Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A507CKW2

Protein Details
Accession A0A507CKW2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-174GTAPNTSSRRRDRRAKRSRDHDNGRRKMNQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-171RRRDRRAKRSRDHDNGRRK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, nucl 6.5, mito 3, plas 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039177  SMG9  
Gene Ontology GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Amino Acid Sequences MEEPTARGAKCGLFPHIVLHHAENSEYRMNKQATSSVPSLIKRERTSSDQVTPPPSSSSSAIPSKQVSTTNRILLVRKPLAAAEGDNSPPSNYSPKRDFHDGPSSPRNPGTATRKQPALDRTSELESNEGAGESSDGDMVDRTIGTAPNTSSRRRDRRAKRSRDHDNGRRKMNQSRVDHAPTPIFHQTPMILERRVPASLQHVHQQSPPHHPDHSADFIPNYSGVAIPPFQASAPVSDSHSTPAPAQIQKSSRSAAPTPDVLAAAMLKHIKATAQPPCQPILASPPLPTIEKPSINLIDDNWNCIIPTKHLADTPGCFIVGIIGRSHRVVSTLIQHFTQSTPPPAPTATKPIRGVTFHITPERIIVLGAQQIHTSPKVHESSRDYQIAQFLFSVCHVLVVVGDGLIDTEMWDFVKRVESIMSRGRASPAPHQRSDVGSSNASNISQQQRFVADETEFRPEIIFLARRGQFPDDYYAACEEVQNIFNQDTSRFRVQGSNVNMTKFLRRPDENVVHPNVFLLPDSNPRTLFFQPPVSAAAVASIPNQAPKPAHHPTFHEFVEGAFSIPCTTIVLINTLRNSIFEIPRYMMNGTGMLQKWYMVSEKDWGKSATRVWEGILATASASSDIRNGSLSVDIVGAVSGSGQGGPSSRRNDDVGHKVMRRSERDGEHRDREKHQLHPTTLGSGSGYIDDIDRRNRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.33
4 0.33
5 0.3
6 0.3
7 0.29
8 0.27
9 0.28
10 0.24
11 0.26
12 0.3
13 0.29
14 0.29
15 0.33
16 0.34
17 0.35
18 0.35
19 0.36
20 0.34
21 0.38
22 0.38
23 0.35
24 0.38
25 0.38
26 0.42
27 0.43
28 0.47
29 0.44
30 0.48
31 0.48
32 0.5
33 0.55
34 0.56
35 0.56
36 0.54
37 0.55
38 0.56
39 0.53
40 0.48
41 0.43
42 0.38
43 0.34
44 0.3
45 0.29
46 0.29
47 0.33
48 0.33
49 0.34
50 0.34
51 0.33
52 0.35
53 0.38
54 0.36
55 0.37
56 0.41
57 0.41
58 0.43
59 0.43
60 0.43
61 0.41
62 0.46
63 0.42
64 0.38
65 0.35
66 0.3
67 0.29
68 0.28
69 0.24
70 0.16
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.16
76 0.16
77 0.18
78 0.25
79 0.25
80 0.31
81 0.36
82 0.41
83 0.47
84 0.54
85 0.54
86 0.52
87 0.59
88 0.55
89 0.57
90 0.62
91 0.58
92 0.53
93 0.51
94 0.45
95 0.37
96 0.42
97 0.43
98 0.43
99 0.48
100 0.5
101 0.53
102 0.53
103 0.56
104 0.55
105 0.52
106 0.46
107 0.42
108 0.4
109 0.41
110 0.41
111 0.35
112 0.3
113 0.24
114 0.21
115 0.18
116 0.14
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.13
135 0.21
136 0.25
137 0.28
138 0.35
139 0.44
140 0.53
141 0.58
142 0.68
143 0.71
144 0.79
145 0.86
146 0.88
147 0.88
148 0.88
149 0.91
150 0.91
151 0.9
152 0.88
153 0.89
154 0.85
155 0.83
156 0.8
157 0.74
158 0.71
159 0.7
160 0.69
161 0.63
162 0.62
163 0.62
164 0.6
165 0.58
166 0.52
167 0.46
168 0.38
169 0.38
170 0.37
171 0.3
172 0.24
173 0.23
174 0.21
175 0.21
176 0.24
177 0.22
178 0.18
179 0.18
180 0.2
181 0.21
182 0.21
183 0.18
184 0.16
185 0.19
186 0.24
187 0.25
188 0.3
189 0.29
190 0.3
191 0.33
192 0.38
193 0.35
194 0.39
195 0.42
196 0.37
197 0.36
198 0.36
199 0.36
200 0.35
201 0.36
202 0.28
203 0.24
204 0.22
205 0.21
206 0.2
207 0.18
208 0.12
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.14
229 0.12
230 0.15
231 0.19
232 0.2
233 0.21
234 0.24
235 0.27
236 0.29
237 0.31
238 0.28
239 0.25
240 0.27
241 0.27
242 0.25
243 0.24
244 0.22
245 0.21
246 0.2
247 0.19
248 0.14
249 0.13
250 0.1
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.09
259 0.14
260 0.2
261 0.26
262 0.3
263 0.32
264 0.34
265 0.34
266 0.31
267 0.26
268 0.25
269 0.23
270 0.2
271 0.19
272 0.19
273 0.2
274 0.21
275 0.2
