 0.38
88 0.45
89 0.54
90 0.61
91 0.71
92 0.75
93 0.79
94 0.86
95 0.85
96 0.85
97 0.84
98 0.83
99 0.78
100 0.69
101 0.59
102 0.48
103 0.4
104 0.3
105 0.21
106 0.11
107 0.05
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.07
134 0.08
135 0.07
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.06
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.06
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.18
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.12
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.12
197 0.1
198 0.11
199 0.14
200 0.14
201 0.16
202 0.15
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.16
210 0.2
211 0.21
212 0.21
213 0.21
214 0.18
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.15
234 0.16
235 0.19
236 0.22
237 0.23
238 0.23
239 0.26
240 0.28
241 0.3
242 0.36
243 0.37
244 0.39
245 0.43
246 0.46
247 0.44
248 0.41
249 0.36
250 0.34
251 0.31
252 0.25
253 0.21
254 0.18
255 0.2
256 0.21
257 0.21
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.17
263 0.16
264 0.16
265 0.18
266 0.25
267 0.28
268 0.34
269 0.41
270 0.49
271 0.53
272 0.55
273 0.63
274 0.65
275 0.68
276 0.71
277 0.68
278 0.64
279 0.68
280 0.66
281 0.57
282 0.52
283 0.47
284 0.41
285 0.44
286 0.41
287 0.32
288 0.35
289 0.35
290 0.32
291 0.33
292 0.38
293 0.36
294 0.38
295 0.38
296 0.37
297 0.38
298 0.38
299 0.4
300 0.36
301 0.33
302 0.31
303 0.35
304 0.36
305 0.36
306 0.4
307 0.37
308 0.36
309 0.38
310 0.4
311 0.38
312 0.37
313 0.35
314 0.3
315 0.28
316 0.26
317 0.21
318 0.18
319 0.13
320 0.11
321 0.17
322 0.18
323 0.18
324 0.22
325 0.25
326 0.31
327 0.37
328 0.44
329 0.49
330 0.56
331 0.64
332 0.69
333 0.72
334 0.7
335 0.72
336 0.66
337 0.57
338 0.52
339 0.46
340 0.41
341 0.41
342 0.44
343 0.44
344 0.47
345 0.54
346 0.6
347 0.68
348 0.74
349 0.77
350 0.81
351 0.84
352 0.89
353 0.92
354 0.95
355 0.95
356 0.95
357 0.93
358 0.92
359 0.92
360 0.87
361 0.79
362 0.73