276 0.19
277 0.2
278 0.2
279 0.2
280 0.22
281 0.22
282 0.22
283 0.22
284 0.18
285 0.22
286 0.21
287 0.23
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.18
292 0.18
293 0.1
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.18
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.15
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.15
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.18
325 0.2
326 0.14
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.15
332 0.16
333 0.14
334 0.22
335 0.22
336 0.26
337 0.27
338 0.28
339 0.29
340 0.28
341 0.29
342 0.25
343 0.25
344 0.22
345 0.23
346 0.21
347 0.19
348 0.19
349 0.16
350 0.11
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.13
364 0.16
365 0.17
366 0.21
367 0.26
368 0.3
369 0.34
370 0.35
371 0.31
372 0.29
373 0.32
374 0.28
375 0.22
376 0.16
377 0.12
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.12
405 0.13
406 0.16
407 0.22
408 0.24
409 0.21
410 0.21
411 0.23
412 0.24
413 0.26
414 0.31
415 0.36
416 0.4
417 0.4
418 0.41
419 0.4
420 0.4
421 0.42
422 0.37
423 0.29
424 0.24
425 0.23
426 0.23
427 0.22
428 0.2
429 0.15
430 0.15
431 0.19
432 0.19
433 0.19
434 0.18
435 0.19
436 0.2
437 0.21
438 0.19
439 0.13
440 0.15
441 0.16
442 0.2
443 0.18
444 0.17
445 0.16
446 0.14
447 0.14
448 0.15
449 0.16
450 0.12
451 0.19
452 0.22
453 0.23
454 0.25
455 0.26
456 0.24
457 0.23
458 0.27
459 0.21
460 0.19
461 0.2
462 0.18
463 0.16
464 0.15
465 0.14
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.11
470 0.12
471 0.11
472 0.12
473 0.13
474 0.13
475 0.15
476 0.19
477 0.22
478 0.22
479 0.22
480 0.26
481 0.27
482 0.33
483 0.35
484 0.39
485 0.37
486 0.37
487 0.38
488 0.34
489 0.38
490 0.33
491 0.32
492 0.3
493 0.31
494 0.34
495 0.42
496 0.47
497 0.46
498 0.49
499 0.49
500 0.43
501 0.4
502 0.37
503 0.28
504 0.21
505 0.17
506 0.12
507 0.1
508 0.17
509 0.22
510 0.23
511 0.23
512 0.24
513 0.28
514 0.29
515 0.32
516 0.27
517 0.28
518 0.27
519 0.27
520 0.28
521 0.25
522 0.22
523 0.18
524 0.15
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.12
531 0.12
532 0.14
533 0.15
534 0.17
535 0.24
536 0.3
537 0.35
538 0.35
539 0.4
540 0.42
541 0.46
542 0.44
543 0.38
544 0.29
545 0.24
546 0.26
547 0.21
548 0.17
549 0.11
550 0.11
551 0.1
552 0.11
553 0.11
554 0.08
555 0.08
556 0.09
557 0.1
558 0.14
559 0.15
560 0.18
561 0.18
562 0.19
563 0.18
564 0.17
565 0.2
566 0.21
567 0.22
568 0.21
569 0.24
570 0.24
571 0.25
572 0.27
573 0.24
574 0.2
575 0.18
576 0.17
577 0.15
578 0.2
579 0.19
580 0.18
581 0.18
582 0.17
583 0.16
584 0.17
585 0.18
586 0.13
587 0.14
588 0.2
589 0.25
590 0.27
591 0.3
592 0.3
593 0.3
594 0.32
595 0.34
596 0.35
597 0.32
598 0.31
599 0.29
600 0.32
601 0.3
602 0.27
603 0.24
604 0.16
605 0.13
606 0.13
607 0.12
608 0.08
609 0.08
610 0.07
611 0.09
612 0.09
613 0.1
614 0.11
615 0.11
616 0.11
617 0.12
618 0.12
619 0.11
620 0.1
621 0.09
622 0.08
623 0.08
624 0.06
625 0.05
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.05
632 0.07
633 0.12
634 0.19
635 0.24
636 0.26
637 0.29
638 0.31
639 0.35
640 0.42
641 0.46
642 0.46
643 0.49
644 0.5
645 0.51
646 0.56
647 0.6
648 0.57
649 0.56
650 0.57
651 0.58
652 0.64
653 0.7
654 0.71
655 0.73
656 0.76
657 0.75
658 0.71
659 0.73
660 0.68
661 0.68
662 0.69
663 0.68
664 0.62
665 0.63
666 0.6
667 0.54
668 0.5
669 0.42
670 0.32
671 0.24
672 0.22
673 0.16
674 0.15
675 0.1
676 0.11
677 0.14
678 0.18